Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VFP0

Protein Details
Accession A0A316VFP0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-317EEKQKAGKASKKKKQSQNSQAAQPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-307EKQKAGKASKKKK
533-552RRKSGTRTPRGARGRGGSKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MPHPSPVTATKDLSSLKWSDCLNEDFTEESVKEIDPREHFFDLSLKRLLSWQAELLQKEVKEVKEKSLTIKIPPNQSEEMSWSSAATGKPQLSYAERLRRAKEGSKATANEGVEDGVTQDKEERDVRGKDLSTKSTSNPSLLSGDTSKVTSSDISPSLSSYGDTVATSSPAISSSGSPSLAPPSYASSAPSTAVSAPVPTTQVNIWEARRLQLQEQTKKLNEAKPTADVETDQGNKVNEYGSADAPKLNGEAIGANAKPNESQASPETSNRATEDPASLNENGKLNSAADGKAEEKQKAGKASKKKKQSQNSQAAQPPLISDASNWPSPNMAKEKAIRNASPLTPSQDIKSRQNSSDESRPSTDAPKPSPSPLANGSVLDQLDVEVLHPSRKEERQRKGGKQWIAIVPTLTHSVPPNTRPTQQQKRSGKNQGVVGSSNAKRVNGVPHAKQPFDARSSSDPQSSAPRSRLQRNDEATQDTLNKDDIGNANEASAIAETSSNLQYIGQFPQFPQAQIVESGVDSTKTGQPVTGQRRKSGTRTPRGARGRGGSKRSSDSEANNANTSADTSQQGDVDSNSVSNAQPSGSSDRSAKPSQRRDTLPNTRKPPSGPRFQNQGGGGSRRSTIQMMNGLDQQYYDPYMQAMHFGGPPPPMFAGGPPPFGHPGPSFAPQFGAMQVPILESTPVEFAPKGNSTSEEPTSALLWQIEFYFSHQNLQGDFYLRKVMDSQGYVTIEKLAAFNRVKRLSGENIDLIRDTIRFSKVLQLNEDASKVRKAFGWEPYVLVEGQHAQQWQIQPPSIPQSPYMGSPPAHPNANAYPLPPIQFSPYGPPEMIGSPPLNGAAPPLPMRNMPYPGFPPSMHYGNAEHIPPHAMGFAPHAENGARSPSSAGMDSLAQSAEQLSISGGSAPNFYRNNNDQAEEDEEDSPLGVVAATGLGGTLMPTNKKEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.27
4 0.29
5 0.29
6 0.27
7 0.3
8 0.32
9 0.31
10 0.29
11 0.28
12 0.25
13 0.25
14 0.26
15 0.21
16 0.19
17 0.17
18 0.16
19 0.19
20 0.2
21 0.26
22 0.26
23 0.32
24 0.37
25 0.37
26 0.36
27 0.34
28 0.39
29 0.36
30 0.36
31 0.35
32 0.29
33 0.27
34 0.3
35 0.33
36 0.28
37 0.27
38 0.26
39 0.28
40 0.33
41 0.33
42 0.33
43 0.34
44 0.3
45 0.33
46 0.35
47 0.32
48 0.36
49 0.37
50 0.42
51 0.46
52 0.47
53 0.48
54 0.52
55 0.52
56 0.49
57 0.57
58 0.55
59 0.56
60 0.58
61 0.57
62 0.51
63 0.49
64 0.45
65 0.4
66 0.38
67 0.31
68 0.28
69 0.22
70 0.2
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.23
78 0.26
79 0.25
80 0.32
81 0.37
82 0.42
83 0.49
84 0.53
85 0.55
86 0.58
87 0.6
88 0.59
89 0.59
90 0.57
91 0.56
92 0.59
93 0.57
94 0.55
95 0.55
96 0.49
97 0.41
98 0.33
99 0.27
100 0.19
101 0.17
102 0.14
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.13
107 0.13
108 0.18
109 0.2
110 0.23
111 0.28
112 0.3
113 0.33
114 0.36
115 0.37
116 0.41
117 0.45
118 0.45
119 0.43
120 0.43
121 0.43
122 0.45
123 0.45
124 0.39
125 0.34
126 0.31
127 0.28
128 0.26
129 0.26
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.16
135 0.14
136 0.15
137 0.13
138 0.13
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.12
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.18
167 0.18
168 0.18
169 0.15
170 0.17
171 0.19
172 0.19
173 0.2
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.15
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.15
190 0.16
191 0.19
192 0.19
193 0.22
194 0.23
195 0.24
196 0.28
197 0.27
198 0.27
199 0.31
200 0.4
201 0.42
202 0.47
203 0.51
204 0.48
205 0.52
206 0.55
207 0.52
208 0.49
209 0.45
210 0.43
211 0.41
212 0.42
213 0.36
214 0.32
215 0.27
216 0.23
217 0.24
218 0.23
219 0.2
220 0.19
221 0.19
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.12
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.11
249 0.14
250 0.15
251 0.21
252 0.23
253 0.24
254 0.27
255 0.25
256 0.26
257 0.24
258 0.24
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.16
263 0.17
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.2
268 0.2
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.18
280 0.2
281 0.18
282 0.18
283 0.22
284 0.25
285 0.31
286 0.36
287 0.38
288 0.46
289 0.57
290 0.63
291 0.7
292 0.76
293 0.78
294 0.82
295 0.86
296 0.86
297 0.85
298 0.82
299 0.79
300 0.73
301 0.65
302 0.56
303 0.45
304 0.34
305 0.25
306 0.21
307 0.14
308 0.1
309 0.14
310 0.17
311 0.19
312 0.19
313 0.17
314 0.19
315 0.19
316 0.23
317 0.22
318 0.21
319 0.22
320 0.27
321 0.33
322 0.38
323 0.42
324 0.38
325 0.36
326 0.38
327 0.35
328 0.33
329 0.28
330 0.26
331 0.25
332 0.25
333 0.23
334 0.27
335 0.3
336 0.33
337 0.4
338 0.39
339 0.38
340 0.42
341 0.43
342 0.41
343 0.46
344 0.42
345 0.38
346 0.36
347 0.36
348 0.33
349 0.34
350 0.33
351 0.3
352 0.3
353 0.33
354 0.32
355 0.33
356 0.37
357 0.32
358 0.31
359 0.29
360 0.3
361 0.24
362 0.23
363 0.22
364 0.19
365 0.18
366 0.15
367 0.12
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.08
375 0.08
376 0.1
377 0.15
378 0.21
379 0.31
380 0.39
381 0.46
382 0.56
383 0.64
384 0.69
385 0.73
386 0.74
387 0.68
388 0.62
389 0.59
390 0.52
391 0.45
392 0.39
393 0.3
394 0.23
395 0.19
396 0.19
397 0.13
398 0.11
399 0.1
400 0.13
401 0.14
402 0.17
403 0.23
404 0.23
405 0.26
406 0.33
407 0.42
408 0.49
409 0.55
410 0.63
411 0.65
412 0.7
413 0.76
414 0.77
415 0.71
416 0.64
417 0.6
418 0.53
419 0.46
420 0.39
421 0.32
422 0.3
423 0.26
424 0.27
425 0.23
426 0.2
427 0.19
428 0.2
429 0.23
430 0.24
431 0.27
432 0.25
433 0.32
434 0.35
435 0.34
436 0.34
437 0.32
438 0.28
439 0.26
440 0.25
441 0.2
442 0.21
443 0.26
444 0.26
445 0.24
446 0.22
447 0.2
448 0.26
449 0.27
450 0.26
451 0.24
452 0.28
453 0.31
454 0.38
455 0.43
456 0.42
457 0.46
458 0.47
459 0.48
460 0.44
461 0.42
462 0.35
463 0.3
464 0.26
465 0.19
466 0.16
467 0.13
468 0.11
469 0.09
470 0.1
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.08
479 0.06
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.09
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.16
496 0.17
497 0.16
498 0.16
499 0.14
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.08
504 0.07
505 0.08
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.12
515 0.2
516 0.3
517 0.35
518 0.34
519 0.36
520 0.41
521 0.44
522 0.46
523 0.47
524 0.47
525 0.49
526 0.56
527 0.56
528 0.61
529 0.64
530 0.61
531 0.55
532 0.51
533 0.5
534 0.49
535 0.5
536 0.44
537 0.41
538 0.42
539 0.42
540 0.4
541 0.34
542 0.3
543 0.32
544 0.34
545 0.33
546 0.3
547 0.27
548 0.23
549 0.2
550 0.19
551 0.13
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.11
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.07
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.08
571 0.14
572 0.14
573 0.15
574 0.17
575 0.2
576 0.25
577 0.29
578 0.34
579 0.38
580 0.46
581 0.51
582 0.55
583 0.57
584 0.57
585 0.63
586 0.68
587 0.67
588 0.66
589 0.66
590 0.63
591 0.61
592 0.58
593 0.59
594 0.54
595 0.56
596 0.53
597 0.52
598 0.57
599 0.56
600 0.58
601 0.48
602 0.47
603 0.39
604 0.36
605 0.32
606 0.25
607 0.24
608 0.2
609 0.2
610 0.16
611 0.14
612 0.14
613 0.19
614 0.19
615 0.2
616 0.22
617 0.21
618 0.2
619 0.19
620 0.16
621 0.12
622 0.12
623 0.11
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.1
632 0.1
633 0.12
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.12
638 0.12
639 0.11
640 0.11
641 0.18
642 0.18
643 0.21
644 0.2
645 0.22
646 0.23
647 0.23
648 0.26
649 0.18
650 0.2
651 0.21
652 0.24
653 0.23
654 0.21
655 0.22
656 0.19
657 0.19
658 0.16
659 0.14
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.08
665 0.08
666 0.07
667 0.05
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.13
675 0.15
676 0.16
677 0.16
678 0.18
679 0.2
680 0.24
681 0.25
682 0.22
683 0.2
684 0.2
685 0.19
686 0.17
687 0.15
688 0.11
689 0.09
690 0.08
691 0.08
692 0.09
693 0.08
694 0.11
695 0.17
696 0.17
697 0.2
698 0.22
699 0.23
700 0.22
701 0.25
702 0.23
703 0.19
704 0.19
705 0.18
706 0.2
707 0.19
708 0.19
709 0.18
710 0.19
711 0.19
712 0.2
713 0.21
714 0.2
715 0.22
716 0.22
717 0.21
718 0.19
719 0.16
720 0.15
721 0.15
722 0.11
723 0.17
724 0.19
725 0.23
726 0.3
727 0.32
728 0.33
729 0.34
730 0.38
731 0.36
732 0.38
733 0.38
734 0.34
735 0.33
736 0.33
737 0.3
738 0.26
739 0.21
740 0.17
741 0.15
742 0.14
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.25
747 0.28
748 0.31
749 0.32
750 0.31
751 0.33
752 0.34
753 0.35
754 0.27
755 0.24
756 0.26
757 0.24
758 0.22
759 0.21
760 0.26
761 0.29
762 0.35
763 0.38
764 0.34
765 0.34
766 0.35
767 0.34
768 0.27
769 0.22
770 0.16
771 0.12
772 0.13
773 0.14
774 0.13
775 0.13
776 0.16
777 0.2
778 0.25
779 0.26
780 0.26
781 0.24
782 0.28
783 0.34
784 0.34
785 0.31
786 0.27
787 0.27
788 0.28
789 0.29
790 0.29
791 0.25
792 0.22
793 0.26
794 0.31
795 0.31
796 0.32
797 0.29
798 0.31
799 0.31
800 0.36
801 0.32
802 0.26
803 0.28
804 0.27
805 0.29
806 0.26
807 0.24
808 0.22
809 0.24
810 0.25
811 0.28
812 0.29
813 0.3
814 0.29
815 0.28
816 0.25
817 0.24
818 0.24
819 0.19
820 0.17
821 0.15
822 0.15
823 0.15
824 0.13
825 0.12
826 0.14
827 0.12
828 0.14
829 0.16
830 0.18
831 0.19
832 0.2
833 0.26
834 0.28
835 0.31
836 0.29
837 0.32
838 0.34
839 0.37
840 0.39
841 0.34
842 0.34
843 0.34
844 0.36
845 0.32
846 0.31
847 0.28
848 0.28
849 0.31
850 0.27
851 0.22
852 0.2
853 0.21
854 0.19
855 0.18
856 0.15
857 0.12
858 0.11
859 0.15
860 0.18
861 0.17
862 0.16
863 0.17
864 0.17
865 0.17
866 0.18
867 0.2
868 0.16
869 0.15
870 0.17
871 0.18
872 0.2
873 0.2
874 0.19
875 0.15
876 0.16
877 0.16
878 0.16
879 0.14
880 0.11
881 0.1
882 0.1
883 0.1
884 0.08
885 0.07
886 0.07
887 0.07
888 0.08
889 0.1
890 0.11
891 0.1
892 0.13
893 0.14
894 0.21
895 0.23
896 0.24
897 0.3
898 0.33
899 0.4
900 0.41
901 0.42
902 0.36
903 0.38
904 0.42
905 0.36
906 0.34
907 0.27
908 0.24
909 0.22
910 0.21
911 0.17
912 0.11
913 0.08
914 0.05
915 0.04
916 0.04
917 0.04
918 0.04
919 0.04
920 0.03
921 0.03
922 0.03
923 0.04
924 0.08
925 0.11
926 0.15