Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VJ40

Protein Details
Accession A0A316VJ40    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-247DYYSTQKERVQRQRERKEKQVLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-103RDGRSSRGGARGRGGERGGRGRGGAGSRGGRR
258-297AGRGRGGEGRGGRGGRGRGEGRGRGRGEGRGRGAPRGARG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.5, cyto 13, nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVASRNPFAALGDEDSAPVAVAPAAKKDAAAPAAPKRTIPGLNRNGASRGAEGARAPRADAADGAEAPQQRDGRSSRGGARGRGGERGGRGRGGAGSRGGRRQFDRHSATGKDDSNKKIEQGWGGDDPKRELDAEDGAKADAAEEEAGEGEKKDAAAPTANGSAEKELPAVVEEEEKDNTKTLDEYLAEQAAKRAQIGAFKEARAAEVDDKALGTKVTKQLGDDYYSTQKERVQRQRERKEKQVLEIEQNFNPPPSAGRGRGGEGRGGRGGRGRGEGRGRGRGEGRGRGAPRGARGGNAPGANINLADSSAFPTLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.17
4 0.16
5 0.13
6 0.1
7 0.07
8 0.06
9 0.08
10 0.09
11 0.12
12 0.14
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.2
17 0.19
18 0.21
19 0.24
20 0.3
21 0.37
22 0.37
23 0.36
24 0.34
25 0.37
26 0.41
27 0.41
28 0.44
29 0.45
30 0.51
31 0.52
32 0.51
33 0.48
34 0.43
35 0.39
36 0.29
37 0.25
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.21
42 0.23
43 0.21
44 0.21
45 0.2
46 0.2
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.21
57 0.19
58 0.17
59 0.22
60 0.23
61 0.25
62 0.28
63 0.3
64 0.31
65 0.39
66 0.41
67 0.39
68 0.4
69 0.42
70 0.39
71 0.4
72 0.35
73 0.29
74 0.3
75 0.34
76 0.31
77 0.25
78 0.24
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.18
83 0.17
84 0.2
85 0.22
86 0.28
87 0.3
88 0.3
89 0.32
90 0.36
91 0.38
92 0.42
93 0.45
94 0.42
95 0.44
96 0.43
97 0.44
98 0.43
99 0.4
100 0.37
101 0.37
102 0.37
103 0.37
104 0.36
105 0.32
106 0.3
107 0.29
108 0.26
109 0.22
110 0.22
111 0.22
112 0.24
113 0.26
114 0.24
115 0.23
116 0.22
117 0.21
118 0.18
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.09
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.1
172 0.09
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.14
185 0.16
186 0.21
187 0.21
188 0.2
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.18
193 0.18
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.08
202 0.07
203 0.11
204 0.16
205 0.19
206 0.19
207 0.2
208 0.24
209 0.26
210 0.28
211 0.24
212 0.23
213 0.27
214 0.29
215 0.29
216 0.25
217 0.27
218 0.31
219 0.4
220 0.47
221 0.5
222 0.58
223 0.69
224 0.78
225 0.85
226 0.85
227 0.84
228 0.84
229 0.78
230 0.75
231 0.73
232 0.66
233 0.65
234 0.65
235 0.59
236 0.5
237 0.49
238 0.43
239 0.34
240 0.3
241 0.22
242 0.16
243 0.19
244 0.23
245 0.23
246 0.26
247 0.28
248 0.31
249 0.36
250 0.35
251 0.34
252 0.3
253 0.31
254 0.31
255 0.29
256 0.27
257 0.27
258 0.29
259 0.26
260 0.31
261 0.29
262 0.31
263 0.37
264 0.43
265 0.44
266 0.5
267 0.48
268 0.47
269 0.48
270 0.49
271 0.49
272 0.5
273 0.49
274 0.49
275 0.49
276 0.48
277 0.51
278 0.46
279 0.44
280 0.45
281 0.41
282 0.34
283 0.35
284 0.36
285 0.37
286 0.33
287 0.3
288 0.23
289 0.24
290 0.22
291 0.19
292 0.15
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.11