Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VDP5

Protein Details
Accession A0A316VDP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-206ETIKKMASKKTTKKRKSIKNEDGEKKPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-204KMASKKTTKKRKSIKNEDGEKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014876  DEK_C  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51998  DEK_C  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10567  SWIB-MDM2_like  
Amino Acid Sequences MPAISPDNLALLKEPILSILRGSDLSLISAKKVRQALEQLNDPKNPNEKLLARLQIQLEEKEHKKQVDELIKVCFDTINNPAPAPTPATGLALPVGNGHSNGYSSASAPNSGASSAPRLALPGMGGIPGSLAAPSAPVVKTEPRSSSSMSTSKAAPSGGKRSRKAEDTISDEEEDADVETIKKMASKKTTKKRKSIKNEDGEKKPPNPNNPFNRPVILSEEMGRVCGGREMPRYMITKQLWAYIKGNDLQNPENKRQIMCDSTLQSLFGKSTVDSFEMAKLISKHVSKKEVTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.13
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.12
12 0.13
13 0.16
14 0.15
15 0.17
16 0.21
17 0.21
18 0.24
19 0.28
20 0.28
21 0.31
22 0.38
23 0.44
24 0.45
25 0.53
26 0.55
27 0.56
28 0.58
29 0.54
30 0.51
31 0.5
32 0.46
33 0.4
34 0.39
35 0.36
36 0.37
37 0.42
38 0.42
39 0.37
40 0.4
41 0.38
42 0.37
43 0.37
44 0.35
45 0.32
46 0.34
47 0.34
48 0.37
49 0.41
50 0.36
51 0.35
52 0.37
53 0.43
54 0.44
55 0.45
56 0.4
57 0.4
58 0.39
59 0.37
60 0.33
61 0.25
62 0.16
63 0.15
64 0.18
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.21
71 0.21
72 0.17
73 0.13
74 0.13
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.09
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.08
126 0.11
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.18
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.23
135 0.24
136 0.23
137 0.22
138 0.2
139 0.18
140 0.18
141 0.16
142 0.14
143 0.14
144 0.22
145 0.28
146 0.35
147 0.37
148 0.4
149 0.43
150 0.44
151 0.44
152 0.4
153 0.37
154 0.36
155 0.37
156 0.34
157 0.31
158 0.28
159 0.25
160 0.2
161 0.16
162 0.09
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.08
170 0.1
171 0.15
172 0.23
173 0.33
174 0.43
175 0.54
176 0.65
177 0.7
178 0.78
179 0.83
180 0.85
181 0.86
182 0.87
183 0.87
184 0.86
185 0.89
186 0.86
187 0.83
188 0.79
189 0.73
190 0.69
191 0.67
192 0.63
193 0.62
194 0.63
195 0.66
196 0.68
197 0.7
198 0.68
199 0.62
200 0.58
201 0.5
202 0.43
203 0.39
204 0.32
205 0.25
206 0.23
207 0.25
208 0.22
209 0.21
210 0.19
211 0.14
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.19
217 0.21
218 0.23
219 0.29
220 0.31
221 0.3
222 0.36
223 0.32
224 0.34
225 0.32
226 0.37
227 0.34
228 0.35
229 0.36
230 0.3
231 0.33
232 0.32
233 0.34
234 0.31
235 0.32
236 0.33
237 0.38
238 0.42
239 0.44
240 0.47
241 0.46
242 0.42
243 0.42
244 0.43
245 0.4
246 0.37
247 0.38
248 0.34
249 0.36
250 0.36
251 0.33
252 0.28
253 0.25
254 0.23
255 0.17
256 0.15
257 0.11
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.17
264 0.16
265 0.16
266 0.18
267 0.17
268 0.19
269 0.24
270 0.28
271 0.34
272 0.4
273 0.47