Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VGF4

Protein Details
Accession A0A316VGF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-97PNVLRNSARRNLKKRKRVIEEMQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-90RRNLKKRKR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024096  NO_sig/Golgi_transp_ligand-bd  
IPR007194  TRAPP_component  
IPR037992  TRAPPC6/Trs33  
Gene Ontology GO:0048193  P:Golgi vesicle transport  
GO:0043087  P:regulation of GTPase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04051  TRAPP  
CDD cd14944  TRAPPC6A_Trs33  
Amino Acid Sequences MANATSPEPPTRLSLGQPVPIASHFVPTSSTHSSSSSANNANATASSSSLVNPTSLALSLPHSDHSVPLMIEMPNVLRNSARRNLKKRKRVIEEMQEAGLSVEGLTVSAGPQNEDEEVIKRLEAIGSHIGSTFVERLSRERPPFSTTLDVLKFICKELWTAIWDKQVDNLRTNHRGVYVLQDNVFKPLLRLSVPAQGVNPSSELALASRVQLAMPTGMIRGALARLGVASTVVAESSQVPQCTFHVKTTTQRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.36
4 0.35
5 0.32
6 0.29
7 0.28
8 0.3
9 0.21
10 0.23
11 0.18
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.26
16 0.26
17 0.28
18 0.24
19 0.26
20 0.27
21 0.27
22 0.29
23 0.29
24 0.27
25 0.27
26 0.26
27 0.25
28 0.23
29 0.21
30 0.2
31 0.14
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.13
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.14
66 0.2
67 0.27
68 0.35
69 0.41
70 0.51
71 0.62
72 0.7
73 0.78
74 0.81
75 0.84
76 0.82
77 0.82
78 0.8
79 0.79
80 0.74
81 0.66
82 0.57
83 0.47
84 0.39
85 0.3
86 0.21
87 0.11
88 0.05
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.08
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.1
124 0.13
125 0.19
126 0.21
127 0.22
128 0.24
129 0.26
130 0.28
131 0.28
132 0.27
133 0.22
134 0.25
135 0.24
136 0.23
137 0.2
138 0.2
139 0.18
140 0.15
141 0.15
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.14
148 0.16
149 0.2
150 0.21
151 0.2
152 0.24
153 0.3
154 0.3
155 0.31
156 0.33
157 0.34
158 0.38
159 0.39
160 0.34
161 0.28
162 0.27
163 0.24
164 0.27
165 0.25
166 0.23
167 0.23
168 0.25
169 0.24
170 0.25
171 0.26
172 0.18
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.14
177 0.16
178 0.15
179 0.21
180 0.23
181 0.23
182 0.21
183 0.21
184 0.22
185 0.2
186 0.19
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.12
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.19
228 0.21
229 0.28
230 0.29
231 0.29
232 0.3
233 0.33