FuNGI

A0A2T9Y728

Protein Details

Accession

A0A2T9Y728

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
626-652	NNGNNRRNEYHNNRNNRRNNYDRQNFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

extr 18, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041976 KOW_Spt5_3 IPR041977 KOW_Spt5_4 IPR041978 KOW_Spt5_5 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF00467 KOW
CDD	cd06083 KOW_Spt5_3 cd06084 KOW_Spt5_4 cd06085 KOW_Spt5_5

Amino Acid Sequences

TEGDLVGISGLVISVQSDGTVRVKIDTSEIARGSSRSRGQPIMSFQQKQLRKYFRPGDHVKVIRGKSSGLTGSVVAVEDLIVTLISDLSLNEVKVFAKDLIQSKEVVTSVSENKFDKNEMVFLDSGRVSAIVLASEKGMYKVLDQNNQFLIVKEYEVSPMYKRANQIIATDSTGQEIKKGDIVKELSGLRRSGMIVQLNRFVAFIKSESISENSGIFPARVRNLISSASRQTYNRNSSNPNFQPRQGFQGNRGNQNARKSAPAFRGRDPIIGQYVIITRGPSKGYMGIVKTTSGNIARIELHTSARIVNVERDKLDVKLKDGRTVPAVSFGTFGGQNGSDLGDSSGFPSPYSNTKSLPFTPGAPGNASSSYGGSWEKPNISSDSSSAWGSGTPSVSNGDGWNQKDSGSSWGSGTPSVSNDNAWDQNDSGSTAGWGSGGGGGQEASTDNAWDQKDTSSSSGWGGASTQETSNQGSWDQNDTSPSSAGWGSGGAPEASNDSGWNQKDTGSTSGWGGGASTQEVANDSTWDQKDTESSSGRGSGAKETSNESAWGQPDTGASSGWDTGGATGGGGSNSNDQNSWGYSDIKNGVNNSGFGDDYPTPNSVDGWLNSVASERVADRGDRSFNNGNNRRNEYHNNRNNRRNNYDRQNFSRPQNKPRSSNYQGSDNYNPRRNREYNNNYDSHRGGYKDSNNRGSEWNSGSFDSSHSNHTSKNDATSNQNDDDNWGPSTYDNDPSSNWGSSQSTEQPGSGWGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.04
2	0.04
3	0.05
4	0.06
5	0.09
6	0.11
7	0.13
8	0.14
9	0.15
10	0.16
11	0.17
12	0.2
13	0.23
14	0.25
15	0.29
16	0.29
17	0.29
18	0.29
19	0.3
20	0.3
21	0.32
22	0.35
23	0.35
24	0.39
25	0.42
26	0.43
27	0.48
28	0.52
29	0.54
30	0.56
31	0.53
32	0.52
33	0.57
34	0.6
35	0.6
36	0.62
37	0.62
38	0.6
39	0.67
40	0.72
41	0.7
42	0.74
43	0.75
44	0.73
45	0.73
46	0.71
47	0.68
48	0.66
49	0.61
50	0.55
51	0.5
52	0.43
53	0.34
54	0.35
55	0.3
56	0.23
57	0.23
58	0.18
59	0.18
60	0.17
61	0.16
62	0.1
63	0.09
64	0.07
65	0.06
66	0.05
67	0.05
68	0.04
69	0.03
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.04
74	0.04
75	0.08
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.11
80	0.12
81	0.12
82	0.15
83	0.12
84	0.13
85	0.18
86	0.24
87	0.28
88	0.28
89	0.28
90	0.26
91	0.29
92	0.26
93	0.22
94	0.17
95	0.17
96	0.22
97	0.25
98	0.28
99	0.26
100	0.28
101	0.29
102	0.3
103	0.29
104	0.24
105	0.24
106	0.21
107	0.24
108	0.22
109	0.2
110	0.22
111	0.18
112	0.16
113	0.14
114	0.12
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.09
124	0.09
125	0.1
126	0.1
127	0.12
128	0.2
129	0.25
130	0.31
131	0.32
132	0.35
133	0.34
134	0.37
135	0.34
136	0.27
137	0.26
138	0.19
139	0.18
140	0.15
141	0.15
142	0.14
143	0.15
144	0.16
145	0.14
146	0.2
147	0.23
148	0.25
149	0.27
150	0.29
151	0.33
152	0.33
153	0.33
154	0.3
155	0.28
156	0.28
157	0.27
158	0.23
159	0.2
160	0.2
161	0.18
162	0.16
163	0.16
164	0.14
165	0.16
166	0.18
167	0.17
168	0.22
169	0.24
170	0.22
171	0.25
172	0.27
173	0.27
174	0.28
175	0.27
176	0.21
177	0.21
178	0.21
179	0.19
180	0.21
181	0.23
182	0.24
183	0.25
184	0.29
185	0.28
186	0.28
187	0.26
188	0.21
189	0.16
190	0.14
191	0.13
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.14
196	0.15
197	0.15
198	0.14
199	0.14
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.1
204	0.1
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.16
210	0.17
211	0.21
212	0.21
213	0.22
214	0.24
215	0.25
216	0.26
217	0.25
218	0.3
219	0.36
220	0.41
221	0.42
222	0.42
223	0.46
224	0.47
225	0.57
226	0.57
227	0.56
228	0.51
229	0.49
230	0.52
231	0.46
232	0.51
233	0.46
234	0.41
235	0.39
236	0.47
237	0.48
238	0.47
239	0.5
240	0.48
241	0.46
242	0.5
243	0.47
244	0.39
245	0.39
246	0.35
247	0.38
248	0.41
249	0.46
250	0.44
251	0.43
252	0.49
253	0.45
254	0.45
255	0.4
256	0.34
257	0.28
258	0.24
259	0.21
260	0.15
261	0.15
262	0.13
263	0.13
264	0.1
265	0.09
266	0.11
267	0.12
268	0.11
269	0.11
270	0.11
271	0.13
272	0.15
273	0.15
274	0.16
275	0.15
276	0.16
277	0.15
278	0.13
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.11
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.12
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.1
295	0.15
296	0.17
297	0.18
298	0.17
299	0.19
300	0.19
301	0.2
302	0.25
303	0.2
304	0.21
305	0.27
306	0.28
307	0.31
308	0.31
309	0.3
310	0.28
311	0.28
312	0.25
313	0.23
314	0.23
315	0.17
316	0.17
317	0.15
318	0.14
319	0.12
320	0.12
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.07
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.07
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.1
337	0.14
338	0.19
339	0.18
340	0.17
341	0.2
342	0.23
343	0.23
344	0.25
345	0.21
346	0.18
347	0.2
348	0.2
349	0.19
350	0.16
351	0.16
352	0.14
353	0.14
354	0.13
355	0.11
356	0.09
357	0.08
358	0.09
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.11
365	0.13
366	0.13
367	0.14
368	0.14
369	0.13
370	0.13
371	0.14
372	0.13
373	0.11
374	0.1
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.1
386	0.14
387	0.15
388	0.16
389	0.15
390	0.15
391	0.15
392	0.16
393	0.16
394	0.14
395	0.13
396	0.12
397	0.13
398	0.14
399	0.13
400	0.13
401	0.09
402	0.09
403	0.11
404	0.1
405	0.09
406	0.1
407	0.12
408	0.13
409	0.13
410	0.13
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.11
415	0.09
416	0.07
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.03
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.09
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.12
441	0.13
442	0.15
443	0.11
444	0.12
445	0.12
446	0.13
447	0.12
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.11
456	0.12
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.12
461	0.14
462	0.16
463	0.16
464	0.15
465	0.16
466	0.16
467	0.17
468	0.15
469	0.14
470	0.12
471	0.11
472	0.1
473	0.08
474	0.07
475	0.06
476	0.07
477	0.08
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.07
485	0.08
486	0.13
487	0.14
488	0.15
489	0.14
490	0.15
491	0.16
492	0.19
493	0.2
494	0.16
495	0.16
496	0.15
497	0.16
498	0.15
499	0.13
500	0.1
501	0.08
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.08
509	0.08
510	0.09
511	0.09
512	0.15
513	0.15
514	0.17
515	0.16
516	0.15
517	0.17
518	0.19
519	0.23
520	0.19
521	0.2
522	0.19
523	0.21
524	0.21
525	0.2
526	0.19
527	0.19
528	0.19
529	0.19
530	0.19
531	0.21
532	0.22
533	0.21
534	0.21
535	0.18
536	0.19
537	0.18
538	0.18
539	0.15
540	0.14
541	0.13
542	0.14
543	0.13
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.06
559	0.07
560	0.1
561	0.11
562	0.12
563	0.12
564	0.13
565	0.14
566	0.15
567	0.16
568	0.13
569	0.16
570	0.16
571	0.2
572	0.23
573	0.24
574	0.25
575	0.24
576	0.26
577	0.24
578	0.24
579	0.22
580	0.19
581	0.16
582	0.14
583	0.18
584	0.15
585	0.17
586	0.18
587	0.18
588	0.17
589	0.17
590	0.18
591	0.15
592	0.17
593	0.15
594	0.17
595	0.16
596	0.16
597	0.15
598	0.16
599	0.14
600	0.11
601	0.11
602	0.08
603	0.1
604	0.12
605	0.13
606	0.14
607	0.18
608	0.23
609	0.22
610	0.29
611	0.32
612	0.36
613	0.46
614	0.52
615	0.55
616	0.58
617	0.64
618	0.61
619	0.61
620	0.67
621	0.65
622	0.68
623	0.69
624	0.73
625	0.75
626	0.82
627	0.84
628	0.83
629	0.83
630	0.8
631	0.81
632	0.81
633	0.82
634	0.8
635	0.79
636	0.79
637	0.76
638	0.76
639	0.76
640	0.71
641	0.72
642	0.75
643	0.75
644	0.72
645	0.74
646	0.76
647	0.73
648	0.75
649	0.68
650	0.66
651	0.62
652	0.62
653	0.63
654	0.62
655	0.64
656	0.63
657	0.64
658	0.6
659	0.66
660	0.65
661	0.64
662	0.66
663	0.67
664	0.69
665	0.73
666	0.71
667	0.64
668	0.64
669	0.57
670	0.5
671	0.44
672	0.35
673	0.32
674	0.36
675	0.43
676	0.48
677	0.55
678	0.59
679	0.57
680	0.58
681	0.58
682	0.53
683	0.5
684	0.44
685	0.41
686	0.35
687	0.35
688	0.34
689	0.3
690	0.29
691	0.28
692	0.25
693	0.26
694	0.28
695	0.29
696	0.3
697	0.33
698	0.38
699	0.34
700	0.39
701	0.38
702	0.37
703	0.43
704	0.46
705	0.49
706	0.45
707	0.44
708	0.38
709	0.37
710	0.37
711	0.33
712	0.27
713	0.22
714	0.2
715	0.18
716	0.23
717	0.22
718	0.26
719	0.25
720	0.25
721	0.26
722	0.31
723	0.35
724	0.31
725	0.29
726	0.25
727	0.26
728	0.26
729	0.31
730	0.32
731	0.33
732	0.33
733	0.33
734	0.29

A0A2T9Y728

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer