Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A316VGZ1

Protein Details
Accession A0A316VGZ1    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKKHEKKTAKGRLDKFYHLBasic
252-271ANVFEPEKKRRKREGYDEGEBasic
384-412ERLQSEKDKRSRKERRRRNEARQKKVLKMBasic
500-520ERDAKHRAREARKKNEHNDEWBasic
860-915GSNKGKGRPKGVKGRYRMVDSRGKKELRAQKRRDKAAGKKTTSSTSRKPRIPNGYGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-263KKRRK
390-408KDKRSRKERRRRNEARQKK
505-512HRAREARK
791-818ARPIKKVAEAKARKKMRAMKQLESARKK
840-910VLRKAGAKQKERKIQVVVAGGSNKGKGRPKGVKGRYRMVDSRGKKELRAQKRRDKAAGKKTTSSTSRKPRI
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MPKKHEKKTAKGRLDKFYHLAKQQGFRSRAAFKLVQLNKKFGFLESARCVIDLCAAPGGWLQVASKQMPPNSLIVGVDLVPIKPIPRCITFAEDINSYKCRDQLRAELKDWKADAVLHDGAPNVGTAWVQDAYAQSELVLQSLKLAVEFLAPGGTFVTKVFRSKDYNNLLWVFNQLFKKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCQEFKAPKRIDPKFLDPRHVFKDLDPVADTALIQSTVDGKNSAQSIKIASNAVANVFEPEKKRRKREGYDEGETILFKAIGAKDFIESQDPISLLGTFNEIQFKRDEDKPFADPTKTDDNIKACCSDLKVLGKKDFRNLLKWRKIWREDMGIEVPANHPSKEEEEGKEKVEVTEMDEDEAIDQELERLQSEKDKRSRKERRRRNEARQKKVLKMQLSMTTPMDIGMDVQDEALHGGEEFFDLVNGGAHKRVAAGEEAGSSESEQSEGEESEEDDLEAEERRKRQLEAEMDGMYEEYQHKVSERDAKHRAREARKKNEHNDEWYGFTKDKDEEDEGEESEEGGYELFNKRKEVEETYDTDDEEDDAEEREEEEEREEARRAAREAALDRGQGPNFEDHDVQMEDDEGDVENLVQSLESGKDKDARQSREAAIWFDNPLFKGMQGLDADDEDDDEEEEDEEDDEEEEEESDVSEEGEDVEMSEDEASGTDSPPTDAENEDQWRFEDEDQDVIKQKKIQEKGLTTAEAISLASQLVNREKSKSDLIDDGFTKQNFVDKSDLPQWFLDDEQHHYKPNIPVTKEAVQALAARQRALDARPIKKVAEAKARKKMRAMKQLESARKKAEGISDNVDISEREKAANIDKVLRKAGAKQKERKIQVVVAGGSNKGKGRPKGVKGRYRMVDSRGKKELRAQKRRDKAAGKKTTSSTSRKPRIPNGYGGRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.78
3 0.72
4 0.7
5 0.67
6 0.61
7 0.61
8 0.57
9 0.59
10 0.6
11 0.65
12 0.59
13 0.54
14 0.56
15 0.54
16 0.51
17 0.5
18 0.44
19 0.38
20 0.46
21 0.51
22 0.54
23 0.53
24 0.57
25 0.51
26 0.53
27 0.5
28 0.4
29 0.41
30 0.33
31 0.38
32 0.36
33 0.38
34 0.34
35 0.33
36 0.33
37 0.25
38 0.29
39 0.21
40 0.18
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.16
45 0.17
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.12
50 0.16
51 0.18
52 0.22
53 0.26
54 0.28
55 0.3
56 0.31
57 0.3
58 0.28
59 0.27
60 0.22
61 0.17
62 0.16
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.19
72 0.22
73 0.24
74 0.28
75 0.3
76 0.36
77 0.37
78 0.39
79 0.36
80 0.35
81 0.33
82 0.34
83 0.33
84 0.29
85 0.28
86 0.29
87 0.29
88 0.3
89 0.34
90 0.4
91 0.48
92 0.52
93 0.54
94 0.59
95 0.57
96 0.58
97 0.53
98 0.44
99 0.35
100 0.3
101 0.28
102 0.25
103 0.25
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.18
108 0.16
109 0.14
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.09
116 0.08
117 0.1
118 0.1
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.13
145 0.13
146 0.17
147 0.2
148 0.24
149 0.3
150 0.33
151 0.43
152 0.45
153 0.46
154 0.47
155 0.47
156 0.43
157 0.37
158 0.37
159 0.29
160 0.27
161 0.26
162 0.23
163 0.22
164 0.22
165 0.26
166 0.27
167 0.32
168 0.35
169 0.41
170 0.49
171 0.54
172 0.58
173 0.61
174 0.62
175 0.6
176 0.54
177 0.52
178 0.44
179 0.39
180 0.35
181 0.28
182 0.22
183 0.19
184 0.17
185 0.11
186 0.09
187 0.11
188 0.14
189 0.16
190 0.25
191 0.26
192 0.31
193 0.41
194 0.46
195 0.52
196 0.53
197 0.61
198 0.62
199 0.63
200 0.67
201 0.6
202 0.62
203 0.59
204 0.56
205 0.47
206 0.37
207 0.45
208 0.36
209 0.36
210 0.3
211 0.25
212 0.22
213 0.21
214 0.2
215 0.11
216 0.1
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.24
245 0.34
246 0.42
247 0.5
248 0.59
249 0.68
250 0.73
251 0.8
252 0.82
253 0.8
254 0.77
255 0.69
256 0.6
257 0.51
258 0.42
259 0.32
260 0.22
261 0.13
262 0.08
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.16
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.2
289 0.21
290 0.27
291 0.31
292 0.29
293 0.32
294 0.34
295 0.38
296 0.38
297 0.35
298 0.29
299 0.3
300 0.34
301 0.31
302 0.3
303 0.29
304 0.3
305 0.31
306 0.32
307 0.28
308 0.2
309 0.2
310 0.2
311 0.18
312 0.19
313 0.24
314 0.29
315 0.31
316 0.37
317 0.42
318 0.42
319 0.45
320 0.49
321 0.43
322 0.46
323 0.51
324 0.55
325 0.58
326 0.62
327 0.64
328 0.65
329 0.68
330 0.65
331 0.6
332 0.56
333 0.48
334 0.47
335 0.4
336 0.32
337 0.28
338 0.23
339 0.2
340 0.18
341 0.18
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.16
346 0.2
347 0.23
348 0.2
349 0.24
350 0.26
351 0.26
352 0.26
353 0.24
354 0.2
355 0.18
356 0.15
357 0.13
358 0.17
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.12
364 0.12
365 0.09
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.13
375 0.18
376 0.26
377 0.33
378 0.42
379 0.46
380 0.57
381 0.67
382 0.72
383 0.78
384 0.81
385 0.84
386 0.86
387 0.91
388 0.92
389 0.92
390 0.91
391 0.9
392 0.89
393 0.83
394 0.77
395 0.74
396 0.69
397 0.6
398 0.52
399 0.45
400 0.41
401 0.38
402 0.35
403 0.28
404 0.23
405 0.2
406 0.18
407 0.15
408 0.08
409 0.07
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.08
463 0.1
464 0.11
465 0.14
466 0.15
467 0.16
468 0.18
469 0.24
470 0.26
471 0.26
472 0.28
473 0.26
474 0.24
475 0.23
476 0.21
477 0.13
478 0.1
479 0.08
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.11
486 0.19
487 0.21
488 0.28
489 0.36
490 0.4
491 0.44
492 0.5
493 0.56
494 0.57
495 0.65
496 0.67
497 0.69
498 0.75
499 0.79
500 0.8
501 0.82
502 0.75
503 0.7
504 0.66
505 0.56
506 0.5
507 0.43
508 0.38
509 0.28
510 0.25
511 0.22
512 0.17
513 0.17
514 0.16
515 0.16
516 0.15
517 0.18
518 0.18
519 0.16
520 0.16
521 0.15
522 0.11
523 0.1
524 0.08
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.09
530 0.11
531 0.13
532 0.14
533 0.15
534 0.18
535 0.21
536 0.24
537 0.26
538 0.26
539 0.28
540 0.33
541 0.32
542 0.29
543 0.26
544 0.22
545 0.17
546 0.14
547 0.11
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.11
560 0.12
561 0.12
562 0.14
563 0.16
564 0.16
565 0.17
566 0.17
567 0.18
568 0.19
569 0.23
570 0.22
571 0.21
572 0.2
573 0.21
574 0.2
575 0.18
576 0.17
577 0.16
578 0.16
579 0.17
580 0.16
581 0.13
582 0.16
583 0.16
584 0.15
585 0.11
586 0.1
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.05
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.03
598 0.03
599 0.04
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.1
604 0.15
605 0.16
606 0.25
607 0.32
608 0.35
609 0.36
610 0.4
611 0.4
612 0.4
613 0.4
614 0.35
615 0.29
616 0.25
617 0.24
618 0.2
619 0.2
620 0.16
621 0.16
622 0.14
623 0.11
624 0.12
625 0.11
626 0.14
627 0.12
628 0.13
629 0.12
630 0.12
631 0.12
632 0.1
633 0.1
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.04
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.04
662 0.06
663 0.05
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.07
674 0.08
675 0.08
676 0.09
677 0.09
678 0.1
679 0.12
680 0.17
681 0.21
682 0.21
683 0.21
684 0.21
685 0.23
686 0.24
687 0.23
688 0.21
689 0.17
690 0.23
691 0.23
692 0.24
693 0.27
694 0.27
695 0.29
696 0.28
697 0.33
698 0.35
699 0.39
700 0.44
701 0.47
702 0.49
703 0.52
704 0.52
705 0.48
706 0.4
707 0.35
708 0.28
709 0.2
710 0.16
711 0.11
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.09
717 0.14
718 0.2
719 0.21
720 0.23
721 0.25
722 0.28
723 0.33
724 0.32
725 0.3
726 0.3
727 0.31
728 0.33
729 0.32
730 0.32
731 0.32
732 0.3
733 0.27
734 0.22
735 0.25
736 0.21
737 0.23
738 0.25
739 0.21
740 0.27
741 0.34
742 0.35
743 0.32
744 0.32
745 0.3
746 0.27
747 0.26
748 0.25
749 0.19
750 0.24
751 0.3
752 0.31
753 0.32
754 0.32
755 0.37
756 0.38
757 0.44
758 0.46
759 0.4
760 0.43
761 0.46
762 0.51
763 0.47
764 0.42
765 0.34
766 0.28
767 0.27
768 0.27
769 0.26
770 0.22
771 0.19
772 0.19
773 0.2
774 0.22
775 0.21
776 0.27
777 0.29
778 0.34
779 0.4
780 0.42
781 0.41
782 0.44
783 0.48
784 0.47
785 0.5
786 0.55
787 0.57
788 0.65
789 0.72
790 0.69
791 0.72
792 0.74
793 0.73
794 0.74
795 0.72
796 0.68
797 0.71
798 0.77
799 0.79
800 0.77
801 0.71
802 0.64
803 0.6
804 0.54
805 0.48
806 0.46
807 0.41
808 0.39
809 0.39
810 0.38
811 0.36
812 0.35
813 0.32
814 0.24
815 0.21
816 0.21
817 0.17
818 0.15
819 0.16
820 0.18
821 0.23
822 0.29
823 0.3
824 0.33
825 0.38
826 0.41
827 0.42
828 0.43
829 0.39
830 0.42
831 0.49
832 0.5
833 0.55
834 0.61
835 0.68
836 0.76
837 0.79
838 0.76
839 0.72
840 0.65
841 0.62
842 0.58
843 0.5
844 0.44
845 0.4
846 0.36
847 0.32
848 0.31
849 0.27
850 0.27
851 0.34
852 0.35
853 0.43
854 0.51
855 0.59
856 0.67
857 0.75
858 0.78
859 0.77
860 0.82
861 0.78
862 0.76
863 0.72
864 0.68
865 0.68
866 0.65
867 0.66
868 0.65
869 0.61
870 0.56
871 0.61
872 0.64
873 0.65
874 0.7
875 0.72
876 0.74
877 0.82
878 0.88
879 0.87
880 0.87
881 0.86
882 0.86
883 0.87
884 0.82
885 0.79
886 0.75
887 0.74
888 0.72
889 0.7
890 0.69
891 0.7
892 0.73
893 0.74
894 0.78
895 0.79
896 0.81
897 0.78
898 0.78