FuNGI

Q2U264

Protein Details

Accession

Q2U264

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-176	VPAAVPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESSQLTDETADHDIEKKKKSKKSKDKTKSKQADTEG	Hydrophilic
479-511	PEPETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-140	EKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKH
156-170	KKKKSKKSKDKTKSK
486-511	KTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 12.5, cyto_mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	aor:AO090038000585 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MKIFQSRACRQHGKSTTFNFIQKFSAMKHYRMLSSSMKLRLGACLETYRPRHRLPFLHMSKEGKEKKKVSTSENPSDIDPRRYSTGAPVAPLSNTMAVDAMEIDSERVPAAVPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESSQLTDETADHDIEKKKKSKKSKDKTKSKQADTEGAAIPDSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHAKASLLAEHLSPLLLTYYAPLQGVILAYSDASISSTPPSPYTSSDPADPNPKPLTLAKTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSNWKWVPPGEEGSVSGDQQKTATTSEDDESEPSASFDQEKEHFNPVSLANPVSDTLNEEANAEDDESAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDVDVIPGSERDRSFLSIEGTMLSPEEEARVLEDERNGILTTSATPRRGRSQEPRVSMSGALAAPSVAAIPEPETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.68
3	0.68
4	0.64
5	0.66
6	0.57
7	0.5
8	0.46
9	0.39
10	0.36
11	0.3
12	0.36
13	0.35
14	0.35
15	0.39
16	0.41
17	0.42
18	0.41
19	0.43
20	0.38
21	0.4
22	0.45
23	0.43
24	0.41
25	0.4
26	0.38
27	0.38
28	0.35
29	0.3
30	0.26
31	0.25
32	0.27
33	0.33
34	0.4
35	0.43
36	0.46
37	0.49
38	0.54
39	0.57
40	0.6
41	0.6
42	0.64
43	0.62
44	0.65
45	0.65
46	0.62
47	0.59
48	0.63
49	0.64
50	0.61
51	0.64
52	0.61
53	0.65
54	0.7
55	0.7
56	0.68
57	0.69
58	0.71
59	0.7
60	0.7
61	0.63
62	0.55
63	0.58
64	0.53
65	0.5
66	0.42
67	0.37
68	0.37
69	0.36
70	0.35
71	0.34
72	0.38
73	0.32
74	0.32
75	0.3
76	0.27
77	0.26
78	0.26
79	0.21
80	0.15
81	0.13
82	0.12
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.09
87	0.07
88	0.06
89	0.06
90	0.07
91	0.06
92	0.07
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.08
98	0.12
99	0.13
100	0.15
101	0.24
102	0.32
103	0.4
104	0.49
105	0.58
106	0.64
107	0.75
108	0.83
109	0.86
110	0.88
111	0.92
112	0.92
113	0.92
114	0.89
115	0.84
116	0.81
117	0.79
118	0.74
119	0.73
120	0.72
121	0.71
122	0.71
123	0.75
124	0.79
125	0.8
126	0.84
127	0.86
128	0.88
129	0.86
130	0.87
131	0.78
132	0.68
133	0.58
134	0.48
135	0.4
136	0.3
137	0.22
138	0.13
139	0.16
140	0.21
141	0.26
142	0.33
143	0.38
144	0.45
145	0.54
146	0.64
147	0.71
148	0.76
149	0.82
150	0.87
151	0.9
152	0.93
153	0.94
154	0.94
155	0.93
156	0.87
157	0.83
158	0.75
159	0.71
160	0.62
161	0.56
162	0.46
163	0.36
164	0.31
165	0.23
166	0.19
167	0.12
168	0.1
169	0.06
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.07
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.06
184	0.06
185	0.08
186	0.09
187	0.1
188	0.13
189	0.14
190	0.15
191	0.16
192	0.16
193	0.14
194	0.16
195	0.16
196	0.15
197	0.14
198	0.13
199	0.12
200	0.12
201	0.11
202	0.08
203	0.06
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.03
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.05
226	0.07
227	0.08
228	0.09
229	0.11
230	0.12
231	0.14
232	0.18
233	0.21
234	0.2
235	0.23
236	0.23
237	0.23
238	0.29
239	0.27
240	0.26
241	0.24
242	0.23
243	0.22
244	0.22
245	0.24
246	0.2
247	0.22
248	0.18
249	0.19
250	0.19
251	0.17
252	0.15
253	0.11
254	0.08
255	0.06
256	0.05
257	0.04
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.04
265	0.04
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.15
270	0.16
271	0.19
272	0.19
273	0.21
274	0.16
275	0.21
276	0.22
277	0.19
278	0.18
279	0.17
280	0.16
281	0.14
282	0.13
283	0.07
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.05
299	0.06
300	0.09
301	0.1
302	0.14
303	0.17
304	0.2
305	0.27
306	0.32
307	0.41
308	0.47
309	0.51
310	0.51
311	0.49
312	0.51
313	0.46
314	0.43
315	0.34
316	0.27
317	0.22
318	0.23
319	0.22
320	0.18
321	0.19
322	0.16
323	0.14
324	0.14
325	0.14
326	0.11
327	0.11
328	0.13
329	0.1
330	0.12
331	0.13
332	0.15
333	0.15
334	0.14
335	0.14
336	0.14
337	0.12
338	0.11
339	0.11
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.12
344	0.14
345	0.18
346	0.2
347	0.25
348	0.24
349	0.24
350	0.25
351	0.22
352	0.22
353	0.2
354	0.17
355	0.13
356	0.13
357	0.13
358	0.12
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.12
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.09
369	0.08
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.07
382	0.11
383	0.14
384	0.16
385	0.16
386	0.19
387	0.21
388	0.28
389	0.33
390	0.35
391	0.37
392	0.36
393	0.36
394	0.37
395	0.36
396	0.31
397	0.26
398	0.23
399	0.18
400	0.17
401	0.17
402	0.14
403	0.14
404	0.16
405	0.15
406	0.14
407	0.16
408	0.18
409	0.19
410	0.21
411	0.23
412	0.19
413	0.19
414	0.18
415	0.16
416	0.14
417	0.13
418	0.1
419	0.08
420	0.07
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.09
425	0.11
426	0.12
427	0.14
428	0.15
429	0.15
430	0.15
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.12
435	0.11
436	0.12
437	0.19
438	0.24
439	0.26
440	0.29
441	0.33
442	0.42
443	0.47
444	0.52
445	0.55
446	0.61
447	0.65
448	0.69
449	0.69
450	0.62
451	0.59
452	0.51
453	0.41
454	0.35
455	0.26
456	0.2
457	0.15
458	0.12
459	0.1
460	0.1
461	0.09
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.07
466	0.11
467	0.15
468	0.18
469	0.21
470	0.24
471	0.3
472	0.39
473	0.45
474	0.48
475	0.54
476	0.61
477	0.69
478	0.77
479	0.82
480	0.82
481	0.86
482	0.89
483	0.89
484	0.91
485	0.9
486	0.9
487	0.91
488	0.92
489	0.92
490	0.93
491	0.94

Q2U264

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer