Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VDH0

Protein Details
Accession A0A316VDH0    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
165-189EEEAERERKKKRSEKKNERFANRTABasic
195-220QNSWQKFAKKAEKKGHMKKEKSMFKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-183RERKKKRSEKKNER
201-215FAKKAEKKGHMKKEK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002999  Tudor  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50304  TUDOR  
CDD cd21182  Tudor_SMN_SPF30-like  
Amino Acid Sequences MDAEELRTYEQQLVQVRTALEADPKNEELRLLEEELQKIIDLNKDIANTQNAASSSSHSGAGPSVSKPQSNNIEPKHKFAAGDECQAKYEGDGRFYDARIVSVAGSQHNPMYTILFKGYNETAIVTSESLKPSRHAGHHKIASNDQAQSSSSQALGSRQAKLTPEEEAERERKKKRSEKKNERFANRTAEAQAVQNSWQKFAKKAEKKGHMKKEKSMFKTPDDPLAKVGVIGAGRGMTQYGDRKKHMYDGDGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.31
4 0.28
5 0.27
6 0.23
7 0.23
8 0.22
9 0.22
10 0.24
11 0.26
12 0.26
13 0.25
14 0.25
15 0.19
16 0.2
17 0.22
18 0.2
19 0.23
20 0.26
21 0.26
22 0.26
23 0.25
24 0.21
25 0.19
26 0.18
27 0.16
28 0.14
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.18
33 0.21
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.19
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.18
52 0.19
53 0.21
54 0.21
55 0.27
56 0.33
57 0.36
58 0.43
59 0.42
60 0.51
61 0.5
62 0.54
63 0.51
64 0.45
65 0.4
66 0.34
67 0.38
68 0.3
69 0.36
70 0.34
71 0.3
72 0.3
73 0.3
74 0.28
75 0.19
76 0.22
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.21
84 0.16
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.15
120 0.18
121 0.22
122 0.27
123 0.32
124 0.38
125 0.43
126 0.45
127 0.44
128 0.42
129 0.4
130 0.35
131 0.31
132 0.23
133 0.18
134 0.16
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.16
143 0.17
144 0.18
145 0.18
146 0.19
147 0.21
148 0.22
149 0.22
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.21
155 0.26
156 0.3
157 0.37
158 0.41
159 0.46
160 0.54
161 0.63
162 0.69
163 0.74
164 0.79
165 0.83
166 0.87
167 0.91
168 0.9
169 0.88
170 0.82
171 0.75
172 0.72
173 0.62
174 0.54
175 0.44
176 0.37
177 0.31
178 0.28
179 0.26
180 0.18
181 0.2
182 0.22
183 0.21
184 0.22
185 0.26
186 0.25
187 0.27
188 0.35
189 0.43
190 0.47
191 0.57
192 0.64
193 0.7
194 0.79
195 0.86
196 0.88
197 0.87
198 0.83
199 0.82
200 0.82
201 0.81
202 0.78
203 0.77
204 0.71
205 0.67
206 0.71
207 0.64
208 0.63
209 0.57
210 0.51
211 0.43
212 0.41
213 0.34
214 0.26
215 0.24
216 0.17
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.06
225 0.11
226 0.2
227 0.28
228 0.34
229 0.38
230 0.41
231 0.43
232 0.5
233 0.5