Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316V980

Protein Details
Accession A0A316V980    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-327RLGAQQKKKSKAGKKTKAKEAEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-201LKKSGKKGKGP
311-323KKKSKAGKKTKAK
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 9.333, nucl 8.5, cyto_nucl 7.333, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MTSNAKRKTFGPPASVNGGILSSELAGQQGGAPSTSKRTRFDVPSSTAEEDTAGDLDIEEQDRKRLQQGRKGRVVTDGYDSEDSSGDEGSDAEELDQVKDDDKEEEDEDMFNLDQAPGSGDEDAKSKGNKKKYLELNDIEGQEFSDDESGKDKEEGDAEFELEDDEEEGEGQDAEAGDENLHDPEAVVRPLKKSGKKGKGPESKEMGFQIEKFNMKNEMATGRFDEEGNYIENAKDPHAEHDKWLSGNYNRKNIKAAKEAQERRMQEAKMKEERREFADLDEDECKMYLVGYMLKGESVLEALQRLGAQQKKKSKAGKKTKAKEAEMVVDNSEDLERVKADLNKITALASELMSRFGLVNVYEATYESLLRDVQRSGLVRSTWDPAAEKSNGAGKDASGTIAYVYKWSPAYLKAMSEQSGQETDPETAKQTFGPFNVTDLLSWKKGGYFGDDGERIQLQPEGQNDSEWSSWQDVFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.56
3 0.46
4 0.36
5 0.3
6 0.22
7 0.17
8 0.12
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.08
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.13
21 0.22
22 0.29
23 0.32
24 0.33
25 0.38
26 0.45
27 0.5
28 0.56
29 0.56
30 0.54
31 0.55
32 0.57
33 0.54
34 0.47
35 0.4
36 0.33
37 0.26
38 0.21
39 0.16
40 0.11
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.13
48 0.18
49 0.2
50 0.22
51 0.29
52 0.36
53 0.41
54 0.48
55 0.58
56 0.63
57 0.7
58 0.71
59 0.64
60 0.62
61 0.58
62 0.5
63 0.45
64 0.37
65 0.32
66 0.31
67 0.3
68 0.24
69 0.21
70 0.19
71 0.14
72 0.12
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.16
91 0.15
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.13
111 0.14
112 0.17
113 0.24
114 0.3
115 0.39
116 0.45
117 0.48
118 0.55
119 0.62
120 0.67
121 0.67
122 0.63
123 0.6
124 0.57
125 0.53
126 0.44
127 0.35
128 0.27
129 0.19
130 0.16
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.06
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.2
178 0.27
179 0.3
180 0.38
181 0.47
182 0.55
183 0.62
184 0.68
185 0.72
186 0.74
187 0.74
188 0.72
189 0.67
190 0.58
191 0.52
192 0.46
193 0.38
194 0.29
195 0.25
196 0.22
197 0.18
198 0.19
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.17
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.14
225 0.2
226 0.2
227 0.2
228 0.22
229 0.23
230 0.21
231 0.21
232 0.2
233 0.19
234 0.27
235 0.3
236 0.36
237 0.36
238 0.36
239 0.41
240 0.42
241 0.43
242 0.41
243 0.43
244 0.44
245 0.52
246 0.56
247 0.55
248 0.58
249 0.53
250 0.52
251 0.52
252 0.43
253 0.38
254 0.39
255 0.41
256 0.44
257 0.46
258 0.45
259 0.44
260 0.46
261 0.44
262 0.43
263 0.36
264 0.28
265 0.31
266 0.26
267 0.24
268 0.23
269 0.19
270 0.15
271 0.15
272 0.13
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.12
294 0.16
295 0.21
296 0.28
297 0.37
298 0.43
299 0.5
300 0.59
301 0.62
302 0.68
303 0.75
304 0.78
305 0.8
306 0.83
307 0.86
308 0.85
309 0.78
310 0.72
311 0.64
312 0.6
313 0.52
314 0.44
315 0.35
316 0.26
317 0.23
318 0.19
319 0.16
320 0.09
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.11
326 0.13
327 0.16
328 0.19
329 0.2
330 0.2
331 0.2
332 0.19
333 0.16
334 0.15
335 0.13
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.11
360 0.12
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.22
365 0.22
366 0.23
367 0.24
368 0.27
369 0.23
370 0.23
371 0.22
372 0.2
373 0.25
374 0.24
375 0.22
376 0.19
377 0.25
378 0.23
379 0.24
380 0.22
381 0.16
382 0.18
383 0.18
384 0.17
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.15
396 0.16
397 0.21
398 0.21
399 0.23
400 0.24
401 0.26
402 0.27
403 0.28
404 0.26
405 0.24
406 0.24
407 0.22
408 0.2
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.19
413 0.19
414 0.18
415 0.19
416 0.2
417 0.22
418 0.23
419 0.23
420 0.27
421 0.23
422 0.25
423 0.27
424 0.25
425 0.21
426 0.22
427 0.26
428 0.22
429 0.23
430 0.21
431 0.19
432 0.22
433 0.22
434 0.24
435 0.22
436 0.23
437 0.3
438 0.31
439 0.3
440 0.3
441 0.3
442 0.24
443 0.22
444 0.22
445 0.16
446 0.19
447 0.22
448 0.25
449 0.25
450 0.26
451 0.26
452 0.28
453 0.27
454 0.24
455 0.25
456 0.22