Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UMR9

Protein Details
Accession A0A316UMR9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
855-881GHPHQQQQQHHHHPHHHPHHQQPPPQHBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10.833, nucl 5.5, cyto_nucl 5.333, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MSLRGARGGSTAASRGGSRLSTSSPRGGSGSSPSTRGWSTPNGFRGPSAAAAPAPAPPSQAPSASAFPSLGSQTQTAQRGDDAASRTLFVLVSLVGNTVTAKTRSGQRFVGILHSTSPGDLGVSLSSAQEIKGDGTLGAPQKLLVINGGDLDIVEAHEVTLGEPVREADRQSFRTDVEISAAARPDPASRALEKWDDDGSALSGGIEDGSATNNSSKSSKPGQAWDQFAANEARFGLKSNYDEDLYTTKLDRSGKDFKEKERRAARLAAEIEGQVSSNTHMAEERGHVDDSGQNEEDKYGAVKRGPNAYVPPAARRAAASPRVVLAEAAEKKAGAAAPSIAVNVASPTIPDGDGSGATAPKATTVAAAAPAAAGGAAPEDGKSNRLHSDFKQFVSSERMRFESRKQQQTEQEKKARLAELKSWSSSFKLKTPMPEDVASVVHKSPDSKPRDPALQKSLSPAPAHAQSSSMAPTSSSGAASASTAATPAPPSTQAAQLADTKAMLSKMTIPKIPPFKAKQDGAAPAAGAAPALPSSSAMSKMSAKASSFKPFNPAAASFTPGAGAGAASSTPAAPAPPANPFFGNRPLNKSATPLHVREDFTPFKKGSSKVVPESSSIPPTWPYNGKSFRAMYTQPQAQGPAVPGTPGHATTPLQQGQGEGGGAPPVPGTPQYAPSPALVYQPQQQQQPPMGPPSGPYRFPPHGQYPMPMPHGMPHGGPGMPFAGGAPVQQQQQFAMMPHTPHNPHAPHAMPFSPPMPPQGPPATMYSPQMAAAAAAQAAAGTVQAAPGQFAAGGALPPGTPRTTANAAGKGGAALPPQMYYGQGGPMPPHFVAGPMGPASMRPGGGFHAHGQHGGHPHQQQQQHHHHPHHHPHHQQPPPQHMHPGVAHPAQQQQQAVPPPPHSMASSDASGTPAVNSPAMGSTAGGKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.18
7 0.22
8 0.27
9 0.31
10 0.37
11 0.35
12 0.36
13 0.35
14 0.34
15 0.31
16 0.31
17 0.34
18 0.3
19 0.31
20 0.3
21 0.33
22 0.33
23 0.32
24 0.29
25 0.31
26 0.35
27 0.4
28 0.46
29 0.45
30 0.45
31 0.43
32 0.42
33 0.35
34 0.31
35 0.25
36 0.2
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.17
44 0.16
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.22
49 0.24
50 0.28
51 0.26
52 0.26
53 0.21
54 0.19
55 0.21
56 0.2
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.19
61 0.25
62 0.29
63 0.28
64 0.27
65 0.25
66 0.25
67 0.26
68 0.27
69 0.24
70 0.23
71 0.22
72 0.22
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.14
77 0.11
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.16
90 0.26
91 0.31
92 0.35
93 0.35
94 0.34
95 0.36
96 0.35
97 0.4
98 0.32
99 0.28
100 0.25
101 0.25
102 0.23
103 0.2
104 0.19
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.14
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.16
155 0.19
156 0.26
157 0.28
158 0.31
159 0.32
160 0.3
161 0.32
162 0.32
163 0.25
164 0.21
165 0.21
166 0.19
167 0.19
168 0.2
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.14
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.2
178 0.24
179 0.27
180 0.26
181 0.27
182 0.25
183 0.21
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.14
204 0.18
205 0.24
206 0.29
207 0.3
208 0.37
209 0.43
210 0.47
211 0.5
212 0.46
213 0.42
214 0.36
215 0.35
216 0.32
217 0.23
218 0.18
219 0.14
220 0.14
221 0.12
222 0.15
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.18
227 0.2
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.2
232 0.18
233 0.18
234 0.16
235 0.15
236 0.18
237 0.21
238 0.2
239 0.25
240 0.33
241 0.36
242 0.45
243 0.48
244 0.52
245 0.61
246 0.63
247 0.65
248 0.64
249 0.64
250 0.58
251 0.6
252 0.53
253 0.49
254 0.47
255 0.38
256 0.3
257 0.26
258 0.23
259 0.17
260 0.16
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.16
278 0.18
279 0.16
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.12
285 0.11
286 0.09
287 0.11
288 0.13
289 0.16
290 0.19
291 0.25
292 0.25
293 0.26
294 0.27
295 0.28
296 0.3
297 0.28
298 0.29
299 0.26
300 0.26
301 0.24
302 0.23
303 0.23
304 0.24
305 0.28
306 0.27
307 0.23
308 0.24
309 0.24
310 0.23
311 0.2
312 0.13
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.02
362 0.02
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.05
367 0.05
368 0.08
369 0.08
370 0.1
371 0.14
372 0.16
373 0.19
374 0.2
375 0.29
376 0.3
377 0.3
378 0.31
379 0.28
380 0.28
381 0.33
382 0.34
383 0.27
384 0.26
385 0.28
386 0.27
387 0.29
388 0.33
389 0.35
390 0.41
391 0.47
392 0.48
393 0.51
394 0.57
395 0.66
396 0.7
397 0.68
398 0.67
399 0.6
400 0.59
401 0.56
402 0.51
403 0.43
404 0.36
405 0.33
406 0.33
407 0.33
408 0.32
409 0.3
410 0.27
411 0.26
412 0.27
413 0.23
414 0.2
415 0.24
416 0.24
417 0.29
418 0.31
419 0.33
420 0.32
421 0.31
422 0.27
423 0.23
424 0.23
425 0.18
426 0.16
427 0.12
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.14
432 0.22
433 0.29
434 0.3
435 0.34
436 0.36
437 0.44
438 0.44
439 0.45
440 0.43
441 0.38
442 0.36
443 0.36
444 0.36
445 0.3
446 0.28
447 0.23
448 0.19
449 0.19
450 0.2
451 0.16
452 0.14
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.11
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.07
478 0.08
479 0.1
480 0.11
481 0.12
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.11
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.07
491 0.06
492 0.12
493 0.16
494 0.18
495 0.19
496 0.2
497 0.25
498 0.32
499 0.34
500 0.34
501 0.33
502 0.37
503 0.42
504 0.42
505 0.39
506 0.37
507 0.37
508 0.32
509 0.28
510 0.22
511 0.16
512 0.15
513 0.12
514 0.08
515 0.05
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.04
522 0.05
523 0.07
524 0.07
525 0.09
526 0.11
527 0.12
528 0.14
529 0.15
530 0.14
531 0.18
532 0.2
533 0.25
534 0.25
535 0.24
536 0.27
537 0.26
538 0.27
539 0.25
540 0.23
541 0.21
542 0.2
543 0.21
544 0.17
545 0.16
546 0.15
547 0.12
548 0.11
549 0.07
550 0.06
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.05
562 0.06
563 0.11
564 0.13
565 0.14
566 0.15
567 0.17
568 0.2
569 0.27
570 0.32
571 0.29
572 0.33
573 0.36
574 0.37
575 0.36
576 0.36
577 0.31
578 0.33
579 0.35
580 0.3
581 0.3
582 0.32
583 0.34
584 0.32
585 0.36
586 0.33
587 0.31
588 0.35
589 0.31
590 0.29
591 0.32
592 0.32
593 0.32
594 0.36
595 0.39
596 0.39
597 0.43
598 0.42
599 0.38
600 0.41
601 0.37
602 0.31
603 0.26
604 0.22
605 0.2
606 0.2
607 0.22
608 0.22
609 0.22
610 0.28
611 0.33
612 0.34
613 0.37
614 0.37
615 0.35
616 0.35
617 0.35
618 0.31
619 0.32
620 0.34
621 0.31
622 0.3
623 0.29
624 0.25
625 0.25
626 0.21
627 0.16
628 0.13
629 0.12
630 0.11
631 0.11
632 0.12
633 0.12
634 0.11
635 0.11
636 0.12
637 0.15
638 0.22
639 0.22
640 0.22
641 0.21
642 0.2
643 0.19
644 0.19
645 0.15
646 0.08
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.05
652 0.04
653 0.05
654 0.06
655 0.1
656 0.1
657 0.14
658 0.16
659 0.18
660 0.19
661 0.19
662 0.21
663 0.18
664 0.2
665 0.18
666 0.18
667 0.22
668 0.28
669 0.31
670 0.33
671 0.34
672 0.35
673 0.37
674 0.39
675 0.35
676 0.32
677 0.3
678 0.26
679 0.26
680 0.31
681 0.31
682 0.28
683 0.28
684 0.32
685 0.35
686 0.37
687 0.42
688 0.39
689 0.43
690 0.42
691 0.42
692 0.39
693 0.41
694 0.42
695 0.36
696 0.3
697 0.25
698 0.28
699 0.27
700 0.21
701 0.18
702 0.17
703 0.17
704 0.16
705 0.14
706 0.12
707 0.1
708 0.1
709 0.08
710 0.07
711 0.07
712 0.08
713 0.09
714 0.11
715 0.14
716 0.15
717 0.16
718 0.14
719 0.17
720 0.17
721 0.16
722 0.17
723 0.17
724 0.17
725 0.2
726 0.26
727 0.26
728 0.28
729 0.34
730 0.32
731 0.32
732 0.36
733 0.35
734 0.32
735 0.34
736 0.33
737 0.26
738 0.27
739 0.26
740 0.24
741 0.22
742 0.25
743 0.23
744 0.22
745 0.27
746 0.29
747 0.29
748 0.27
749 0.32
750 0.3
751 0.3
752 0.31
753 0.27
754 0.23
755 0.22
756 0.2
757 0.15
758 0.11
759 0.1
760 0.08
761 0.06
762 0.05
763 0.05
764 0.04
765 0.04
766 0.04
767 0.03
768 0.03
769 0.03
770 0.04
771 0.05
772 0.05
773 0.06
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.05
782 0.06
783 0.05
784 0.07
785 0.09
786 0.09
787 0.1
788 0.11
789 0.17
790 0.21
791 0.27
792 0.31
793 0.33
794 0.33
795 0.32
796 0.31
797 0.25
798 0.22
799 0.18
800 0.14
801 0.11
802 0.11
803 0.1
804 0.12
805 0.12
806 0.12
807 0.11
808 0.12
809 0.13
810 0.14
811 0.14
812 0.15
813 0.17
814 0.2
815 0.18
816 0.18
817 0.16
818 0.16
819 0.17
820 0.15
821 0.16
822 0.13
823 0.13
824 0.12
825 0.12
826 0.15
827 0.15
828 0.15
829 0.12
830 0.13
831 0.15
832 0.18
833 0.2
834 0.19
835 0.23
836 0.23
837 0.25
838 0.25
839 0.27
840 0.3
841 0.31
842 0.35
843 0.32
844 0.39
845 0.44
846 0.5
847 0.52
848 0.56
849 0.64
850 0.68
851 0.73
852 0.73
853 0.75
854 0.79
855 0.83
856 0.84
857 0.83
858 0.81
859 0.82
860 0.85
861 0.84
862 0.81
863 0.78
864 0.78
865 0.76
866 0.71
867 0.67
868 0.59
869 0.56
870 0.52
871 0.5
872 0.46
873 0.4
874 0.41
875 0.37
876 0.43
877 0.41
878 0.42
879 0.38
880 0.33
881 0.38
882 0.41
883 0.45
884 0.42
885 0.4
886 0.41
887 0.42
888 0.42
889 0.36
890 0.31
891 0.29
892 0.29
893 0.28
894 0.24
895 0.22
896 0.22
897 0.21
898 0.19
899 0.16
900 0.15
901 0.15
902 0.14
903 0.14
904 0.13
905 0.14
906 0.15
907 0.14
908 0.11