Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VC11

Protein Details
Accession A0A316VC11    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
352-373YTRPSAPTSKSQPRKAQPVEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 10.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MAMTTATLNDGKINRSNTSPPSLRLQLRFIKTIYQNLTNVYFLLIEQGASTSIASTKNALTIQMNSLKAQVRGDLIDNASSSRSQTPSGLRSKSTSGGLSDLRPEHSKRVKDIHLFEALLRPNVGVKGSMASTSTQNSFMPSLKQAIQAIEVINEILNELMERANVHAANQARIRTLVAEIEQRDTTMVQSIRKLASLRESCHRLVKLGKEEEDSIKRAESKPLAYDDILHYARTLSQTTTAPPGFKLQLDEEGERSHDADPAGDQPAKKRKLFQLAGDDDDEAEAGKNGQIPSHLQDKLPFPSIDAIRRGASVIRPPTWDMFQKGILQMDQEDVDGNPETNGQLQEQEAQYTRPSAPTSKSQPRKAQPVEEEEDGFGLDLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.4
4 0.4
5 0.47
6 0.46
7 0.42
8 0.46
9 0.52
10 0.54
11 0.51
12 0.54
13 0.54
14 0.55
15 0.55
16 0.48
17 0.49
18 0.46
19 0.51
20 0.48
21 0.45
22 0.41
23 0.41
24 0.43
25 0.34
26 0.31
27 0.23
28 0.18
29 0.13
30 0.15
31 0.12
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.06
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.15
45 0.15
46 0.17
47 0.16
48 0.17
49 0.22
50 0.27
51 0.27
52 0.24
53 0.28
54 0.29
55 0.29
56 0.28
57 0.24
58 0.19
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.16
72 0.19
73 0.24
74 0.3
75 0.37
76 0.38
77 0.35
78 0.37
79 0.38
80 0.38
81 0.35
82 0.29
83 0.22
84 0.23
85 0.23
86 0.21
87 0.23
88 0.21
89 0.22
90 0.24
91 0.25
92 0.31
93 0.37
94 0.39
95 0.39
96 0.45
97 0.49
98 0.52
99 0.54
100 0.48
101 0.45
102 0.42
103 0.37
104 0.36
105 0.31
106 0.25
107 0.21
108 0.17
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.12
138 0.11
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.09
165 0.09
166 0.12
167 0.12
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.11
177 0.13
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.16
182 0.12
183 0.2
184 0.22
185 0.23
186 0.26
187 0.3
188 0.3
189 0.34
190 0.33
191 0.27
192 0.27
193 0.3
194 0.32
195 0.31
196 0.31
197 0.28
198 0.3
199 0.32
200 0.32
201 0.28
202 0.21
203 0.19
204 0.21
205 0.2
206 0.23
207 0.21
208 0.19
209 0.2
210 0.22
211 0.23
212 0.2
213 0.21
214 0.18
215 0.22
216 0.21
217 0.18
218 0.16
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.09
224 0.12
225 0.12
226 0.14
227 0.19
228 0.19
229 0.17
230 0.17
231 0.2
232 0.18
233 0.18
234 0.19
235 0.15
236 0.2
237 0.23
238 0.23
239 0.21
240 0.2
241 0.21
242 0.19
243 0.19
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.21
254 0.31
255 0.36
256 0.36
257 0.4
258 0.43
259 0.52
260 0.55
261 0.53
262 0.54
263 0.51
264 0.53
265 0.47
266 0.41
267 0.3
268 0.27
269 0.21
270 0.11
271 0.08
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.13
280 0.16
281 0.23
282 0.24
283 0.21
284 0.25
285 0.29
286 0.31
287 0.34
288 0.3
289 0.24
290 0.3
291 0.33
292 0.34
293 0.32
294 0.31
295 0.27
296 0.27
297 0.27
298 0.22
299 0.22
300 0.25
301 0.28
302 0.28
303 0.3
304 0.32
305 0.35
306 0.37
307 0.38
308 0.34
309 0.31
310 0.31
311 0.32
312 0.32
313 0.31
314 0.27
315 0.24
316 0.21
317 0.2
318 0.17
319 0.14
320 0.13
321 0.1
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.19
334 0.19
335 0.22
336 0.2
337 0.21
338 0.22
339 0.23
340 0.23
341 0.22
342 0.24
343 0.25
344 0.28
345 0.36
346 0.44
347 0.52
348 0.61
349 0.66
350 0.73
351 0.77
352 0.84
353 0.81
354 0.81
355 0.77
356 0.76
357 0.72
358 0.65
359 0.58
360 0.48
361 0.41
362 0.32