Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2T9YCU4

Protein Details
Accession A0A2T9YCU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
550-580LVLCWQWYTYPKRKNENKKTEKAEESNKKNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
562-580RKNENKKTEKAEESNKKNK
Subcellular Location(s) nucl 7.5, cyto_nucl 5.333, plas 5, E.R. 5, mito 3.5, cyto_mito 3.333, cyto 2, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008429  CLPTM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05602  CLPTM1  
Amino Acid Sequences MPSLNISNIITYCTYAFGLWYLSRIFSIGVQLYYPSLHIPLINETPKQIRSLPKHDLAWKKTHNYLVSLYTSKSEKISGIEFFETSDLVYRSQVFVPGDGRFLYENIESNNKPKKISNGLDLNINITLPSDFYQKNENSMYLYAIIHQKENIVENIDNTSSAVDVFDPLVLVTSSKLVLSRERTKDTKVQLLDEKAMNEKRVVEPQQVFHEPHAKTRVTLELVLERHRFPSWRFPSDIAPYIRVVRGSGKTPDYLPLFWENPLSTRSIHLKPLANYTKVAHKRIEGESMGSFETNVKINVVQLGWFRLCLMLTKTLAQFESPDSLIKASSEEIDNLKEMVYENDSRILLLTIIASVLHLIFEFLAYKEDISFWSQESKNDKQPEKLDDLKNSMSTDPKIIPNSSNENWKGISRSGVAMRTISSVVGTLYLWDQRQNTSILVVMSSFAGAAIEVWKFVMVAYAAYSLIYQKHNGYFSYIIHVLLSTVYLLEFIQMFPQLMINHKLKSVDSIPLVAFMYRFFTTFIDDLFAMVISMPTLTRIGTFRDDIVFLVLCWQWYTYPKRKNENKKTEKAEESNKKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.13
4 0.11
5 0.14
6 0.13
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.11
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.18
28 0.24
29 0.28
30 0.27
31 0.29
32 0.34
33 0.35
34 0.36
35 0.36
36 0.38
37 0.43
38 0.5
39 0.55
40 0.56
41 0.6
42 0.66
43 0.7
44 0.66
45 0.67
46 0.66
47 0.64
48 0.64
49 0.64
50 0.58
51 0.52
52 0.49
53 0.44
54 0.42
55 0.38
56 0.33
57 0.3
58 0.29
59 0.27
60 0.25
61 0.22
62 0.19
63 0.19
64 0.22
65 0.21
66 0.23
67 0.23
68 0.21
69 0.21
70 0.2
71 0.17
72 0.14
73 0.15
74 0.13
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.16
79 0.16
80 0.21
81 0.17
82 0.18
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.18
87 0.19
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.22
95 0.22
96 0.28
97 0.37
98 0.36
99 0.37
100 0.38
101 0.43
102 0.47
103 0.5
104 0.51
105 0.49
106 0.49
107 0.51
108 0.48
109 0.42
110 0.33
111 0.28
112 0.2
113 0.13
114 0.12
115 0.08
116 0.09
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.22
121 0.22
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.24
128 0.17
129 0.17
130 0.15
131 0.19
132 0.19
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.19
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.18
143 0.17
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.13
166 0.2
167 0.29
168 0.34
169 0.39
170 0.41
171 0.44
172 0.5
173 0.49
174 0.49
175 0.41
176 0.4
177 0.4
178 0.4
179 0.39
180 0.34
181 0.31
182 0.29
183 0.3
184 0.27
185 0.22
186 0.22
187 0.21
188 0.27
189 0.28
190 0.29
191 0.29
192 0.3
193 0.35
194 0.36
195 0.35
196 0.3
197 0.35
198 0.29
199 0.32
200 0.35
201 0.29
202 0.26
203 0.27
204 0.29
205 0.23
206 0.24
207 0.2
208 0.2
209 0.21
210 0.25
211 0.25
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.19
217 0.29
218 0.31
219 0.33
220 0.35
221 0.34
222 0.38
223 0.4
224 0.44
225 0.35
226 0.3
227 0.27
228 0.26
229 0.25
230 0.21
231 0.18
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.2
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.24
240 0.21
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.18
246 0.19
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.1
252 0.12
253 0.17
254 0.18
255 0.2
256 0.23
257 0.26
258 0.26
259 0.35
260 0.36
261 0.32
262 0.31
263 0.29
264 0.35
265 0.35
266 0.37
267 0.29
268 0.26
269 0.29
270 0.3
271 0.33
272 0.23
273 0.21
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.12
278 0.11
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.1
307 0.12
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.09
360 0.16
361 0.17
362 0.22
363 0.28
364 0.32
365 0.37
366 0.45
367 0.46
368 0.45
369 0.49
370 0.49
371 0.48
372 0.52
373 0.49
374 0.44
375 0.47
376 0.43
377 0.4
378 0.36
379 0.31
380 0.26
381 0.22
382 0.22
383 0.2
384 0.22
385 0.23
386 0.23
387 0.24
388 0.25
389 0.32
390 0.31
391 0.36
392 0.33
393 0.33
394 0.32
395 0.32
396 0.3
397 0.24
398 0.25
399 0.17
400 0.19
401 0.21
402 0.22
403 0.21
404 0.19
405 0.18
406 0.17
407 0.16
408 0.13
409 0.1
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.1
417 0.1
418 0.13
419 0.14
420 0.15
421 0.17
422 0.18
423 0.17
424 0.15
425 0.16
426 0.13
427 0.12
428 0.11
429 0.09
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.11
454 0.13
455 0.13
456 0.16
457 0.2
458 0.21
459 0.22
460 0.24
461 0.23
462 0.22
463 0.27
464 0.24
465 0.2
466 0.19
467 0.18
468 0.14
469 0.12
470 0.12
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.09
482 0.08
483 0.12
484 0.12
485 0.15
486 0.21
487 0.23
488 0.23
489 0.25
490 0.26
491 0.24
492 0.28
493 0.27
494 0.27
495 0.25
496 0.26
497 0.24
498 0.25
499 0.25
500 0.2
501 0.17
502 0.12
503 0.16
504 0.13
505 0.14
506 0.13
507 0.13
508 0.17
509 0.17
510 0.17
511 0.16
512 0.15
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.09
517 0.08
518 0.08
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.09
526 0.11
527 0.15
528 0.19
529 0.21
530 0.21
531 0.23
532 0.23
533 0.21
534 0.23
535 0.19
536 0.14
537 0.17
538 0.16
539 0.14
540 0.14
541 0.15
542 0.14
543 0.22
544 0.31
545 0.37
546 0.45
547 0.54
548 0.64
549 0.73
550 0.82
551 0.86
552 0.89
553 0.89
554 0.9
555 0.91
556 0.89
557 0.88
558 0.85
559 0.84
560 0.83