Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VJX9

Protein Details
Accession A0A316VJX9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-399RSAGRSSRGKPLRASRKPNKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-399SAGRSSRGKPLRASRKPNKK
Subcellular Location(s) mito 19, cyto_nucl 5, nucl 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022898  RNase_HII  
IPR001352  RNase_HII/HIII  
IPR024567  RNase_HII/HIII_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01351  RNase_HII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51975  RNASE_H_2  
CDD cd07182  RNase_HII_bacteria_HII_like  
Amino Acid Sequences MTTTLRRSSRRSTQASDGKVNTIVALPEKRNGAKSAAKASAKEVQNEAKDNTILVVKGKRKAKDEVSEASPPVNAAKAAKTADEEVSGEDSFDSVEANRLKQMLHYERQIIEGERKRLAMEGCKDIVEAMKRFAIIGVDEVGVGPLAGPCVSGAVVLSIGVADAKSNYNLANLAGINDSKKLKPAQREALAIQIKQYSMANNLGICTSQEVDTLNPRAASMEAMRRAVTGLLEGPLAGYRVHLLVDYHTVPGIADTIGQTCLEKGDAKSQSIAAASIIAKVYRDEYMLQLHQSYPHFGFDRNAGYGTAAHMAALRSGLICPEHRLSFTPVRLAYEKIQQGKDTTEESKADVSTATELIRSDSQKENELTEEVDQKVTGRSAGRSSRGKPLRASRKPNKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.72
4 0.64
5 0.56
6 0.51
7 0.45
8 0.35
9 0.28
10 0.23
11 0.21
12 0.25
13 0.24
14 0.27
15 0.32
16 0.34
17 0.36
18 0.37
19 0.37
20 0.37
21 0.41
22 0.44
23 0.47
24 0.47
25 0.44
26 0.46
27 0.49
28 0.45
29 0.43
30 0.4
31 0.39
32 0.41
33 0.45
34 0.41
35 0.36
36 0.33
37 0.3
38 0.27
39 0.22
40 0.18
41 0.18
42 0.25
43 0.27
44 0.34
45 0.4
46 0.44
47 0.47
48 0.54
49 0.58
50 0.58
51 0.58
52 0.57
53 0.56
54 0.55
55 0.51
56 0.44
57 0.36
58 0.28
59 0.23
60 0.18
61 0.13
62 0.11
63 0.13
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.17
72 0.15
73 0.17
74 0.16
75 0.14
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.04
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.17
89 0.26
90 0.27
91 0.3
92 0.32
93 0.35
94 0.35
95 0.37
96 0.36
97 0.29
98 0.32
99 0.34
100 0.34
101 0.32
102 0.32
103 0.3
104 0.31
105 0.31
106 0.29
107 0.27
108 0.28
109 0.27
110 0.27
111 0.26
112 0.24
113 0.25
114 0.22
115 0.19
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.16
121 0.13
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.02
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.12
166 0.11
167 0.14
168 0.18
169 0.21
170 0.28
171 0.35
172 0.4
173 0.41
174 0.43
175 0.41
176 0.45
177 0.42
178 0.35
179 0.29
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.17
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.12
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.17
253 0.19
254 0.2
255 0.21
256 0.21
257 0.21
258 0.19
259 0.18
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.16
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.2
279 0.2
280 0.22
281 0.18
282 0.21
283 0.21
284 0.21
285 0.22
286 0.21
287 0.24
288 0.21
289 0.21
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.14
308 0.18
309 0.19
310 0.2
311 0.23
312 0.28
313 0.34
314 0.34
315 0.36
316 0.33
317 0.37
318 0.37
319 0.38
320 0.34
321 0.35
322 0.39
323 0.4
324 0.41
325 0.38
326 0.38
327 0.37
328 0.37
329 0.33
330 0.3
331 0.28
332 0.26
333 0.27
334 0.27
335 0.25
336 0.22
337 0.18
338 0.17
339 0.15
340 0.15
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.15
345 0.2
346 0.2
347 0.23
348 0.29
349 0.31
350 0.36
351 0.38
352 0.36
353 0.34
354 0.33
355 0.3
356 0.26
357 0.29
358 0.24
359 0.23
360 0.21
361 0.2
362 0.21
363 0.2
364 0.2
365 0.18
366 0.2
367 0.27
368 0.33
369 0.4
370 0.44
371 0.47
372 0.55
373 0.59
374 0.61
375 0.62
376 0.66
377 0.7
378 0.73
379 0.8