Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YUD7

Protein Details
Accession A0A2T9YUD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-53VSIISPVRFKKKPKTKQNINSRTYHTHydrophilic
65-94IISDKEPSPSKTKKKLKKRIKVEVHINLEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-85PSKTKKKLKKRIK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
Amino Acid Sequences MSDPKKRFFQSSSQTNIVHVISDSSSDVSIISPVRFKKKPKTKQNINSRTYHTTQKLNSPISTAIISDKEPSPSKTKKKLKKRIKVEVHINLEYNEAKVLLIAGSHNNNILGSIQIDQLFSCKGNLKPTKALLTTYMMDYEWVREKIGNEAIIVIGCHPPDIKEHTPGAFNLNAETVFVSPQLLPDSRYTSYHPKLMLLWFDGFVRMVISSANLIPGDWESIQNSAFVQDFPLLSKPNENDTVVKSQLIDFLNHSQFPESTLSALQYIDFSSFKHQLVTAVPGRYSKDIKDNKYGYVGLSKSIKNIKQLNNLKMEKLCCQSSSLGFLNLFWINQIIAELGQACQAQILFPTQEQVENSELGPNGAGSVILTERAFNSKYFPRYSLYKPDYTTPGLLSHSKIIYSKYTDSENAWMYLGSANFTKSAWGVFTTKEYKISNFEIGVLLNCYYHKNSIHLYNGTDPKKNYQIPLPFSINWQKYSTQDKPWTLSYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.54
3 0.53
4 0.43
5 0.33
6 0.25
7 0.19
8 0.14
9 0.15
10 0.15
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.09
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.18
20 0.23
21 0.32
22 0.38
23 0.45
24 0.53
25 0.62
26 0.71
27 0.77
28 0.83
29 0.86
30 0.9
31 0.94
32 0.94
33 0.88
34 0.84
35 0.8
36 0.76
37 0.68
38 0.67
39 0.6
40 0.57
41 0.55
42 0.57
43 0.58
44 0.55
45 0.52
46 0.46
47 0.42
48 0.36
49 0.34
50 0.25
51 0.2
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.22
57 0.25
58 0.28
59 0.34
60 0.42
61 0.51
62 0.58
63 0.67
64 0.72
65 0.8
66 0.88
67 0.9
68 0.91
69 0.92
70 0.92
71 0.92
72 0.91
73 0.9
74 0.88
75 0.84
76 0.76
77 0.66
78 0.56
79 0.48
80 0.39
81 0.29
82 0.2
83 0.13
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.1
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.09
99 0.07
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.15
110 0.16
111 0.26
112 0.32
113 0.35
114 0.39
115 0.42
116 0.46
117 0.42
118 0.42
119 0.34
120 0.32
121 0.29
122 0.25
123 0.22
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.17
133 0.21
134 0.24
135 0.21
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.1
148 0.18
149 0.19
150 0.22
151 0.24
152 0.25
153 0.26
154 0.26
155 0.27
156 0.21
157 0.18
158 0.15
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.17
174 0.17
175 0.19
176 0.22
177 0.28
178 0.3
179 0.31
180 0.3
181 0.26
182 0.27
183 0.27
184 0.25
185 0.19
186 0.17
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.18
226 0.18
227 0.18
228 0.19
229 0.22
230 0.19
231 0.19
232 0.15
233 0.14
234 0.18
235 0.17
236 0.15
237 0.13
238 0.18
239 0.19
240 0.19
241 0.19
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.11
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.15
265 0.19
266 0.19
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.2
271 0.21
272 0.22
273 0.18
274 0.24
275 0.3
276 0.34
277 0.41
278 0.41
279 0.4
280 0.41
281 0.4
282 0.31
283 0.29
284 0.25
285 0.19
286 0.21
287 0.2
288 0.21
289 0.27
290 0.28
291 0.29
292 0.37
293 0.4
294 0.47
295 0.54
296 0.56
297 0.59
298 0.58
299 0.54
300 0.49
301 0.45
302 0.4
303 0.36
304 0.32
305 0.23
306 0.24
307 0.24
308 0.21
309 0.25
310 0.21
311 0.19
312 0.18
313 0.17
314 0.18
315 0.16
316 0.15
317 0.1
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.12
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.06
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.17
364 0.22
365 0.27
366 0.3
367 0.31
368 0.31
369 0.36
370 0.41
371 0.47
372 0.46
373 0.46
374 0.44
375 0.47
376 0.48
377 0.45
378 0.41
379 0.32
380 0.29
381 0.27
382 0.27
383 0.25
384 0.24
385 0.22
386 0.22
387 0.22
388 0.22
389 0.23
390 0.26
391 0.28
392 0.26
393 0.29
394 0.29
395 0.3
396 0.32
397 0.3
398 0.26
399 0.23
400 0.2
401 0.17
402 0.18
403 0.16
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.12
414 0.13
415 0.14
416 0.21
417 0.25
418 0.26
419 0.3
420 0.31
421 0.31
422 0.34
423 0.37
424 0.34
425 0.3
426 0.3
427 0.25
428 0.24
429 0.23
430 0.19
431 0.15
432 0.12
433 0.13
434 0.15
435 0.17
436 0.21
437 0.21
438 0.23
439 0.27
440 0.33
441 0.39
442 0.38
443 0.39
444 0.43
445 0.5
446 0.51
447 0.52
448 0.48
449 0.48
450 0.55
451 0.55
452 0.5
453 0.5
454 0.55
455 0.55
456 0.6
457 0.58
458 0.5
459 0.53
460 0.59
461 0.54
462 0.49
463 0.46
464 0.42
465 0.42
466 0.51
467 0.5
468 0.5
469 0.55
470 0.56
471 0.58