Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9Y2F6

Protein Details
Accession A0A2T9Y2F6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
480-503DIEYTVKAKKKRRKRTANIYENYGHydrophilic
958-984LTPFGSRKQPQMQRQRQRPQPVIRGRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
486-494KAKKKRRKR
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5, mito 4, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044765  DDX47/Rrp3_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR005824  KOW  
IPR041973  KOW_Spt5_1  
IPR041976  KOW_Spt5_3  
IPR041977  KOW_Spt5_4  
IPR041978  KOW_Spt5_5  
IPR005100  NGN-domain  
IPR036735  NGN_dom_sf  
IPR039385  NGN_Euk  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR005825  Ribosomal_L24/26_CS  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF00467  KOW  
PF03439  Spt5-NGN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
PS01108  RIBOSOMAL_L24  
CDD cd17954  DEADc_DDX47  
cd06081  KOW_Spt5_1  
cd06083  KOW_Spt5_3  
cd06084  KOW_Spt5_4  
cd06085  KOW_Spt5_5  
cd09888  NGN_Euk  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDQPQTSDSATVTFAQLGVMPQLCEACEKVGYKAPSDIQKEAIPWALKNRDIIGLAQTGSGKTAAFAIPILQALWENPSGLFACVMAPTRELAYQISEAFESLGAAIGARSVVIVGGMDMVTQALSLSKKPHIIVCTPGRLKDHLENTKGFSLRTLKYLVMDEADRLLDMDFGPQIEDILKVIPQERNTFLFSATMTTKVAKLQRASLRNPVKVEVSSKYSTVDKLIQNYIFFPSKFKDTYLVWFINEIVGKSTIVFSHTVHEVMRLGMLLRSLGMDAIPLHGQLTMERRLGALNKFKSGTRKILIATDVASRGLDIPTVDFVINYDMPTNSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELLQRIETAIGKKMTEFPYEKDQVMLLQERVTEAQRIAISELKEFQSKNTKTDFEEELRALKQSYKKTKTSTEDYDQDDEHTEDSANHDIQQQDYSEEESDDQDYQTNSRRKRSDDEQDDIEYTVKAKKKRRKRTANIYENYGSRRRTATVAEHVPKQFLLPGVQDPHLWMVKCSIGKERDVVFQLMRRFAEKANSGQPLGIFSAYCRNGLSGVVYLEANSQADVQIALERTAGILSQKLMLVPIDQMVDVIRIKRKDQSIQPGAWVRVKRGKYAGDLAQVLSIIDSTDSAELKLGYLEKEFKLVSLQTDKVNPTLEEITLFSAGDSEALTEAAMAAAAASALENRDDNDKNSASFNLGDKVKVIEGDLIGVSGTVVTLESDGIYKVKINLDQEKNKTQRNIRQTVMSFRSRQLSKLFREGDHVKVLRGKHAGMTGTVVAISGIIVTLISDLSMTEIKVFARDLQQSKEVSVSVQNSTFEKNDLVTLDGGRTVAIVLAMEKGLYKVLDQNGDVSTIKSYEAAPTRGNPKFNVAIDVGGNEIKVNDVVRETNGSNRSGVIIQLNRFVAFVRSENVVENGGIFVSRVRNLAGSAPQKDNLTPFGSRKQPQMQRQRQRPQPVIRGRDQLLGKTVLITRGPFKGYMGVVKNSTATMAKVELYTSAKMINVERDKLNIKMNDGRVVPASSFGDNGYNRNNSGGRGSTGSSPFPGANTPNFQPGTPFGGSWGNNSGVSGSPAWNSSGGSGGASWGGSGVSSSTPAWGGDNTSIGSGSMPQTPGVAWNSSSKTGDTAWSSTEPAGTGNNDSWGSGSGNKGSGFGGRMDVPQTPGVPTPAPSNIPETPSNAGWGSSLTGSESVGGGWSGGGGGSSWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.12
4 0.11
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.13
14 0.17
15 0.18
16 0.21
17 0.27
18 0.29
19 0.29
20 0.34
21 0.37
22 0.41
23 0.45
24 0.44
25 0.4
26 0.4
27 0.39
28 0.37
29 0.38
30 0.31
31 0.28
32 0.35
33 0.37
34 0.36
35 0.38
36 0.37
37 0.34
38 0.33
39 0.33
40 0.27
41 0.24
42 0.22
43 0.22
44 0.21
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.1
89 0.07
90 0.08
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.06
112 0.08
113 0.1
114 0.14
115 0.18
116 0.22
117 0.23
118 0.28
119 0.3
120 0.31
121 0.38
122 0.41
123 0.48
124 0.47
125 0.49
126 0.47
127 0.45
128 0.48
129 0.48
130 0.51
131 0.49
132 0.51
133 0.49
134 0.51
135 0.55
136 0.5
137 0.42
138 0.37
139 0.36
140 0.33
141 0.34
142 0.31
143 0.26
144 0.27
145 0.29
146 0.25
147 0.21
148 0.2
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.14
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.13
170 0.17
171 0.2
172 0.24
173 0.26
174 0.28
175 0.3
176 0.3
177 0.26
178 0.23
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.17
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.2
187 0.25
188 0.26
189 0.27
190 0.34
191 0.41
192 0.47
193 0.5
194 0.54
195 0.58
196 0.57
197 0.57
198 0.51
199 0.45
200 0.41
201 0.41
202 0.35
203 0.33
204 0.3
205 0.28
206 0.28
207 0.27
208 0.26
209 0.26
210 0.28
211 0.25
212 0.28
213 0.33
214 0.32
215 0.31
216 0.32
217 0.33
218 0.3
219 0.27
220 0.26
221 0.23
222 0.27
223 0.27
224 0.27
225 0.26
226 0.24
227 0.3
228 0.34
229 0.32
230 0.27
231 0.27
232 0.26
233 0.25
234 0.24
235 0.18
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.13
246 0.14
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.12
252 0.12
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.14
273 0.16
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.22
279 0.26
280 0.3
281 0.29
282 0.32
283 0.33
284 0.35
285 0.41
286 0.42
287 0.43
288 0.36
289 0.37
290 0.34
291 0.36
292 0.35
293 0.28
294 0.24
295 0.2
296 0.18
297 0.16
298 0.14
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.16
318 0.13
319 0.15
320 0.16
321 0.21
322 0.29
323 0.33
324 0.34
325 0.35
326 0.38
327 0.41
328 0.46
329 0.45
330 0.39
331 0.42
332 0.42
333 0.4
334 0.41
335 0.38
336 0.31
337 0.3
338 0.28
339 0.21
340 0.21
341 0.21
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.22
361 0.24
362 0.28
363 0.28
364 0.26
365 0.34
366 0.37
367 0.36
368 0.3
369 0.27
370 0.23
371 0.24
372 0.23
373 0.15
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.1
381 0.13
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.15
388 0.18
389 0.16
390 0.18
391 0.18
392 0.2
393 0.27
394 0.28
395 0.3
396 0.32
397 0.32
398 0.32
399 0.36
400 0.37
401 0.29
402 0.31
403 0.28
404 0.26
405 0.25
406 0.24
407 0.2
408 0.2
409 0.24
410 0.29
411 0.39
412 0.43
413 0.47
414 0.5
415 0.58
416 0.59
417 0.6
418 0.58
419 0.54
420 0.53
421 0.52
422 0.5
423 0.42
424 0.37
425 0.32
426 0.25
427 0.19
428 0.14
429 0.11
430 0.09
431 0.11
432 0.13
433 0.11
434 0.12
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.16
439 0.13
440 0.11
441 0.12
442 0.13
443 0.11
444 0.11
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.12
453 0.19
454 0.25
455 0.27
456 0.34
457 0.38
458 0.4
459 0.46
460 0.52
461 0.54
462 0.54
463 0.55
464 0.5
465 0.48
466 0.45
467 0.39
468 0.32
469 0.21
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.23
474 0.31
475 0.4
476 0.51
477 0.62
478 0.72
479 0.78
480 0.84
481 0.89
482 0.91
483 0.92
484 0.84
485 0.78
486 0.7
487 0.61
488 0.55
489 0.48
490 0.37
491 0.28
492 0.28
493 0.23
494 0.22
495 0.23
496 0.23
497 0.26
498 0.32
499 0.33
500 0.36
501 0.35
502 0.34
503 0.31
504 0.26
505 0.21
506 0.14
507 0.13
508 0.1
509 0.12
510 0.14
511 0.15
512 0.15
513 0.14
514 0.16
515 0.17
516 0.15
517 0.13
518 0.12
519 0.14
520 0.15
521 0.16
522 0.2
523 0.19
524 0.2
525 0.23
526 0.23
527 0.23
528 0.24
529 0.24
530 0.19
531 0.21
532 0.22
533 0.21
534 0.2
535 0.18
536 0.17
537 0.17
538 0.21
539 0.19
540 0.2
541 0.23
542 0.24
543 0.23
544 0.22
545 0.21
546 0.17
547 0.16
548 0.13
549 0.08
550 0.07
551 0.14
552 0.14
553 0.14
554 0.13
555 0.12
556 0.12
557 0.13
558 0.13
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.04
570 0.05
571 0.04
572 0.04
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.06
586 0.05
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.07
597 0.07
598 0.08
599 0.11
600 0.12
601 0.13
602 0.18
603 0.2
604 0.24
605 0.29
606 0.36
607 0.37
608 0.37
609 0.39
610 0.38
611 0.37
612 0.36
613 0.32
614 0.25
615 0.27
616 0.28
617 0.26
618 0.27
619 0.27
620 0.25
621 0.28
622 0.28
623 0.23
624 0.23
625 0.21
626 0.18
627 0.16
628 0.13
629 0.09
630 0.07
631 0.04
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.04
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.07
645 0.09
646 0.09
647 0.11
648 0.11
649 0.1
650 0.11
651 0.11
652 0.12
653 0.14
654 0.15
655 0.15
656 0.18
657 0.18
658 0.18
659 0.19
660 0.16
661 0.15
662 0.15
663 0.13
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.1
668 0.09
669 0.07
670 0.06
671 0.06
672 0.05
673 0.05
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.03
679 0.03
680 0.03
681 0.03
682 0.02
683 0.02
684 0.02
685 0.02
686 0.02
687 0.02
688 0.02
689 0.03
690 0.03
691 0.04
692 0.04
693 0.09
694 0.11
695 0.12
696 0.16
697 0.17
698 0.17
699 0.18
700 0.18
701 0.15
702 0.15
703 0.15
704 0.15
705 0.15
706 0.14
707 0.14
708 0.15
709 0.13
710 0.12
711 0.11
712 0.08
713 0.07
714 0.08
715 0.07
716 0.06
717 0.06
718 0.05
719 0.05
720 0.03
721 0.03
722 0.02
723 0.02
724 0.02
725 0.03
726 0.03
727 0.03
728 0.04
729 0.04
730 0.05
731 0.05
732 0.05
733 0.07
734 0.09
735 0.11
736 0.15
737 0.23
738 0.3
739 0.37
740 0.42
741 0.49
742 0.51
743 0.53
744 0.55
745 0.54
746 0.54
747 0.56
748 0.56
749 0.49
750 0.51
751 0.49
752 0.51
753 0.49
754 0.46
755 0.39
756 0.35
757 0.41
758 0.35
759 0.36
760 0.35
761 0.37
762 0.35
763 0.42
764 0.43
765 0.36
766 0.42
767 0.42
768 0.39
769 0.39
770 0.36
771 0.29
772 0.31
773 0.31
774 0.29
775 0.28
776 0.25
777 0.19
778 0.21
779 0.21
780 0.17
781 0.18
782 0.13
783 0.11
784 0.11
785 0.09
786 0.06
787 0.05
788 0.04
789 0.03
790 0.02
791 0.02
792 0.02
793 0.02
794 0.03
795 0.02
796 0.02
797 0.03
798 0.03
799 0.04
800 0.05
801 0.05
802 0.05
803 0.06
804 0.07
805 0.08
806 0.08
807 0.09
808 0.13
809 0.18
810 0.21
811 0.23
812 0.27
813 0.27
814 0.27
815 0.26
816 0.22
817 0.17
818 0.18
819 0.18
820 0.15
821 0.16
822 0.17
823 0.17
824 0.19
825 0.19
826 0.16
827 0.14
828 0.13
829 0.13
830 0.12
831 0.12
832 0.11
833 0.11
834 0.1
835 0.1
836 0.09
837 0.07
838 0.07
839 0.05
840 0.05
841 0.04
842 0.04
843 0.04
844 0.05
845 0.05
846 0.05
847 0.05
848 0.05
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.1
853 0.13
854 0.15
855 0.15
856 0.17
857 0.17
858 0.19
859 0.19
860 0.14
861 0.13
862 0.11
863 0.11
864 0.1
865 0.1
866 0.13
867 0.16
868 0.18
869 0.19
870 0.22
871 0.3
872 0.33
873 0.35
874 0.3
875 0.32
876 0.34
877 0.33
878 0.33
879 0.25
880 0.23
881 0.21
882 0.2
883 0.16
884 0.12
885 0.11
886 0.07
887 0.07
888 0.06
889 0.07
890 0.07
891 0.06
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.13
896 0.13
897 0.19
898 0.22
899 0.22
900 0.21
901 0.21
902 0.21
903 0.18
904 0.19
905 0.18
906 0.19
907 0.19
908 0.23
909 0.23
910 0.21
911 0.21
912 0.2
913 0.17
914 0.15
915 0.15
916 0.13
917 0.14
918 0.15
919 0.16
920 0.16
921 0.15
922 0.13
923 0.12
924 0.1
925 0.08
926 0.07
927 0.06
928 0.07
929 0.08
930 0.1
931 0.1
932 0.11
933 0.11
934 0.12
935 0.15
936 0.21
937 0.24
938 0.27
939 0.29
940 0.31
941 0.31
942 0.31
943 0.3
944 0.26
945 0.24
946 0.23
947 0.24
948 0.29
949 0.36
950 0.37
951 0.43
952 0.49
953 0.54
954 0.61
955 0.69
956 0.73
957 0.76
958 0.84
959 0.87
960 0.86
961 0.87
962 0.86
963 0.84
964 0.83
965 0.82
966 0.78
967 0.74
968 0.72
969 0.64
970 0.62
971 0.54
972 0.46
973 0.4
974 0.35
975 0.29
976 0.26
977 0.25
978 0.21
979 0.21
980 0.2
981 0.19
982 0.21
983 0.22
984 0.2
985 0.19
986 0.2
987 0.2
988 0.26
989 0.27
990 0.27
991 0.26
992 0.27
993 0.26
994 0.22
995 0.23
996 0.16
997 0.13
998 0.12
999 0.12
1000 0.12
1001 0.11
1002 0.12
1003 0.14
1004 0.16
1005 0.16
1006 0.15
1007 0.14
1008 0.14
1009 0.16
1010 0.17
1011 0.23
1012 0.25
1013 0.28
1014 0.28
1015 0.31
1016 0.33
1017 0.34
1018 0.4
1019 0.33
1020 0.34
1021 0.38
1022 0.39
1023 0.41
1024 0.39
1025 0.38
1026 0.32
1027 0.32
1028 0.27
1029 0.23
1030 0.22
1031 0.17
1032 0.17
1033 0.16
1034 0.2
1035 0.19
1036 0.22
1037 0.25
1038 0.25
1039 0.25
1040 0.28
1041 0.29
1042 0.23
1043 0.27
1044 0.26
1045 0.22
1046 0.22
1047 0.24
1048 0.25
1049 0.27
1050 0.27
1051 0.24
1052 0.23
1053 0.21
1054 0.2
1055 0.22
1056 0.19
1057 0.21
1058 0.25
1059 0.26
1060 0.31
1061 0.32
1062 0.31
1063 0.3
1064 0.29
1065 0.31
1066 0.27
1067 0.25
1068 0.2
1069 0.26
1070 0.26
1071 0.26
1072 0.27
1073 0.22
1074 0.21
1075 0.22
1076 0.21
1077 0.15
1078 0.17
1079 0.16
1080 0.14
1081 0.13
1082 0.14
1083 0.15
1084 0.15
1085 0.14
1086 0.12
1087 0.13
1088 0.12
1089 0.11
1090 0.1
1091 0.1
1092 0.09
1093 0.09
1094 0.08
1095 0.06
1096 0.05
1097 0.05
1098 0.05
1099 0.06
1100 0.06
1101 0.08
1102 0.08
1103 0.09
1104 0.1
1105 0.1
1106 0.12
1107 0.11
1108 0.13
1109 0.13
1110 0.15
1111 0.14
1112 0.14
1113 0.14
1114 0.12
1115 0.12
1116 0.11
1117 0.12
1118 0.14
1119 0.14
1120 0.14
1121 0.14
1122 0.15
1123 0.18
1124 0.19
1125 0.19
1126 0.17
1127 0.22
1128 0.26
1129 0.29
1130 0.3
1131 0.26
1132 0.26
1133 0.25
1134 0.28
1135 0.25
1136 0.23
1137 0.23
1138 0.24
1139 0.25
1140 0.23
1141 0.23
1142 0.19
1143 0.16
1144 0.18
1145 0.16
1146 0.17
1147 0.16
1148 0.2
1149 0.19
1150 0.19
1151 0.18
1152 0.18
1153 0.18
1154 0.17
1155 0.19
1156 0.18
1157 0.21
1158 0.21
1159 0.21
1160 0.2
1161 0.2
1162 0.19
1163 0.18
1164 0.18
1165 0.17
1166 0.18
1167 0.19
1168 0.21
1169 0.21
1170 0.22
1171 0.22
1172 0.21
1173 0.22
1174 0.23
1175 0.22
1176 0.22
1177 0.24
1178 0.26
1179 0.27
1180 0.27
1181 0.31
1182 0.31
1183 0.34
1184 0.34
1185 0.33
1186 0.33
1187 0.31
1188 0.33
1189 0.27
1190 0.24
1191 0.2
1192 0.19
1193 0.17
1194 0.14
1195 0.13
1196 0.12
1197 0.12
1198 0.11
1199 0.12
1200 0.11
1201 0.08
1202 0.09
1203 0.08
1204 0.07
1205 0.06
1206 0.06
1207 0.05
1208 0.05
1209 0.05