FuNGI

A0A2T9YLK3

Protein Details

Accession

A0A2T9YLK3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic
1171-1195	ANERNNYASRQNRPRYNQNQGYNQG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAFYRWLIRKYPKIQTQVIEEKPIIIDGIEIPVDASKPNPNAFETDNLYLDMNGIVHPCCHPQDKPAPETEDEMMIEVFKCLDKVFCMIRPRKIIYMALDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEANLEMKKKVALKKQLLGSSDITEEPEEKAWDSNCITPGTPFMEKLAKSIRYYVAEKLNTDPAWGKLNIIISDSNVPGEGEHKLMDFIRNQRSSPGYNPNTTHVLYGLDADLIMLALATHEPHFKILREDVFWKQGSNNGCRTCGGVGHFARECTASEAQIQAFKRRTSSLEQPHVFCNIDILREYLEVQLIPPNLKGSKWNPTKGPIVDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGALDKLISIWKTSMYSMGGYLTNNGDVDLSMVQVIMDQIAILESETFVNRKKREERMENSAPRPNITPKETTNNEPDSNSLSNQIENQNKLNRAAAIEIKKLLQNEDQKMLNRVAAMEIKKSIESESIDDSSKSEILDDTNNNAVNDDDNLNEGINTAHDTDKIDHLQDNIQSVKKSSNEKVNSEISDETRIDEIKADESIPFSESKDKIADTGEPETPTKRKIEEVIGDDNTEQETEDDILLSKKAHIESDSDEEMADEELLLQGTALTNKVSKNIDVSNGISVEKSALEASSNNEVVVQDTIVEDEEEEKPIDLPEEVIEDSIEILNKVDTVRLWEEGYKDRYYSQKFEISSQDHNEIRKIVKSYIEGLCWVLHYYYKGCASWGWYFPYHYSPLASDFVDMKTLDIKFELGEPLKPLEQLMSVLPAASKSSLPEPFSELMVSESSPILDFYPESFAIDLNGKKQFWQGVALLPFIDESRLLNSLRPLYPKLTESELIRNSDGYAIICVSSTNPLYEKMCEVYTKAIDEFILIENGPDSCIYAKLGRDLNFVPHTTFPSPLLSVGKPDVEQDSSISTKFEIPREHELSINQQKVENGTDGEVKPLNGDKIGNPVSQQGVKLLPGVKLPAPRLNAADKEFVYTNGRSGYTGGNRGQNYGNNRDFSHFYRQEGSDVNYERGYGGNQRGRNGVHEQREYTRFNPYSRNMNRGRQQGGYNGGQNSGQYHPRNDYNSRPQREYHDNGNSGNYYGKFPGGGHEGNQGYSNRGQSGYNYRGNNDRGNYGNRGYHHHQGNSGQGYRPQTSFQPGANERNNYASRQNRPRYNQNQGYNQGQGGNMPPNDGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.69
3	0.73
4	0.73
5	0.68
6	0.69
7	0.69
8	0.64
9	0.59
10	0.51
11	0.45
12	0.4
13	0.36
14	0.26
15	0.16
16	0.14
17	0.09
18	0.12
19	0.1
20	0.1
21	0.1
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.12
26	0.16
27	0.21
28	0.24
29	0.26
30	0.27
31	0.3
32	0.32
33	0.35
34	0.34
35	0.33
36	0.31
37	0.29
38	0.28
39	0.24
40	0.22
41	0.17
42	0.12
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.13
48	0.16
49	0.2
50	0.24
51	0.25
52	0.32
53	0.41
54	0.48
55	0.5
56	0.53
57	0.53
58	0.5
59	0.53
60	0.46
61	0.39
62	0.31
63	0.28
64	0.21
65	0.17
66	0.16
67	0.12
68	0.11
69	0.09
70	0.09
71	0.08
72	0.1
73	0.1
74	0.15
75	0.19
76	0.24
77	0.34
78	0.4
79	0.47
80	0.53
81	0.56
82	0.56
83	0.55
84	0.53
85	0.48
86	0.48
87	0.42
88	0.35
89	0.32
90	0.27
91	0.26
92	0.24
93	0.19
94	0.12
95	0.15
96	0.22
97	0.29
98	0.39
99	0.47
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.81
105	0.78
106	0.75
107	0.75
108	0.73
109	0.69
110	0.66
111	0.61
112	0.58
113	0.57
114	0.52
115	0.41
116	0.34
117	0.32
118	0.33
119	0.36
120	0.4
121	0.47
122	0.52
123	0.59
124	0.65
125	0.66
126	0.61
127	0.57
128	0.5
129	0.42
130	0.37
131	0.3
132	0.24
133	0.2
134	0.19
135	0.17
136	0.17
137	0.16
138	0.15
139	0.18
140	0.17
141	0.21
142	0.22
143	0.24
144	0.25
145	0.25
146	0.25
147	0.22
148	0.24
149	0.25
150	0.24
151	0.2
152	0.21
153	0.25
154	0.25
155	0.29
156	0.34
157	0.33
158	0.33
159	0.37
160	0.39
161	0.38
162	0.4
163	0.42
164	0.42
165	0.4
166	0.4
167	0.39
168	0.41
169	0.36
170	0.36
171	0.32
172	0.25
173	0.28
174	0.27
175	0.24
176	0.2
177	0.24
178	0.22
179	0.22
180	0.2
181	0.17
182	0.2
183	0.19
184	0.17
185	0.14
186	0.13
187	0.11
188	0.12
189	0.12
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.12
195	0.15
196	0.19
197	0.25
198	0.33
199	0.35
200	0.35
201	0.38
202	0.41
203	0.41
204	0.42
205	0.46
206	0.41
207	0.44
208	0.46
209	0.45
210	0.45
211	0.42
212	0.37
213	0.26
214	0.23
215	0.18
216	0.17
217	0.13
218	0.09
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.05
223	0.04
224	0.03
225	0.02
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.06
230	0.08
231	0.08
232	0.12
233	0.14
234	0.15
235	0.19
236	0.23
237	0.25
238	0.27
239	0.3
240	0.31
241	0.35
242	0.35
243	0.32
244	0.27
245	0.29
246	0.31
247	0.32
248	0.36
249	0.32
250	0.33
251	0.32
252	0.33
253	0.3
254	0.27
255	0.24
256	0.25
257	0.23
258	0.27
259	0.28
260	0.26
261	0.26
262	0.24
263	0.22
264	0.19
265	0.19
266	0.15
267	0.16
268	0.17
269	0.17
270	0.22
271	0.22
272	0.24
273	0.27
274	0.27
275	0.28
276	0.29
277	0.32
278	0.33
279	0.42
280	0.44
281	0.5
282	0.52
283	0.51
284	0.51
285	0.5
286	0.44
287	0.34
288	0.29
289	0.2
290	0.18
291	0.17
292	0.16
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.11
297	0.11
298	0.09
299	0.09
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.13
304	0.15
305	0.15
306	0.16
307	0.21
308	0.21
309	0.3
310	0.37
311	0.41
312	0.4
313	0.44
314	0.5
315	0.45
316	0.45
317	0.39
318	0.37
319	0.35
320	0.33
321	0.3
322	0.24
323	0.23
324	0.2
325	0.15
326	0.1
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.09
345	0.12
346	0.13
347	0.13
348	0.12
349	0.14
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.09
354	0.07
355	0.09
356	0.11
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.12
362	0.12
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.12
368	0.11
369	0.1
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.06
377	0.08
378	0.06
379	0.06
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.05
396	0.07
397	0.11
398	0.19
399	0.21
400	0.28
401	0.34
402	0.42
403	0.52
404	0.6
405	0.61
406	0.63
407	0.71
408	0.7
409	0.67
410	0.64
411	0.55
412	0.47
413	0.45
414	0.41
415	0.36
416	0.33
417	0.33
418	0.3
419	0.39
420	0.4
421	0.4
422	0.41
423	0.4
424	0.38
425	0.34
426	0.32
427	0.29
428	0.27
429	0.24
430	0.22
431	0.17
432	0.17
433	0.19
434	0.24
435	0.23
436	0.24
437	0.28
438	0.29
439	0.3
440	0.31
441	0.3
442	0.24
443	0.21
444	0.21
445	0.22
446	0.21
447	0.2
448	0.2
449	0.2
450	0.21
451	0.2
452	0.21
453	0.21
454	0.25
455	0.26
456	0.29
457	0.31
458	0.3
459	0.33
460	0.31
461	0.25
462	0.19
463	0.16
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.14
468	0.15
469	0.15
470	0.15
471	0.15
472	0.14
473	0.12
474	0.12
475	0.13
476	0.14
477	0.15
478	0.16
479	0.15
480	0.15
481	0.14
482	0.13
483	0.11
484	0.09
485	0.07
486	0.08
487	0.12
488	0.12
489	0.13
490	0.15
491	0.16
492	0.16
493	0.15
494	0.14
495	0.11
496	0.12
497	0.1
498	0.08
499	0.07
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.09
511	0.1
512	0.13
513	0.14
514	0.14
515	0.13
516	0.14
517	0.15
518	0.15
519	0.16
520	0.15
521	0.16
522	0.15
523	0.15
524	0.18
525	0.19
526	0.23
527	0.24
528	0.31
529	0.33
530	0.35
531	0.38
532	0.38
533	0.34
534	0.32
535	0.29
536	0.21
537	0.21
538	0.19
539	0.16
540	0.14
541	0.14
542	0.12
543	0.12
544	0.11
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.09
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.14
555	0.14
556	0.15
557	0.16
558	0.15
559	0.15
560	0.15
561	0.16
562	0.13
563	0.16
564	0.15
565	0.16
566	0.16
567	0.18
568	0.18
569	0.18
570	0.17
571	0.15
572	0.15
573	0.16
574	0.2
575	0.22
576	0.24
577	0.27
578	0.26
579	0.25
580	0.24
581	0.21
582	0.17
583	0.13
584	0.09
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.09
599	0.1
600	0.12
601	0.16
602	0.16
603	0.14
604	0.14
605	0.13
606	0.13
607	0.11
608	0.08
609	0.04
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.02
616	0.03
617	0.03
618	0.04
619	0.04
620	0.06
621	0.06
622	0.1
623	0.11
624	0.11
625	0.13
626	0.14
627	0.15
628	0.15
629	0.16
630	0.14
631	0.14
632	0.14
633	0.11
634	0.1
635	0.08
636	0.07
637	0.06
638	0.05
639	0.04
640	0.05
641	0.05
642	0.08
643	0.1
644	0.11
645	0.1
646	0.1
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.08
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.04
657	0.06
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.08
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.06
666	0.06
667	0.05
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.09
684	0.1
685	0.11
686	0.12
687	0.13
688	0.15
689	0.2
690	0.24
691	0.21
692	0.2
693	0.21
694	0.27
695	0.29
696	0.3
697	0.28
698	0.29
699	0.29
700	0.32
701	0.36
702	0.33
703	0.33
704	0.32
705	0.34
706	0.31
707	0.31
708	0.3
709	0.26
710	0.24
711	0.23
712	0.23
713	0.19
714	0.2
715	0.2
716	0.24
717	0.23
718	0.22
719	0.19
720	0.18
721	0.17
722	0.14
723	0.14
724	0.09
725	0.08
726	0.09
727	0.09
728	0.11
729	0.13
730	0.12
731	0.12
732	0.13
733	0.16
734	0.19
735	0.2
736	0.2
737	0.2
738	0.21
739	0.22
740	0.24
741	0.22
742	0.19
743	0.17
744	0.14
745	0.17
746	0.17
747	0.16
748	0.14
749	0.13
750	0.13
751	0.14
752	0.13
753	0.1
754	0.13
755	0.13
756	0.12
757	0.11
758	0.11
759	0.09
760	0.1
761	0.13
762	0.1
763	0.11
764	0.12
765	0.14
766	0.14
767	0.14
768	0.13
769	0.1
770	0.1
771	0.1
772	0.09
773	0.09
774	0.08
775	0.08
776	0.08
777	0.08
778	0.08
779	0.08
780	0.08
781	0.07
782	0.12
783	0.15
784	0.16
785	0.17
786	0.2
787	0.2
788	0.2
789	0.19
790	0.15
791	0.13
792	0.12
793	0.12
794	0.08
795	0.07
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.06
800	0.06
801	0.06
802	0.07
803	0.1
804	0.1
805	0.11
806	0.1
807	0.1
808	0.11
809	0.14
810	0.14
811	0.14
812	0.18
813	0.17
814	0.18
815	0.2
816	0.21
817	0.18
818	0.21
819	0.18
820	0.2
821	0.21
822	0.2
823	0.18
824	0.16
825	0.15
826	0.12
827	0.11
828	0.06
829	0.06
830	0.07
831	0.1
832	0.1
833	0.12
834	0.14
835	0.19
836	0.21
837	0.23
838	0.24
839	0.24
840	0.26
841	0.26
842	0.26
843	0.25
844	0.25
845	0.25
846	0.3
847	0.31
848	0.31
849	0.3
850	0.28
851	0.24
852	0.23
853	0.21
854	0.13
855	0.1
856	0.08
857	0.08
858	0.08
859	0.07
860	0.07
861	0.09
862	0.09
863	0.1
864	0.1
865	0.13
866	0.14
867	0.15
868	0.17
869	0.16
870	0.16
871	0.16
872	0.16
873	0.18
874	0.18
875	0.18
876	0.17
877	0.15
878	0.14
879	0.13
880	0.14
881	0.1
882	0.1
883	0.08
884	0.08
885	0.08
886	0.08
887	0.08
888	0.07
889	0.06
890	0.06
891	0.07
892	0.09
893	0.11
894	0.12
895	0.16
896	0.22
897	0.22
898	0.25
899	0.25
900	0.29
901	0.3
902	0.3
903	0.27
904	0.23
905	0.27
906	0.25
907	0.25
908	0.21
909	0.2
910	0.2
911	0.2
912	0.22
913	0.18
914	0.19
915	0.2
916	0.2
917	0.17
918	0.18
919	0.18
920	0.16
921	0.16
922	0.14
923	0.16
924	0.16
925	0.16
926	0.16
927	0.14
928	0.18
929	0.21
930	0.24
931	0.25
932	0.29
933	0.38
934	0.42
935	0.42
936	0.38
937	0.37
938	0.42
939	0.46
940	0.44
941	0.36
942	0.33
943	0.33
944	0.34
945	0.34
946	0.26
947	0.18
948	0.16
949	0.21
950	0.2
951	0.22
952	0.21
953	0.18
954	0.19
955	0.2
956	0.2
957	0.16
958	0.17
959	0.14
960	0.22
961	0.25
962	0.23
963	0.21
964	0.23
965	0.25
966	0.26
967	0.25
968	0.19
969	0.17
970	0.17
971	0.2
972	0.2
973	0.17
974	0.17
975	0.2
976	0.21
977	0.24
978	0.27
979	0.3
980	0.3
981	0.31
982	0.33
983	0.35
984	0.36
985	0.34
986	0.36
987	0.3
988	0.31
989	0.29
990	0.28
991	0.28
992	0.24
993	0.24
994	0.22
995	0.22
996	0.19
997	0.2
998	0.24
999	0.24
1000	0.29
1001	0.3
1002	0.34
1003	0.34
1004	0.36
1005	0.37
1006	0.36
1007	0.38
1008	0.41
1009	0.43
1010	0.38
1011	0.4
1012	0.41
1013	0.41
1014	0.4
1015	0.45
1016	0.38
1017	0.36
1018	0.4
1019	0.39
1020	0.38
1021	0.38
1022	0.37
1023	0.34
1024	0.34
1025	0.34
1026	0.28
1027	0.27
1028	0.25
1029	0.22
1030	0.21
1031	0.2
1032	0.26
1033	0.3
1034	0.33
1035	0.35
1036	0.38
1037	0.38
1038	0.41
1039	0.43
1040	0.42
1041	0.43
1042	0.45
1043	0.47
1044	0.5
1045	0.55
1046	0.54
1047	0.48
1048	0.5
1049	0.45
1050	0.44
1051	0.48
1052	0.46
1053	0.51
1054	0.51
1055	0.59
1056	0.55
1057	0.61
1058	0.66
1059	0.65
1060	0.65
1061	0.58
1062	0.56
1063	0.52
1064	0.52
1065	0.47
1066	0.44
1067	0.38
1068	0.35
1069	0.31
1070	0.29
1071	0.26
1072	0.24
1073	0.28
1074	0.26
1075	0.29
1076	0.33
1077	0.39
1078	0.45
1079	0.46
1080	0.52
1081	0.55
1082	0.62
1083	0.65
1084	0.63
1085	0.6
1086	0.62
1087	0.66
1088	0.62
1089	0.61
1090	0.6
1091	0.56
1092	0.54
1093	0.55
1094	0.48
1095	0.4
1096	0.4
1097	0.31
1098	0.25
1099	0.23
1100	0.22
1101	0.19
1102	0.18
1103	0.22
1104	0.23
1105	0.23
1106	0.21
1107	0.27
1108	0.27
1109	0.27
1110	0.31
1111	0.27
1112	0.25
1113	0.28
1114	0.29
1115	0.23
1116	0.24
1117	0.23
1118	0.25
1119	0.33
1120	0.37
1121	0.4
1122	0.4
1123	0.4
1124	0.46
1125	0.5
1126	0.52
1127	0.45
1128	0.43
1129	0.41
1130	0.44
1131	0.47
1132	0.43
1133	0.44
1134	0.39
1135	0.44
1136	0.45
1137	0.48
1138	0.5
1139	0.48
1140	0.48
1141	0.47
1142	0.53
1143	0.52
1144	0.5
1145	0.44
1146	0.42
1147	0.45
1148	0.44
1149	0.42
1150	0.37
1151	0.34
1152	0.38
1153	0.38
1154	0.36
1155	0.4
1156	0.42
1157	0.49
1158	0.54
1159	0.54
1160	0.48
1161	0.53
1162	0.53
1163	0.47
1164	0.51
1165	0.5
1166	0.53
1167	0.6
1168	0.68
1169	0.69
1170	0.75
1171	0.83
1172	0.83
1173	0.85
1174	0.85
1175	0.82
1176	0.82
1177	0.78
1178	0.75
1179	0.67
1180	0.59
1181	0.5
1182	0.41
1183	0.34
1184	0.29
1185	0.31
1186	0.26

A0A2T9YLK3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer