Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9Y1X6

Protein Details
Accession A0A2T9Y1X6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-148RIDTRRSSRSRSRQRFGRSRSNERRPYRKRSSPNRRSRSPGDRBasic
301-320MNSDRPRRYSREPRDPREFGBasic
432-451HDRGRTDRSPPPRRNYNSNYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-152RRSSRSRSRQRFGRSRSNERRPYRKRSSPNRRSRSPGDRGRFN
275-276PR
331-369GEPRKQYGRSRSNGRGEFNRRGHNEISPRGRRIESPPRP
406-429ERGRGGPPPPGRGRPMGANRSPPP
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTSPIIHSEPISLEPEIEMSASVYGNDNSNADDGIKIKNSSNYNSEKVSQDSNFAPSPPQEASGWDLEPAVSNEPEASWGQTEDNADNKIDNLSDGFDKKDDEFMRIDTRRSSRSRSRQRFGRSRSNERRPYRKRSSPNRRSRSPGDRGRFNKDMKSREYPNPTSILGVFGLSMYTREDGLKEVFSKFGLVEKISIIYDKNDRNRSRGYGFVTMDSLDAASVARSKTNGMNLDGRKIRVDYSITQKPHSPGSRRVDGPGFNDRNDRPPRYDRNRPRGGRFEGGMRGGRDDNRYDGRNKDGMNSDRPRRYSREPRDPREFGDEIRRPYSPSGEPRKQYGRSRSNGRGEFNRRGHNEISPRGRRIESPPRPGDRRDDFYRMDRGPDRSGRDDYADRGPDNGHYDNSRERGRGGPPPPGRGRPMGANRSPPPYHHDRGRTDRSPPPRRNYNSNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.15
4 0.13
5 0.1
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.16
22 0.19
23 0.2
24 0.22
25 0.28
26 0.32
27 0.34
28 0.4
29 0.42
30 0.42
31 0.43
32 0.44
33 0.41
34 0.4
35 0.41
36 0.35
37 0.32
38 0.31
39 0.32
40 0.3
41 0.27
42 0.27
43 0.21
44 0.25
45 0.22
46 0.22
47 0.18
48 0.18
49 0.22
50 0.22
51 0.22
52 0.18
53 0.17
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.17
70 0.16
71 0.19
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.13
78 0.12
79 0.09
80 0.1
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.24
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.24
92 0.32
93 0.32
94 0.33
95 0.32
96 0.36
97 0.4
98 0.42
99 0.47
100 0.49
101 0.58
102 0.68
103 0.71
104 0.76
105 0.77
106 0.83
107 0.85
108 0.82
109 0.83
110 0.8
111 0.81
112 0.83
113 0.85
114 0.85
115 0.83
116 0.87
117 0.84
118 0.85
119 0.84
120 0.83
121 0.83
122 0.84
123 0.88
124 0.87
125 0.9
126 0.89
127 0.84
128 0.82
129 0.8
130 0.78
131 0.76
132 0.75
133 0.71
134 0.71
135 0.7
136 0.71
137 0.69
138 0.62
139 0.6
140 0.57
141 0.56
142 0.53
143 0.55
144 0.53
145 0.54
146 0.61
147 0.56
148 0.51
149 0.48
150 0.42
151 0.36
152 0.3
153 0.24
154 0.15
155 0.13
156 0.1
157 0.07
158 0.07
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.12
176 0.12
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.15
186 0.19
187 0.26
188 0.34
189 0.35
190 0.38
191 0.4
192 0.42
193 0.39
194 0.37
195 0.34
196 0.32
197 0.31
198 0.28
199 0.25
200 0.22
201 0.2
202 0.15
203 0.11
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.03
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.22
218 0.22
219 0.28
220 0.28
221 0.27
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.17
226 0.19
227 0.16
228 0.22
229 0.29
230 0.29
231 0.3
232 0.31
233 0.31
234 0.35
235 0.37
236 0.35
237 0.36
238 0.42
239 0.47
240 0.45
241 0.46
242 0.42
243 0.39
244 0.38
245 0.39
246 0.34
247 0.29
248 0.34
249 0.32
250 0.38
251 0.42
252 0.41
253 0.36
254 0.42
255 0.52
256 0.55
257 0.66
258 0.67
259 0.71
260 0.78
261 0.77
262 0.75
263 0.73
264 0.7
265 0.63
266 0.53
267 0.47
268 0.4
269 0.38
270 0.35
271 0.27
272 0.24
273 0.22
274 0.24
275 0.23
276 0.21
277 0.23
278 0.24
279 0.26
280 0.27
281 0.27
282 0.3
283 0.31
284 0.3
285 0.3
286 0.33
287 0.34
288 0.41
289 0.45
290 0.48
291 0.5
292 0.53
293 0.53
294 0.52
295 0.58
296 0.6
297 0.63
298 0.67
299 0.71
300 0.76
301 0.81
302 0.76
303 0.7
304 0.66
305 0.57
306 0.48
307 0.49
308 0.46
309 0.4
310 0.41
311 0.39
312 0.33
313 0.33
314 0.36
315 0.31
316 0.36
317 0.42
318 0.47
319 0.49
320 0.53
321 0.6
322 0.62
323 0.64
324 0.65
325 0.64
326 0.64
327 0.7
328 0.73
329 0.74
330 0.72
331 0.68
332 0.67
333 0.66
334 0.68
335 0.66
336 0.66
337 0.59
338 0.59
339 0.56
340 0.53
341 0.53
342 0.51
343 0.56
344 0.54
345 0.54
346 0.53
347 0.53
348 0.49
349 0.51
350 0.54
351 0.53
352 0.56
353 0.62
354 0.66
355 0.69
356 0.68
357 0.69
358 0.65
359 0.63
360 0.6
361 0.58
362 0.53
363 0.54
364 0.6
365 0.51
366 0.5
367 0.48
368 0.46
369 0.47
370 0.49
371 0.51
372 0.48
373 0.5
374 0.46
375 0.46
376 0.44
377 0.4
378 0.42
379 0.4
380 0.35
381 0.33
382 0.32
383 0.3
384 0.33
385 0.31
386 0.26
387 0.24
388 0.28
389 0.33
390 0.38
391 0.38
392 0.34
393 0.34
394 0.36
395 0.39
396 0.44
397 0.42
398 0.46
399 0.47
400 0.55
401 0.6
402 0.6
403 0.6
404 0.55
405 0.55
406 0.54
407 0.59
408 0.6
409 0.58
410 0.62
411 0.61
412 0.65
413 0.63
414 0.55
415 0.53
416 0.52
417 0.54
418 0.54
419 0.59
420 0.6
421 0.68
422 0.76
423 0.72
424 0.7
425 0.72
426 0.74
427 0.76
428 0.76
429 0.76
430 0.77
431 0.79