FuNGI

A0A316VHA6

Protein Details

Accession

A0A316VHA6

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-34	EAALAERKKRQEKGTLKRTKQRESWSYS	Hydrophilic
37-65	VSRSVSPSRSRSRSRSPSRISPRRPGDVE	Hydrophilic
118-142	SPDADHRRTRERSERRQGRRDLLDR	Basic
148-195	SDDEGRKSSKRHRSRRDSAYDEGREEEESSKRRRRRKERDHDDDFDRR	Basic
211-233	SGSHYEKRDRRTRRSSRASEDDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-26	RKKRQEKGTLKRTK
46-60	SRSRSRSPSRISPRR
109-138	RTAKARSSRSPDADHRRTRERSERRQGRRD
151-165	EGRKSSKRHRSRRDS
174-186	EESSKRRRRRKER

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MYADREEAALAERKKRQEKGTLKRTKQRESWSYSSSVSRSVSPSRSRSRSRSPSRISPRRPGDVENRERELQEQLRKRAMMSKRSRSSVNASNDQPSGSPDAKEDDSRRTAKARSSRSPDADHRRTRERSERRQGRRDLLDRHSEDRSDDEGRKSSKRHRSRRDSAYDEGREEEESSKRRRRRKERDHDDDFDRRSSNKDYDSRHGGDSESGSHYEKRDRRTRRSSRASEDDSMRKSRRSDHRSGRYFDSPRSNGGGGYYDSYYGHYDNRYGPQQPYYEPYRYESPPPRRRRSESRARSPDLDDYEMRSIFCSQLAARLTQRDLGEFFEDKLGEGTVMDVRIVMDKVTGRSKGVGYVELKEEQLVEKALFLSGTVLFGIPIIVQKTDAARNKGGEASSAAGAPARPNLPVALSALSPEQAANLIKLDGNPIHIDPGNIPSVSARLYVGNLHFSLTEADIKSVFEPFGAILSVDLHRELGTLKSKGFAFVQFINTDVAEKAIEHMNGFELAGRNIKVNHVNSARASGAVPSTSSGSEGNVPANASGHNVPDSNDMSGAGATLTSSFDEGGGGGLTASSRAALMEKLARIDRQSEVSDAANAKKSTEQNRPSNIPQAKSRGVHLKNMFNPEEETERGWEVELAEDIKEECQQKYGKVDTVKVDINSMGEVYIRFVDVEGAEKAVQGLNGRFFGGRSISATFISEGFLVSMLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.6
3	0.63
4	0.66
5	0.73
6	0.76
7	0.8
8	0.82
9	0.83
10	0.85
11	0.88
12	0.86
13	0.84
14	0.83
15	0.81
16	0.79
17	0.76
18	0.71
19	0.66
20	0.59
21	0.56
22	0.47
23	0.43
24	0.35
25	0.32
26	0.33
27	0.36
28	0.41
29	0.44
30	0.51
31	0.56
32	0.63
33	0.68
34	0.71
35	0.75
36	0.78
37	0.81
38	0.83
39	0.81
40	0.83
41	0.86
42	0.89
43	0.86
44	0.85
45	0.83
46	0.8
47	0.75
48	0.71
49	0.71
50	0.71
51	0.73
52	0.69
53	0.67
54	0.61
55	0.58
56	0.53
57	0.51
58	0.48
59	0.49
60	0.5
61	0.51
62	0.55
63	0.55
64	0.55
65	0.55
66	0.55
67	0.56
68	0.57
69	0.62
70	0.63
71	0.66
72	0.67
73	0.63
74	0.62
75	0.6
76	0.58
77	0.55
78	0.5
79	0.5
80	0.48
81	0.44
82	0.37
83	0.31
84	0.29
85	0.23
86	0.21
87	0.18
88	0.23
89	0.25
90	0.3
91	0.31
92	0.32
93	0.38
94	0.4
95	0.41
96	0.41
97	0.42
98	0.44
99	0.51
100	0.52
101	0.54
102	0.6
103	0.66
104	0.66
105	0.7
106	0.72
107	0.73
108	0.74
109	0.73
110	0.71
111	0.72
112	0.71
113	0.72
114	0.73
115	0.73
116	0.74
117	0.78
118	0.82
119	0.82
120	0.87
121	0.86
122	0.83
123	0.82
124	0.79
125	0.75
126	0.71
127	0.71
128	0.65
129	0.62
130	0.56
131	0.47
132	0.41
133	0.37
134	0.35
135	0.31
136	0.3
137	0.3
138	0.34
139	0.37
140	0.41
141	0.43
142	0.48
143	0.54
144	0.61
145	0.68
146	0.73
147	0.79
148	0.84
149	0.89
150	0.88
151	0.83
152	0.79
153	0.78
154	0.7
155	0.61
156	0.53
157	0.44
158	0.35
159	0.31
160	0.28
161	0.24
162	0.27
163	0.34
164	0.42
165	0.48
166	0.56
167	0.65
168	0.74
169	0.79
170	0.84
171	0.88
172	0.89
173	0.92
174	0.91
175	0.86
176	0.82
177	0.78
178	0.69
179	0.61
180	0.51
181	0.42
182	0.38
183	0.37
184	0.34
185	0.34
186	0.37
187	0.39
188	0.44
189	0.5
190	0.48
191	0.44
192	0.41
193	0.34
194	0.3
195	0.26
196	0.22
197	0.17
198	0.16
199	0.17
200	0.19
201	0.2
202	0.27
203	0.31
204	0.36
205	0.43
206	0.5
207	0.58
208	0.67
209	0.76
210	0.77
211	0.83
212	0.82
213	0.81
214	0.81
215	0.76
216	0.7
217	0.65
218	0.61
219	0.54
220	0.55
221	0.48
222	0.43
223	0.39
224	0.44
225	0.49
226	0.51
227	0.56
228	0.6
229	0.69
230	0.72
231	0.74
232	0.71
233	0.68
234	0.63
235	0.58
236	0.56
237	0.47
238	0.43
239	0.42
240	0.36
241	0.28
242	0.26
243	0.24
244	0.15
245	0.16
246	0.14
247	0.11
248	0.11
249	0.12
250	0.13
251	0.11
252	0.12
253	0.11
254	0.13
255	0.15
256	0.18
257	0.2
258	0.21
259	0.22
260	0.24
261	0.25
262	0.24
263	0.26
264	0.27
265	0.27
266	0.25
267	0.27
268	0.28
269	0.29
270	0.35
271	0.4
272	0.46
273	0.53
274	0.62
275	0.68
276	0.7
277	0.75
278	0.77
279	0.77
280	0.78
281	0.78
282	0.79
283	0.78
284	0.74
285	0.7
286	0.62
287	0.58
288	0.5
289	0.43
290	0.32
291	0.27
292	0.26
293	0.24
294	0.22
295	0.17
296	0.15
297	0.12
298	0.12
299	0.1
300	0.07
301	0.12
302	0.13
303	0.14
304	0.14
305	0.16
306	0.16
307	0.19
308	0.19
309	0.15
310	0.15
311	0.14
312	0.16
313	0.14
314	0.14
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.11
319	0.09
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.09
334	0.11
335	0.12
336	0.11
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.14
341	0.16
342	0.14
343	0.15
344	0.17
345	0.16
346	0.16
347	0.13
348	0.13
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.03
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.08
373	0.15
374	0.18
375	0.2
376	0.21
377	0.22
378	0.23
379	0.24
380	0.22
381	0.16
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.08
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.1
422	0.13
423	0.13
424	0.12
425	0.12
426	0.1
427	0.1
428	0.11
429	0.1
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.1
434	0.11
435	0.12
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.1
442	0.13
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.1
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.05
456	0.04
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.1
466	0.14
467	0.15
468	0.15
469	0.18
470	0.18
471	0.2
472	0.2
473	0.18
474	0.16
475	0.17
476	0.2
477	0.17
478	0.18
479	0.17
480	0.16
481	0.15
482	0.12
483	0.1
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.1
488	0.11
489	0.1
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.1
494	0.11
495	0.09
496	0.09
497	0.12
498	0.12
499	0.13
500	0.13
501	0.16
502	0.21
503	0.21
504	0.28
505	0.27
506	0.29
507	0.29
508	0.31
509	0.28
510	0.22
511	0.21
512	0.15
513	0.14
514	0.11
515	0.11
516	0.09
517	0.1
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.12
523	0.12
524	0.13
525	0.12
526	0.12
527	0.11
528	0.12
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.12
533	0.12
534	0.13
535	0.14
536	0.17
537	0.18
538	0.16
539	0.15
540	0.14
541	0.13
542	0.12
543	0.11
544	0.07
545	0.05
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.05
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.06
568	0.08
569	0.13
570	0.14
571	0.17
572	0.19
573	0.2
574	0.21
575	0.24
576	0.23
577	0.23
578	0.24
579	0.22
580	0.22
581	0.21
582	0.24
583	0.23
584	0.24
585	0.27
586	0.25
587	0.25
588	0.29
589	0.35
590	0.39
591	0.47
592	0.52
593	0.54
594	0.61
595	0.66
596	0.64
597	0.67
598	0.65
599	0.59
600	0.57
601	0.56
602	0.55
603	0.5
604	0.52
605	0.52
606	0.49
607	0.54
608	0.54
609	0.55
610	0.55
611	0.61
612	0.57
613	0.48
614	0.48
615	0.42
616	0.4
617	0.33
618	0.29
619	0.24
620	0.24
621	0.23
622	0.21
623	0.19
624	0.15
625	0.15
626	0.14
627	0.13
628	0.11
629	0.12
630	0.12
631	0.12
632	0.16
633	0.17
634	0.16
635	0.21
636	0.23
637	0.26
638	0.32
639	0.36
640	0.37
641	0.39
642	0.44
643	0.42
644	0.45
645	0.46
646	0.39
647	0.37
648	0.31
649	0.28
650	0.23
651	0.19
652	0.14
653	0.11
654	0.1
655	0.11
656	0.11
657	0.1
658	0.1
659	0.1
660	0.12
661	0.11
662	0.14
663	0.13
664	0.14
665	0.14
666	0.14
667	0.14
668	0.13
669	0.14
670	0.15
671	0.17
672	0.19
673	0.2
674	0.21
675	0.21
676	0.2
677	0.22
678	0.21
679	0.19
680	0.18
681	0.19
682	0.2
683	0.2
684	0.22
685	0.19
686	0.17
687	0.17
688	0.14
689	0.12
690	0.11

A0A316VHA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer