Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YH49

Protein Details
Accession A0A2T9YH49    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-454LIVTKGRGFTKEKNKKKKGSYAGGKITLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
434-444FTKEKNKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MNNELLQIVYAYLAQNGYTKAIDALEKESKAKNSSKSNSDSSSSDSDSSDSESEKEEKPKEEKKAESSSSDSDSSSSSSDSSSSDSDSSSSSDSDSDSDSSDSEKEEEKMKVVEEEKKSDSSSSSSDSDSSSSDSDSSSSDSDSSSDSDSEKEEEKKEEKKSDSSKEEKMEVVEEEKKSDSSSSSSDSDSSKETSKVEKKEDSSSSDSSSSSDSDSDSSSSDSESEKEEKKEVVKEDKKSDSSSSSSDSDSSSSDSDSESEKEETPKEEEKADSSSSDSSSSSDSDSDSSDSESEKEEEKKKVSSGSSSDTDGDDEREDEDLEMKSDNEPKPSHKRVNSEDSQSNSKRMKIEQMTPIKQNERKIPGTAPQQKTFKANDRTERRKSSTPFQRIKPEEVEFLNDQLKDNSYSAIANNDDYGMRAHNDLIVTKGRGFTKEKNKKKKGSYAGGKITLGSNSVKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.12
3 0.13
4 0.14
5 0.13
6 0.14
7 0.13
8 0.15
9 0.16
10 0.15
11 0.21
12 0.25
13 0.27
14 0.3
15 0.34
16 0.36
17 0.4
18 0.45
19 0.46
20 0.5
21 0.56
22 0.6
23 0.61
24 0.63
25 0.61
26 0.58
27 0.51
28 0.46
29 0.44
30 0.39
31 0.34
32 0.29
33 0.26
34 0.23
35 0.25
36 0.21
37 0.17
38 0.16
39 0.18
40 0.21
41 0.25
42 0.32
43 0.33
44 0.38
45 0.45
46 0.53
47 0.58
48 0.63
49 0.64
50 0.63
51 0.68
52 0.65
53 0.61
54 0.58
55 0.52
56 0.48
57 0.43
58 0.36
59 0.27
60 0.25
61 0.22
62 0.18
63 0.15
64 0.12
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.19
98 0.23
99 0.24
100 0.31
101 0.3
102 0.34
103 0.35
104 0.36
105 0.36
106 0.32
107 0.3
108 0.25
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.16
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.16
139 0.18
140 0.19
141 0.23
142 0.28
143 0.34
144 0.39
145 0.44
146 0.44
147 0.49
148 0.54
149 0.57
150 0.6
151 0.58
152 0.58
153 0.53
154 0.52
155 0.44
156 0.38
157 0.31
158 0.24
159 0.23
160 0.23
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.19
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.18
177 0.18
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.23
182 0.29
183 0.32
184 0.36
185 0.38
186 0.39
187 0.44
188 0.45
189 0.42
190 0.4
191 0.36
192 0.33
193 0.3
194 0.27
195 0.22
196 0.21
197 0.16
198 0.12
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.14
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.24
219 0.25
220 0.32
221 0.35
222 0.38
223 0.42
224 0.45
225 0.45
226 0.42
227 0.4
228 0.33
229 0.29
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.21
234 0.2
235 0.19
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.13
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.2
253 0.22
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.22
259 0.21
260 0.17
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.15
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.15
283 0.2
284 0.25
285 0.28
286 0.3
287 0.3
288 0.3
289 0.33
290 0.31
291 0.3
292 0.28
293 0.29
294 0.28
295 0.28
296 0.27
297 0.23
298 0.23
299 0.19
300 0.17
301 0.13
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.11
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.11
313 0.18
314 0.19
315 0.22
316 0.24
317 0.3
318 0.4
319 0.48
320 0.54
321 0.53
322 0.59
323 0.61
324 0.68
325 0.66
326 0.63
327 0.6
328 0.55
329 0.58
330 0.53
331 0.53
332 0.46
333 0.45
334 0.41
335 0.38
336 0.43
337 0.4
338 0.45
339 0.47
340 0.55
341 0.56
342 0.57
343 0.61
344 0.59
345 0.58
346 0.57
347 0.56
348 0.54
349 0.52
350 0.5
351 0.48
352 0.47
353 0.54
354 0.58
355 0.56
356 0.56
357 0.57
358 0.56
359 0.58
360 0.57
361 0.56
362 0.56
363 0.57
364 0.6
365 0.66
366 0.74
367 0.77
368 0.8
369 0.77
370 0.75
371 0.73
372 0.73
373 0.74
374 0.75
375 0.74
376 0.72
377 0.76
378 0.72
379 0.73
380 0.68
381 0.61
382 0.55
383 0.48
384 0.47
385 0.37
386 0.36
387 0.35
388 0.29
389 0.27
390 0.24
391 0.25
392 0.23
393 0.22
394 0.19
395 0.16
396 0.17
397 0.16
398 0.19
399 0.18
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.15
406 0.13
407 0.13
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.18
414 0.2
415 0.21
416 0.22
417 0.27
418 0.26
419 0.3
420 0.36
421 0.42
422 0.48
423 0.57
424 0.66
425 0.73
426 0.81
427 0.86
428 0.89
429 0.9
430 0.89
431 0.89
432 0.88
433 0.87
434 0.86
435 0.81
436 0.72
437 0.62
438 0.54
439 0.44
440 0.36
441 0.29