Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9Y5P3

Protein Details
Accession A0A2T9Y5P3    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-29STIGTRSSKKTEKNIPEKQDDKHydrophilic
34-56QQTPVKRGRGRPRKSVIQNQTEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-46RGRGRPR
227-243KSKRNLKFEEKAAKRKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MGNTKRKSTIGTRSSKKTEKNIPEKQDDKNTSVQQTPVKRGRGRPRKSVIQNQTEQPDLVEEKPKKIDSTTNIDESIKKIKPIENVCEPIEPKDESKVNETAKQETKDESKANEIVESNTKPEIKEEKDEQRHIIKKEDVLEKQSESTESELKETTNKVVSNNEESESEGSSSDSDGSSDEDGVDICERQDLPEHLKERAKKLALLRQKMGAGVMENKKDVYKEFEKSKRNLKFEEKAAKRKKTAQELLFKQEVEESGENYERIRSWDYSIEDVERYNAKEDAKKENTVVGFADWNDVAQRKYNKLVNELKPDMESYNYQKNVTNMIKNLNPDVAPTEEDVSLLLESNISKPTEHAIEKLSKSIID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.76
4 0.75
5 0.76
6 0.77
7 0.8
8 0.81
9 0.8
10 0.82
11 0.79
12 0.77
13 0.77
14 0.72
15 0.65
16 0.64
17 0.61
18 0.56
19 0.54
20 0.52
21 0.49
22 0.51
23 0.56
24 0.55
25 0.58
26 0.59
27 0.66
28 0.73
29 0.76
30 0.76
31 0.77
32 0.78
33 0.79
34 0.83
35 0.84
36 0.82
37 0.81
38 0.79
39 0.74
40 0.69
41 0.61
42 0.51
43 0.41
44 0.34
45 0.28
46 0.25
47 0.29
48 0.28
49 0.31
50 0.36
51 0.37
52 0.35
53 0.34
54 0.39
55 0.35
56 0.42
57 0.42
58 0.4
59 0.4
60 0.39
61 0.38
62 0.34
63 0.37
64 0.29
65 0.27
66 0.28
67 0.3
68 0.37
69 0.42
70 0.46
71 0.45
72 0.47
73 0.46
74 0.48
75 0.44
76 0.39
77 0.37
78 0.31
79 0.25
80 0.27
81 0.29
82 0.26
83 0.3
84 0.33
85 0.32
86 0.36
87 0.37
88 0.38
89 0.41
90 0.41
91 0.38
92 0.36
93 0.37
94 0.37
95 0.37
96 0.32
97 0.3
98 0.3
99 0.29
100 0.28
101 0.24
102 0.21
103 0.24
104 0.23
105 0.2
106 0.21
107 0.22
108 0.2
109 0.23
110 0.28
111 0.25
112 0.3
113 0.35
114 0.42
115 0.48
116 0.5
117 0.5
118 0.51
119 0.54
120 0.5
121 0.5
122 0.41
123 0.37
124 0.42
125 0.45
126 0.38
127 0.36
128 0.36
129 0.31
130 0.3
131 0.27
132 0.22
133 0.16
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.19
147 0.21
148 0.23
149 0.23
150 0.22
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.16
155 0.14
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.08
178 0.09
179 0.14
180 0.19
181 0.21
182 0.23
183 0.28
184 0.3
185 0.31
186 0.36
187 0.32
188 0.3
189 0.33
190 0.38
191 0.42
192 0.43
193 0.41
194 0.37
195 0.36
196 0.33
197 0.28
198 0.21
199 0.14
200 0.17
201 0.2
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.19
209 0.2
210 0.24
211 0.32
212 0.4
213 0.46
214 0.5
215 0.58
216 0.59
217 0.58
218 0.59
219 0.58
220 0.56
221 0.57
222 0.64
223 0.61
224 0.64
225 0.69
226 0.7
227 0.66
228 0.68
229 0.68
230 0.68
231 0.7
232 0.66
233 0.67
234 0.65
235 0.67
236 0.61
237 0.53
238 0.43
239 0.36
240 0.29
241 0.25
242 0.21
243 0.16
244 0.16
245 0.18
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.12
250 0.15
251 0.17
252 0.16
253 0.17
254 0.23
255 0.25
256 0.26
257 0.27
258 0.26
259 0.23
260 0.21
261 0.21
262 0.18
263 0.17
264 0.17
265 0.18
266 0.19
267 0.24
268 0.27
269 0.35
270 0.37
271 0.38
272 0.36
273 0.39
274 0.36
275 0.33
276 0.3
277 0.21
278 0.18
279 0.16
280 0.18
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.19
287 0.24
288 0.25
289 0.32
290 0.36
291 0.36
292 0.43
293 0.52
294 0.52
295 0.57
296 0.56
297 0.51
298 0.48
299 0.47
300 0.39
301 0.33
302 0.29
303 0.26
304 0.33
305 0.34
306 0.34
307 0.35
308 0.35
309 0.41
310 0.43
311 0.43
312 0.36
313 0.4
314 0.42
315 0.42
316 0.43
317 0.37
318 0.31
319 0.27
320 0.27
321 0.23
322 0.22
323 0.21
324 0.21
325 0.17
326 0.17
327 0.16
328 0.14
329 0.12
330 0.11
331 0.09
332 0.08
333 0.09
334 0.11
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.19
340 0.25
341 0.26
342 0.26
343 0.29
344 0.36
345 0.38
346 0.41