Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VH55

Protein Details
Accession A0A316VH55    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSRGKKKIKIRRSRSGTTAHBasic
423-442VTNYKSWCRRARSRFSQGKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-14RGKKKIKIRRSR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Amino Acid Sequences MSRGKKKIKIRRSRSGTTAHIKGDQNGNDDAVMDACGRRIDGKTITSKVFSHHSHQDEEYICDHKKFDEKSVKRVSQLLSDLFATHFILALPLLFYEELQRIEIEVIRATVMDFIEEGLDPRQINSIAEDVDTESRIKTQTEKYLDKLCLIVTRISTEDTFDLVCDLSARHGRDLNKWGPPCACSFANCLGCLQTLTESVLQTQPIIPDMNKFRSDKYSAFSIKNILKRERAADIGTSSESSYNRFAETWQALDDLFWKVSGKIKPMQIPSIRAAIDKIKATNGVAIWYAVASRELKTWTSYGNKGKGKRDQIETTEEDILTAKNLMSIFKCSEITNSKEEDDSARASFAINGRKHLGTVCKEQGNAAFGRTCYIEAAEHYTRGIGYDAENAVIPLNRAQCSIKLERFEEAELDCSTSILIDVTNYKSWCRRARSRFSQGKLEEGKSDLEHALFLALNDEKTYKDRLQLCQGFLMEAVKEYDPSSITSKKWQLPSYPEIQDMHKHDQTSSSSNSKNSDSSNRTSSTTIPEVSIEDVYMQVLFTVAFSLIVRQKTGVRIRVPISLWKKPERISEKVRSIMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.76
4 0.73
5 0.7
6 0.62
7 0.6
8 0.55
9 0.53
10 0.54
11 0.49
12 0.44
13 0.39
14 0.37
15 0.29
16 0.28
17 0.24
18 0.16
19 0.13
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.13
26 0.15
27 0.19
28 0.22
29 0.28
30 0.34
31 0.38
32 0.4
33 0.39
34 0.38
35 0.36
36 0.39
37 0.37
38 0.36
39 0.41
40 0.42
41 0.44
42 0.44
43 0.46
44 0.41
45 0.41
46 0.37
47 0.33
48 0.31
49 0.28
50 0.28
51 0.25
52 0.31
53 0.31
54 0.38
55 0.44
56 0.46
57 0.55
58 0.65
59 0.65
60 0.59
61 0.62
62 0.54
63 0.5
64 0.5
65 0.42
66 0.33
67 0.3
68 0.29
69 0.23
70 0.22
71 0.16
72 0.12
73 0.1
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.09
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.14
90 0.15
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.12
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.17
126 0.21
127 0.28
128 0.35
129 0.38
130 0.41
131 0.47
132 0.47
133 0.43
134 0.38
135 0.3
136 0.26
137 0.25
138 0.23
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.09
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.21
159 0.23
160 0.29
161 0.36
162 0.37
163 0.4
164 0.4
165 0.4
166 0.37
167 0.37
168 0.33
169 0.3
170 0.26
171 0.2
172 0.23
173 0.27
174 0.28
175 0.27
176 0.25
177 0.21
178 0.2
179 0.19
180 0.16
181 0.1
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.1
195 0.14
196 0.19
197 0.23
198 0.26
199 0.27
200 0.27
201 0.31
202 0.35
203 0.31
204 0.29
205 0.32
206 0.32
207 0.32
208 0.31
209 0.32
210 0.33
211 0.37
212 0.39
213 0.35
214 0.34
215 0.34
216 0.36
217 0.33
218 0.29
219 0.25
220 0.21
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.13
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.14
248 0.16
249 0.18
250 0.21
251 0.24
252 0.29
253 0.31
254 0.36
255 0.32
256 0.34
257 0.32
258 0.31
259 0.28
260 0.23
261 0.23
262 0.19
263 0.19
264 0.17
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.04
278 0.06
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.16
288 0.21
289 0.25
290 0.32
291 0.36
292 0.4
293 0.45
294 0.49
295 0.53
296 0.52
297 0.53
298 0.48
299 0.47
300 0.47
301 0.44
302 0.4
303 0.34
304 0.29
305 0.23
306 0.2
307 0.17
308 0.11
309 0.09
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.11
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.12
320 0.16
321 0.19
322 0.22
323 0.22
324 0.23
325 0.22
326 0.21
327 0.21
328 0.19
329 0.17
330 0.16
331 0.13
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.13
336 0.15
337 0.21
338 0.19
339 0.22
340 0.24
341 0.24
342 0.24
343 0.24
344 0.27
345 0.23
346 0.28
347 0.31
348 0.3
349 0.3
350 0.3
351 0.29
352 0.26
353 0.22
354 0.17
355 0.14
356 0.12
357 0.14
358 0.13
359 0.12
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.07
373 0.07
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.12
384 0.12
385 0.14
386 0.15
387 0.17
388 0.23
389 0.29
390 0.29
391 0.3
392 0.31
393 0.31
394 0.32
395 0.29
396 0.25
397 0.19
398 0.18
399 0.15
400 0.15
401 0.13
402 0.11
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.07
410 0.1
411 0.14
412 0.15
413 0.17
414 0.22
415 0.29
416 0.36
417 0.42
418 0.49
419 0.55
420 0.66
421 0.74
422 0.8
423 0.81
424 0.78
425 0.79
426 0.7
427 0.69
428 0.63
429 0.55
430 0.46
431 0.39
432 0.36
433 0.27
434 0.29
435 0.2
436 0.15
437 0.13
438 0.12
439 0.11
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.13
449 0.19
450 0.18
451 0.25
452 0.3
453 0.34
454 0.44
455 0.48
456 0.47
457 0.45
458 0.44
459 0.37
460 0.32
461 0.28
462 0.18
463 0.14
464 0.15
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.15
471 0.19
472 0.21
473 0.22
474 0.3
475 0.37
476 0.42
477 0.48
478 0.49
479 0.5
480 0.53
481 0.57
482 0.56
483 0.51
484 0.48
485 0.43
486 0.42
487 0.44
488 0.43
489 0.46
490 0.41
491 0.39
492 0.36
493 0.4
494 0.41
495 0.39
496 0.38
497 0.37
498 0.38
499 0.4
500 0.42
501 0.4
502 0.38
503 0.38
504 0.42
505 0.41
506 0.43
507 0.46
508 0.45
509 0.45
510 0.43
511 0.41
512 0.38
513 0.37
514 0.32
515 0.27
516 0.26
517 0.25
518 0.25
519 0.23
520 0.16
521 0.12
522 0.11
523 0.11
524 0.1
525 0.08
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.06
531 0.05
532 0.06
533 0.06
534 0.12
535 0.17
536 0.19
537 0.2
538 0.21
539 0.24
540 0.32
541 0.4
542 0.42
543 0.41
544 0.45
545 0.47
546 0.52
547 0.51
548 0.52
549 0.52
550 0.53
551 0.56
552 0.58
553 0.61
554 0.59
555 0.67
556 0.64
557 0.65
558 0.67
559 0.7
560 0.7