Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QWH4

Protein Details
Accession C4QWH4    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-179TMSDKKTGKGKKSKKKDKAKSKPKVDKAKAQBasic
191-222EKVQGKDKSKSKAKKEKKKKKQAVNQDKSPEEBasic
230-259PSEDTPVKSKPKKRTKKPKSKAKDPESSSEBasic
277-305SSASAKTKSKPKITIKQRPSPKPEPDSNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-181KKTGKGKKSKKKDKAKSKPKVDKAKAQEQ
184-212VDKPDSKEKVQGKDKSKSKAKKEKKKKKQ
237-252KSKPKKRTKKPKSKAK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.499, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0228  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MGRNKLDEPSITCPTEKIIVRRIPPELPEEEFKELFTPCVEGEWNGYYRYVKGHVAKDMYDETTFARAYIRFDSLEQSENFMKTFREKVNHDPEHFRVERAIYLHIGPFEEEPVKEETEPLESNEYFQRFLEWYNTGCEGEAPHLLVPTMSDKKTGKGKKSKKKDKAKSKPKVDKAKAQEQQEVDKPDSKEKVQGKDKSKSKAKKEKKKKKQAVNQDKSPEEVKTTSSAPSEDTPVKSKPKKRTKKPKSKAKDPESSSEPNENSNETSKPSDLENPSSASAKTKSKPKITIKQRPSPKPEPDSNSPQNHAAENSSTVFIEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.36
3 0.35
4 0.33
5 0.36
6 0.42
7 0.46
8 0.5
9 0.51
10 0.48
11 0.46
12 0.46
13 0.4
14 0.37
15 0.38
16 0.38
17 0.39
18 0.35
19 0.33
20 0.3
21 0.27
22 0.24
23 0.19
24 0.16
25 0.11
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.15
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.21
37 0.2
38 0.22
39 0.27
40 0.31
41 0.35
42 0.36
43 0.36
44 0.36
45 0.35
46 0.32
47 0.25
48 0.22
49 0.18
50 0.19
51 0.18
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.16
56 0.19
57 0.19
58 0.17
59 0.18
60 0.21
61 0.21
62 0.24
63 0.22
64 0.23
65 0.23
66 0.23
67 0.22
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.23
72 0.23
73 0.27
74 0.3
75 0.39
76 0.49
77 0.54
78 0.54
79 0.53
80 0.51
81 0.54
82 0.51
83 0.42
84 0.33
85 0.28
86 0.27
87 0.23
88 0.23
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.16
109 0.15
110 0.17
111 0.2
112 0.21
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.13
117 0.14
118 0.16
119 0.13
120 0.13
121 0.15
122 0.16
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.1
136 0.13
137 0.13
138 0.16
139 0.16
140 0.2
141 0.29
142 0.34
143 0.37
144 0.44
145 0.55
146 0.61
147 0.72
148 0.8
149 0.81
150 0.87
151 0.89
152 0.9
153 0.91
154 0.92
155 0.91
156 0.91
157 0.91
158 0.89
159 0.9
160 0.82
161 0.8
162 0.75
163 0.75
164 0.7
165 0.63
166 0.59
167 0.49
168 0.49
169 0.45
170 0.41
171 0.33
172 0.33
173 0.31
174 0.31
175 0.32
176 0.29
177 0.32
178 0.34
179 0.41
180 0.44
181 0.51
182 0.53
183 0.6
184 0.65
185 0.66
186 0.7
187 0.7
188 0.72
189 0.75
190 0.79
191 0.81
192 0.87
193 0.89
194 0.91
195 0.94
196 0.93
197 0.93
198 0.92
199 0.92
200 0.92
201 0.9
202 0.86
203 0.81
204 0.72
205 0.64
206 0.56
207 0.45
208 0.36
209 0.28
210 0.22
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.17
218 0.2
219 0.21
220 0.22
221 0.24
222 0.28
223 0.37
224 0.43
225 0.5
226 0.56
227 0.64
228 0.73
229 0.8
230 0.87
231 0.89
232 0.92
233 0.95
234 0.95
235 0.94
236 0.94
237 0.94
238 0.91
239 0.89
240 0.82
241 0.79
242 0.74
243 0.68
244 0.61
245 0.57
246 0.49
247 0.43
248 0.4
249 0.35
250 0.31
251 0.3
252 0.27
253 0.23
254 0.26
255 0.23
256 0.22
257 0.23
258 0.29
259 0.3
260 0.33
261 0.32
262 0.32
263 0.33
264 0.34
265 0.31
266 0.28
267 0.28
268 0.3
269 0.34
270 0.4
271 0.47
272 0.53
273 0.63
274 0.69
275 0.75
276 0.78
277 0.84
278 0.84
279 0.85
280 0.87
281 0.87
282 0.87
283 0.86
284 0.84
285 0.82
286 0.82
287 0.8
288 0.78
289 0.78
290 0.77
291 0.75
292 0.68
293 0.65
294 0.58
295 0.52
296 0.46
297 0.39
298 0.32
299 0.29
300 0.27
301 0.24