Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316V3J4

Protein Details
Accession A0A316V3J4    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-139IDILGKRKGKQKNPSENVQCFHydrophilic
615-637LRFSRNASRVKKKEEKARNAAEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
624-630VKKKEEK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044272  GATA18/19/20  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MGSRKPEWKRQRSASMFDNSQLANVQSTQQGNEIFDSNFPLSQTSINALFSTDTGFNTFPSTSAQYTSFVQPMQNYMQQQSNSQQQQQQAQPQIAKPYHSIISPFPLELDKRYTNQEKIDILGKRKGKQKNPSENVQCFWALLSIRPKDFSNFAFLHLDPTLEESLGRSFEQLIGTSVLDMIHPNDANMIRFNILQYASEKGNKGKMVRCTMKSARSMGKYVSSSSQDEVRMESYSFDQLTDVRMELIGDEMILCFFHAVEDRSRRGDDRLANLCETSLDSFNDQWCQSLWQHVFSKRMVEQSMVERLHNGHPIKVFQILSNVSKPSMLFSWPPPRLFDSMIDESNKSDTETYRDGSYFADVFARSAFETDFREEDIGLSQHMNACNKRHLKATTITADGLRIEFEILVIPRGDIRFAVFSIFKAEYVTEEVAQSAFRQPQQPSFATTTSDQNQQSPAQSFYPQLQLNQTLPTTIPSFQSMPAASNPYFVQMSQMFYNMPSARMIDNADLSEYGRRSSLQVDPITSQPSASMANNTFLQSNQSRDEQSQHVDLSGYRGRRQDIMPSSHPVQRPRHQSISYFESPGKKCLTCGTSKSPEWRKGPDGNKSLCNACGLRFSRNASRVKKKEEKARNAAEVAANGGVIPVHLRRKFEAERDRKKISIQKPSQSTSQQQTQSQSQQPTQMDLAGLSAFANISPELDIQIPSSMLASSSRLDSGLTESTSSIEDFMTDYEMDIKDEFGSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.75
3 0.67
4 0.58
5 0.54
6 0.43
7 0.37
8 0.32
9 0.25
10 0.19
11 0.17
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.22
17 0.23
18 0.22
19 0.23
20 0.24
21 0.19
22 0.19
23 0.23
24 0.21
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.17
29 0.18
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.17
39 0.14
40 0.13
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.18
45 0.18
46 0.14
47 0.18
48 0.21
49 0.19
50 0.21
51 0.22
52 0.21
53 0.24
54 0.27
55 0.25
56 0.22
57 0.23
58 0.21
59 0.24
60 0.27
61 0.29
62 0.28
63 0.29
64 0.34
65 0.33
66 0.35
67 0.36
68 0.4
69 0.4
70 0.43
71 0.45
72 0.43
73 0.5
74 0.53
75 0.56
76 0.52
77 0.52
78 0.51
79 0.49
80 0.54
81 0.47
82 0.44
83 0.38
84 0.36
85 0.33
86 0.3
87 0.3
88 0.23
89 0.27
90 0.26
91 0.24
92 0.21
93 0.23
94 0.23
95 0.24
96 0.29
97 0.26
98 0.27
99 0.35
100 0.4
101 0.41
102 0.43
103 0.46
104 0.39
105 0.38
106 0.43
107 0.4
108 0.39
109 0.42
110 0.44
111 0.45
112 0.52
113 0.6
114 0.62
115 0.67
116 0.73
117 0.77
118 0.77
119 0.81
120 0.82
121 0.76
122 0.69
123 0.61
124 0.5
125 0.39
126 0.33
127 0.26
128 0.17
129 0.18
130 0.25
131 0.26
132 0.27
133 0.29
134 0.29
135 0.29
136 0.32
137 0.28
138 0.28
139 0.24
140 0.26
141 0.27
142 0.26
143 0.27
144 0.24
145 0.23
146 0.16
147 0.18
148 0.16
149 0.12
150 0.12
151 0.1
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.16
186 0.19
187 0.2
188 0.2
189 0.25
190 0.26
191 0.29
192 0.32
193 0.37
194 0.43
195 0.48
196 0.49
197 0.52
198 0.54
199 0.56
200 0.54
201 0.52
202 0.49
203 0.45
204 0.45
205 0.38
206 0.38
207 0.33
208 0.31
209 0.3
210 0.27
211 0.25
212 0.25
213 0.27
214 0.23
215 0.22
216 0.22
217 0.19
218 0.17
219 0.15
220 0.15
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.06
246 0.07
247 0.13
248 0.18
249 0.21
250 0.23
251 0.25
252 0.25
253 0.26
254 0.3
255 0.29
256 0.31
257 0.36
258 0.35
259 0.35
260 0.33
261 0.31
262 0.25
263 0.22
264 0.16
265 0.11
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.16
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.13
276 0.2
277 0.2
278 0.22
279 0.27
280 0.3
281 0.32
282 0.29
283 0.33
284 0.27
285 0.3
286 0.25
287 0.22
288 0.2
289 0.21
290 0.27
291 0.24
292 0.22
293 0.2
294 0.21
295 0.22
296 0.27
297 0.24
298 0.19
299 0.2
300 0.21
301 0.21
302 0.22
303 0.2
304 0.14
305 0.17
306 0.17
307 0.18
308 0.2
309 0.19
310 0.15
311 0.16
312 0.15
313 0.13
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.15
318 0.25
319 0.27
320 0.28
321 0.28
322 0.29
323 0.29
324 0.29
325 0.26
326 0.23
327 0.23
328 0.24
329 0.23
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.18
334 0.12
335 0.1
336 0.09
337 0.12
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.15
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.08
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.08
369 0.1
370 0.13
371 0.14
372 0.16
373 0.23
374 0.25
375 0.27
376 0.29
377 0.29
378 0.3
379 0.31
380 0.34
381 0.3
382 0.28
383 0.27
384 0.22
385 0.21
386 0.18
387 0.14
388 0.09
389 0.06
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.12
415 0.13
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.12
425 0.16
426 0.17
427 0.22
428 0.27
429 0.27
430 0.28
431 0.29
432 0.28
433 0.26
434 0.26
435 0.26
436 0.23
437 0.29
438 0.25
439 0.23
440 0.25
441 0.24
442 0.25
443 0.22
444 0.22
445 0.17
446 0.18
447 0.18
448 0.17
449 0.22
450 0.2
451 0.19
452 0.2
453 0.21
454 0.2
455 0.21
456 0.2
457 0.14
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.15
468 0.15
469 0.15
470 0.19
471 0.16
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.14
477 0.16
478 0.13
479 0.15
480 0.14
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.19
485 0.15
486 0.15
487 0.13
488 0.14
489 0.14
490 0.15
491 0.16
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.13
499 0.12
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.12
504 0.15
505 0.18
506 0.21
507 0.22
508 0.23
509 0.24
510 0.26
511 0.27
512 0.24
513 0.2
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.13
518 0.15
519 0.14
520 0.16
521 0.18
522 0.18
523 0.17
524 0.15
525 0.2
526 0.18
527 0.2
528 0.2
529 0.22
530 0.23
531 0.24
532 0.28
533 0.26
534 0.27
535 0.26
536 0.23
537 0.21
538 0.2
539 0.19
540 0.2
541 0.22
542 0.21
543 0.22
544 0.25
545 0.26
546 0.29
547 0.3
548 0.33
549 0.36
550 0.4
551 0.4
552 0.43
553 0.45
554 0.47
555 0.5
556 0.48
557 0.49
558 0.5
559 0.56
560 0.58
561 0.62
562 0.59
563 0.58
564 0.57
565 0.57
566 0.52
567 0.45
568 0.4
569 0.41
570 0.41
571 0.41
572 0.4
573 0.32
574 0.3
575 0.34
576 0.36
577 0.33
578 0.37
579 0.42
580 0.44
581 0.47
582 0.56
583 0.59
584 0.62
585 0.62
586 0.62
587 0.59
588 0.61
589 0.65
590 0.65
591 0.65
592 0.61
593 0.6
594 0.57
595 0.53
596 0.44
597 0.41
598 0.33
599 0.26
600 0.3
601 0.28
602 0.3
603 0.32
604 0.37
605 0.41
606 0.47
607 0.55
608 0.55
609 0.64
610 0.66
611 0.72
612 0.77
613 0.76
614 0.79
615 0.81
616 0.83
617 0.81
618 0.81
619 0.76
620 0.67
621 0.62
622 0.53
623 0.43
624 0.34
625 0.25
626 0.17
627 0.12
628 0.11
629 0.08
630 0.06
631 0.08
632 0.11
633 0.19
634 0.22
635 0.25
636 0.27
637 0.36
638 0.41
639 0.48
640 0.55
641 0.57
642 0.65
643 0.7
644 0.73
645 0.67
646 0.69
647 0.69
648 0.67
649 0.68
650 0.66
651 0.67
652 0.69
653 0.71
654 0.7
655 0.67
656 0.65
657 0.61
658 0.61
659 0.57
660 0.54
661 0.56
662 0.57
663 0.59
664 0.59
665 0.57
666 0.51
667 0.54
668 0.5
669 0.49
670 0.43
671 0.36
672 0.29
673 0.23
674 0.21
675 0.14
676 0.13
677 0.09
678 0.08
679 0.06
680 0.06
681 0.08
682 0.06
683 0.07
684 0.08
685 0.09
686 0.1
687 0.11
688 0.12
689 0.11
690 0.13
691 0.12
692 0.11
693 0.11
694 0.1
695 0.09
696 0.1
697 0.11
698 0.11
699 0.13
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.16
705 0.18
706 0.18
707 0.17
708 0.17
709 0.18
710 0.19
711 0.18
712 0.14
713 0.1
714 0.09
715 0.09
716 0.1
717 0.11
718 0.1
719 0.1
720 0.14
721 0.15
722 0.16
723 0.15
724 0.16
725 0.14