Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VHT6

Protein Details
Accession A0A316VHT6    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-238SETQKKTRVRRQSDASTQRKKPPRGSRPAKPASAHydrophilic
412-437DGTGTKKRSSKRKAAKRPKKPTISDDBasic
480-502ELARKHRNDKRERVKMRKQMRLHBasic
855-892SAAASDRERKQRRIQEEQRKQRERARRRPRPDDDGVEIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-215RR
219-234ASTQRKKPPRGSRPAK
417-432KKRSSKRKAAKRPKKP
483-497RKHRNDKRERVKMRK
862-884ERKQRRIQEEQRKQRERARRRPR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR017884  SANT_dom  
IPR039467  TFIIIB_B''_Myb  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF15963  Myb_DNA-bind_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
PS51293  SANT  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSRVQKRTAEARFRPSNAGPSRSGQATAISMPSASQPSNEGRAQQSASDAPTVTTDESIEPQQAASVTPSKQVGRPIAIPTPISTPSNIGTPRPLPKRVTPGPPSGSNPIRRPSAAPSSSTSSFAVNSSPASRPKGTLISTPIAAPGSSRGKSIERPGSLVRSTPTPSFPRSASRPPPAAESSSSKRKDVGPTPENAPSSEPASETQKKTRVRRQSDASTQRKKPPRGSRPAKPASAYTLYSREHRSEVEERAASASGRTFDVNAAIRKDWQALSHEDREPYVKQAEQLQKEHEIAMEAFHEIYGRSDSEEDDDAATASPSKKGSQPSKDRSGQPAAPKNAYLIFRSEYEQSGKGKKGSGAISTAWHALSETERASYRSKAEEAKREWEIAMAQWKENNSDDSDEESEESDGTGTKKRSSKRKAAKRPKKPTISDDEAEYHGSQNDDAAKEKLDNRSATMLDLSQLRFNHGRASAKTFELARKHRNDKRERVKMRKQMRLHNLRTEQELTALVGPGANGSNDAPNTNGAQGADHGAEDDAQAQQSEHSDAESIVNDGHTSATDGEDGAQSDAESVGAASTSTHHTLREKKFSIRTRIVDGKIVLDESSLQQSRNDDAGYGAQNEMIDINESDRFVNSSSHAKSRPRNDRWNVEETKEFLKAVSMWGSDFEMIARMFPSRNRSQIRAKWRSMERTDSHSLDLAFKRRLPVNLDEYARLAGVDLSGEAPAIELPTFNIKKANEDDEDMENIPPIKRGDEEEEPVGKVEQIQYDEDGLEIVDEGDDLDQQNRAPTLTRSKRRTPAGDMPPPSAARQTPGEEREMPRTKRMRSSSLASQAGTAVSGTTSASNVHGASSAAASDRERKQRRIQEEQRKQRERARRRPRPDDDGVEILEEGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.71
3 0.64
4 0.64
5 0.6
6 0.58
7 0.52
8 0.48
9 0.49
10 0.44
11 0.42
12 0.32
13 0.28
14 0.25
15 0.24
16 0.21
17 0.17
18 0.15
19 0.14
20 0.16
21 0.18
22 0.15
23 0.14
24 0.17
25 0.22
26 0.28
27 0.29
28 0.29
29 0.29
30 0.33
31 0.34
32 0.31
33 0.3
34 0.27
35 0.27
36 0.26
37 0.23
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.16
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.14
50 0.15
51 0.14
52 0.13
53 0.15
54 0.18
55 0.18
56 0.21
57 0.25
58 0.26
59 0.29
60 0.34
61 0.35
62 0.35
63 0.37
64 0.39
65 0.4
66 0.4
67 0.38
68 0.33
69 0.32
70 0.31
71 0.29
72 0.25
73 0.22
74 0.21
75 0.27
76 0.26
77 0.24
78 0.26
79 0.31
80 0.4
81 0.44
82 0.49
83 0.47
84 0.52
85 0.61
86 0.62
87 0.66
88 0.62
89 0.64
90 0.64
91 0.64
92 0.61
93 0.6
94 0.6
95 0.58
96 0.58
97 0.54
98 0.53
99 0.49
100 0.47
101 0.46
102 0.49
103 0.43
104 0.41
105 0.4
106 0.42
107 0.42
108 0.42
109 0.36
110 0.27
111 0.25
112 0.23
113 0.2
114 0.14
115 0.15
116 0.16
117 0.2
118 0.23
119 0.28
120 0.29
121 0.29
122 0.32
123 0.36
124 0.35
125 0.35
126 0.36
127 0.33
128 0.33
129 0.31
130 0.28
131 0.23
132 0.2
133 0.16
134 0.17
135 0.21
136 0.2
137 0.21
138 0.23
139 0.25
140 0.3
141 0.38
142 0.4
143 0.35
144 0.39
145 0.41
146 0.44
147 0.41
148 0.39
149 0.32
150 0.28
151 0.3
152 0.28
153 0.31
154 0.3
155 0.32
156 0.33
157 0.33
158 0.36
159 0.4
160 0.47
161 0.49
162 0.52
163 0.53
164 0.51
165 0.55
166 0.51
167 0.47
168 0.41
169 0.4
170 0.4
171 0.45
172 0.46
173 0.41
174 0.41
175 0.42
176 0.47
177 0.48
178 0.51
179 0.46
180 0.47
181 0.5
182 0.54
183 0.5
184 0.43
185 0.37
186 0.28
187 0.26
188 0.23
189 0.2
190 0.17
191 0.24
192 0.3
193 0.32
194 0.38
195 0.43
196 0.5
197 0.58
198 0.65
199 0.68
200 0.69
201 0.73
202 0.74
203 0.76
204 0.78
205 0.8
206 0.81
207 0.8
208 0.77
209 0.79
210 0.8
211 0.78
212 0.77
213 0.78
214 0.78
215 0.8
216 0.82
217 0.82
218 0.83
219 0.84
220 0.77
221 0.68
222 0.59
223 0.54
224 0.49
225 0.41
226 0.34
227 0.32
228 0.3
229 0.32
230 0.34
231 0.3
232 0.27
233 0.26
234 0.3
235 0.29
236 0.31
237 0.34
238 0.3
239 0.29
240 0.28
241 0.28
242 0.22
243 0.18
244 0.15
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.14
251 0.17
252 0.18
253 0.2
254 0.19
255 0.2
256 0.21
257 0.23
258 0.2
259 0.18
260 0.18
261 0.21
262 0.27
263 0.31
264 0.32
265 0.3
266 0.31
267 0.32
268 0.3
269 0.27
270 0.24
271 0.19
272 0.18
273 0.26
274 0.33
275 0.35
276 0.36
277 0.36
278 0.37
279 0.36
280 0.35
281 0.27
282 0.2
283 0.15
284 0.14
285 0.11
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.11
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.15
311 0.23
312 0.31
313 0.39
314 0.49
315 0.54
316 0.61
317 0.66
318 0.65
319 0.63
320 0.61
321 0.55
322 0.54
323 0.55
324 0.5
325 0.45
326 0.42
327 0.37
328 0.36
329 0.33
330 0.25
331 0.19
332 0.17
333 0.17
334 0.19
335 0.19
336 0.17
337 0.18
338 0.2
339 0.21
340 0.24
341 0.25
342 0.24
343 0.25
344 0.24
345 0.26
346 0.24
347 0.23
348 0.2
349 0.19
350 0.19
351 0.18
352 0.18
353 0.13
354 0.11
355 0.1
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.12
363 0.14
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.19
368 0.25
369 0.29
370 0.36
371 0.37
372 0.4
373 0.39
374 0.37
375 0.35
376 0.28
377 0.24
378 0.17
379 0.21
380 0.17
381 0.16
382 0.16
383 0.17
384 0.18
385 0.19
386 0.18
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.14
393 0.13
394 0.12
395 0.11
396 0.09
397 0.09
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.11
402 0.11
403 0.16
404 0.21
405 0.27
406 0.37
407 0.44
408 0.53
409 0.59
410 0.69
411 0.76
412 0.82
413 0.88
414 0.89
415 0.92
416 0.91
417 0.89
418 0.82
419 0.76
420 0.73
421 0.69
422 0.58
423 0.49
424 0.42
425 0.34
426 0.32
427 0.26
428 0.18
429 0.12
430 0.12
431 0.09
432 0.08
433 0.09
434 0.08
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.11
439 0.14
440 0.17
441 0.19
442 0.19
443 0.19
444 0.21
445 0.2
446 0.19
447 0.16
448 0.13
449 0.1
450 0.12
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.18
458 0.18
459 0.21
460 0.2
461 0.26
462 0.25
463 0.24
464 0.25
465 0.23
466 0.25
467 0.28
468 0.32
469 0.34
470 0.39
471 0.48
472 0.51
473 0.59
474 0.64
475 0.67
476 0.72
477 0.76
478 0.77
479 0.78
480 0.83
481 0.83
482 0.83
483 0.82
484 0.76
485 0.75
486 0.76
487 0.77
488 0.71
489 0.7
490 0.66
491 0.58
492 0.56
493 0.49
494 0.38
495 0.29
496 0.25
497 0.18
498 0.13
499 0.12
500 0.08
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.06
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.05
561 0.04
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.07
569 0.1
570 0.1
571 0.12
572 0.16
573 0.26
574 0.32
575 0.4
576 0.4
577 0.44
578 0.53
579 0.59
580 0.64
581 0.61
582 0.58
583 0.56
584 0.6
585 0.55
586 0.5
587 0.43
588 0.35
589 0.29
590 0.26
591 0.19
592 0.12
593 0.12
594 0.09
595 0.15
596 0.14
597 0.14
598 0.15
599 0.16
600 0.18
601 0.19
602 0.18
603 0.12
604 0.12
605 0.15
606 0.15
607 0.14
608 0.12
609 0.11
610 0.11
611 0.11
612 0.1
613 0.07
614 0.07
615 0.06
616 0.08
617 0.08
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.1
622 0.1
623 0.11
624 0.12
625 0.18
626 0.2
627 0.25
628 0.3
629 0.36
630 0.42
631 0.51
632 0.59
633 0.61
634 0.69
635 0.7
636 0.75
637 0.74
638 0.76
639 0.68
640 0.6
641 0.55
642 0.47
643 0.43
644 0.35
645 0.3
646 0.21
647 0.19
648 0.17
649 0.16
650 0.16
651 0.13
652 0.12
653 0.13
654 0.14
655 0.12
656 0.12
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.1
664 0.13
665 0.21
666 0.23
667 0.32
668 0.36
669 0.41
670 0.5
671 0.56
672 0.64
673 0.66
674 0.64
675 0.64
676 0.67
677 0.7
678 0.65
679 0.66
680 0.58
681 0.56
682 0.59
683 0.52
684 0.46
685 0.39
686 0.36
687 0.33
688 0.35
689 0.33
690 0.3
691 0.3
692 0.33
693 0.34
694 0.36
695 0.35
696 0.37
697 0.38
698 0.41
699 0.41
700 0.38
701 0.36
702 0.33
703 0.28
704 0.21
705 0.15
706 0.09
707 0.07
708 0.06
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.06
717 0.05
718 0.05
719 0.06
720 0.16
721 0.17
722 0.17
723 0.22
724 0.22
725 0.28
726 0.32
727 0.36
728 0.28
729 0.31
730 0.33
731 0.31
732 0.33
733 0.29
734 0.25
735 0.21
736 0.2
737 0.18
738 0.18
739 0.16
740 0.15
741 0.15
742 0.19
743 0.25
744 0.28
745 0.32
746 0.34
747 0.35
748 0.34
749 0.33
750 0.3
751 0.23
752 0.19
753 0.18
754 0.17
755 0.17
756 0.18
757 0.18
758 0.19
759 0.19
760 0.17
761 0.14
762 0.1
763 0.08
764 0.06
765 0.05
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.04
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.08
774 0.09
775 0.12
776 0.12
777 0.12
778 0.14
779 0.18
780 0.29
781 0.38
782 0.48
783 0.53
784 0.61
785 0.69
786 0.75
787 0.76
788 0.74
789 0.74
790 0.74
791 0.76
792 0.7
793 0.65
794 0.61
795 0.57
796 0.49
797 0.43
798 0.34
799 0.28
800 0.3
801 0.31
802 0.34
803 0.35
804 0.39
805 0.4
806 0.43
807 0.5
808 0.55
809 0.53
810 0.55
811 0.6
812 0.6
813 0.64
814 0.67
815 0.64
816 0.6
817 0.64
818 0.63
819 0.65
820 0.62
821 0.53
822 0.47
823 0.4
824 0.35
825 0.28
826 0.19
827 0.1
828 0.07
829 0.07
830 0.07
831 0.07
832 0.07
833 0.08
834 0.09
835 0.11
836 0.11
837 0.11
838 0.11
839 0.11
840 0.11
841 0.11
842 0.1
843 0.09
844 0.11
845 0.13
846 0.2
847 0.28
848 0.38
849 0.45
850 0.51
851 0.61
852 0.68
853 0.75
854 0.79
855 0.81
856 0.82
857 0.86
858 0.91
859 0.91
860 0.9
861 0.87
862 0.85
863 0.85
864 0.85
865 0.84
866 0.85
867 0.85
868 0.87
869 0.92
870 0.92
871 0.9
872 0.87
873 0.83
874 0.78
875 0.71
876 0.62
877 0.52