FuNGI

A0A316VBR4

Protein Details

Accession

A0A316VBR4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
97-122	GVPEHADTFRRKRKRKQNEQTSDVTE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
106-112	RRKRKRK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022042 snRNA-activating_su3
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF12251 SNAPC3

Amino Acid Sequences

MTSNEGNVQGKRYDASSELLIGPESERIKLSEIANDPIFAQCQKVPTYSKALTSTEEEALARRCSVYELQKKVKETVDDRKLASELRTRLLTWVVEGVPEHADTFRRKRKRKQNEQTSDVTENESDDTLENATSHEVEPIRGLQSLQKVQDSVPNAFKFMANPALASAYHQQGGRSDGSAIVAPTPTHLLKNIEYPSSVIEAVSERQTSDGKESRPFILEISIYSRPPRGMWAKEKFDRIVRSVPDSGYHLEEEKEFEDNSHWQDGERFEIPERTKRGPQSMFGRSGPYESLQLAQKIEIRSDATLKDLRDGFYCRMDDIPESVNESEKFKAWNKQVAVGDLSSAAPQMHQYTGQKRRTDSCFLIEDVLYSEYAGQDAYALLLSTHFSKPNEDGAPPRASASGQRMEDVKMDSLELCTGKLYWLLHQGSCEHVWVIDVMRLAREEECKRPNSESVTTFLRNDSAVNPIVRWSRPVKREEAFLFGPCQICDKRPSDMIVAGGGRFRPLNGKETCKGLGDDNVGVCEYCWYTLNGDKVEIAGAGGEGWSVIPLT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.22
3	0.19
4	0.21
5	0.2
6	0.2
7	0.19
8	0.17
9	0.15
10	0.18
11	0.18
12	0.16
13	0.16
14	0.17
15	0.21
16	0.25
17	0.25
18	0.27
19	0.29
20	0.33
21	0.33
22	0.32
23	0.29
24	0.26
25	0.27
26	0.19
27	0.19
28	0.16
29	0.19
30	0.21
31	0.25
32	0.28
33	0.3
34	0.38
35	0.37
36	0.4
37	0.4
38	0.39
39	0.38
40	0.38
41	0.37
42	0.3
43	0.29
44	0.25
45	0.24
46	0.26
47	0.24
48	0.2
49	0.17
50	0.16
51	0.18
52	0.24
53	0.32
54	0.37
55	0.45
56	0.53
57	0.58
58	0.61
59	0.62
60	0.6
61	0.57
62	0.54
63	0.56
64	0.56
65	0.55
66	0.53
67	0.51
68	0.47
69	0.42
70	0.4
71	0.37
72	0.31
73	0.31
74	0.32
75	0.3
76	0.3
77	0.31
78	0.27
79	0.2
80	0.21
81	0.17
82	0.16
83	0.15
84	0.15
85	0.14
86	0.14
87	0.13
88	0.11
89	0.15
90	0.2
91	0.3
92	0.38
93	0.48
94	0.57
95	0.66
96	0.77
97	0.84
98	0.89
99	0.91
100	0.92
101	0.92
102	0.88
103	0.84
104	0.79
105	0.71
106	0.6
107	0.5
108	0.39
109	0.3
110	0.25
111	0.19
112	0.13
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.08
118	0.08
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.13
126	0.14
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.14
131	0.21
132	0.25
133	0.25
134	0.25
135	0.24
136	0.24
137	0.28
138	0.28
139	0.25
140	0.28
141	0.27
142	0.27
143	0.26
144	0.26
145	0.22
146	0.21
147	0.23
148	0.15
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.15
153	0.17
154	0.17
155	0.13
156	0.15
157	0.16
158	0.16
159	0.16
160	0.19
161	0.17
162	0.15
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.09
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.12
176	0.14
177	0.15
178	0.21
179	0.22
180	0.2
181	0.2
182	0.2
183	0.19
184	0.18
185	0.17
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.11
190	0.12
191	0.11
192	0.09
193	0.11
194	0.12
195	0.12
196	0.17
197	0.2
198	0.2
199	0.24
200	0.26
201	0.26
202	0.27
203	0.26
204	0.21
205	0.18
206	0.16
207	0.13
208	0.16
209	0.16
210	0.15
211	0.16
212	0.17
213	0.15
214	0.15
215	0.2
216	0.21
217	0.25
218	0.33
219	0.4
220	0.46
221	0.49
222	0.52
223	0.48
224	0.48
225	0.44
226	0.39
227	0.37
228	0.31
229	0.31
230	0.3
231	0.28
232	0.24
233	0.23
234	0.22
235	0.17
236	0.17
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.11
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.12
247	0.14
248	0.13
249	0.13
250	0.11
251	0.14
252	0.14
253	0.16
254	0.15
255	0.13
256	0.12
257	0.18
258	0.2
259	0.23
260	0.27
261	0.27
262	0.3
263	0.32
264	0.38
265	0.34
266	0.37
267	0.38
268	0.38
269	0.38
270	0.35
271	0.35
272	0.28
273	0.28
274	0.24
275	0.17
276	0.14
277	0.11
278	0.12
279	0.11
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.15
284	0.14
285	0.14
286	0.13
287	0.12
288	0.12
289	0.14
290	0.13
291	0.12
292	0.15
293	0.15
294	0.17
295	0.17
296	0.17
297	0.18
298	0.21
299	0.19
300	0.2
301	0.2
302	0.18
303	0.17
304	0.17
305	0.16
306	0.14
307	0.14
308	0.11
309	0.13
310	0.13
311	0.15
312	0.15
313	0.16
314	0.15
315	0.14
316	0.18
317	0.18
318	0.25
319	0.26
320	0.32
321	0.31
322	0.37
323	0.37
324	0.35
325	0.33
326	0.25
327	0.22
328	0.16
329	0.15
330	0.09
331	0.08
332	0.07
333	0.05
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.1
338	0.14
339	0.23
340	0.33
341	0.39
342	0.41
343	0.42
344	0.48
345	0.5
346	0.53
347	0.45
348	0.4
349	0.36
350	0.34
351	0.33
352	0.27
353	0.22
354	0.17
355	0.15
356	0.11
357	0.09
358	0.08
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.08
372	0.1
373	0.13
374	0.13
375	0.16
376	0.18
377	0.24
378	0.25
379	0.23
380	0.25
381	0.27
382	0.29
383	0.27
384	0.26
385	0.21
386	0.19
387	0.21
388	0.24
389	0.26
390	0.24
391	0.25
392	0.25
393	0.26
394	0.27
395	0.26
396	0.21
397	0.14
398	0.15
399	0.14
400	0.13
401	0.14
402	0.12
403	0.1
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.2
411	0.22
412	0.22
413	0.23
414	0.23
415	0.24
416	0.24
417	0.23
418	0.15
419	0.12
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.1
424	0.11
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.14
430	0.2
431	0.22
432	0.29
433	0.36
434	0.38
435	0.41
436	0.44
437	0.46
438	0.45
439	0.47
440	0.4
441	0.38
442	0.41
443	0.4
444	0.37
445	0.33
446	0.28
447	0.22
448	0.22
449	0.19
450	0.17
451	0.19
452	0.18
453	0.18
454	0.21
455	0.25
456	0.25
457	0.28
458	0.31
459	0.36
460	0.43
461	0.47
462	0.49
463	0.47
464	0.54
465	0.52
466	0.51
467	0.44
468	0.4
469	0.38
470	0.33
471	0.33
472	0.25
473	0.29
474	0.24
475	0.25
476	0.3
477	0.3
478	0.32
479	0.34
480	0.37
481	0.34
482	0.34
483	0.32
484	0.29
485	0.27
486	0.23
487	0.22
488	0.19
489	0.17
490	0.16
491	0.15
492	0.2
493	0.21
494	0.29
495	0.32
496	0.4
497	0.4
498	0.45
499	0.46
500	0.41
501	0.4
502	0.34
503	0.34
504	0.3
505	0.31
506	0.27
507	0.26
508	0.24
509	0.22
510	0.2
511	0.17
512	0.14
513	0.12
514	0.13
515	0.13
516	0.16
517	0.21
518	0.27
519	0.25
520	0.25
521	0.24
522	0.23
523	0.23
524	0.19
525	0.14
526	0.08
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.04
532	0.04

A0A316VBR4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer