Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YGL1

Protein Details
Accession A0A2T9YGL1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-440CKDKCKGECGCRREHKHRHRYEECGCKNEHKHRHRCKEDECRHRGICEHKKRHKFHPVKYMKRFDDCLBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016487  Lsm6/sSmF  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01726  LSm6  
Amino Acid Sequences MEENRSQKSPSEFLRKIIGNKVIVRLNSGIDYKGTLACLDGYMNIALENTEEYVNGILKNKYGDTFLRGNNDTRTINSYHKMRISLATFSLFVFHVKYARSGINNKYDNHKDIASISPPALGEFQAASQVLPAFNPSVYWENSACAPYDQSFISGTPVSYGNYFFIGLSPGNGPQEDMYEIAFGYNKYLTGIRKSLSAPFVASGQSLGIASQTYFSFYVFSERNGLFDVGIGKVGEQAGISIINYVDPNPLPWAQKWSGYGDGLYSWEDYLWQSFPVTEISTILETSYYTNTVLSPVTATTQTTATVDLTMPATSTQTIPSTLFSTMTSVLMQTTTPTEMSTNMNYITQTVLETVTIEDSVIVQTKTILKTECKDKCKGECGCRREHKHRHRYEECGCKNEHKHRHRCKEDECRHRGICEHKKRHKFHPVKYMKRFDDCLNNWKYNEMKPLHEKEVEIVADTDTKVEYI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.55
3 0.53
4 0.55
5 0.53
6 0.48
7 0.49
8 0.52
9 0.49
10 0.44
11 0.44
12 0.38
13 0.33
14 0.31
15 0.29
16 0.24
17 0.19
18 0.21
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.1
41 0.11
42 0.12
43 0.15
44 0.15
45 0.16
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.21
50 0.21
51 0.23
52 0.28
53 0.3
54 0.35
55 0.36
56 0.38
57 0.37
58 0.41
59 0.36
60 0.32
61 0.33
62 0.29
63 0.32
64 0.35
65 0.36
66 0.37
67 0.39
68 0.39
69 0.36
70 0.39
71 0.36
72 0.33
73 0.31
74 0.27
75 0.24
76 0.22
77 0.22
78 0.16
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.16
86 0.19
87 0.24
88 0.28
89 0.33
90 0.4
91 0.44
92 0.44
93 0.49
94 0.51
95 0.49
96 0.46
97 0.41
98 0.32
99 0.3
100 0.32
101 0.26
102 0.22
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.13
125 0.14
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.18
130 0.18
131 0.16
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.13
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.08
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.1
176 0.11
177 0.14
178 0.16
179 0.15
180 0.18
181 0.19
182 0.21
183 0.2
184 0.19
185 0.16
186 0.14
187 0.15
188 0.12
189 0.11
190 0.08
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.12
206 0.11
207 0.12
208 0.15
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.18
241 0.18
242 0.2
243 0.21
244 0.21
245 0.21
246 0.19
247 0.19
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.13
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.08
350 0.07
351 0.1
352 0.14
353 0.15
354 0.18
355 0.2
356 0.21
357 0.26
358 0.37
359 0.43
360 0.44
361 0.49
362 0.52
363 0.56
364 0.62
365 0.65
366 0.65
367 0.66
368 0.66
369 0.7
370 0.75
371 0.77
372 0.79
373 0.82
374 0.83
375 0.85
376 0.89
377 0.89
378 0.84
379 0.84
380 0.83
381 0.83
382 0.77
383 0.71
384 0.64
385 0.63
386 0.66
387 0.68
388 0.7
389 0.69
390 0.75
391 0.81
392 0.89
393 0.89
394 0.89
395 0.88
396 0.89
397 0.89
398 0.89
399 0.84
400 0.82
401 0.74
402 0.67
403 0.63
404 0.63
405 0.63
406 0.64
407 0.68
408 0.7
409 0.78
410 0.82
411 0.86
412 0.87
413 0.86
414 0.83
415 0.84
416 0.84
417 0.85
418 0.89
419 0.89
420 0.84
421 0.8
422 0.75
423 0.69
424 0.69
425 0.63
426 0.62
427 0.6
428 0.59
429 0.53
430 0.54
431 0.53
432 0.47
433 0.51
434 0.45
435 0.45
436 0.5
437 0.56
438 0.57
439 0.56
440 0.51
441 0.45
442 0.49
443 0.41
444 0.34
445 0.27
446 0.22
447 0.22
448 0.22
449 0.2