Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UJ17

Protein Details
Accession A0A316UJ17    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-48LSSPHPRPPIERRKNLDTRINTALKAGKRKPKRRTKDDGEDLDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-18RK
25-39NTALKAGKRKPKRRT
278-287FKRKVREAKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MLTPLSSPHPRPPIERRKNLDTRINTALKAGKRKPKRRTKDDGEDLDPAADAEVAELRSAMLNAADDDVLSNEDRKPALAKLRLLPRVVDGLQKQHWQQSIFDSNLLEAVRRFLEPLPDKSLPALNIQRELFKGLEKLSPAIDTISLKMSGLGKVVIFYSRNRRVEPDLRRRADRLIEAWSRPILKRSASYRAMEIPKAAAPYLPSTARLLDSQSQAASQSQGQIDQSRRNVHIPQPVAGGFKVAPRSLVGAGSGGEGEAGDASLRAANLGRERLNAFKRKVREAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.75
3 0.74
4 0.77
5 0.83
6 0.83
7 0.82
8 0.76
9 0.71
10 0.7
11 0.64
12 0.54
13 0.49
14 0.48
15 0.44
16 0.49
17 0.51
18 0.53
19 0.61
20 0.71
21 0.78
22 0.83
23 0.88
24 0.88
25 0.9
26 0.9
27 0.9
28 0.9
29 0.86
30 0.79
31 0.7
32 0.61
33 0.5
34 0.4
35 0.29
36 0.19
37 0.12
38 0.08
39 0.05
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.16
65 0.23
66 0.27
67 0.29
68 0.34
69 0.42
70 0.45
71 0.44
72 0.41
73 0.34
74 0.34
75 0.31
76 0.29
77 0.22
78 0.24
79 0.26
80 0.29
81 0.28
82 0.29
83 0.31
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.3
88 0.28
89 0.28
90 0.23
91 0.2
92 0.2
93 0.19
94 0.13
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.17
102 0.2
103 0.24
104 0.29
105 0.29
106 0.29
107 0.29
108 0.3
109 0.23
110 0.24
111 0.25
112 0.19
113 0.22
114 0.22
115 0.23
116 0.21
117 0.22
118 0.17
119 0.14
120 0.14
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.19
147 0.27
148 0.29
149 0.29
150 0.32
151 0.37
152 0.45
153 0.52
154 0.54
155 0.56
156 0.57
157 0.59
158 0.57
159 0.54
160 0.49
161 0.41
162 0.31
163 0.29
164 0.29
165 0.27
166 0.27
167 0.26
168 0.25
169 0.24
170 0.25
171 0.2
172 0.18
173 0.23
174 0.26
175 0.32
176 0.33
177 0.34
178 0.33
179 0.38
180 0.39
181 0.34
182 0.3
183 0.24
184 0.21
185 0.21
186 0.19
187 0.13
188 0.11
189 0.13
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.18
199 0.19
200 0.19
201 0.18
202 0.18
203 0.17
204 0.17
205 0.15
206 0.12
207 0.14
208 0.13
209 0.14
210 0.15
211 0.2
212 0.23
213 0.28
214 0.33
215 0.34
216 0.36
217 0.39
218 0.42
219 0.42
220 0.46
221 0.42
222 0.38
223 0.36
224 0.35
225 0.33
226 0.29
227 0.25
228 0.17
229 0.19
230 0.21
231 0.18
232 0.18
233 0.16
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.14
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.12
256 0.17
257 0.22
258 0.23
259 0.25
260 0.28
261 0.36
262 0.43
263 0.48
264 0.5
265 0.52
266 0.57
267 0.65