FuNGI

A0A316VIH1

Protein Details

Accession

A0A316VIH1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
395-424	VVLVKKSYPDTKKRRTRRTWRLKSMAKLDG	Hydrophilic
475-496	EERIQRRREHKAMWKARQAAKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
406-415	KKRRTRRTWR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEYITPSAPQQGLVLCADCGTPITPNNANLCLSCLRASVDITEGIPKQSTVNFCRNCERYLNPPISWVPAQLESRELLAICLKKLKGLNKVRLIDASFIWTEPHSKRLKVKLTVQKEVLTSTILQQIFEVEYVVQYGQCPDCTRLAAQNTWRAQIQVRQKVPHKRTFLLIEQMILKHNAHKETINIEEKKDGLNFYYAQRSHAIKMVEFLANIAPIRSQSSATIISADVHSSTQNNKFTYSVEIVPICKDEMVVLPKRLAKSMGNIGQLTLCYRVTNSIRLMDPLTLQIADVTADKYYRDPFESLCQIPELVEFLVLDIEPSGLVSADGKWLTADAQVSPLNAQSFGEADAVYHTRTHLGAVLQAGDTVLGYHLGKSNLNSDNWDSIPDERKPDVVLVKKSYPDTKKRRTRRTWRLKSMAKLDGETADEGKAAVGRRGGLDGQKVQADYEYFLRELEEDDEMRKGVNLYRDPAAEERIQRRREHKAMWKARQAAKALQKEQDGTGDEVMDEAADVDDGMTDDGFTTDGESEFGDEVPSVPIDELLDDFDDMNMD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.14
3	0.14
4	0.13
5	0.12
6	0.12
7	0.1
8	0.12
9	0.13
10	0.19
11	0.22
12	0.26
13	0.3
14	0.31
15	0.31
16	0.28
17	0.3
18	0.26
19	0.25
20	0.22
21	0.19
22	0.19
23	0.19
24	0.2
25	0.18
26	0.18
27	0.17
28	0.16
29	0.2
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.18
34	0.18
35	0.21
36	0.28
37	0.29
38	0.38
39	0.41
40	0.44
41	0.53
42	0.54
43	0.52
44	0.51
45	0.49
46	0.47
47	0.52
48	0.53
49	0.44
50	0.46
51	0.44
52	0.44
53	0.41
54	0.34
55	0.28
56	0.28
57	0.3
58	0.26
59	0.27
60	0.22
61	0.22
62	0.21
63	0.18
64	0.13
65	0.17
66	0.18
67	0.17
68	0.23
69	0.22
70	0.25
71	0.31
72	0.36
73	0.41
74	0.49
75	0.57
76	0.6
77	0.63
78	0.6
79	0.58
80	0.53
81	0.45
82	0.36
83	0.31
84	0.22
85	0.2
86	0.19
87	0.16
88	0.2
89	0.19
90	0.27
91	0.27
92	0.31
93	0.38
94	0.46
95	0.54
96	0.55
97	0.64
98	0.66
99	0.69
100	0.72
101	0.67
102	0.61
103	0.53
104	0.47
105	0.38
106	0.29
107	0.22
108	0.17
109	0.22
110	0.19
111	0.18
112	0.16
113	0.17
114	0.16
115	0.15
116	0.14
117	0.07
118	0.07
119	0.08
120	0.08
121	0.07
122	0.06
123	0.09
124	0.1
125	0.11
126	0.14
127	0.15
128	0.17
129	0.18
130	0.2
131	0.23
132	0.25
133	0.28
134	0.31
135	0.37
136	0.36
137	0.37
138	0.35
139	0.31
140	0.29
141	0.31
142	0.36
143	0.37
144	0.4
145	0.45
146	0.52
147	0.61
148	0.67
149	0.68
150	0.64
151	0.56
152	0.56
153	0.55
154	0.51
155	0.48
156	0.41
157	0.34
158	0.3
159	0.29
160	0.26
161	0.23
162	0.19
163	0.17
164	0.21
165	0.21
166	0.2
167	0.2
168	0.21
169	0.22
170	0.29
171	0.32
172	0.3
173	0.29
174	0.29
175	0.28
176	0.28
177	0.26
178	0.2
179	0.13
180	0.14
181	0.15
182	0.15
183	0.23
184	0.21
185	0.22
186	0.25
187	0.26
188	0.24
189	0.27
190	0.25
191	0.17
192	0.19
193	0.2
194	0.17
195	0.15
196	0.14
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.06
202	0.06
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.13
211	0.11
212	0.11
213	0.1
214	0.1
215	0.08
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.11
220	0.17
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.22
225	0.22
226	0.25
227	0.23
228	0.18
229	0.16
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.12
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.09
239	0.13
240	0.15
241	0.15
242	0.18
243	0.2
244	0.21
245	0.21
246	0.2
247	0.16
248	0.16
249	0.22
250	0.24
251	0.24
252	0.24
253	0.23
254	0.22
255	0.21
256	0.18
257	0.13
258	0.09
259	0.07
260	0.07
261	0.11
262	0.12
263	0.15
264	0.15
265	0.16
266	0.16
267	0.17
268	0.18
269	0.14
270	0.13
271	0.11
272	0.1
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.07
284	0.09
285	0.1
286	0.11
287	0.12
288	0.12
289	0.17
290	0.21
291	0.2
292	0.19
293	0.18
294	0.16
295	0.15
296	0.14
297	0.11
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.06
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.11
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.06
336	0.06
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.09
361	0.1
362	0.11
363	0.12
364	0.18
365	0.2
366	0.2
367	0.22
368	0.21
369	0.23
370	0.23
371	0.23
372	0.18
373	0.19
374	0.24
375	0.24
376	0.27
377	0.24
378	0.25
379	0.24
380	0.26
381	0.29
382	0.3
383	0.33
384	0.33
385	0.36
386	0.38
387	0.4
388	0.45
389	0.46
390	0.5
391	0.55
392	0.61
393	0.69
394	0.76
395	0.85
396	0.87
397	0.91
398	0.92
399	0.93
400	0.93
401	0.93
402	0.93
403	0.89
404	0.85
405	0.81
406	0.76
407	0.66
408	0.56
409	0.47
410	0.38
411	0.33
412	0.27
413	0.2
414	0.14
415	0.12
416	0.11
417	0.1
418	0.11
419	0.1
420	0.11
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.16
426	0.16
427	0.2
428	0.2
429	0.22
430	0.23
431	0.22
432	0.21
433	0.2
434	0.19
435	0.16
436	0.17
437	0.17
438	0.15
439	0.15
440	0.15
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.12
446	0.14
447	0.15
448	0.14
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.21
454	0.22
455	0.25
456	0.28
457	0.28
458	0.3
459	0.31
460	0.32
461	0.29
462	0.33
463	0.39
464	0.45
465	0.49
466	0.52
467	0.57
468	0.62
469	0.64
470	0.66
471	0.67
472	0.69
473	0.76
474	0.79
475	0.81
476	0.8
477	0.8
478	0.78
479	0.71
480	0.69
481	0.68
482	0.68
483	0.64
484	0.6
485	0.55
486	0.51
487	0.48
488	0.44
489	0.37
490	0.31
491	0.27
492	0.22
493	0.19
494	0.17
495	0.16
496	0.11
497	0.08
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.06
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.08
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.1
521	0.09
522	0.1
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.09
527	0.1
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.11
533	0.11
534	0.11

A0A316VIH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer