FuNGI

Q2U9W3

Protein Details

Accession

Q2U9W3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-49	RSEGSASRAKRRKQRGGAEWEVSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
32-40	SRAKRRKQR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046349 C1-like_sf IPR007198 Ssl1-like IPR004595 TFIIH_C1-like_dom IPR012170 TFIIH_SSL1/p44 IPR002035 VWF_A IPR036465 vWFA_dom_sf IPR013087 Znf_C2H2_type IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0005675 C:transcription factor TFIIH holo complex GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006289 P:nucleotide-excision repair GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	aor:AO090102000640 -
Pfam	View protein in Pfam PF07975 C1_4 PF04056 Ssl1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50234 VWFA PS00028 ZINC_FINGER_C2H2_1
CDD	cd01453 vWA_transcription_factor_IIH_type

Amino Acid Sequences

MGDSDEEYIGEVSEDEDDNNVFRGSRSEGSASRAKRRKQRGGAEWEVSRTWETLVEGADGTISSTVEGLLEAGKRKRLLKDTTPLQRGIIRHLILIIDLSQSMTEKDLRPTRYLLTLRYAQELVREFFEQNPISQLGVLGLRDGLAIRISDLSGNPTEHISAIQTLRDQDPKGLPSLQNGIEMARGALFHTPSHGTREIFIIFGSLLSSDPGDIHQTIANLINDKVRVGIVGLAAQVAICRELCAKTNGGDDTRYGVALNEQHFRELLMDVTTPPATYSQKQSASSLLMMGFPSRTVETSPSLCACHSKSSCGGYLCSRCNSKVCGLPAECPSCGLTLILSTHLARSYHHLFPLVNWVEVPWQRASRSSVCFACGIAFPPVPPKDQWQTTENQAKGMSVSSRYECTVCENHFCIDCDLFAHEVVHNCPGCQSKPTFPKKADLLGCQAGLGLEIMDTSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.1
4	0.1
5	0.11
6	0.13
7	0.12
8	0.1
9	0.1
10	0.13
11	0.17
12	0.19
13	0.22
14	0.26
15	0.27
16	0.32
17	0.4
18	0.42
19	0.47
20	0.53
21	0.58
22	0.63
23	0.72
24	0.77
25	0.8
26	0.85
27	0.84
28	0.85
29	0.85
30	0.81
31	0.73
32	0.65
33	0.56
34	0.47
35	0.38
36	0.29
37	0.22
38	0.17
39	0.16
40	0.14
41	0.15
42	0.14
43	0.13
44	0.12
45	0.11
46	0.09
47	0.09
48	0.07
49	0.06
50	0.05
51	0.05
52	0.05
53	0.05
54	0.05
55	0.05
56	0.07
57	0.09
58	0.15
59	0.17
60	0.22
61	0.25
62	0.3
63	0.37
64	0.42
65	0.48
66	0.51
67	0.58
68	0.63
69	0.69
70	0.69
71	0.63
72	0.57
73	0.53
74	0.46
75	0.43
76	0.4
77	0.31
78	0.27
79	0.27
80	0.25
81	0.2
82	0.2
83	0.14
84	0.08
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.09
91	0.11
92	0.13
93	0.2
94	0.27
95	0.29
96	0.31
97	0.33
98	0.34
99	0.38
100	0.39
101	0.34
102	0.33
103	0.36
104	0.35
105	0.35
106	0.34
107	0.26
108	0.28
109	0.29
110	0.25
111	0.21
112	0.22
113	0.19
114	0.2
115	0.26
116	0.22
117	0.19
118	0.2
119	0.19
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.07
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.1
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.12
145	0.11
146	0.11
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.11
152	0.12
153	0.15
154	0.18
155	0.17
156	0.18
157	0.2
158	0.2
159	0.22
160	0.23
161	0.21
162	0.2
163	0.24
164	0.21
165	0.19
166	0.18
167	0.16
168	0.13
169	0.13
170	0.11
171	0.07
172	0.06
173	0.05
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.09
178	0.11
179	0.11
180	0.16
181	0.18
182	0.17
183	0.17
184	0.19
185	0.18
186	0.15
187	0.15
188	0.1
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.1
212	0.1
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.04
226	0.03
227	0.04
228	0.05
229	0.06
230	0.08
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.14
235	0.15
236	0.15
237	0.15
238	0.13
239	0.14
240	0.14
241	0.12
242	0.1
243	0.09
244	0.1
245	0.13
246	0.14
247	0.16
248	0.15
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.15
253	0.12
254	0.1
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.1
263	0.12
264	0.13
265	0.18
266	0.23
267	0.27
268	0.28
269	0.28
270	0.27
271	0.26
272	0.25
273	0.21
274	0.15
275	0.12
276	0.11
277	0.1
278	0.08
279	0.07
280	0.08
281	0.07
282	0.08
283	0.08
284	0.1
285	0.13
286	0.14
287	0.16
288	0.16
289	0.16
290	0.16
291	0.18
292	0.17
293	0.23
294	0.23
295	0.24
296	0.26
297	0.28
298	0.31
299	0.29
300	0.29
301	0.27
302	0.32
303	0.32
304	0.33
305	0.33
306	0.31
307	0.33
308	0.34
309	0.32
310	0.31
311	0.3
312	0.33
313	0.32
314	0.35
315	0.38
316	0.38
317	0.34
318	0.29
319	0.28
320	0.21
321	0.2
322	0.16
323	0.1
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.13
331	0.13
332	0.12
333	0.18
334	0.22
335	0.24
336	0.25
337	0.26
338	0.23
339	0.24
340	0.34
341	0.29
342	0.23
343	0.21
344	0.2
345	0.24
346	0.26
347	0.28
348	0.21
349	0.22
350	0.23
351	0.26
352	0.32
353	0.31
354	0.34
355	0.37
356	0.34
357	0.33
358	0.33
359	0.29
360	0.26
361	0.21
362	0.18
363	0.17
364	0.16
365	0.15
366	0.22
367	0.24
368	0.25
369	0.25
370	0.3
371	0.34
372	0.39
373	0.42
374	0.38
375	0.4
376	0.46
377	0.54
378	0.47
379	0.42
380	0.38
381	0.34
382	0.31
383	0.3
384	0.24
385	0.18
386	0.22
387	0.21
388	0.23
389	0.24
390	0.24
391	0.22
392	0.26
393	0.29
394	0.28
395	0.32
396	0.32
397	0.33
398	0.35
399	0.36
400	0.33
401	0.27
402	0.25
403	0.2
404	0.2
405	0.18
406	0.16
407	0.16
408	0.15
409	0.17
410	0.19
411	0.25
412	0.23
413	0.22
414	0.25
415	0.28
416	0.28
417	0.31
418	0.34
419	0.37
420	0.47
421	0.56
422	0.61
423	0.59
424	0.65
425	0.64
426	0.68
427	0.64
428	0.58
429	0.56
430	0.51
431	0.49
432	0.4
433	0.36
434	0.26
435	0.21
436	0.16
437	0.09
438	0.05

Q2U9W3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer