Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VDQ0

Protein Details
Accession A0A316VDQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
463-485QQGEEKQKKARQRKTQPNRRETAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
471-474KARQ
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTSLPRDRNSLADSGDKTLDPFDPTDQLLDDDDDAAFEEKLRGLRAAGQEDVEIYTWGGGGEGDLGDDDKDDGLGDLLDETGDAFNDDTFGMGNVGKDFDFGGTGGKQTSLPAFFEPDVPKGPSGFGQVKKNDAAFASTMDDFWRMPGPPSRSAVPASSGPSLDEIEAQMRNQRNVPAPSQPLASAPPTEPQAQRKPLTMEEVEAEMRARRSQAPPAAEASKPQAVPGRDDSAFPALGSAPPRPQQAPPQVQPVQVQLPIPPMPNPNDPNLQQLLFQRMRIMLETLPNPIQGRIMSLPPYMHFGITDSVVRDFPALTVAASPEKLPQQIDNPRLWPRIDGSPEEQNTIRFMVDTALAKIDEAFRQENKRQVRISKIQSMAPRNNLMSRSDKDFITRIQVSQLISSDPYTDDFYAHIYFALHGNRSRVTLPASNEEEKQKEQKKVEESTNGQDNSNAQQGEEKQKKARQRKTQPNRRETAMLRMQQQVERIVQNRKERIEKAGASASLEGALGRVSLGTTKAPRQMLQINQDGTEAGSASPPTTNGAAKNDGSDVTGTGHAQNAAQQALQGASLAQGGVQKRPALNKLEVLTILEKLYDIVLNLEQSRRTAPADVSEQNNDPAAVEWRQQRDVLASQLWQELRVLEPLEVSDPHPFVSLLSTVKGKRILPRALRHLSSEQTLTAMTMIVASFDRLDVVRESVVLDEPVNTKASPAAAERRANVQRQTEAFVTSIVPGMLSLMATVPMRIVSGMLALFLERNNPVRVAQSKPGVAFLTIFLSRAASLRQSAPSLSSPIMSAGGLNKGDGSGAPSPADLAQWNEIFNLLIQRLAQPPEQLVTLFPSTRAKARLPFGAPALDGARKAQLEVEDRDIWQLMAAIAVSANMTQQQILVTGLREKILENVLEAKQWSAANPIAASHGEADLRIRNVNLLLHALNLDAAQITV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.32
4 0.28
5 0.33
6 0.34
7 0.34
8 0.35
9 0.3
10 0.27
11 0.26
12 0.26
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.21
17 0.22
18 0.22
19 0.21
20 0.2
21 0.19
22 0.19
23 0.16
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.1
30 0.09
31 0.1
32 0.12
33 0.14
34 0.16
35 0.15
36 0.15
37 0.22
38 0.27
39 0.29
40 0.28
41 0.27
42 0.25
43 0.25
44 0.26
45 0.2
46 0.14
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.11
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.17
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.2
107 0.2
108 0.26
109 0.27
110 0.26
111 0.28
112 0.28
113 0.28
114 0.24
115 0.25
116 0.21
117 0.25
118 0.29
119 0.31
120 0.37
121 0.39
122 0.42
123 0.44
124 0.43
125 0.38
126 0.31
127 0.28
128 0.21
129 0.2
130 0.19
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.16
135 0.13
136 0.14
137 0.16
138 0.13
139 0.16
140 0.24
141 0.28
142 0.32
143 0.35
144 0.36
145 0.35
146 0.36
147 0.34
148 0.3
149 0.28
150 0.27
151 0.25
152 0.23
153 0.21
154 0.21
155 0.2
156 0.17
157 0.14
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.19
163 0.21
164 0.23
165 0.25
166 0.28
167 0.32
168 0.35
169 0.38
170 0.38
171 0.39
172 0.39
173 0.38
174 0.34
175 0.28
176 0.27
177 0.25
178 0.2
179 0.17
180 0.19
181 0.2
182 0.25
183 0.27
184 0.32
185 0.39
186 0.44
187 0.45
188 0.46
189 0.47
190 0.45
191 0.47
192 0.4
193 0.32
194 0.27
195 0.27
196 0.23
197 0.19
198 0.18
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.2
205 0.28
206 0.33
207 0.34
208 0.34
209 0.37
210 0.38
211 0.34
212 0.33
213 0.3
214 0.29
215 0.25
216 0.25
217 0.26
218 0.24
219 0.28
220 0.31
221 0.31
222 0.27
223 0.28
224 0.28
225 0.26
226 0.25
227 0.2
228 0.16
229 0.12
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.16
234 0.19
235 0.23
236 0.24
237 0.26
238 0.33
239 0.41
240 0.47
241 0.46
242 0.52
243 0.51
244 0.51
245 0.5
246 0.44
247 0.37
248 0.3
249 0.28
250 0.2
251 0.21
252 0.21
253 0.21
254 0.19
255 0.2
256 0.23
257 0.3
258 0.31
259 0.3
260 0.34
261 0.34
262 0.36
263 0.35
264 0.31
265 0.27
266 0.27
267 0.31
268 0.27
269 0.27
270 0.24
271 0.22
272 0.23
273 0.21
274 0.21
275 0.13
276 0.16
277 0.17
278 0.19
279 0.18
280 0.19
281 0.19
282 0.17
283 0.17
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.15
292 0.2
293 0.17
294 0.15
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.21
321 0.28
322 0.32
323 0.31
324 0.34
325 0.37
326 0.39
327 0.38
328 0.31
329 0.27
330 0.29
331 0.29
332 0.28
333 0.27
334 0.32
335 0.32
336 0.33
337 0.31
338 0.25
339 0.24
340 0.21
341 0.17
342 0.1
343 0.1
344 0.08
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.11
355 0.13
356 0.15
357 0.21
358 0.24
359 0.31
360 0.34
361 0.38
362 0.39
363 0.41
364 0.45
365 0.48
366 0.5
367 0.51
368 0.49
369 0.47
370 0.5
371 0.53
372 0.49
373 0.44
374 0.41
375 0.34
376 0.35
377 0.32
378 0.29
379 0.27
380 0.26
381 0.28
382 0.27
383 0.26
384 0.26
385 0.26
386 0.24
387 0.25
388 0.23
389 0.18
390 0.18
391 0.2
392 0.18
393 0.18
394 0.17
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.07
410 0.07
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.13
416 0.13
417 0.15
418 0.15
419 0.13
420 0.15
421 0.17
422 0.18
423 0.22
424 0.26
425 0.26
426 0.27
427 0.29
428 0.28
429 0.26
430 0.33
431 0.33
432 0.35
433 0.36
434 0.39
435 0.42
436 0.44
437 0.46
438 0.43
439 0.4
440 0.38
441 0.42
442 0.37
443 0.32
444 0.28
445 0.25
446 0.21
447 0.22
448 0.18
449 0.11
450 0.13
451 0.16
452 0.25
453 0.28
454 0.28
455 0.3
456 0.34
457 0.43
458 0.51
459 0.58
460 0.59
461 0.66
462 0.75
463 0.81
464 0.88
465 0.89
466 0.86
467 0.8
468 0.71
469 0.66
470 0.55
471 0.53
472 0.49
473 0.42
474 0.37
475 0.37
476 0.36
477 0.32
478 0.33
479 0.26
480 0.21
481 0.21
482 0.21
483 0.24
484 0.29
485 0.33
486 0.36
487 0.37
488 0.4
489 0.38
490 0.39
491 0.39
492 0.34
493 0.31
494 0.29
495 0.26
496 0.22
497 0.21
498 0.17
499 0.11
500 0.1
501 0.07
502 0.04
503 0.04
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.04
510 0.06
511 0.08
512 0.11
513 0.15
514 0.16
515 0.17
516 0.2
517 0.24
518 0.27
519 0.3
520 0.33
521 0.29
522 0.28
523 0.27
524 0.24
525 0.19
526 0.14
527 0.1
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.08
536 0.09
537 0.1
538 0.12
539 0.15
540 0.15
541 0.15
542 0.15
543 0.14
544 0.13
545 0.12
546 0.09
547 0.08
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.1
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.06
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.07
569 0.08
570 0.09
571 0.11
572 0.12
573 0.14
574 0.17
575 0.2
576 0.22
577 0.23
578 0.25
579 0.25
580 0.25
581 0.23
582 0.22
583 0.19
584 0.15
585 0.14
586 0.1
587 0.08
588 0.07
589 0.08
590 0.06
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.1
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.13
602 0.14
603 0.13
604 0.16
605 0.21
606 0.22
607 0.24
608 0.25
609 0.24
610 0.23
611 0.23
612 0.19
613 0.14
614 0.12
615 0.13
616 0.12
617 0.15
618 0.19
619 0.22
620 0.24
621 0.24
622 0.23
623 0.23
624 0.24
625 0.22
626 0.18
627 0.16
628 0.16
629 0.19
630 0.19
631 0.16
632 0.14
633 0.12
634 0.12
635 0.13
636 0.12
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.1
641 0.11
642 0.11
643 0.12
644 0.12
645 0.12
646 0.13
647 0.12
648 0.11
649 0.12
650 0.12
651 0.1
652 0.11
653 0.15
654 0.15
655 0.18
656 0.22
657 0.22
658 0.27
659 0.34
660 0.4
661 0.44
662 0.51
663 0.57
664 0.58
665 0.58
666 0.55
667 0.51
668 0.45
669 0.39
670 0.33
671 0.24
672 0.19
673 0.18
674 0.14
675 0.1
676 0.08
677 0.06
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.06
683 0.05
684 0.05
685 0.06
686 0.06
687 0.08
688 0.08
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.1
693 0.1
694 0.11
695 0.1
696 0.09
697 0.09
698 0.11
699 0.12
700 0.13
701 0.12
702 0.11
703 0.12
704 0.12
705 0.12
706 0.14
707 0.2
708 0.25
709 0.27
710 0.28
711 0.36
712 0.4
713 0.43
714 0.44
715 0.41
716 0.4
717 0.39
718 0.42
719 0.35
720 0.31
721 0.27
722 0.23
723 0.19
724 0.15
725 0.14
726 0.09
727 0.08
728 0.06
729 0.07
730 0.06
731 0.05
732 0.05
733 0.04
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.06
738 0.06
739 0.06
740 0.06
741 0.06
742 0.04
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.06
748 0.06
749 0.06
750 0.08
751 0.09
752 0.13
753 0.14
754 0.15
755 0.16
756 0.21
757 0.25
758 0.28
759 0.32
760 0.34
761 0.35
762 0.34
763 0.36
764 0.31
765 0.28
766 0.23
767 0.18
768 0.17
769 0.15
770 0.15
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.12
775 0.13
776 0.11
777 0.13
778 0.15
779 0.18
780 0.18
781 0.19
782 0.21
783 0.21
784 0.22
785 0.2
786 0.18
787 0.16
788 0.16
789 0.16
790 0.13
791 0.11
792 0.1
793 0.14
794 0.14
795 0.13
796 0.12
797 0.11
798 0.12
799 0.11
800 0.14
801 0.12
802 0.13
803 0.13
804 0.13
805 0.14
806 0.14
807 0.15
808 0.12
809 0.12
810 0.16
811 0.16
812 0.17
813 0.16
814 0.16
815 0.15
816 0.15
817 0.16
818 0.11
819 0.12
820 0.12
821 0.15
822 0.18
823 0.21
824 0.22
825 0.19
826 0.2
827 0.21
828 0.21
829 0.18
830 0.16
831 0.17
832 0.19
833 0.18
834 0.18
835 0.22
836 0.24
837 0.28
838 0.32
839 0.31
840 0.34
841 0.38
842 0.44
843 0.42
844 0.43
845 0.4
846 0.38
847 0.34
848 0.3
849 0.29
850 0.23
851 0.2
852 0.19
853 0.21
854 0.19
855 0.19
856 0.2
857 0.21
858 0.25
859 0.28
860 0.33
861 0.3
862 0.31
863 0.32
864 0.3
865 0.24
866 0.19
867 0.17
868 0.1
869 0.09
870 0.08
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.05
876 0.06
877 0.07
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.09
882 0.09
883 0.11
884 0.11
885 0.11
886 0.15
887 0.16
888 0.17
889 0.17
890 0.16
891 0.19
892 0.21
893 0.2
894 0.18
895 0.22
896 0.22
897 0.24
898 0.24
899 0.21
900 0.21
901 0.21
902 0.2
903 0.19
904 0.2
905 0.2
906 0.2
907 0.19
908 0.19
909 0.19
910 0.19
911 0.15
912 0.15
913 0.13
914 0.13
915 0.16
916 0.18
917 0.2
918 0.2
919 0.19
920 0.19
921 0.21
922 0.23
923 0.21
924 0.2
925 0.18
926 0.18
927 0.18
928 0.16
929 0.14
930 0.12
931 0.11