Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VAM0

Protein Details
Accession A0A316VAM0    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-471KMAQREKEHKEEERKRREKQKSERGKSSDNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-466REKEHKEEERKRREKQKSERGK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAPKKQKQSLADFLADETTGKVDWADDFDDLPAAPLPRADRGIPQRGSDWLSSMPDRADRDRSSGLGSERQSYPAREELPLPTQPPYTAFIGNLSFDVSEEDIASFFAPDQTTSVRLVTGGDGRAKGFGYVEFEALDGLKNALTKSGSQLAGRTARVSVAEPREAKGPAFSSVAEEATQWRRAGPLPPSSDGASGPGRRGGDRPGYNRFESSGGSSGFDNMDVVAGGGRSGFGSKFAPSAPREPRRNVEPLEPSQGDNASDWRTGKPVSEMASPMHSSRRPSASPAAAGAEGGRAPSFRRHGDATEVDEKYSNQERLGFGSKFVATPPDSPSVQKRSGFGFDRRNKDAAAAAPASAGDGADTWRSARRTSANGPASNGASKSAEGTSGEPAQRKKLELKPRSTPVGGDAPADAASSDKGNNPFGNARPVDASDRQREIEEKMAQREKEHKEEERKRREKQKSERGKSSDNGDGAARSNTVSNEKAVNGEGVKSPTTTAAATPKQPAPTGAWGGGRKPSGALAGNQEGSTEQSTNSDVDALTSNVEAVSVKDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.35
3 0.27
4 0.18
5 0.14
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.16
24 0.19
25 0.22
26 0.22
27 0.28
28 0.36
29 0.45
30 0.45
31 0.45
32 0.42
33 0.43
34 0.46
35 0.37
36 0.32
37 0.25
38 0.27
39 0.26
40 0.26
41 0.25
42 0.26
43 0.3
44 0.31
45 0.36
46 0.33
47 0.38
48 0.39
49 0.38
50 0.36
51 0.36
52 0.35
53 0.34
54 0.34
55 0.33
56 0.32
57 0.36
58 0.35
59 0.33
60 0.34
61 0.33
62 0.34
63 0.3
64 0.31
65 0.31
66 0.34
67 0.35
68 0.33
69 0.29
70 0.28
71 0.27
72 0.27
73 0.25
74 0.23
75 0.21
76 0.19
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.17
81 0.15
82 0.11
83 0.1
84 0.12
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.11
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.18
112 0.17
113 0.16
114 0.13
115 0.11
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.14
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.21
137 0.24
138 0.27
139 0.27
140 0.24
141 0.18
142 0.17
143 0.18
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.26
148 0.26
149 0.26
150 0.29
151 0.29
152 0.27
153 0.23
154 0.2
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.12
163 0.14
164 0.17
165 0.2
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.19
170 0.23
171 0.24
172 0.28
173 0.29
174 0.3
175 0.32
176 0.32
177 0.31
178 0.26
179 0.24
180 0.21
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.2
187 0.21
188 0.25
189 0.3
190 0.33
191 0.38
192 0.42
193 0.42
194 0.41
195 0.38
196 0.3
197 0.26
198 0.24
199 0.2
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.1
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.13
225 0.14
226 0.22
227 0.3
228 0.37
229 0.42
230 0.44
231 0.47
232 0.47
233 0.5
234 0.45
235 0.42
236 0.39
237 0.36
238 0.39
239 0.36
240 0.32
241 0.28
242 0.27
243 0.21
244 0.16
245 0.16
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.19
266 0.23
267 0.21
268 0.24
269 0.28
270 0.25
271 0.24
272 0.22
273 0.2
274 0.15
275 0.14
276 0.11
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.1
284 0.13
285 0.13
286 0.16
287 0.18
288 0.19
289 0.23
290 0.24
291 0.25
292 0.29
293 0.28
294 0.26
295 0.25
296 0.24
297 0.24
298 0.27
299 0.22
300 0.15
301 0.18
302 0.18
303 0.21
304 0.27
305 0.22
306 0.18
307 0.2
308 0.2
309 0.17
310 0.17
311 0.16
312 0.12
313 0.14
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.2
318 0.26
319 0.29
320 0.32
321 0.31
322 0.29
323 0.28
324 0.34
325 0.36
326 0.37
327 0.41
328 0.45
329 0.5
330 0.51
331 0.5
332 0.44
333 0.41
334 0.37
335 0.28
336 0.24
337 0.18
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.1
343 0.08
344 0.04
345 0.03
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.16
354 0.19
355 0.24
356 0.28
357 0.37
358 0.39
359 0.39
360 0.4
361 0.39
362 0.36
363 0.32
364 0.28
365 0.2
366 0.14
367 0.13
368 0.13
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.13
374 0.17
375 0.19
376 0.21
377 0.22
378 0.28
379 0.29
380 0.3
381 0.35
382 0.39
383 0.48
384 0.52
385 0.58
386 0.6
387 0.63
388 0.66
389 0.58
390 0.5
391 0.44
392 0.42
393 0.35
394 0.28
395 0.22
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.13
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.12
405 0.14
406 0.17
407 0.18
408 0.2
409 0.24
410 0.25
411 0.32
412 0.28
413 0.27
414 0.25
415 0.27
416 0.29
417 0.32
418 0.36
419 0.34
420 0.37
421 0.37
422 0.36
423 0.36
424 0.34
425 0.35
426 0.37
427 0.35
428 0.4
429 0.46
430 0.45
431 0.47
432 0.54
433 0.52
434 0.53
435 0.55
436 0.55
437 0.6
438 0.7
439 0.77
440 0.79
441 0.81
442 0.82
443 0.86
444 0.88
445 0.88
446 0.88
447 0.89
448 0.89
449 0.9
450 0.9
451 0.86
452 0.81
453 0.74
454 0.69
455 0.64
456 0.53
457 0.45
458 0.36
459 0.31
460 0.26
461 0.24
462 0.19
463 0.13
464 0.14
465 0.15
466 0.18
467 0.18
468 0.18
469 0.2
470 0.2
471 0.21
472 0.2
473 0.21
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.19
478 0.2
479 0.18
480 0.18
481 0.17
482 0.18
483 0.16
484 0.16
485 0.22
486 0.25
487 0.28
488 0.33
489 0.36
490 0.37
491 0.37
492 0.37
493 0.33
494 0.36
495 0.36
496 0.34
497 0.36
498 0.35
499 0.37
500 0.4
501 0.36
502 0.3
503 0.27
504 0.25
505 0.23
506 0.24
507 0.24
508 0.25
509 0.29
510 0.3
511 0.29
512 0.28
513 0.24
514 0.24
515 0.25
516 0.19
517 0.14
518 0.14
519 0.16
520 0.17
521 0.17
522 0.15
523 0.12
524 0.13
525 0.15
526 0.13
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.1
531 0.11
532 0.09