Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316V4H7

Protein Details
Accession A0A316V4H7    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-80NQDERERDGRRRRDPSPPTRQARRDEEERKQKRQKEKEEEEEQQVBasic
117-144GTTKMVKKYKAIKRERQKYEKREHGDNTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-71RERDGRRRRDPSPPTRQARRDEEERKQKRQKE
128-131IKRE
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, plas 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000432  DNA_mismatch_repair_MutS_C  
IPR036187  DNA_mismatch_repair_MutS_sf  
IPR045076  MutS_family  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140664  F:ATP-dependent DNA damage sensor activity  
GO:0030983  F:mismatched DNA binding  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00488  MutS_V  
PF08648  SNRNP27  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00486  DNA_MISMATCH_REPAIR_2  
Amino Acid Sequences MSSRYGDRAPARSYRDLDRDRERDRRSVSPSRRGYNQDERERDGRRRRDPSPPTRQARRDEEERKQKRQKEKEEEEEQQVSLAAADAKAKQELEERAQNGNEDEDDMMKAMGFGGFGTTKMVKKYKAIKRERQKYEKREHGDNTCNEKVDLIDHCHQFAKDRSVETCKCRWMMSAKTFKLETVGKPSLSDWFMIRQAKDLSVDHIDLQNKYSTHQSGLVRQVIMIAAGYCPPLEQFNAIIANLDVIISFAFVSSHAPIPYVRPQIFEMGKNAPMIVKEARHPCLEVQDDLNFIPNDAETVPDESKFLVITGPNMGGKSTYIRSIGIIALVSQAGCFVSCAPGAKVPIFDAILARFGAGDNQTKGVSTFIAEMLETSTILRLATRDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWSISEFISSKIRSKCLFASHFAETVALADQIKHVQNLHCKVHVEPRHDSQALEKESEITLLYKVEPGIYDRSYNIHVAELAGFSPSVIKLAKRKADEMEDVDGEISPLLTVHAKSTEEGMEIIEEFMRAFASNKRMRSDGTEAESLSFLVAEYRERCGENAFVQKVLESL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.6
3 0.6
4 0.62
5 0.65
6 0.67
7 0.67
8 0.74
9 0.7
10 0.69
11 0.68
12 0.69
13 0.67
14 0.7
15 0.71
16 0.72
17 0.75
18 0.72
19 0.74
20 0.72
21 0.72
22 0.72
23 0.73
24 0.73
25 0.7
26 0.71
27 0.71
28 0.71
29 0.73
30 0.72
31 0.72
32 0.72
33 0.74
34 0.73
35 0.76
36 0.8
37 0.81
38 0.82
39 0.82
40 0.81
41 0.84
42 0.86
43 0.84
44 0.82
45 0.79
46 0.78
47 0.77
48 0.78
49 0.79
50 0.81
51 0.83
52 0.84
53 0.85
54 0.86
55 0.87
56 0.88
57 0.87
58 0.88
59 0.87
60 0.86
61 0.83
62 0.79
63 0.7
64 0.59
65 0.48
66 0.39
67 0.29
68 0.2
69 0.15
70 0.09
71 0.07
72 0.09
73 0.1
74 0.12
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.19
79 0.23
80 0.28
81 0.33
82 0.34
83 0.36
84 0.37
85 0.37
86 0.32
87 0.29
88 0.23
89 0.17
90 0.15
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.1
105 0.13
106 0.14
107 0.2
108 0.24
109 0.24
110 0.31
111 0.41
112 0.47
113 0.55
114 0.63
115 0.68
116 0.75
117 0.84
118 0.87
119 0.88
120 0.9
121 0.89
122 0.9
123 0.89
124 0.83
125 0.81
126 0.76
127 0.73
128 0.72
129 0.69
130 0.67
131 0.59
132 0.55
133 0.46
134 0.41
135 0.33
136 0.28
137 0.24
138 0.22
139 0.25
140 0.25
141 0.27
142 0.28
143 0.28
144 0.29
145 0.3
146 0.31
147 0.27
148 0.28
149 0.31
150 0.37
151 0.42
152 0.43
153 0.44
154 0.41
155 0.39
156 0.37
157 0.37
158 0.35
159 0.39
160 0.43
161 0.48
162 0.45
163 0.47
164 0.46
165 0.43
166 0.41
167 0.36
168 0.29
169 0.27
170 0.29
171 0.26
172 0.26
173 0.27
174 0.27
175 0.24
176 0.23
177 0.15
178 0.15
179 0.2
180 0.23
181 0.22
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.24
186 0.21
187 0.19
188 0.19
189 0.19
190 0.16
191 0.19
192 0.2
193 0.18
194 0.19
195 0.19
196 0.17
197 0.17
198 0.2
199 0.17
200 0.17
201 0.22
202 0.22
203 0.24
204 0.3
205 0.31
206 0.27
207 0.26
208 0.25
209 0.18
210 0.17
211 0.11
212 0.06
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.05
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.13
246 0.19
247 0.23
248 0.22
249 0.22
250 0.23
251 0.28
252 0.3
253 0.27
254 0.24
255 0.2
256 0.21
257 0.19
258 0.18
259 0.14
260 0.12
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.15
265 0.19
266 0.21
267 0.21
268 0.22
269 0.19
270 0.23
271 0.23
272 0.19
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.17
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.05
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.09
313 0.08
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.03
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.07
328 0.09
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.06
342 0.06
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.1
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.07
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.09
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.13
401 0.14
402 0.21
403 0.24
404 0.28
405 0.29
406 0.32
407 0.34
408 0.36
409 0.38
410 0.36
411 0.37
412 0.35
413 0.35
414 0.32
415 0.28
416 0.2
417 0.17
418 0.14
419 0.1
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.12
424 0.13
425 0.13
426 0.15
427 0.19
428 0.27
429 0.34
430 0.36
431 0.35
432 0.36
433 0.37
434 0.45
435 0.46
436 0.43
437 0.42
438 0.44
439 0.48
440 0.47
441 0.45
442 0.41
443 0.44
444 0.41
445 0.37
446 0.32
447 0.26
448 0.26
449 0.26
450 0.21
451 0.13
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.13
460 0.17
461 0.17
462 0.18
463 0.18
464 0.21
465 0.22
466 0.23
467 0.2
468 0.16
469 0.15
470 0.14
471 0.14
472 0.12
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.08
478 0.07
479 0.09
480 0.1
481 0.13
482 0.2
483 0.29
484 0.36
485 0.38
486 0.41
487 0.44
488 0.49
489 0.5
490 0.47
491 0.43
492 0.37
493 0.34
494 0.31
495 0.26
496 0.2
497 0.15
498 0.1
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.08
503 0.08
504 0.1
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.18
509 0.18
510 0.16
511 0.16
512 0.14
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.1
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.09
523 0.14
524 0.23
525 0.29
526 0.33
527 0.37
528 0.39
529 0.4
530 0.45
531 0.47
532 0.44
533 0.44
534 0.43
535 0.4
536 0.39
537 0.37
538 0.3
539 0.23
540 0.16
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.13
545 0.15
546 0.19
547 0.22
548 0.23
549 0.24
550 0.25
551 0.28
552 0.3
553 0.37
554 0.35
555 0.33
556 0.32