Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YIP0

Protein Details
Accession A0A2T9YIP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-102EANISKKLLRRRRPFQDLDKQTHydrophilic
352-376TEPKSEHSKHKIKPEINNENKKIRLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR045537  Lar7_xRRM  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0070034  F:telomerase RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
GO:1904868  P:telomerase catalytic core complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PF00076  RRM_1  
PF19977  xRRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
PS51939  XRRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSEIDRNEGGVAEEIVGQLEYYLSDWNLRKDEFLQAKIKEAPGGWIHINTFFEFPRLQNLYSKTIILPSLKLVAKNSKEIEANISKKLLRRRRPFQDLDKQTIDKRTVYVEGFIKPYTTAQSIKSLFENFFGKILFVNPYYDLEKNHFHGFAFIEFYNDNSATSCVTSINKAYNNEVIDTINLDELKNKLPNLRAWKKTDWEKLKMEYLNLQTLMQREIKRPFQIKDSSIIRVHGIHPESTVDTLVKLIAKKKPVDYVDHEKGSIFAYLIFQTPKDASKASEYFENKELYHKNSLDSKGSPQTDFNINELAPVLLEKNFHIRTKIIKGKEETNYWEHITYNPNSLYKINNSTEPKSEHSKHKIKPEINNENKKIRLDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.08
5 0.06
6 0.06
7 0.05
8 0.06
9 0.08
10 0.08
11 0.14
12 0.17
13 0.22
14 0.27
15 0.27
16 0.28
17 0.28
18 0.38
19 0.37
20 0.41
21 0.43
22 0.4
23 0.45
24 0.46
25 0.45
26 0.37
27 0.32
28 0.31
29 0.26
30 0.29
31 0.25
32 0.23
33 0.23
34 0.24
35 0.25
36 0.22
37 0.22
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.24
43 0.26
44 0.25
45 0.29
46 0.33
47 0.36
48 0.36
49 0.36
50 0.28
51 0.27
52 0.29
53 0.24
54 0.21
55 0.17
56 0.23
57 0.23
58 0.24
59 0.26
60 0.32
61 0.33
62 0.38
63 0.38
64 0.35
65 0.35
66 0.34
67 0.38
68 0.38
69 0.38
70 0.34
71 0.35
72 0.33
73 0.36
74 0.46
75 0.48
76 0.5
77 0.57
78 0.65
79 0.72
80 0.79
81 0.82
82 0.82
83 0.83
84 0.79
85 0.76
86 0.71
87 0.64
88 0.58
89 0.56
90 0.48
91 0.38
92 0.33
93 0.28
94 0.26
95 0.24
96 0.25
97 0.22
98 0.22
99 0.23
100 0.22
101 0.2
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.23
109 0.24
110 0.24
111 0.26
112 0.25
113 0.22
114 0.23
115 0.23
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.13
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.13
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.2
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.15
139 0.16
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.13
157 0.16
158 0.16
159 0.18
160 0.2
161 0.2
162 0.19
163 0.19
164 0.15
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.16
178 0.21
179 0.3
180 0.37
181 0.39
182 0.43
183 0.46
184 0.48
185 0.54
186 0.58
187 0.54
188 0.52
189 0.5
190 0.47
191 0.5
192 0.45
193 0.38
194 0.34
195 0.3
196 0.26
197 0.24
198 0.22
199 0.18
200 0.18
201 0.2
202 0.2
203 0.19
204 0.21
205 0.25
206 0.29
207 0.34
208 0.37
209 0.36
210 0.37
211 0.4
212 0.37
213 0.39
214 0.38
215 0.36
216 0.33
217 0.32
218 0.27
219 0.24
220 0.23
221 0.22
222 0.2
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.15
236 0.18
237 0.23
238 0.26
239 0.28
240 0.34
241 0.35
242 0.39
243 0.41
244 0.47
245 0.48
246 0.47
247 0.45
248 0.37
249 0.36
250 0.31
251 0.24
252 0.14
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.21
266 0.22
267 0.22
268 0.29
269 0.29
270 0.31
271 0.34
272 0.35
273 0.28
274 0.33
275 0.35
276 0.32
277 0.38
278 0.35
279 0.34
280 0.39
281 0.42
282 0.39
283 0.38
284 0.39
285 0.39
286 0.41
287 0.39
288 0.33
289 0.33
290 0.36
291 0.36
292 0.32
293 0.27
294 0.24
295 0.23
296 0.23
297 0.19
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.18
305 0.22
306 0.23
307 0.25
308 0.26
309 0.31
310 0.41
311 0.48
312 0.45
313 0.49
314 0.51
315 0.57
316 0.61
317 0.59
318 0.55
319 0.5
320 0.49
321 0.44
322 0.41
323 0.34
324 0.31
325 0.32
326 0.29
327 0.31
328 0.31
329 0.29
330 0.31
331 0.31
332 0.33
333 0.33
334 0.39
335 0.35
336 0.4
337 0.45
338 0.46
339 0.51
340 0.5
341 0.5
342 0.51
343 0.55
344 0.57
345 0.61
346 0.67
347 0.67
348 0.74
349 0.78
350 0.76
351 0.79
352 0.8
353 0.81
354 0.83
355 0.87
356 0.83
357 0.81
358 0.79