FuNGI

A0A316VLB0

Protein Details

Accession

A0A316VLB0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
144-168	HKCAYPTCDKKPKKPHLSQRNSALP	Hydrophilic
440-466	DVLTRAHKRQQTEERKKKRDEEDDLFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039693 Rtr1/RPAP2 IPR007308 Rtr1/RPAP2_dom IPR038534 Rtr1/RPAP2_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0043175 F:RNA polymerase core enzyme binding GO:0008420 F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity
Pfam	View protein in Pfam PF04181 RPAP2_Rtr1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51479 ZF_RTR1

Amino Acid Sequences

MNTGQHSYERPKANGTITTMTSRGRMPQAHANLLVQLPPDELKQMAANPRAAIHASNQAGPSKWAMNEQDRNQYLPSSSVQMSDVKLLAESFQERRQKEAKVFMWQHMLIASGSQLERNMLKRALTQVSLPDWLQILQERHLAHKCAYPTCDKKPKKPHLSQRNSALPLDAPRYRISLSRRTMERDERDDAGGQNSFCSNACWRRGEWVSRWVLNNGESTRKIQKEISDEMFGSGLKDHHGLGNEVEEGGKWERVMDEEHWTEIELLEDLEDKGEVDRLSDDEDAAKQTNSPKPDKIMSPVLPTPTSPALSQSENCNDVLSGQATIVARDHAKRRADTKGTAEGFLDLIDSLQIRERATDADTTPTNSIANLPQRIQIDLPIDQDDLTDELGSGTSTNLAGLIKSASRKTQSHLQFDSEGDVSMSDDTTSEDDHADNEEDVLTRAHKRQQTEERKKKRDEEDDLFAQAWQAMSEEKARGTWEEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.46
3	0.43
4	0.39
5	0.4
6	0.37
7	0.34
8	0.32
9	0.29
10	0.28
11	0.3
12	0.3
13	0.32
14	0.4
15	0.44
16	0.47
17	0.47
18	0.42
19	0.38
20	0.36
21	0.32
22	0.24
23	0.18
24	0.15
25	0.15
26	0.15
27	0.14
28	0.13
29	0.13
30	0.14
31	0.19
32	0.25
33	0.28
34	0.3
35	0.29
36	0.29
37	0.3
38	0.29
39	0.25
40	0.2
41	0.24
42	0.24
43	0.26
44	0.27
45	0.27
46	0.27
47	0.27
48	0.27
49	0.22
50	0.21
51	0.24
52	0.28
53	0.35
54	0.42
55	0.46
56	0.53
57	0.5
58	0.52
59	0.47
60	0.43
61	0.35
62	0.29
63	0.26
64	0.21
65	0.2
66	0.19
67	0.2
68	0.2
69	0.2
70	0.2
71	0.19
72	0.14
73	0.14
74	0.13
75	0.12
76	0.12
77	0.15
78	0.16
79	0.23
80	0.3
81	0.3
82	0.36
83	0.4
84	0.43
85	0.45
86	0.51
87	0.47
88	0.5
89	0.53
90	0.49
91	0.51
92	0.45
93	0.41
94	0.31
95	0.29
96	0.18
97	0.16
98	0.13
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.13
105	0.15
106	0.19
107	0.18
108	0.19
109	0.21
110	0.26
111	0.27
112	0.25
113	0.23
114	0.23
115	0.23
116	0.24
117	0.22
118	0.18
119	0.15
120	0.15
121	0.15
122	0.16
123	0.16
124	0.15
125	0.19
126	0.19
127	0.23
128	0.26
129	0.27
130	0.24
131	0.26
132	0.27
133	0.27
134	0.29
135	0.33
136	0.36
137	0.44
138	0.53
139	0.54
140	0.61
141	0.68
142	0.76
143	0.78
144	0.82
145	0.83
146	0.84
147	0.88
148	0.85
149	0.82
150	0.79
151	0.71
152	0.61
153	0.51
154	0.41
155	0.35
156	0.34
157	0.27
158	0.21
159	0.19
160	0.21
161	0.21
162	0.24
163	0.26
164	0.31
165	0.33
166	0.37
167	0.39
168	0.42
169	0.47
170	0.5
171	0.51
172	0.47
173	0.46
174	0.41
175	0.4
176	0.36
177	0.31
178	0.25
179	0.22
180	0.16
181	0.14
182	0.12
183	0.12
184	0.1
185	0.11
186	0.14
187	0.17
188	0.21
189	0.22
190	0.22
191	0.28
192	0.31
193	0.34
194	0.32
195	0.35
196	0.35
197	0.36
198	0.36
199	0.31
200	0.29
201	0.26
202	0.27
203	0.2
204	0.2
205	0.19
206	0.21
207	0.27
208	0.26
209	0.27
210	0.25
211	0.27
212	0.28
213	0.32
214	0.31
215	0.26
216	0.25
217	0.24
218	0.22
219	0.18
220	0.13
221	0.1
222	0.07
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.08
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.06
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.1
243	0.09
244	0.14
245	0.14
246	0.14
247	0.14
248	0.14
249	0.13
250	0.11
251	0.1
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.07
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.11
273	0.1
274	0.09
275	0.15
276	0.19
277	0.22
278	0.25
279	0.25
280	0.28
281	0.31
282	0.31
283	0.3
284	0.34
285	0.31
286	0.33
287	0.33
288	0.32
289	0.29
290	0.28
291	0.26
292	0.21
293	0.21
294	0.15
295	0.17
296	0.17
297	0.18
298	0.19
299	0.21
300	0.22
301	0.22
302	0.22
303	0.19
304	0.17
305	0.15
306	0.15
307	0.11
308	0.08
309	0.06
310	0.1
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.11
316	0.14
317	0.19
318	0.23
319	0.27
320	0.29
321	0.33
322	0.4
323	0.43
324	0.43
325	0.44
326	0.46
327	0.43
328	0.41
329	0.38
330	0.3
331	0.25
332	0.21
333	0.16
334	0.07
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.08
340	0.1
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.13
345	0.14
346	0.17
347	0.14
348	0.17
349	0.18
350	0.2
351	0.2
352	0.19
353	0.17
354	0.14
355	0.16
356	0.17
357	0.22
358	0.23
359	0.23
360	0.27
361	0.28
362	0.29
363	0.28
364	0.26
365	0.23
366	0.21
367	0.23
368	0.2
369	0.2
370	0.18
371	0.17
372	0.15
373	0.12
374	0.11
375	0.09
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.08
390	0.1
391	0.14
392	0.16
393	0.2
394	0.26
395	0.27
396	0.32
397	0.4
398	0.45
399	0.5
400	0.51
401	0.5
402	0.46
403	0.45
404	0.44
405	0.35
406	0.27
407	0.19
408	0.16
409	0.13
410	0.11
411	0.11
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.11
421	0.14
422	0.14
423	0.13
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.13
428	0.13
429	0.13
430	0.16
431	0.21
432	0.29
433	0.32
434	0.36
435	0.45
436	0.55
437	0.64
438	0.71
439	0.77
440	0.81
441	0.86
442	0.9
443	0.89
444	0.88
445	0.86
446	0.84
447	0.8
448	0.77
449	0.72
450	0.66
451	0.57
452	0.47
453	0.37
454	0.28
455	0.21
456	0.13
457	0.1
458	0.09
459	0.1
460	0.15
461	0.16
462	0.16
463	0.17
464	0.19

A0A316VLB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer