Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9Y3L1

Protein Details
Accession A0A2T9Y3L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-240DSVNIRKLPKQKQKTEFHRLGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MDEQPYNQIALTEEQFSRPLATAGNSVNPSNSKQQNTTKTSGLIKSQTFSEQLVKIIASGINQERQLTAMAVSCSQKIALASFQGWVRNTQNPYESCKNFIRALKIRFASTQTKKRLRDKMHHLIQTSFVIQYVEEFMNLYTAIGSMTEEEAVDRFIRNPKEHARASVLVHNPQELLMAIQIAESYETASSRANYHKWHPPQHNCFQNNHLPQEDKIEVDSVNIRKLPKQKQKTEFHRLGLCFYWEVLEADIMLSFKTVDITDNNNQEQEIPTRFNHEHYLDFMDLQTPTPPLFLNVGINDRKYLALIDSGATTEMIYPYIVTEKRLNTEKLKIPIRITVADEKQEDKTIPSNEENELNEMTRHTDNPEIAEILKEYKPEFTKKDINLPPLRPERVKIKTGEAEPINRHPTWRHLIDNGHTTIVKTDYASLCHYFTQKELSKRLDQYLKEFSECQIDIQYKPGKHNEAADALSRKYEPFDLPIYYKYNKNNKEMPRTNKTLINRLKNNSQKIIYDQDQDAIFKPKENGEKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.22
4 0.22
5 0.19
6 0.18
7 0.15
8 0.16
9 0.19
10 0.2
11 0.26
12 0.26
13 0.25
14 0.28
15 0.29
16 0.31
17 0.35
18 0.4
19 0.39
20 0.44
21 0.53
22 0.6
23 0.64
24 0.64
25 0.58
26 0.56
27 0.57
28 0.53
29 0.5
30 0.46
31 0.41
32 0.38
33 0.37
34 0.36
35 0.31
36 0.3
37 0.3
38 0.25
39 0.24
40 0.24
41 0.21
42 0.19
43 0.19
44 0.17
45 0.12
46 0.16
47 0.19
48 0.22
49 0.23
50 0.23
51 0.21
52 0.21
53 0.22
54 0.17
55 0.14
56 0.13
57 0.14
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.16
70 0.18
71 0.2
72 0.21
73 0.23
74 0.25
75 0.29
76 0.31
77 0.32
78 0.37
79 0.35
80 0.43
81 0.48
82 0.46
83 0.44
84 0.46
85 0.46
86 0.45
87 0.47
88 0.48
89 0.47
90 0.5
91 0.53
92 0.5
93 0.48
94 0.45
95 0.47
96 0.47
97 0.49
98 0.54
99 0.56
100 0.63
101 0.68
102 0.75
103 0.8
104 0.78
105 0.78
106 0.79
107 0.8
108 0.8
109 0.77
110 0.7
111 0.61
112 0.56
113 0.48
114 0.39
115 0.28
116 0.2
117 0.15
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.11
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.15
144 0.21
145 0.22
146 0.28
147 0.34
148 0.42
149 0.42
150 0.43
151 0.42
152 0.4
153 0.41
154 0.43
155 0.38
156 0.35
157 0.34
158 0.31
159 0.26
160 0.22
161 0.2
162 0.13
163 0.1
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.14
180 0.16
181 0.19
182 0.24
183 0.33
184 0.39
185 0.47
186 0.53
187 0.59
188 0.65
189 0.7
190 0.74
191 0.68
192 0.63
193 0.6
194 0.59
195 0.54
196 0.49
197 0.42
198 0.34
199 0.32
200 0.35
201 0.31
202 0.22
203 0.18
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.18
208 0.13
209 0.15
210 0.16
211 0.17
212 0.2
213 0.29
214 0.38
215 0.44
216 0.52
217 0.6
218 0.67
219 0.77
220 0.81
221 0.83
222 0.77
223 0.7
224 0.66
225 0.57
226 0.5
227 0.4
228 0.32
229 0.23
230 0.18
231 0.15
232 0.1
233 0.1
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.07
248 0.12
249 0.16
250 0.2
251 0.2
252 0.19
253 0.19
254 0.19
255 0.19
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.19
261 0.19
262 0.21
263 0.23
264 0.22
265 0.2
266 0.19
267 0.23
268 0.17
269 0.17
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.14
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.09
308 0.09
309 0.12
310 0.15
311 0.16
312 0.2
313 0.25
314 0.27
315 0.26
316 0.33
317 0.36
318 0.4
319 0.44
320 0.43
321 0.4
322 0.41
323 0.4
324 0.35
325 0.32
326 0.32
327 0.29
328 0.3
329 0.29
330 0.28
331 0.26
332 0.26
333 0.23
334 0.18
335 0.22
336 0.21
337 0.23
338 0.24
339 0.25
340 0.24
341 0.27
342 0.26
343 0.23
344 0.21
345 0.18
346 0.16
347 0.14
348 0.17
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.16
353 0.16
354 0.18
355 0.19
356 0.16
357 0.15
358 0.15
359 0.13
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.18
365 0.21
366 0.26
367 0.29
368 0.31
369 0.39
370 0.4
371 0.49
372 0.49
373 0.54
374 0.56
375 0.55
376 0.57
377 0.56
378 0.59
379 0.5
380 0.48
381 0.49
382 0.48
383 0.5
384 0.43
385 0.43
386 0.45
387 0.45
388 0.49
389 0.42
390 0.42
391 0.41
392 0.46
393 0.44
394 0.38
395 0.39
396 0.33
397 0.37
398 0.39
399 0.39
400 0.36
401 0.35
402 0.39
403 0.42
404 0.46
405 0.4
406 0.34
407 0.31
408 0.28
409 0.25
410 0.22
411 0.19
412 0.13
413 0.17
414 0.16
415 0.19
416 0.22
417 0.22
418 0.21
419 0.23
420 0.25
421 0.2
422 0.2
423 0.27
424 0.3
425 0.34
426 0.39
427 0.43
428 0.48
429 0.51
430 0.58
431 0.56
432 0.52
433 0.52
434 0.54
435 0.51
436 0.46
437 0.43
438 0.36
439 0.36
440 0.35
441 0.3
442 0.27
443 0.27
444 0.25
445 0.31
446 0.37
447 0.32
448 0.38
449 0.43
450 0.42
451 0.42
452 0.46
453 0.43
454 0.4
455 0.4
456 0.4
457 0.37
458 0.32
459 0.33
460 0.29
461 0.25
462 0.24
463 0.25
464 0.21
465 0.21
466 0.24
467 0.26
468 0.28
469 0.32
470 0.35
471 0.34
472 0.39
473 0.44
474 0.51
475 0.53
476 0.58
477 0.63
478 0.66
479 0.75
480 0.78
481 0.78
482 0.77
483 0.77
484 0.74
485 0.72
486 0.68
487 0.68
488 0.68
489 0.69
490 0.68
491 0.67
492 0.73
493 0.75
494 0.77
495 0.74
496 0.68
497 0.6
498 0.58
499 0.6
500 0.54
501 0.5
502 0.44
503 0.4
504 0.38
505 0.37
506 0.34
507 0.34
508 0.3
509 0.28
510 0.3
511 0.34