Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QX73

Protein Details
Accession C4QX73    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-434NSTILFSKIKTRKKKKDRGKETKELFKKSHydrophilic
920-944ELERLEKSKERRIARKKLKEGLPVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-428KIKTRKKKKDRGKETK
923-938RLEKSKERRIARKKLK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0012  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MDVDFDNALNGQVGGFDQFFDGTTKHADNAIDFSDEEELADEEVGDAPQRRTDVDDEHKPPEGTYEMNLSGSEKEDLLFKNLEREASEGTELPLPTIGGLKVPNFDNNIGLNETISERNECNQISNSHFVKHLEKTMIRTQMLKYYYPSFQKSKPISFSSLFPPPLASFQLYDGRDCTPLLPLKALQEVDPDEKKIFKSSFSAHQSKGDKRSQSVKHIELMELESNNTQIPPRKQKETLKHLDRNIVLSTLSWDDTELLSDKLEERHNRNRTKPNFQQMQYDDWDVDTDMILEGTLDTSRLNLKLDMNDPHLLFLNQKHKPSPAGKMNARFPMNSKSFEMKFNISNDMQYQMLKDNYQSKIRSTIGNLSIDHSIPATILQTPFYKVKLSKQELRRFHRPVFNSRPNSTILFSKIKTRKKKKDRGKETKELFKKSVDLTLGDSASFFLLEYSEEQPVALSNFGMGSKLINYYRKLNDDDNSRPKLPVGETHVLGVQDRSPFWNFGFVEPGNLVPTFYNNMVRAPIFRHEPEETDFLLIRSSGGGISPRYFLRSLDHVFTVGQTFPVVDVPGPHSRKVTSTSKNRLKMIVYRVLNKNERHRLVVKDISIHFPDQNDMQNRQRLKEFMEYQKNGEDHGFWKIKGNEILPGFKEIQQMIQPEDIALLEAMQFGQLNLEDYDSLREETLIGQTTATTEEALQVQMAPWSTTKNFIQATQGKAMLQVHGIGDPSKKGEAISFLRISMKGGFKSSMEDIVEKAEQMDNKKSQGHSYNVAVQQKMYDEEISRVWYAQQRALSKTSDMMERELGPTEAPTASSVYDDQNQITEMAKTLEEFVLSPLQTTVSSVKPASIKEKKHMKITRMVRDQNGILQRRTQLVTDQKVIAAYIQRKQEQEKAEIDAEKISFTNDEEQNRRAKKILEEELERLEKSKERRIARKKLKEGLPVVSSLSNTDSDARLSGKGIGKGKSTSRRCATCGALGHIRTNKACPMYYSAMNKSNPNMSDLPVYDIQY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.23
17 0.23
18 0.2
19 0.18
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.15
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.1
33 0.12
34 0.13
35 0.16
36 0.17
37 0.17
38 0.2
39 0.24
40 0.3
41 0.35
42 0.44
43 0.46
44 0.49
45 0.53
46 0.5
47 0.46
48 0.41
49 0.35
50 0.26
51 0.24
52 0.25
53 0.21
54 0.22
55 0.22
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.18
60 0.13
61 0.12
62 0.16
63 0.17
64 0.2
65 0.22
66 0.2
67 0.26
68 0.27
69 0.29
70 0.25
71 0.26
72 0.25
73 0.25
74 0.27
75 0.19
76 0.2
77 0.23
78 0.21
79 0.19
80 0.17
81 0.14
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.18
90 0.22
91 0.23
92 0.23
93 0.24
94 0.23
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.18
99 0.15
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.19
106 0.24
107 0.23
108 0.25
109 0.26
110 0.29
111 0.31
112 0.38
113 0.36
114 0.33
115 0.35
116 0.35
117 0.36
118 0.36
119 0.36
120 0.36
121 0.36
122 0.41
123 0.46
124 0.5
125 0.46
126 0.45
127 0.41
128 0.41
129 0.42
130 0.38
131 0.34
132 0.32
133 0.37
134 0.39
135 0.43
136 0.41
137 0.42
138 0.51
139 0.53
140 0.55
141 0.56
142 0.54
143 0.54
144 0.5
145 0.49
146 0.45
147 0.46
148 0.4
149 0.33
150 0.32
151 0.27
152 0.28
153 0.28
154 0.23
155 0.17
156 0.19
157 0.27
158 0.25
159 0.25
160 0.24
161 0.23
162 0.23
163 0.22
164 0.19
165 0.18
166 0.21
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.23
171 0.27
172 0.27
173 0.21
174 0.21
175 0.24
176 0.28
177 0.28
178 0.28
179 0.25
180 0.27
181 0.27
182 0.3
183 0.27
184 0.23
185 0.26
186 0.28
187 0.36
188 0.42
189 0.46
190 0.42
191 0.49
192 0.53
193 0.55
194 0.59
195 0.57
196 0.52
197 0.5
198 0.59
199 0.56
200 0.59
201 0.6
202 0.54
203 0.53
204 0.51
205 0.47
206 0.39
207 0.37
208 0.31
209 0.23
210 0.22
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.18
217 0.26
218 0.36
219 0.41
220 0.47
221 0.54
222 0.63
223 0.71
224 0.74
225 0.76
226 0.75
227 0.77
228 0.73
229 0.73
230 0.65
231 0.57
232 0.48
233 0.38
234 0.28
235 0.21
236 0.2
237 0.15
238 0.14
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.13
250 0.2
251 0.24
252 0.3
253 0.4
254 0.49
255 0.56
256 0.63
257 0.7
258 0.7
259 0.75
260 0.76
261 0.76
262 0.75
263 0.7
264 0.7
265 0.62
266 0.6
267 0.53
268 0.46
269 0.35
270 0.27
271 0.26
272 0.17
273 0.15
274 0.09
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.07
287 0.08
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.16
292 0.2
293 0.22
294 0.24
295 0.27
296 0.25
297 0.24
298 0.23
299 0.2
300 0.19
301 0.22
302 0.27
303 0.28
304 0.3
305 0.31
306 0.32
307 0.38
308 0.4
309 0.42
310 0.41
311 0.46
312 0.49
313 0.53
314 0.57
315 0.58
316 0.55
317 0.47
318 0.42
319 0.42
320 0.4
321 0.36
322 0.34
323 0.32
324 0.33
325 0.35
326 0.35
327 0.29
328 0.3
329 0.29
330 0.3
331 0.25
332 0.25
333 0.22
334 0.21
335 0.18
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.14
340 0.13
341 0.15
342 0.2
343 0.23
344 0.29
345 0.29
346 0.27
347 0.31
348 0.32
349 0.32
350 0.28
351 0.32
352 0.29
353 0.31
354 0.3
355 0.25
356 0.25
357 0.23
358 0.21
359 0.14
360 0.1
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.09
367 0.1
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.17
372 0.16
373 0.23
374 0.32
375 0.37
376 0.43
377 0.51
378 0.59
379 0.65
380 0.72
381 0.74
382 0.69
383 0.68
384 0.67
385 0.61
386 0.62
387 0.63
388 0.65
389 0.61
390 0.58
391 0.54
392 0.49
393 0.47
394 0.39
395 0.31
396 0.26
397 0.24
398 0.23
399 0.31
400 0.37
401 0.44
402 0.53
403 0.61
404 0.68
405 0.75
406 0.85
407 0.86
408 0.9
409 0.92
410 0.93
411 0.91
412 0.9
413 0.85
414 0.85
415 0.81
416 0.74
417 0.64
418 0.54
419 0.47
420 0.38
421 0.36
422 0.27
423 0.21
424 0.18
425 0.19
426 0.18
427 0.15
428 0.14
429 0.1
430 0.09
431 0.08
432 0.06
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.06
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.06
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.07
454 0.1
455 0.13
456 0.14
457 0.19
458 0.22
459 0.25
460 0.27
461 0.27
462 0.29
463 0.32
464 0.38
465 0.4
466 0.42
467 0.39
468 0.36
469 0.34
470 0.33
471 0.27
472 0.24
473 0.24
474 0.22
475 0.22
476 0.22
477 0.23
478 0.21
479 0.2
480 0.16
481 0.11
482 0.09
483 0.09
484 0.11
485 0.11
486 0.12
487 0.12
488 0.17
489 0.16
490 0.15
491 0.19
492 0.17
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.11
497 0.1
498 0.1
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.11
504 0.1
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.14
511 0.14
512 0.14
513 0.18
514 0.17
515 0.19
516 0.21
517 0.21
518 0.19
519 0.17
520 0.17
521 0.13
522 0.13
523 0.11
524 0.08
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.09
533 0.09
534 0.11
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.17
539 0.18
540 0.18
541 0.19
542 0.17
543 0.16
544 0.16
545 0.15
546 0.1
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.1
556 0.18
557 0.19
558 0.2
559 0.2
560 0.21
561 0.23
562 0.28
563 0.31
564 0.32
565 0.4
566 0.49
567 0.57
568 0.61
569 0.61
570 0.57
571 0.52
572 0.49
573 0.46
574 0.43
575 0.37
576 0.39
577 0.42
578 0.46
579 0.5
580 0.48
581 0.51
582 0.51
583 0.51
584 0.49
585 0.48
586 0.45
587 0.45
588 0.45
589 0.37
590 0.33
591 0.33
592 0.32
593 0.3
594 0.28
595 0.22
596 0.19
597 0.19
598 0.16
599 0.2
600 0.2
601 0.23
602 0.27
603 0.31
604 0.32
605 0.33
606 0.33
607 0.29
608 0.29
609 0.33
610 0.34
611 0.38
612 0.46
613 0.45
614 0.45
615 0.48
616 0.44
617 0.37
618 0.32
619 0.24
620 0.16
621 0.22
622 0.22
623 0.18
624 0.24
625 0.24
626 0.27
627 0.28
628 0.28
629 0.25
630 0.25
631 0.28
632 0.22
633 0.24
634 0.22
635 0.22
636 0.24
637 0.19
638 0.2
639 0.2
640 0.21
641 0.19
642 0.18
643 0.15
644 0.13
645 0.13
646 0.11
647 0.08
648 0.06
649 0.05
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.03
656 0.04
657 0.04
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.09
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.11
671 0.1
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.1
677 0.1
678 0.07
679 0.06
680 0.07
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.08
688 0.07
689 0.07
690 0.11
691 0.11
692 0.15
693 0.16
694 0.2
695 0.2
696 0.2
697 0.28
698 0.29
699 0.33
700 0.32
701 0.32
702 0.27
703 0.28
704 0.28
705 0.2
706 0.16
707 0.13
708 0.11
709 0.1
710 0.11
711 0.1
712 0.1
713 0.11
714 0.12
715 0.11
716 0.11
717 0.11
718 0.11
719 0.16
720 0.19
721 0.23
722 0.22
723 0.22
724 0.24
725 0.24
726 0.25
727 0.24
728 0.24
729 0.19
730 0.21
731 0.21
732 0.19
733 0.23
734 0.22
735 0.21
736 0.18
737 0.18
738 0.16
739 0.19
740 0.18
741 0.15
742 0.15
743 0.14
744 0.15
745 0.19
746 0.25
747 0.25
748 0.27
749 0.32
750 0.31
751 0.35
752 0.39
753 0.39
754 0.35
755 0.36
756 0.41
757 0.42
758 0.45
759 0.39
760 0.33
761 0.3
762 0.27
763 0.26
764 0.2
765 0.16
766 0.14
767 0.16
768 0.17
769 0.18
770 0.17
771 0.16
772 0.17
773 0.2
774 0.21
775 0.24
776 0.28
777 0.28
778 0.31
779 0.34
780 0.33
781 0.29
782 0.29
783 0.27
784 0.27
785 0.25
786 0.23
787 0.23
788 0.23
789 0.23
790 0.21
791 0.19
792 0.15
793 0.14
794 0.13
795 0.11
796 0.11
797 0.1
798 0.1
799 0.1
800 0.11
801 0.12
802 0.13
803 0.16
804 0.17
805 0.16
806 0.16
807 0.16
808 0.16
809 0.15
810 0.13
811 0.1
812 0.11
813 0.11
814 0.1
815 0.12
816 0.11
817 0.11
818 0.11
819 0.12
820 0.15
821 0.15
822 0.15
823 0.13
824 0.13
825 0.13
826 0.15
827 0.16
828 0.13
829 0.16
830 0.16
831 0.19
832 0.21
833 0.23
834 0.31
835 0.36
836 0.39
837 0.45
838 0.56
839 0.57
840 0.65
841 0.69
842 0.64
843 0.65
844 0.71
845 0.72
846 0.71
847 0.72
848 0.65
849 0.63
850 0.59
851 0.56
852 0.56
853 0.5
854 0.41
855 0.4
856 0.4
857 0.4
858 0.4
859 0.33
860 0.32
861 0.37
862 0.4
863 0.4
864 0.39
865 0.35
866 0.34
867 0.33
868 0.28
869 0.26
870 0.25
871 0.26
872 0.33
873 0.36
874 0.38
875 0.43
876 0.47
877 0.45
878 0.46
879 0.44
880 0.42
881 0.42
882 0.41
883 0.37
884 0.34
885 0.29
886 0.24
887 0.21
888 0.18
889 0.14
890 0.14
891 0.22
892 0.23
893 0.3
894 0.33
895 0.37
896 0.45
897 0.48
898 0.48
899 0.44
900 0.43
901 0.44
902 0.49
903 0.54
904 0.52
905 0.53
906 0.54
907 0.57
908 0.56
909 0.49
910 0.41
911 0.35
912 0.34
913 0.35
914 0.41
915 0.42
916 0.48
917 0.59
918 0.68
919 0.76
920 0.82
921 0.87
922 0.86
923 0.88
924 0.86
925 0.85
926 0.79
927 0.74
928 0.65
929 0.55
930 0.48
931 0.4
932 0.33
933 0.25
934 0.23
935 0.17
936 0.16
937 0.17
938 0.16
939 0.15
940 0.17
941 0.17
942 0.16
943 0.17
944 0.22
945 0.25
946 0.31
947 0.35
948 0.36
949 0.37
950 0.41
951 0.49
952 0.53
953 0.53
954 0.57
955 0.6
956 0.62
957 0.62
958 0.63
959 0.58
960 0.54
961 0.53
962 0.49
963 0.48
964 0.45
965 0.49
966 0.49
967 0.49
968 0.45
969 0.44
970 0.43
971 0.4
972 0.39
973 0.35
974 0.38
975 0.38
976 0.43
977 0.46
978 0.47
979 0.5
980 0.52
981 0.52
982 0.49
983 0.51
984 0.45
985 0.43
986 0.39
987 0.33
988 0.37
989 0.34
990 0.36