Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YNC0

Protein Details
Accession A0A2T9YNC0    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-246FFVGKGQQKAKKQTRTQREKVAVEHydrophilic
250-269TFAQPERQRRGPRNEARGGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-113SRGQGGRGRPRGAGGEGR
258-269RRGPRNEARGGR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADSIASKNIFDLLQDDAPDAEVSFNIVKPAAPKQTKPVAKPTAAPTEKRQQAPRSTQSVRGSHRGPPRDSNRDFAPREQSDREFQGRSQQGASRSRGQGGRGRPRGAGGEGRRAYDRHSATGLHDSEKKTKQGWMGDDQKVLKDGEVAAEQAVKDAEEGASTPAEPVEPEDTTKTLEEYLKEKMEKVKLVEGERKETRKANEGVDSSVLKATSVLVKEDEQFFVGKGQQKAKKQTRTQREKVAVEFTATFAQPERQRRGPRNEARGGRGGNTRGQRRTETLNVNDESAFPSLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.15
5 0.16
6 0.16
7 0.14
8 0.1
9 0.08
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.14
17 0.22
18 0.29
19 0.32
20 0.33
21 0.4
22 0.5
23 0.55
24 0.56
25 0.6
26 0.57
27 0.55
28 0.58
29 0.56
30 0.57
31 0.54
32 0.54
33 0.5
34 0.53
35 0.58
36 0.58
37 0.6
38 0.57
39 0.62
40 0.68
41 0.68
42 0.67
43 0.63
44 0.65
45 0.65
46 0.65
47 0.6
48 0.57
49 0.52
50 0.51
51 0.57
52 0.56
53 0.53
54 0.55
55 0.59
56 0.63
57 0.63
58 0.6
59 0.58
60 0.59
61 0.58
62 0.52
63 0.53
64 0.46
65 0.49
66 0.49
67 0.45
68 0.41
69 0.43
70 0.43
71 0.35
72 0.32
73 0.37
74 0.35
75 0.34
76 0.32
77 0.3
78 0.32
79 0.37
80 0.41
81 0.38
82 0.37
83 0.39
84 0.38
85 0.38
86 0.38
87 0.41
88 0.47
89 0.46
90 0.46
91 0.42
92 0.42
93 0.41
94 0.37
95 0.35
96 0.27
97 0.31
98 0.3
99 0.32
100 0.32
101 0.3
102 0.31
103 0.31
104 0.3
105 0.22
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.29
110 0.26
111 0.21
112 0.24
113 0.24
114 0.3
115 0.32
116 0.32
117 0.27
118 0.29
119 0.3
120 0.31
121 0.32
122 0.32
123 0.37
124 0.36
125 0.38
126 0.36
127 0.32
128 0.29
129 0.26
130 0.18
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.17
168 0.19
169 0.2
170 0.21
171 0.24
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.29
176 0.29
177 0.33
178 0.39
179 0.35
180 0.39
181 0.42
182 0.42
183 0.4
184 0.41
185 0.39
186 0.41
187 0.41
188 0.37
189 0.38
190 0.36
191 0.34
192 0.32
193 0.3
194 0.23
195 0.22
196 0.18
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.14
205 0.16
206 0.18
207 0.17
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.14
212 0.17
213 0.21
214 0.24
215 0.32
216 0.38
217 0.45
218 0.55
219 0.63
220 0.68
221 0.72
222 0.78
223 0.8
224 0.84
225 0.84
226 0.84
227 0.82
228 0.76
229 0.7
230 0.65
231 0.54
232 0.47
233 0.4
234 0.32
235 0.26
236 0.22
237 0.2
238 0.15
239 0.22
240 0.25
241 0.33
242 0.39
243 0.44
244 0.54
245 0.63
246 0.71
247 0.75
248 0.78
249 0.79
250 0.81
251 0.78
252 0.75
253 0.73
254 0.65
255 0.58
256 0.55
257 0.48
258 0.46
259 0.49
260 0.52
261 0.51
262 0.53
263 0.53
264 0.51
265 0.56
266 0.57
267 0.57
268 0.54
269 0.56
270 0.53
271 0.5
272 0.46
273 0.39
274 0.33