FuNGI

Q2TX40

Protein Details

Accession

Q2TX40

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
354-373	FEEMRRKRRQWTRAIEKAKS	Hydrophilic
1144-1163	QEWRTSKKGGHLRKIDRTLP	Hydrophilic
1220-1239	IDCPRLNRLRQELRRKIGRA	Hydrophilic
1275-1298	AEASQRFRSRAPRGRQNRTPGIGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
360-362	KRR

Subcellular Location(s)

mito 10.5, nucl 9, cyto_mito 8.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF14529 Exo_endo_phos_2 PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MTTNLRILQLNIMKSRPGMEALINDHQSQNLDMLLIQEPPMTAYRSHVNHSAWRLYRPTYTDESVRFRSLLYVNRRISTSSHRQIHCNHPDVVAIKIWTPELQYLIFSVYIPPVALYEAPEVSSAQQILEEIQTSIRQHAEGNNRVTKLILAGDWNRHHPAWSHRPVHHSFAEHAEELINFFQAHELQWCLAPGQPTFWSLKEPGKTSVLDLTLTNNTERLIKCQLYHHHYGSDHRGTYSEWSLQPKQNVKLKLKRAYDRADWTKVGQDILNLIDPQPRILSSQDLDQVVENLVHTTTTVLDQHVPFLAPSPYSKRWFTPDLKVQQTEVNQIRRRWQDGCAILGPSHPMTKTLFEEMRRKRRQWTRAIEKAKSGHWREFLDKAGEGHLWKAATYMRPRDADMSIPTLKVDTKEVTDNQEKAEVFLEAFFPKMADPGDEEVESPAEELRWEPITEIEIHRSIRAAKGTTAPGEDGIPTLVWKQLWAYLKETITIIFTKSLDLGYYPNQWKRARIVVLRKPGKPDYSAPGAYRPISLLNTLGKLLEAVMARRLSYWAEKYGLLPDTQFGGRPGRNTEQALLVLANAIDRAWVRSRVVTLVAFDLKGAFNGVNKTSLDTRLRAKGIPFKARQWICSFMENRQASVTFDDFETENLPLEHAGLAQGSPLSPILFCFYNSDLVDQPVDSNGGASAFIDDYFRWRTSPSAEENIKKIQEEDIPRIDEWARRTGASFAAEKTELIHLTRRKSEHCKGQILINGQVIKPADTAKLLGVIFDKEMRWKEHIQRAVRRATKVNIALGGLRHLRPEQMRQLYQACVTPTIDYASTVWHNPLRDKTHLRLLRTVQRTALIRILSAFRTVSTEALEVESHILPTHLRLKQRAQITAARLSTLPGNHPIHGVIVRAIARSSHIGSGQRFPLAETMRTMDLNRLQALETIDPTPLAPWRTQPFTEIEIEPDREKAKANASARQAMTGATVFSDASGQQNQLGAAAVALDKNQQILGSRQISIGSMSYWSVYAAELMAIYYAIGLVFQLAQKNQTTATTTRGPATILSDSMSALQAIANAWNKSGQRILQAIHQAAGELKARGIPLRLQWVPGHCGDPGNETADRLAKEAVGLEKKHPFRHLLSREKGYIRDRISKEWEQEWRTSKKGGHLRKIDRTLPSSRTRRLYGSLPRNRAYLLTQLRTGHSWLATYGKQHRFQEEEKCECGAVETVVHVLIDCPRLNRLRQELRRKIGRAFNNISDMLGGAEQGKEGRLQDAPQDSSVLGAVLDYAEASQRFRSRAPRGRQNRTPGIGQHRP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.35
3	0.28
4	0.26
5	0.22
6	0.21
7	0.24
8	0.29
9	0.36
10	0.35
11	0.34
12	0.32
13	0.31
14	0.3
15	0.27
16	0.21
17	0.14
18	0.12
19	0.11
20	0.13
21	0.13
22	0.12
23	0.12
24	0.11
25	0.11
26	0.13
27	0.15
28	0.15
29	0.14
30	0.17
31	0.25
32	0.27
33	0.31
34	0.35
35	0.36
36	0.41
37	0.47
38	0.52
39	0.47
40	0.49
41	0.49
42	0.46
43	0.48
44	0.44
45	0.45
46	0.42
47	0.43
48	0.44
49	0.46
50	0.5
51	0.49
52	0.48
53	0.42
54	0.36
55	0.38
56	0.36
57	0.39
58	0.41
59	0.46
60	0.47
61	0.49
62	0.5
63	0.46
64	0.45
65	0.46
66	0.48
67	0.48
68	0.54
69	0.53
70	0.58
71	0.63
72	0.69
73	0.69
74	0.63
75	0.55
76	0.47
77	0.49
78	0.45
79	0.4
80	0.33
81	0.24
82	0.21
83	0.21
84	0.21
85	0.18
86	0.18
87	0.18
88	0.17
89	0.16
90	0.15
91	0.15
92	0.15
93	0.15
94	0.13
95	0.12
96	0.11
97	0.11
98	0.11
99	0.1
100	0.09
101	0.1
102	0.1
103	0.11
104	0.13
105	0.13
106	0.13
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.16
111	0.14
112	0.11
113	0.11
114	0.1
115	0.11
116	0.12
117	0.11
118	0.09
119	0.11
120	0.14
121	0.15
122	0.17
123	0.17
124	0.16
125	0.17
126	0.24
127	0.32
128	0.36
129	0.42
130	0.46
131	0.45
132	0.45
133	0.44
134	0.37
135	0.29
136	0.23
137	0.17
138	0.16
139	0.2
140	0.27
141	0.3
142	0.34
143	0.36
144	0.35
145	0.35
146	0.35
147	0.41
148	0.43
149	0.5
150	0.53
151	0.53
152	0.6
153	0.63
154	0.64
155	0.59
156	0.51
157	0.44
158	0.42
159	0.43
160	0.35
161	0.31
162	0.26
163	0.22
164	0.21
165	0.19
166	0.14
167	0.09
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.12
178	0.14
179	0.15
180	0.14
181	0.16
182	0.16
183	0.18
184	0.2
185	0.2
186	0.22
187	0.22
188	0.29
189	0.3
190	0.32
191	0.33
192	0.34
193	0.34
194	0.32
195	0.34
196	0.28
197	0.24
198	0.21
199	0.21
200	0.22
201	0.22
202	0.21
203	0.17
204	0.16
205	0.21
206	0.21
207	0.22
208	0.26
209	0.26
210	0.28
211	0.35
212	0.43
213	0.44
214	0.5
215	0.47
216	0.45
217	0.45
218	0.48
219	0.49
220	0.47
221	0.41
222	0.35
223	0.34
224	0.3
225	0.33
226	0.31
227	0.28
228	0.25
229	0.31
230	0.37
231	0.4
232	0.47
233	0.49
234	0.53
235	0.55
236	0.6
237	0.62
238	0.66
239	0.7
240	0.72
241	0.74
242	0.73
243	0.73
244	0.71
245	0.69
246	0.7
247	0.67
248	0.63
249	0.56
250	0.51
251	0.48
252	0.42
253	0.37
254	0.27
255	0.21
256	0.17
257	0.18
258	0.19
259	0.14
260	0.14
261	0.16
262	0.16
263	0.16
264	0.16
265	0.15
266	0.14
267	0.15
268	0.18
269	0.15
270	0.19
271	0.22
272	0.21
273	0.21
274	0.2
275	0.2
276	0.16
277	0.15
278	0.12
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.13
289	0.13
290	0.15
291	0.15
292	0.14
293	0.12
294	0.14
295	0.14
296	0.11
297	0.14
298	0.2
299	0.25
300	0.3
301	0.32
302	0.32
303	0.37
304	0.43
305	0.45
306	0.47
307	0.5
308	0.54
309	0.57
310	0.56
311	0.51
312	0.49
313	0.45
314	0.45
315	0.42
316	0.43
317	0.43
318	0.44
319	0.51
320	0.51
321	0.54
322	0.47
323	0.44
324	0.43
325	0.39
326	0.41
327	0.35
328	0.31
329	0.27
330	0.26
331	0.25
332	0.18
333	0.18
334	0.14
335	0.13
336	0.14
337	0.17
338	0.19
339	0.22
340	0.25
341	0.27
342	0.37
343	0.45
344	0.55
345	0.59
346	0.59
347	0.63
348	0.69
349	0.73
350	0.74
351	0.75
352	0.74
353	0.77
354	0.82
355	0.74
356	0.7
357	0.64
358	0.59
359	0.57
360	0.51
361	0.47
362	0.44
363	0.45
364	0.43
365	0.43
366	0.4
367	0.34
368	0.3
369	0.26
370	0.23
371	0.21
372	0.18
373	0.16
374	0.15
375	0.12
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.16
380	0.22
381	0.26
382	0.29
383	0.3
384	0.31
385	0.33
386	0.32
387	0.29
388	0.26
389	0.26
390	0.22
391	0.21
392	0.2
393	0.18
394	0.18
395	0.16
396	0.16
397	0.12
398	0.13
399	0.17
400	0.19
401	0.25
402	0.29
403	0.28
404	0.26
405	0.3
406	0.28
407	0.24
408	0.24
409	0.17
410	0.13
411	0.12
412	0.13
413	0.08
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.06
421	0.09
422	0.11
423	0.12
424	0.12
425	0.13
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.09
430	0.07
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.07
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.15
443	0.16
444	0.16
445	0.16
446	0.16
447	0.16
448	0.17
449	0.18
450	0.16
451	0.15
452	0.18
453	0.2
454	0.2
455	0.2
456	0.17
457	0.15
458	0.14
459	0.13
460	0.09
461	0.08
462	0.07
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.12
470	0.16
471	0.18
472	0.2
473	0.22
474	0.23
475	0.23
476	0.23
477	0.18
478	0.16
479	0.14
480	0.12
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.1
485	0.09
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.1
490	0.17
491	0.21
492	0.23
493	0.3
494	0.31
495	0.33
496	0.34
497	0.38
498	0.36
499	0.38
500	0.45
501	0.46
502	0.55
503	0.59
504	0.58
505	0.57
506	0.55
507	0.51
508	0.44
509	0.39
510	0.34
511	0.34
512	0.34
513	0.29
514	0.29
515	0.29
516	0.26
517	0.24
518	0.19
519	0.15
520	0.14
521	0.13
522	0.12
523	0.11
524	0.11
525	0.11
526	0.1
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.09
531	0.08
532	0.07
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.11
537	0.12
538	0.1
539	0.13
540	0.15
541	0.14
542	0.15
543	0.15
544	0.16
545	0.18
546	0.18
547	0.15
548	0.13
549	0.11
550	0.12
551	0.11
552	0.11
553	0.09
554	0.13
555	0.14
556	0.16
557	0.2
558	0.21
559	0.24
560	0.24
561	0.23
562	0.2
563	0.19
564	0.18
565	0.13
566	0.1
567	0.07
568	0.06
569	0.05
570	0.04
571	0.03
572	0.04
573	0.04
574	0.06
575	0.08
576	0.1
577	0.1
578	0.11
579	0.12
580	0.13
581	0.14
582	0.12
583	0.11
584	0.11
585	0.11
586	0.1
587	0.09
588	0.09
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.05
593	0.06
594	0.08
595	0.09
596	0.1
597	0.1
598	0.12
599	0.12
600	0.17
601	0.17
602	0.18
603	0.2
604	0.22
605	0.24
606	0.23
607	0.24
608	0.27
609	0.31
610	0.38
611	0.37
612	0.35
613	0.42
614	0.42
615	0.42
616	0.37
617	0.37
618	0.31
619	0.34
620	0.33
621	0.26
622	0.35
623	0.33
624	0.3
625	0.25
626	0.24
627	0.19
628	0.2
629	0.18
630	0.09
631	0.09
632	0.09
633	0.09
634	0.09
635	0.09
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.06
640	0.05
641	0.06
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.03
650	0.03
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.06
656	0.06
657	0.07
658	0.09
659	0.09
660	0.13
661	0.13
662	0.15
663	0.13
664	0.14
665	0.14
666	0.11
667	0.11
668	0.07
669	0.07
670	0.05
671	0.05
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.05
680	0.05
681	0.08
682	0.11
683	0.11
684	0.11
685	0.11
686	0.12
687	0.14
688	0.18
689	0.19
690	0.24
691	0.27
692	0.29
693	0.31
694	0.33
695	0.31
696	0.27
697	0.24
698	0.19
699	0.21
700	0.22
701	0.24
702	0.24
703	0.25
704	0.25
705	0.26
706	0.25
707	0.22
708	0.21
709	0.22
710	0.19
711	0.18
712	0.19
713	0.18
714	0.19
715	0.18
716	0.17
717	0.12
718	0.14
719	0.14
720	0.13
721	0.13
722	0.13
723	0.11
724	0.11
725	0.17
726	0.18
727	0.21
728	0.26
729	0.27
730	0.3
731	0.38
732	0.43
733	0.47
734	0.49
735	0.5
736	0.46
737	0.48
738	0.47
739	0.42
740	0.38
741	0.31
742	0.26
743	0.22
744	0.23
745	0.19
746	0.16
747	0.14
748	0.12
749	0.1
750	0.09
751	0.1
752	0.08
753	0.11
754	0.1
755	0.1
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.11
760	0.11
761	0.11
762	0.14
763	0.16
764	0.19
765	0.24
766	0.31
767	0.37
768	0.44
769	0.47
770	0.52
771	0.55
772	0.59
773	0.59
774	0.54
775	0.5
776	0.46
777	0.45
778	0.39
779	0.35
780	0.27
781	0.23
782	0.21
783	0.18
784	0.19
785	0.15
786	0.14
787	0.14
788	0.13
789	0.16
790	0.17
791	0.22
792	0.27
793	0.31
794	0.32
795	0.33
796	0.35
797	0.33
798	0.32
799	0.29
800	0.21
801	0.17
802	0.17
803	0.14
804	0.12
805	0.13
806	0.12
807	0.1
808	0.09
809	0.1
810	0.11
811	0.11
812	0.13
813	0.14
814	0.15
815	0.17
816	0.23
817	0.25
818	0.31
819	0.35
820	0.36
821	0.43
822	0.46
823	0.46
824	0.45
825	0.46
826	0.49
827	0.48
828	0.46
829	0.37
830	0.37
831	0.36
832	0.32
833	0.31
834	0.22
835	0.18
836	0.18
837	0.19
838	0.16
839	0.15
840	0.13
841	0.09
842	0.12
843	0.12
844	0.12
845	0.11
846	0.11
847	0.1
848	0.11
849	0.1
850	0.08
851	0.1
852	0.1
853	0.08
854	0.08
855	0.08
856	0.07
857	0.1
858	0.18
859	0.19
860	0.22
861	0.26
862	0.3
863	0.36
864	0.4
865	0.4
866	0.36
867	0.38
868	0.39
869	0.41
870	0.36
871	0.32
872	0.27
873	0.25
874	0.24
875	0.2
876	0.18
877	0.2
878	0.21
879	0.21
880	0.21
881	0.21
882	0.2
883	0.19
884	0.18
885	0.11
886	0.12
887	0.12
888	0.12
889	0.12
890	0.1
891	0.11
892	0.12
893	0.13
894	0.12
895	0.14
896	0.18
897	0.2
898	0.24
899	0.24
900	0.23
901	0.21
902	0.2
903	0.23
904	0.22
905	0.21
906	0.18
907	0.19
908	0.19
909	0.2
910	0.2
911	0.18
912	0.2
913	0.21
914	0.2
915	0.19
916	0.18
917	0.19
918	0.21
919	0.18
920	0.16
921	0.14
922	0.13
923	0.13
924	0.12
925	0.11
926	0.12
927	0.12
928	0.12
929	0.16
930	0.21
931	0.25
932	0.25
933	0.27
934	0.27
935	0.28
936	0.31
937	0.26
938	0.25
939	0.25
940	0.27
941	0.25
942	0.25
943	0.22
944	0.19
945	0.2
946	0.19
947	0.21
948	0.26
949	0.29
950	0.32
951	0.36
952	0.42
953	0.4
954	0.39
955	0.33
956	0.26
957	0.24
958	0.18
959	0.14
960	0.08
961	0.08
962	0.07
963	0.07
964	0.07
965	0.06
966	0.09
967	0.1
968	0.1
969	0.11
970	0.12
971	0.12
972	0.11
973	0.11
974	0.08
975	0.06
976	0.06
977	0.06
978	0.05
979	0.05
980	0.07
981	0.06
982	0.07
983	0.07
984	0.07
985	0.09
986	0.11
987	0.18
988	0.19
989	0.2
990	0.2
991	0.2
992	0.2
993	0.19
994	0.17
995	0.1
996	0.09
997	0.08
998	0.08
999	0.08
1000	0.08
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.05
1006	0.05
1007	0.05
1008	0.05
1009	0.04
1010	0.04
1011	0.03
1012	0.03
1013	0.03
1014	0.03
1015	0.03
1016	0.03
1017	0.04
1018	0.06
1019	0.09
1020	0.09
1021	0.12
1022	0.13
1023	0.14
1024	0.15
1025	0.15
1026	0.19
1027	0.17
1028	0.22
1029	0.25
1030	0.25
1031	0.26
1032	0.26
1033	0.25
1034	0.21
1035	0.24
1036	0.2
1037	0.15
1038	0.15
1039	0.14
1040	0.13
1041	0.14
1042	0.13
1043	0.09
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.07
1048	0.11
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.15
1052	0.19
1053	0.2
1054	0.21
1055	0.25
1056	0.21
1057	0.22
1058	0.24
1059	0.25
1060	0.26
1061	0.32
1062	0.3
1063	0.28
1064	0.26
1065	0.21
1066	0.2
1067	0.21
1068	0.18
1069	0.12
1070	0.12
1071	0.12
1072	0.13
1073	0.14
1074	0.16
1075	0.16
1076	0.18
1077	0.26
1078	0.26
1079	0.27
1080	0.3
1081	0.33
1082	0.34
1083	0.33
1084	0.3
1085	0.23
1086	0.24
1087	0.22
1088	0.23
1089	0.21
1090	0.21
1091	0.2
1092	0.18
1093	0.2
1094	0.22
1095	0.22
1096	0.2
1097	0.18
1098	0.14
1099	0.14
1100	0.17
1101	0.21
1102	0.23
1103	0.24
1104	0.27
1105	0.35
1106	0.4
1107	0.44
1108	0.45
1109	0.43
1110	0.43
1111	0.52
1112	0.57
1113	0.58
1114	0.61
1115	0.63
1116	0.65
1117	0.64
1118	0.64
1119	0.57
1120	0.56
1121	0.51
1122	0.54
1123	0.51
1124	0.52
1125	0.58
1126	0.57
1127	0.58
1128	0.57
1129	0.6
1130	0.54
1131	0.58
1132	0.59
1133	0.56
1134	0.53
1135	0.53
1136	0.49
1137	0.5
1138	0.56
1139	0.59
1140	0.61
1141	0.65
1142	0.71
1143	0.76
1144	0.8
1145	0.77
1146	0.73
1147	0.68
1148	0.65
1149	0.62
1150	0.63
1151	0.61
1152	0.61
1153	0.61
1154	0.59
1155	0.57
1156	0.55
1157	0.57
1158	0.57
1159	0.6
1160	0.63
1161	0.64
1162	0.62
1163	0.59
1164	0.56
1165	0.49
1166	0.41
1167	0.4
1168	0.39
1169	0.35
1170	0.38
1171	0.38
1172	0.4
1173	0.4
1174	0.39
1175	0.33
1176	0.25
1177	0.22
1178	0.19
1179	0.22
1180	0.22
1181	0.26
1182	0.34
1183	0.39
1184	0.46
1185	0.48
1186	0.52
1187	0.53
1188	0.56
1189	0.61
1190	0.6
1191	0.58
1192	0.53
1193	0.51
1194	0.46
1195	0.39
1196	0.37
1197	0.27
1198	0.19
1199	0.13
1200	0.12
1201	0.11
1202	0.11
1203	0.11
1204	0.09
1205	0.09
1206	0.11
1207	0.15
1208	0.16
1209	0.17
1210	0.23
1211	0.28
1212	0.32
1213	0.39
1214	0.46
1215	0.52
1216	0.61
1217	0.71
1218	0.74
1219	0.79
1220	0.84
1221	0.8
1222	0.77
1223	0.76
1224	0.74
1225	0.72
1226	0.69
1227	0.64
1228	0.6
1229	0.57
1230	0.49
1231	0.4
1232	0.32
1233	0.24
1234	0.17
1235	0.12
1236	0.08
1237	0.08
1238	0.08
1239	0.09
1240	0.09
1241	0.1
1242	0.11
1243	0.14
1244	0.15
1245	0.16
1246	0.22
1247	0.28
1248	0.3
1249	0.29
1250	0.3
1251	0.26
1252	0.25
1253	0.24
1254	0.17
1255	0.1
1256	0.07
1257	0.07
1258	0.05
1259	0.05
1260	0.04
1261	0.05
1262	0.08
1263	0.09
1264	0.11
1265	0.17
1266	0.21
1267	0.24
1268	0.29
1269	0.39
1270	0.46
1271	0.55
1272	0.64
1273	0.69
1274	0.75
1275	0.83
1276	0.87
1277	0.87
1278	0.86
1279	0.8
1280	0.76
1281	0.73

Q2TX40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer