FuNGI

A0A316VJR7

Protein Details

Accession

A0A316VJR7

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-30	VYNASRTTRQVLKRHRKDGPSLIL	Hydrophilic
278-299	ELELDKSRKRRREKVLRLMEQG	Basic
353-405	SARSGSISKKKKKKSKTEEEPEPENSPTPPPQPKKKMSKKKAQKEKEERERLE	Basic
424-449	KEEEKGKKPKKMSKKKEKELAAKKAE	Basic
463-483	AEAAKKKRPAKGKKAKASEAD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
283-291	KSRKRRREK
357-479	GSISKKKKKKSKTEEEPEPENSPTPPPQPKKKMSKKKAQKEKEERERLEKEREEREKAEREAAAAKAKEEEKGKKPKKMSKKKEKELAAKKAEEEAAAAAAAAAAAAEAAKKKRPAKGKKAKA

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATTASVYNASRTTRQVLKRHRKDGPSLILHLYVNTFRFERQNGAFLCESPLKNLLYFIRDQRVPVDLIDIFDEARIPFFEGCLIVEIHDHRPPSDSNKSTLPPSHLARLATSENENGTPSSRASPSANPEGSSSRIDASIPISEFTTRSLGGNYGFFRRDGTSRQGRDENGANGAFSPNVYRIVLYPTAETLWSDLRYLDETEGQGMWSDDDVLQIESRILTLTSPPLCLTPDPQASRIANLMMSATALPASYSPLSTAPLPYHRQATKKRGINSIELELDKSRKRRREKVLRLMEQGSLLRAKDGIMGGAPSHTANFGRIGFIERWRANKNLEQSKAARVIENKDGKDDASARSGSISKKKKKKSKTEEEPEPENSPTPPPQPKKKMSKKKAQKEKEERERLEKEREEREKAEREAAAAKAKEEEKGKKPKKMSKKKEKELAAKKAEEEAAAAAAAAAAAAEAAKKKRPAKGKKAKASEADVAGDASSVKAANANTPKQTTPKQANKSTPKKSVQPSPKQTAQKKPASQQKQTPQMQPQMPQQNQMGNQGMQQQGMPQQQQQQQPTMQQMQQAQQLQQQFQQQILQSLTPQQQQQAMAMLSQQNMGNAFGMQQNNGNNAFANQFNNLMQGQNNNFQQLQQQQQQQQQQQQQQLQQQMIIQRALQQAGLQPQMNAGNNFGGMNLQHLQAFLAMQQQQQQGNNAGQQQQQQQSTQTSNQQTGTDGLQQFNNQELPVGIGLNNLPQNWGGMN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.46
3	0.53
4	0.61
5	0.69
6	0.76
7	0.81
8	0.84
9	0.82
10	0.82
11	0.82
12	0.8
13	0.74
14	0.68
15	0.61
16	0.55
17	0.49
18	0.41
19	0.34
20	0.28
21	0.23
22	0.22
23	0.21
24	0.2
25	0.25
26	0.27
27	0.31
28	0.3
29	0.36
30	0.35
31	0.39
32	0.38
33	0.33
34	0.36
35	0.36
36	0.33
37	0.29
38	0.32
39	0.28
40	0.27
41	0.3
42	0.28
43	0.25
44	0.29
45	0.31
46	0.35
47	0.35
48	0.35
49	0.34
50	0.34
51	0.31
52	0.27
53	0.26
54	0.19
55	0.19
56	0.19
57	0.17
58	0.14
59	0.13
60	0.15
61	0.1
62	0.11
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.12
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.12
72	0.1
73	0.13
74	0.15
75	0.18
76	0.21
77	0.21
78	0.2
79	0.23
80	0.25
81	0.3
82	0.37
83	0.36
84	0.36
85	0.41
86	0.43
87	0.45
88	0.47
89	0.45
90	0.41
91	0.42
92	0.45
93	0.42
94	0.41
95	0.37
96	0.37
97	0.33
98	0.3
99	0.28
100	0.24
101	0.22
102	0.22
103	0.22
104	0.18
105	0.18
106	0.17
107	0.16
108	0.18
109	0.17
110	0.19
111	0.22
112	0.26
113	0.31
114	0.38
115	0.37
116	0.34
117	0.36
118	0.36
119	0.35
120	0.32
121	0.26
122	0.19
123	0.18
124	0.17
125	0.16
126	0.16
127	0.17
128	0.16
129	0.15
130	0.15
131	0.16
132	0.16
133	0.17
134	0.17
135	0.13
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.14
140	0.18
141	0.18
142	0.19
143	0.2
144	0.19
145	0.2
146	0.22
147	0.23
148	0.24
149	0.31
150	0.36
151	0.38
152	0.44
153	0.46
154	0.44
155	0.45
156	0.45
157	0.38
158	0.32
159	0.3
160	0.24
161	0.21
162	0.2
163	0.16
164	0.12
165	0.12
166	0.09
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.16
172	0.18
173	0.17
174	0.16
175	0.15
176	0.16
177	0.15
178	0.15
179	0.11
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.11
184	0.12
185	0.14
186	0.15
187	0.14
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.14
192	0.12
193	0.11
194	0.1
195	0.09
196	0.07
197	0.08
198	0.06
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.06
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.11
212	0.12
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.15
217	0.15
218	0.16
219	0.18
220	0.25
221	0.26
222	0.27
223	0.32
224	0.31
225	0.31
226	0.29
227	0.23
228	0.16
229	0.14
230	0.13
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.1
245	0.11
246	0.12
247	0.11
248	0.17
249	0.2
250	0.21
251	0.27
252	0.29
253	0.36
254	0.43
255	0.5
256	0.53
257	0.56
258	0.58
259	0.59
260	0.59
261	0.56
262	0.51
263	0.45
264	0.39
265	0.33
266	0.3
267	0.25
268	0.26
269	0.25
270	0.3
271	0.34
272	0.4
273	0.48
274	0.56
275	0.66
276	0.73
277	0.8
278	0.83
279	0.85
280	0.82
281	0.78
282	0.7
283	0.6
284	0.5
285	0.4
286	0.3
287	0.21
288	0.16
289	0.11
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.06
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.12
310	0.12
311	0.15
312	0.21
313	0.21
314	0.25
315	0.27
316	0.29
317	0.28
318	0.31
319	0.36
320	0.37
321	0.38
322	0.37
323	0.36
324	0.38
325	0.4
326	0.37
327	0.31
328	0.25
329	0.26
330	0.31
331	0.35
332	0.31
333	0.27
334	0.27
335	0.25
336	0.25
337	0.23
338	0.16
339	0.14
340	0.14
341	0.12
342	0.14
343	0.16
344	0.17
345	0.24
346	0.32
347	0.38
348	0.47
349	0.56
350	0.64
351	0.71
352	0.8
353	0.82
354	0.83
355	0.85
356	0.86
357	0.86
358	0.82
359	0.77
360	0.68
361	0.59
362	0.49
363	0.38
364	0.3
365	0.22
366	0.19
367	0.2
368	0.26
369	0.3
370	0.38
371	0.46
372	0.54
373	0.63
374	0.72
375	0.78
376	0.78
377	0.83
378	0.84
379	0.86
380	0.89
381	0.86
382	0.87
383	0.86
384	0.89
385	0.89
386	0.87
387	0.79
388	0.76
389	0.74
390	0.67
391	0.64
392	0.57
393	0.51
394	0.51
395	0.53
396	0.49
397	0.46
398	0.48
399	0.46
400	0.43
401	0.42
402	0.33
403	0.29
404	0.27
405	0.26
406	0.25
407	0.19
408	0.18
409	0.18
410	0.18
411	0.2
412	0.22
413	0.27
414	0.31
415	0.42
416	0.47
417	0.51
418	0.58
419	0.64
420	0.7
421	0.75
422	0.78
423	0.79
424	0.84
425	0.86
426	0.87
427	0.86
428	0.85
429	0.84
430	0.82
431	0.76
432	0.67
433	0.59
434	0.53
435	0.45
436	0.34
437	0.25
438	0.15
439	0.1
440	0.08
441	0.07
442	0.04
443	0.04
444	0.03
445	0.03
446	0.02
447	0.01
448	0.02
449	0.02
450	0.02
451	0.05
452	0.07
453	0.1
454	0.17
455	0.21
456	0.27
457	0.38
458	0.47
459	0.57
460	0.67
461	0.74
462	0.77
463	0.81
464	0.8
465	0.74
466	0.69
467	0.61
468	0.51
469	0.42
470	0.32
471	0.25
472	0.19
473	0.15
474	0.1
475	0.06
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.06
480	0.07
481	0.13
482	0.18
483	0.21
484	0.23
485	0.26
486	0.27
487	0.3
488	0.34
489	0.36
490	0.41
491	0.48
492	0.53
493	0.58
494	0.66
495	0.72
496	0.78
497	0.77
498	0.76
499	0.71
500	0.71
501	0.69
502	0.69
503	0.69
504	0.7
505	0.71
506	0.7
507	0.73
508	0.74
509	0.76
510	0.76
511	0.75
512	0.73
513	0.7
514	0.71
515	0.73
516	0.73
517	0.72
518	0.71
519	0.71
520	0.72
521	0.72
522	0.7
523	0.66
524	0.66
525	0.63
526	0.58
527	0.57
528	0.58
529	0.53
530	0.5
531	0.46
532	0.43
533	0.41
534	0.41
535	0.36
536	0.26
537	0.27
538	0.29
539	0.27
540	0.23
541	0.21
542	0.18
543	0.21
544	0.25
545	0.25
546	0.22
547	0.29
548	0.35
549	0.42
550	0.43
551	0.42
552	0.4
553	0.41
554	0.45
555	0.42
556	0.37
557	0.35
558	0.35
559	0.34
560	0.38
561	0.38
562	0.33
563	0.32
564	0.34
565	0.31
566	0.32
567	0.34
568	0.28
569	0.27
570	0.29
571	0.25
572	0.26
573	0.26
574	0.22
575	0.17
576	0.23
577	0.26
578	0.26
579	0.26
580	0.24
581	0.26
582	0.26
583	0.26
584	0.24
585	0.2
586	0.17
587	0.18
588	0.18
589	0.15
590	0.17
591	0.16
592	0.13
593	0.14
594	0.14
595	0.12
596	0.1
597	0.1
598	0.13
599	0.14
600	0.13
601	0.16
602	0.17
603	0.2
604	0.21
605	0.2
606	0.16
607	0.17
608	0.18
609	0.16
610	0.16
611	0.14
612	0.15
613	0.15
614	0.17
615	0.16
616	0.16
617	0.15
618	0.19
619	0.22
620	0.27
621	0.28
622	0.28
623	0.28
624	0.27
625	0.32
626	0.33
627	0.37
628	0.37
629	0.43
630	0.47
631	0.55
632	0.63
633	0.63
634	0.65
635	0.66
636	0.67
637	0.67
638	0.66
639	0.65
640	0.63
641	0.62
642	0.54
643	0.47
644	0.43
645	0.39
646	0.36
647	0.31
648	0.25
649	0.25
650	0.27
651	0.26
652	0.23
653	0.2
654	0.21
655	0.25
656	0.29
657	0.24
658	0.21
659	0.23
660	0.28
661	0.3
662	0.26
663	0.23
664	0.2
665	0.2
666	0.2
667	0.17
668	0.13
669	0.09
670	0.13
671	0.13
672	0.13
673	0.12
674	0.13
675	0.13
676	0.12
677	0.13
678	0.09
679	0.14
680	0.16
681	0.17
682	0.23
683	0.27
684	0.31
685	0.33
686	0.36
687	0.33
688	0.34
689	0.37
690	0.35
691	0.35
692	0.35
693	0.38
694	0.43
695	0.46
696	0.46
697	0.43
698	0.43
699	0.44
700	0.46
701	0.45
702	0.45
703	0.44
704	0.44
705	0.45
706	0.41
707	0.38
708	0.35
709	0.33
710	0.32
711	0.29
712	0.27
713	0.28
714	0.29
715	0.28
716	0.3
717	0.28
718	0.2
719	0.19
720	0.17
721	0.17
722	0.16
723	0.16
724	0.12
725	0.12
726	0.13
727	0.17
728	0.19
729	0.17
730	0.18
731	0.17

A0A316VJR7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer