Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QVX6

Protein Details
Accession C4QVX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-53NECIKEWTKRANTCPKCRRDYSQIRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-267GRKLKKPRRASGIKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018527  Rubredoxin_Fe_BS  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006914  P:autophagy  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0041  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00202  RUBREDOXIN  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd15489  PHD_SF  
Amino Acid Sequences MEEVCSICLEVLVDKEAFTEPCLHYYHNECIKEWTKRANTCPKCRRDYSQIRIGEEVISVKNRSLELHLVDETLEETRERLISYTNLCALCEDPSTSLIYCESCGGSFHFNCIGIGDELDSEWCCPLCGMFQNHLGEASNRNLISATPVGEGRRRVTSIVNTRRTNSIYRSHSNRPAQRAHLMTDSDYTMIVDQHREKLLESQLQESNTQSSGEEESWKLLDEALKSGTQNSQSSEFSTENNVVPLKNTHELGRKLKKPRRASGIKKNVVERSSSHQSTQILKPSSSLISDLLLETRGNSRHPSFTNSTQKLTVEALQSHDPTLKLNIPKTETLSLDQKIVIQKLFIKPRLRNLYDSNTLSKDNYIEINKIICRRLYDKFLQDQLALAYLKQVLEVKERLHGHDLKQFLAQFTHWSELNDFTDDKWQKQETEGSCNHKQTQILSMFDSIIDTMLQNELHKLLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.21
7 0.19
8 0.23
9 0.25
10 0.25
11 0.27
12 0.32
13 0.4
14 0.41
15 0.42
16 0.39
17 0.45
18 0.52
19 0.56
20 0.55
21 0.56
22 0.56
23 0.61
24 0.7
25 0.72
26 0.74
27 0.77
28 0.83
29 0.82
30 0.82
31 0.81
32 0.79
33 0.79
34 0.8
35 0.77
36 0.76
37 0.72
38 0.66
39 0.62
40 0.55
41 0.45
42 0.35
43 0.29
44 0.23
45 0.21
46 0.19
47 0.18
48 0.2
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.23
53 0.22
54 0.25
55 0.24
56 0.22
57 0.21
58 0.2
59 0.17
60 0.13
61 0.12
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.12
69 0.15
70 0.18
71 0.21
72 0.24
73 0.23
74 0.23
75 0.23
76 0.21
77 0.19
78 0.18
79 0.16
80 0.12
81 0.13
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.17
94 0.16
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.12
102 0.12
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.14
116 0.17
117 0.2
118 0.25
119 0.26
120 0.27
121 0.27
122 0.25
123 0.21
124 0.2
125 0.19
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.17
132 0.15
133 0.14
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.18
138 0.2
139 0.19
140 0.21
141 0.2
142 0.2
143 0.22
144 0.28
145 0.36
146 0.44
147 0.49
148 0.48
149 0.49
150 0.51
151 0.51
152 0.46
153 0.4
154 0.39
155 0.37
156 0.41
157 0.46
158 0.49
159 0.55
160 0.6
161 0.61
162 0.58
163 0.56
164 0.54
165 0.53
166 0.48
167 0.42
168 0.37
169 0.32
170 0.27
171 0.24
172 0.21
173 0.15
174 0.13
175 0.11
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.18
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.23
190 0.24
191 0.25
192 0.25
193 0.21
194 0.19
195 0.15
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.09
207 0.08
208 0.1
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.18
223 0.17
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.16
237 0.22
238 0.27
239 0.34
240 0.42
241 0.45
242 0.54
243 0.58
244 0.64
245 0.66
246 0.68
247 0.69
248 0.71
249 0.73
250 0.74
251 0.79
252 0.76
253 0.72
254 0.69
255 0.64
256 0.55
257 0.48
258 0.39
259 0.36
260 0.37
261 0.35
262 0.31
263 0.3
264 0.31
265 0.35
266 0.36
267 0.35
268 0.3
269 0.28
270 0.29
271 0.27
272 0.25
273 0.21
274 0.18
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.16
287 0.17
288 0.22
289 0.23
290 0.29
291 0.31
292 0.39
293 0.48
294 0.47
295 0.47
296 0.44
297 0.42
298 0.38
299 0.34
300 0.28
301 0.21
302 0.19
303 0.2
304 0.21
305 0.21
306 0.2
307 0.2
308 0.17
309 0.15
310 0.18
311 0.2
312 0.21
313 0.24
314 0.27
315 0.29
316 0.31
317 0.33
318 0.33
319 0.3
320 0.29
321 0.31
322 0.28
323 0.26
324 0.24
325 0.23
326 0.24
327 0.24
328 0.21
329 0.17
330 0.21
331 0.27
332 0.35
333 0.39
334 0.43
335 0.44
336 0.54
337 0.63
338 0.6
339 0.58
340 0.56
341 0.57
342 0.56
343 0.56
344 0.5
345 0.42
346 0.41
347 0.37
348 0.32
349 0.25
350 0.2
351 0.22
352 0.2
353 0.19
354 0.2
355 0.23
356 0.25
357 0.28
358 0.29
359 0.26
360 0.28
361 0.31
362 0.35
363 0.38
364 0.41
365 0.44
366 0.48
367 0.5
368 0.48
369 0.43
370 0.39
371 0.32
372 0.29
373 0.23
374 0.16
375 0.14
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.14
381 0.2
382 0.23
383 0.22
384 0.28
385 0.3
386 0.32
387 0.36
388 0.38
389 0.36
390 0.39
391 0.4
392 0.33
393 0.36
394 0.34
395 0.28
396 0.26
397 0.23
398 0.22
399 0.23
400 0.25
401 0.22
402 0.22
403 0.23
404 0.25
405 0.27
406 0.25
407 0.23
408 0.21
409 0.3
410 0.31
411 0.32
412 0.34
413 0.34
414 0.33
415 0.36
416 0.44
417 0.37
418 0.44
419 0.48
420 0.49
421 0.54
422 0.58
423 0.57
424 0.52
425 0.5
426 0.43
427 0.46
428 0.43
429 0.38
430 0.35
431 0.34
432 0.3
433 0.28
434 0.27
435 0.18
436 0.13
437 0.11
438 0.08
439 0.08
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.13