Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316USE8

Protein Details
Accession A0A316USE8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-273GGANVKKERTWRQYMNRKGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-165ERDRERDGGRGRGRSSRSRSPAPRGRDRRRE
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSYRERPDPPRRGDDREQGGRDASRYRPEPPRRPYDDRADGYPRQPPQPYGAGRSDRPPPPMRPDYRDEGTYSRGPAASSSSYQGRSVPPQREQGRAIPPPREDRRERDWDYERSSGAAGSGRNWRDEPRDRYAERDRERDGGRGRGRSSRSRSPAPRGRDRRRETSPPSRTSGSSSKGDHLAATNGISAKYNGTAVAAEPMATGAAPEADAADEEEDAAPIDEAEAAMMASMGFGGFGTTKGTHVKGNSQGGANVKKERTWRQYMNRKGGFNRQLDAVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.75
3 0.75
4 0.7
5 0.61
6 0.59
7 0.52
8 0.47
9 0.42
10 0.37
11 0.36
12 0.36
13 0.41
14 0.48
15 0.57
16 0.64
17 0.67
18 0.73
19 0.73
20 0.79
21 0.79
22 0.79
23 0.78
24 0.71
25 0.69
26 0.65
27 0.6
28 0.55
29 0.55
30 0.48
31 0.44
32 0.43
33 0.39
34 0.37
35 0.42
36 0.42
37 0.4
38 0.44
39 0.43
40 0.43
41 0.45
42 0.48
43 0.43
44 0.47
45 0.47
46 0.45
47 0.49
48 0.57
49 0.59
50 0.56
51 0.58
52 0.58
53 0.56
54 0.52
55 0.46
56 0.39
57 0.38
58 0.35
59 0.3
60 0.25
61 0.22
62 0.2
63 0.18
64 0.19
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.22
72 0.2
73 0.26
74 0.32
75 0.35
76 0.36
77 0.44
78 0.46
79 0.48
80 0.49
81 0.47
82 0.47
83 0.48
84 0.48
85 0.43
86 0.44
87 0.49
88 0.52
89 0.53
90 0.49
91 0.49
92 0.53
93 0.58
94 0.58
95 0.57
96 0.57
97 0.55
98 0.56
99 0.51
100 0.44
101 0.35
102 0.31
103 0.23
104 0.18
105 0.15
106 0.1
107 0.1
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.19
112 0.2
113 0.25
114 0.33
115 0.37
116 0.37
117 0.43
118 0.42
119 0.48
120 0.54
121 0.56
122 0.51
123 0.5
124 0.45
125 0.44
126 0.45
127 0.44
128 0.38
129 0.37
130 0.37
131 0.36
132 0.36
133 0.36
134 0.39
135 0.42
136 0.46
137 0.46
138 0.48
139 0.52
140 0.55
141 0.58
142 0.62
143 0.61
144 0.65
145 0.67
146 0.72
147 0.74
148 0.76
149 0.74
150 0.73
151 0.74
152 0.72
153 0.73
154 0.71
155 0.64
156 0.62
157 0.57
158 0.5
159 0.48
160 0.45
161 0.38
162 0.34
163 0.32
164 0.3
165 0.3
166 0.29
167 0.24
168 0.2
169 0.17
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.14
230 0.16
231 0.19
232 0.2
233 0.27
234 0.31
235 0.37
236 0.37
237 0.35
238 0.37
239 0.4
240 0.44
241 0.42
242 0.41
243 0.37
244 0.39
245 0.45
246 0.52
247 0.54
248 0.57
249 0.63
250 0.67
251 0.76
252 0.82
253 0.85
254 0.82
255 0.79
256 0.75
257 0.76
258 0.74
259 0.67
260 0.59
261 0.54