Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316VB58

Protein Details
Accession A0A316VB58    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-48DGLTNKEKRLARKAEKQAARKSGTKDDEKKRKQEDVVHydrophilic
74-100DIEAVSHKERRKRRKMEKQAAKHGEQEBasic
425-446ERPQGQKRPYGERRQRPWKVEEBasic
463-486IDQPLPKKHKETKEERIQRREAEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-43KEKRLARKAEKQAARKSGTKDDEKKRK
81-93KERRKRRKMEKQA
415-450RRGAPKGKMGERPQGQKRPYGERRQRPWKVEEERKK
468-497PKKHKETKEERIQRREAEKGDRKTTSTRRV
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSSTVVEAVQDGLTNKEKRLARKAEKQAARKSGTKDDEKKRKQEDVVEEDVEISDKEHAEGEKADEEEEEEEDIEAVSHKERRKRRKMEKQAAKHGEQEEGQTGEVDAKANAESENKTVKDATQRSLFSLWVGNLSFKTSPTRLQEWFEQHELFGITRVYMPKGARKFEYNRGFAYVDVPSEEEVKQGIALSEVNLDGRRLLIKSGSDFGGRPTIDAAARALAEGNMAASTGEEHQQNELEGIIGKKGKTGLTKTAQKILRAQKHPPGPTLFIGNLSFNATEEGVRDMIERSAASRFEHESARASNIVSEKKKEAKKSAEDDEEEEAAESTAVENDVAEESKKETTGGKPELLRGAGIRKIRMGEFEDTGKCKGFAFVDFHTPSYATATLIDPRNGHLDGRELILQYAGAEAIRRGAPKGKMGERPQGQKRPYGERRQRPWKVEEERKKLAESAPEPGTFDIDQPLPKKHKETKEERIQRREAEKGDRKTTSTRRVRPGAALASAQRGKVAIDIDAPQGNKKTFGDDDDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.25
4 0.31
5 0.35
6 0.41
7 0.51
8 0.57
9 0.59
10 0.67
11 0.77
12 0.8
13 0.84
14 0.85
15 0.85
16 0.83
17 0.79
18 0.75
19 0.7
20 0.7
21 0.69
22 0.7
23 0.71
24 0.73
25 0.79
26 0.81
27 0.85
28 0.82
29 0.82
30 0.77
31 0.76
32 0.74
33 0.71
34 0.68
35 0.59
36 0.52
37 0.44
38 0.39
39 0.3
40 0.21
41 0.14
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.15
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.19
53 0.16
54 0.17
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.1
66 0.16
67 0.21
68 0.3
69 0.4
70 0.51
71 0.61
72 0.71
73 0.79
74 0.85
75 0.91
76 0.94
77 0.95
78 0.94
79 0.94
80 0.91
81 0.82
82 0.77
83 0.67
84 0.59
85 0.49
86 0.42
87 0.34
88 0.27
89 0.25
90 0.18
91 0.17
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.11
101 0.12
102 0.15
103 0.21
104 0.21
105 0.22
106 0.22
107 0.24
108 0.31
109 0.33
110 0.34
111 0.35
112 0.35
113 0.36
114 0.37
115 0.34
116 0.25
117 0.25
118 0.2
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.17
124 0.16
125 0.14
126 0.19
127 0.18
128 0.23
129 0.28
130 0.32
131 0.31
132 0.34
133 0.4
134 0.41
135 0.44
136 0.41
137 0.36
138 0.31
139 0.3
140 0.27
141 0.21
142 0.16
143 0.12
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.17
150 0.23
151 0.27
152 0.3
153 0.3
154 0.36
155 0.4
156 0.46
157 0.53
158 0.48
159 0.44
160 0.45
161 0.43
162 0.36
163 0.33
164 0.24
165 0.16
166 0.14
167 0.13
168 0.1
169 0.12
170 0.11
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.18
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.05
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.12
237 0.15
238 0.17
239 0.22
240 0.28
241 0.35
242 0.36
243 0.42
244 0.42
245 0.4
246 0.45
247 0.47
248 0.49
249 0.45
250 0.47
251 0.46
252 0.51
253 0.51
254 0.46
255 0.4
256 0.34
257 0.31
258 0.29
259 0.23
260 0.18
261 0.17
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.08
267 0.09
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.11
284 0.13
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.17
291 0.16
292 0.14
293 0.14
294 0.17
295 0.23
296 0.22
297 0.23
298 0.25
299 0.33
300 0.37
301 0.4
302 0.44
303 0.45
304 0.5
305 0.53
306 0.56
307 0.52
308 0.49
309 0.46
310 0.41
311 0.34
312 0.27
313 0.21
314 0.15
315 0.1
316 0.09
317 0.06
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.14
334 0.22
335 0.24
336 0.26
337 0.26
338 0.28
339 0.29
340 0.27
341 0.24
342 0.17
343 0.18
344 0.19
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.2
349 0.2
350 0.22
351 0.22
352 0.2
353 0.2
354 0.23
355 0.25
356 0.25
357 0.26
358 0.24
359 0.2
360 0.18
361 0.18
362 0.15
363 0.15
364 0.17
365 0.18
366 0.25
367 0.26
368 0.26
369 0.25
370 0.24
371 0.21
372 0.2
373 0.19
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.17
378 0.19
379 0.21
380 0.18
381 0.19
382 0.23
383 0.22
384 0.21
385 0.16
386 0.17
387 0.16
388 0.18
389 0.18
390 0.15
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.09
395 0.09
396 0.07
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.08
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.18
405 0.21
406 0.26
407 0.34
408 0.37
409 0.45
410 0.49
411 0.57
412 0.58
413 0.65
414 0.68
415 0.7
416 0.65
417 0.63
418 0.63
419 0.64
420 0.67
421 0.69
422 0.7
423 0.72
424 0.8
425 0.84
426 0.88
427 0.83
428 0.79
429 0.78
430 0.78
431 0.78
432 0.79
433 0.77
434 0.76
435 0.72
436 0.68
437 0.6
438 0.54
439 0.52
440 0.43
441 0.41
442 0.37
443 0.35
444 0.35
445 0.32
446 0.32
447 0.24
448 0.22
449 0.19
450 0.17
451 0.22
452 0.23
453 0.31
454 0.33
455 0.37
456 0.45
457 0.51
458 0.58
459 0.64
460 0.7
461 0.73
462 0.79
463 0.86
464 0.87
465 0.86
466 0.83
467 0.8
468 0.77
469 0.74
470 0.68
471 0.68
472 0.69
473 0.68
474 0.69
475 0.65
476 0.62
477 0.65
478 0.68
479 0.68
480 0.69
481 0.7
482 0.71
483 0.75
484 0.74
485 0.7
486 0.68
487 0.61
488 0.53
489 0.48
490 0.4
491 0.42
492 0.41
493 0.36
494 0.29
495 0.24
496 0.22
497 0.22
498 0.21
499 0.14
500 0.15
501 0.17
502 0.2
503 0.23
504 0.24
505 0.25
506 0.29
507 0.29
508 0.3
509 0.29
510 0.31
511 0.3