FuNGI

A0A316VJF9

Protein Details

Accession

A0A316VJF9

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-52	KRTGEKKDSTGQKRVRNRPNRSKNAKKEAEAKGE	Basic
60-94	QKQNTGEAAPKKRKQRRNKKKKTKKEAKEAKESGD	Basic
396-421	AENNVTQTKKQPKKEQNRTNKAEGEN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-94	DEKKGSEKRTGEKKDSTGQKRVRNRPNRSKNAKKEAEAKGEPAEKAEDQKQNTGEAAPKKRKQRRNKKKKTKKEAKEAKESGD
97-98	PK
328-344	GKTKSAKGTSGSKSKAK
372-378	NKKSKKS

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MEGETGMSPKGDEKKGSEKRTGEKKDSTGQKRVRNRPNRSKNAKKEAEAKGEPAEKAEDQKQNTGEAAPKKRKQRRNKKKKTKKEAKEAKESGDFNPKIKLKVIIRRLPPNLPEHIFWQAISPWVLRSESQKGVAPTEDKSGSLAESSSSKVPFADQAYFVPGKLKDGSRRGVQADSNASPHTFSRAYIRFHKTDDLVNFHRGFDGHLFRDSKGNEYFAVVEFAPFQRMPEDGVRRKKPDTLAGTIEEDEHYKQFVSILTQTEAELAQEKGQGQLEKTDAQLMAHLTSLSADSQNAQKQAKSTPLLEHLRAQRLAKSGTSAQKQSRTGKTKSAKGTSGSKSKAKAISDPSIPTGPKAMVQKQKDSQKTESGNKKSKKSEKSANSARLDKNSISDHAENNVTQTKKQPKKEQNRTNKAEGENSGVGKIASNKNVTPKIPSSPPAKIAILKREMKDSEGQKQTSTTSTQTMDVEQNLKQPPISRGRRGRGAGSGGDT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.54
3	0.6
4	0.62
5	0.6
6	0.66
7	0.73
8	0.76
9	0.73
10	0.7
11	0.7
12	0.71
13	0.75
14	0.73
15	0.73
16	0.72
17	0.74
18	0.78
19	0.83
20	0.84
21	0.85
22	0.88
23	0.89
24	0.92
25	0.93
26	0.93
27	0.94
28	0.93
29	0.94
30	0.9
31	0.84
32	0.83
33	0.8
34	0.79
35	0.7
36	0.62
37	0.58
38	0.55
39	0.5
40	0.42
41	0.37
42	0.29
43	0.33
44	0.38
45	0.38
46	0.36
47	0.42
48	0.41
49	0.39
50	0.38
51	0.35
52	0.34
53	0.36
54	0.43
55	0.48
56	0.53
57	0.62
58	0.71
59	0.79
60	0.84
61	0.86
62	0.88
63	0.89
64	0.94
65	0.95
66	0.96
67	0.98
68	0.98
69	0.97
70	0.96
71	0.96
72	0.95
73	0.92
74	0.91
75	0.83
76	0.77
77	0.73
78	0.64
79	0.57
80	0.56
81	0.49
82	0.39
83	0.45
84	0.41
85	0.36
86	0.36
87	0.4
88	0.37
89	0.45
90	0.54
91	0.53
92	0.57
93	0.64
94	0.66
95	0.64
96	0.61
97	0.56
98	0.52
99	0.47
100	0.42
101	0.36
102	0.37
103	0.32
104	0.27
105	0.25
106	0.19
107	0.19
108	0.19
109	0.16
110	0.13
111	0.14
112	0.15
113	0.14
114	0.18
115	0.22
116	0.23
117	0.25
118	0.28
119	0.27
120	0.28
121	0.29
122	0.26
123	0.21
124	0.24
125	0.22
126	0.18
127	0.18
128	0.17
129	0.14
130	0.13
131	0.12
132	0.08
133	0.09
134	0.1
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.12
139	0.12
140	0.15
141	0.16
142	0.17
143	0.15
144	0.15
145	0.2
146	0.2
147	0.2
148	0.2
149	0.17
150	0.18
151	0.2
152	0.23
153	0.25
154	0.3
155	0.34
156	0.33
157	0.36
158	0.35
159	0.35
160	0.32
161	0.29
162	0.29
163	0.26
164	0.25
165	0.22
166	0.2
167	0.18
168	0.18
169	0.18
170	0.13
171	0.13
172	0.19
173	0.23
174	0.27
175	0.35
176	0.4
177	0.37
178	0.39
179	0.41
180	0.35
181	0.35
182	0.33
183	0.31
184	0.29
185	0.32
186	0.31
187	0.28
188	0.28
189	0.22
190	0.21
191	0.19
192	0.2
193	0.16
194	0.2
195	0.21
196	0.21
197	0.26
198	0.25
199	0.25
200	0.22
201	0.22
202	0.18
203	0.17
204	0.17
205	0.13
206	0.14
207	0.1
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.11
217	0.16
218	0.24
219	0.29
220	0.38
221	0.42
222	0.45
223	0.46
224	0.47
225	0.44
226	0.43
227	0.41
228	0.36
229	0.33
230	0.31
231	0.31
232	0.27
233	0.25
234	0.18
235	0.14
236	0.11
237	0.09
238	0.08
239	0.07
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.09
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.09
252	0.09
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.11
259	0.12
260	0.11
261	0.13
262	0.14
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.12
267	0.11
268	0.12
269	0.11
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.1
281	0.13
282	0.16
283	0.17
284	0.17
285	0.18
286	0.2
287	0.25
288	0.24
289	0.23
290	0.22
291	0.29
292	0.32
293	0.31
294	0.35
295	0.34
296	0.36
297	0.37
298	0.35
299	0.3
300	0.3
301	0.3
302	0.25
303	0.23
304	0.24
305	0.29
306	0.32
307	0.33
308	0.35
309	0.4
310	0.45
311	0.49
312	0.53
313	0.53
314	0.51
315	0.56
316	0.58
317	0.59
318	0.61
319	0.59
320	0.52
321	0.49
322	0.55
323	0.51
324	0.53
325	0.5
326	0.47
327	0.44
328	0.46
329	0.48
330	0.41
331	0.41
332	0.39
333	0.4
334	0.39
335	0.38
336	0.36
337	0.35
338	0.33
339	0.28
340	0.24
341	0.19
342	0.19
343	0.23
344	0.28
345	0.33
346	0.37
347	0.44
348	0.49
349	0.58
350	0.6
351	0.61
352	0.57
353	0.58
354	0.61
355	0.63
356	0.66
357	0.66
358	0.69
359	0.69
360	0.72
361	0.74
362	0.76
363	0.76
364	0.74
365	0.75
366	0.73
367	0.77
368	0.79
369	0.78
370	0.75
371	0.74
372	0.68
373	0.63
374	0.59
375	0.49
376	0.44
377	0.37
378	0.34
379	0.33
380	0.32
381	0.29
382	0.28
383	0.29
384	0.25
385	0.26
386	0.3
387	0.25
388	0.24
389	0.31
390	0.39
391	0.46
392	0.55
393	0.62
394	0.67
395	0.77
396	0.87
397	0.89
398	0.9
399	0.92
400	0.89
401	0.86
402	0.82
403	0.73
404	0.68
405	0.59
406	0.54
407	0.47
408	0.41
409	0.33
410	0.27
411	0.24
412	0.2
413	0.25
414	0.23
415	0.25
416	0.27
417	0.29
418	0.37
419	0.43
420	0.42
421	0.42
422	0.4
423	0.42
424	0.44
425	0.47
426	0.45
427	0.45
428	0.47
429	0.46
430	0.44
431	0.44
432	0.45
433	0.49
434	0.51
435	0.53
436	0.51
437	0.53
438	0.52
439	0.49
440	0.51
441	0.48
442	0.49
443	0.51
444	0.5
445	0.44
446	0.45
447	0.44
448	0.39
449	0.37
450	0.3
451	0.26
452	0.27
453	0.28
454	0.28
455	0.29
456	0.29
457	0.29
458	0.29
459	0.26
460	0.31
461	0.32
462	0.32
463	0.3
464	0.31
465	0.35
466	0.43
467	0.5
468	0.53
469	0.6
470	0.67
471	0.74
472	0.73
473	0.7
474	0.66
475	0.62

A0A316VJF9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer