Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YLU3

Protein Details
Accession A0A2T9YLU3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-166STTPNRQKTMSKIKTKQKKSSLKIENYDFHydrophilic
887-908ILIHMEKKSKQSRKNQNSSCIAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 1, plas 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MSFNTTDAYDYSMQNLQKYPFKLQNIFNKIELTPWIPPATIETTQVSKSKAGTASPKLENNAKTIINPSVSMLVTISEPSKAVPENKQKTEALDEELQSSELVENADIIAQQVTGIKEPLSLEDDIVTLDIQDSLERSTTPNRQKTMSKIKTKQKKSSLKIENYDFYESNVYIGTSDGQIFRIVFPEIVYGSEEASSYQELGRVLVGSGDSSIYWYRLPDLKLLKGPNLPFITGVNCLSVDQLYNMKNTMKRPDIATICITKKKQLEIYEIDKNISLKKEIRLPLEVVTICHSGRYACIADIKSYKIIDLNQQYKPVELAVVNDSYKDPISSKIVKLPRPKIIAIGTNEFFYIVTSSMDASCIGCIVSETGESRKATIQFLEFPKSIAFSSPNLYTILADDSIQIHNVNTEQNYSVKLLKGDKASKPRKILSTNSFPIFAIHPIDFNFGNHSRLAPSDVNQYTLDNNNNVVYSRDNSSNPNIINNMYSEKISVLFNNSINILTKPSTFIIILNFLDQNEVEKAMSITERMVESSSKNLLQTPEVQYLYQRAALIYFKNLLFSDTIECLLKGKFDPRALIHLYKDISILLGTLIEPLSELHLQAHIKKLLDELGDIDKLIKNISESFFDKNNVQLSSIYESYYNSANDLLVKYLELTTSAYTDKATTVVINTALLILYVKTNQKDVTESHILRNHQIIDYQIAKGYLLEQKKYYYAGLIFKCNGNSNKYLDLYEQILSGEITDSDFTGELEYIDYLKSLKNEQILVEKFYKLFDINVELSIKIFILISPGAVAGLNTDSLIFKIEKSSNDNLLRLFIERLIAVHHSKSPLYTTLLAQIYIRDIKRYFLLPESNHHKKELEDAFTVRKNQNQNLTFREFLVQMSEKEKILIHMEKKSKQSRKNQNSSCIANKQVFFCDYLNKNLSENFFDSVRMRCRLIELITEHNQLLDIAKIIETITQHAESYLSIERAILLLKLGKVTEAISILVHEAQEFVEAEMICLTPKSAQSLFKLVYPVNNSEKGVNNKNKTISSICEPYPLILFQEYLKVEDPETAYLLVVDLITKYSDKYDFKGVLEKIPETWLALPFASYLKANFNALSSQTEFALITSGLLAPIMRSMQKDYYSTLSSPIFEDELINSSITKKENTIAIISKAQNDILSHYKANTKNLQAIKNSQPLKSDSIIGKKIPESQHFSDNLYKSKRQLIDGTEPFAYFPKLNLYSHISCLKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.31
4 0.35
5 0.38
6 0.43
7 0.45
8 0.51
9 0.54
10 0.58
11 0.65
12 0.65
13 0.65
14 0.59
15 0.54
16 0.47
17 0.43
18 0.38
19 0.32
20 0.27
21 0.28
22 0.27
23 0.24
24 0.24
25 0.26
26 0.29
27 0.26
28 0.26
29 0.25
30 0.27
31 0.3
32 0.33
33 0.31
34 0.27
35 0.27
36 0.3
37 0.3
38 0.31
39 0.36
40 0.41
41 0.46
42 0.5
43 0.52
44 0.5
45 0.55
46 0.52
47 0.48
48 0.45
49 0.39
50 0.34
51 0.34
52 0.34
53 0.29
54 0.27
55 0.25
56 0.24
57 0.23
58 0.22
59 0.18
60 0.14
61 0.13
62 0.14
63 0.13
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.13
68 0.16
69 0.21
70 0.29
71 0.39
72 0.48
73 0.52
74 0.57
75 0.55
76 0.54
77 0.57
78 0.49
79 0.44
80 0.4
81 0.36
82 0.33
83 0.33
84 0.29
85 0.22
86 0.2
87 0.14
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.16
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.1
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.19
126 0.29
127 0.38
128 0.45
129 0.46
130 0.5
131 0.55
132 0.62
133 0.66
134 0.66
135 0.67
136 0.69
137 0.77
138 0.83
139 0.87
140 0.88
141 0.87
142 0.88
143 0.84
144 0.85
145 0.85
146 0.83
147 0.81
148 0.77
149 0.72
150 0.65
151 0.64
152 0.53
153 0.44
154 0.39
155 0.31
156 0.26
157 0.21
158 0.17
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.13
204 0.18
205 0.19
206 0.23
207 0.27
208 0.31
209 0.36
210 0.38
211 0.39
212 0.4
213 0.4
214 0.41
215 0.38
216 0.34
217 0.29
218 0.28
219 0.26
220 0.22
221 0.22
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.1
228 0.1
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.2
234 0.23
235 0.27
236 0.33
237 0.33
238 0.34
239 0.36
240 0.42
241 0.4
242 0.4
243 0.4
244 0.39
245 0.39
246 0.44
247 0.42
248 0.4
249 0.41
250 0.43
251 0.45
252 0.43
253 0.45
254 0.44
255 0.49
256 0.51
257 0.48
258 0.44
259 0.39
260 0.36
261 0.33
262 0.28
263 0.26
264 0.22
265 0.25
266 0.32
267 0.35
268 0.38
269 0.37
270 0.37
271 0.35
272 0.37
273 0.33
274 0.26
275 0.25
276 0.24
277 0.2
278 0.19
279 0.17
280 0.12
281 0.12
282 0.15
283 0.12
284 0.11
285 0.17
286 0.17
287 0.21
288 0.23
289 0.24
290 0.23
291 0.22
292 0.22
293 0.19
294 0.2
295 0.24
296 0.31
297 0.34
298 0.34
299 0.38
300 0.38
301 0.36
302 0.35
303 0.27
304 0.2
305 0.14
306 0.15
307 0.12
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.11
316 0.12
317 0.18
318 0.22
319 0.23
320 0.3
321 0.36
322 0.41
323 0.5
324 0.53
325 0.54
326 0.55
327 0.53
328 0.49
329 0.47
330 0.46
331 0.41
332 0.4
333 0.33
334 0.29
335 0.29
336 0.24
337 0.21
338 0.15
339 0.12
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.09
358 0.13
359 0.13
360 0.15
361 0.18
362 0.19
363 0.19
364 0.2
365 0.2
366 0.22
367 0.25
368 0.29
369 0.25
370 0.25
371 0.24
372 0.23
373 0.21
374 0.17
375 0.16
376 0.12
377 0.15
378 0.15
379 0.16
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.12
384 0.13
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.13
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.16
405 0.18
406 0.2
407 0.26
408 0.3
409 0.35
410 0.43
411 0.5
412 0.53
413 0.56
414 0.57
415 0.57
416 0.56
417 0.57
418 0.54
419 0.56
420 0.54
421 0.5
422 0.46
423 0.4
424 0.36
425 0.3
426 0.24
427 0.17
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.14
432 0.13
433 0.12
434 0.16
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.15
439 0.14
440 0.14
441 0.19
442 0.14
443 0.14
444 0.21
445 0.21
446 0.23
447 0.23
448 0.23
449 0.2
450 0.23
451 0.23
452 0.15
453 0.16
454 0.14
455 0.14
456 0.14
457 0.13
458 0.11
459 0.11
460 0.13
461 0.15
462 0.16
463 0.19
464 0.22
465 0.25
466 0.23
467 0.23
468 0.22
469 0.19
470 0.18
471 0.17
472 0.16
473 0.12
474 0.12
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.11
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.1
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.18
528 0.2
529 0.22
530 0.22
531 0.22
532 0.2
533 0.21
534 0.21
535 0.18
536 0.14
537 0.09
538 0.1
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.1
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.11
550 0.09
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.1
559 0.13
560 0.14
561 0.17
562 0.16
563 0.21
564 0.23
565 0.25
566 0.23
567 0.22
568 0.21
569 0.19
570 0.18
571 0.13
572 0.1
573 0.08
574 0.07
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.03
581 0.04
582 0.04
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.09
588 0.09
589 0.1
590 0.14
591 0.14
592 0.14
593 0.14
594 0.14
595 0.13
596 0.13
597 0.12
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.07
607 0.06
608 0.08
609 0.09
610 0.12
611 0.12
612 0.15
613 0.16
614 0.17
615 0.17
616 0.17
617 0.19
618 0.16
619 0.15
620 0.14
621 0.14
622 0.16
623 0.16
624 0.14
625 0.11
626 0.11
627 0.12
628 0.13
629 0.11
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.08
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.07
648 0.08
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.06
665 0.09
666 0.09
667 0.11
668 0.11
669 0.12
670 0.14
671 0.14
672 0.19
673 0.24
674 0.24
675 0.28
676 0.31
677 0.31
678 0.31
679 0.32
680 0.26
681 0.19
682 0.19
683 0.15
684 0.14
685 0.15
686 0.14
687 0.13
688 0.12
689 0.11
690 0.1
691 0.12
692 0.14
693 0.14
694 0.15
695 0.15
696 0.16
697 0.17
698 0.18
699 0.16
700 0.13
701 0.14
702 0.19
703 0.19
704 0.21
705 0.21
706 0.21
707 0.22
708 0.25
709 0.25
710 0.22
711 0.23
712 0.23
713 0.25
714 0.25
715 0.25
716 0.2
717 0.2
718 0.18
719 0.16
720 0.13
721 0.1
722 0.1
723 0.09
724 0.08
725 0.06
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.06
743 0.08
744 0.09
745 0.11
746 0.13
747 0.14
748 0.15
749 0.22
750 0.22
751 0.24
752 0.25
753 0.23
754 0.21
755 0.21
756 0.21
757 0.14
758 0.13
759 0.1
760 0.12
761 0.12
762 0.14
763 0.14
764 0.13
765 0.13
766 0.13
767 0.12
768 0.07
769 0.07
770 0.05
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.04
780 0.04
781 0.04
782 0.04
783 0.05
784 0.05
785 0.05
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.11
790 0.14
791 0.16
792 0.22
793 0.25
794 0.31
795 0.33
796 0.34
797 0.29
798 0.29
799 0.27
800 0.22
801 0.2
802 0.12
803 0.11
804 0.1
805 0.09
806 0.09
807 0.12
808 0.12
809 0.12
810 0.14
811 0.15
812 0.15
813 0.16
814 0.16
815 0.15
816 0.17
817 0.17
818 0.16
819 0.21
820 0.21
821 0.21
822 0.19
823 0.17
824 0.17
825 0.2
826 0.2
827 0.17
828 0.17
829 0.18
830 0.2
831 0.21
832 0.2
833 0.2
834 0.26
835 0.23
836 0.3
837 0.38
838 0.44
839 0.43
840 0.43
841 0.4
842 0.34
843 0.41
844 0.39
845 0.34
846 0.29
847 0.3
848 0.33
849 0.35
850 0.4
851 0.33
852 0.33
853 0.34
854 0.36
855 0.44
856 0.43
857 0.44
858 0.46
859 0.49
860 0.44
861 0.39
862 0.37
863 0.28
864 0.24
865 0.25
866 0.21
867 0.17
868 0.19
869 0.2
870 0.18
871 0.19
872 0.19
873 0.15
874 0.19
875 0.23
876 0.24
877 0.31
878 0.37
879 0.42
880 0.5
881 0.58
882 0.62
883 0.64
884 0.71
885 0.75
886 0.79
887 0.85
888 0.83
889 0.82
890 0.79
891 0.76
892 0.72
893 0.65
894 0.58
895 0.51
896 0.46
897 0.39
898 0.36
899 0.31
900 0.27
901 0.24
902 0.28
903 0.25
904 0.3
905 0.31
906 0.29
907 0.29
908 0.29
909 0.3
910 0.26
911 0.25
912 0.21
913 0.19
914 0.2
915 0.21
916 0.23
917 0.26
918 0.25
919 0.24
920 0.23
921 0.26
922 0.27
923 0.27
924 0.27
925 0.25
926 0.29
927 0.32
928 0.34
929 0.3
930 0.27
931 0.25
932 0.2
933 0.18
934 0.11
935 0.08
936 0.07
937 0.07
938 0.07
939 0.07
940 0.09
941 0.08
942 0.1
943 0.13
944 0.13
945 0.13
946 0.13
947 0.13
948 0.11
949 0.14
950 0.15
951 0.12
952 0.11
953 0.11
954 0.11
955 0.11
956 0.12
957 0.08
958 0.07
959 0.09
960 0.09
961 0.1
962 0.1
963 0.1
964 0.1
965 0.11
966 0.11
967 0.1
968 0.1
969 0.08
970 0.09
971 0.1
972 0.1
973 0.09
974 0.08
975 0.07
976 0.07
977 0.08
978 0.08
979 0.07
980 0.1
981 0.1
982 0.11
983 0.11
984 0.11
985 0.09
986 0.09
987 0.09
988 0.08
989 0.09
990 0.14
991 0.16
992 0.2
993 0.23
994 0.29
995 0.3
996 0.29
997 0.32
998 0.27
999 0.29
1000 0.3
1001 0.32
1002 0.31
1003 0.34
1004 0.32
1005 0.33
1006 0.39
1007 0.41
1008 0.47
1009 0.51
1010 0.51
1011 0.53
1012 0.56
1013 0.54
1014 0.51
1015 0.47
1016 0.41
1017 0.39
1018 0.39
1019 0.34
1020 0.34
1021 0.33
1022 0.3
1023 0.3
1024 0.25
1025 0.21
1026 0.16
1027 0.16
1028 0.12
1029 0.18
1030 0.18
1031 0.18
1032 0.2
1033 0.18
1034 0.18
1035 0.21
1036 0.22
1037 0.17
1038 0.18
1039 0.16
1040 0.14
1041 0.13
1042 0.13
1043 0.09
1044 0.08
1045 0.06
1046 0.05
1047 0.06
1048 0.07
1049 0.07
1050 0.08
1051 0.11
1052 0.17
1053 0.19
1054 0.22
1055 0.29
1056 0.3
1057 0.32
1058 0.39
1059 0.37
1060 0.37
1061 0.38
1062 0.36
1063 0.3
1064 0.29
1065 0.28
1066 0.22
1067 0.23
1068 0.19
1069 0.18
1070 0.17
1071 0.16
1072 0.14
1073 0.15
1074 0.14
1075 0.12
1076 0.12
1077 0.15
1078 0.17
1079 0.18
1080 0.17
1081 0.18
1082 0.19
1083 0.2
1084 0.23
1085 0.2
1086 0.19
1087 0.18
1088 0.19
1089 0.17
1090 0.15
1091 0.15
1092 0.11
1093 0.09
1094 0.08
1095 0.08
1096 0.07
1097 0.07
1098 0.07
1099 0.05
1100 0.08
1101 0.1
1102 0.11
1103 0.12
1104 0.17
1105 0.22
1106 0.25
1107 0.27
1108 0.28
1109 0.31
1110 0.32
1111 0.31
1112 0.31
1113 0.28
1114 0.25
1115 0.25
1116 0.24
1117 0.2
1118 0.17
1119 0.17
1120 0.14
1121 0.16
1122 0.16
1123 0.15
1124 0.13
1125 0.14
1126 0.18
1127 0.19
1128 0.19
1129 0.18
1130 0.2
1131 0.23
1132 0.25
1133 0.28
1134 0.28
1135 0.3
1136 0.36
1137 0.35
1138 0.36
1139 0.33
1140 0.32
1141 0.29
1142 0.26
1143 0.27
1144 0.26
1145 0.28
1146 0.26
1147 0.27
1148 0.34
1149 0.36
1150 0.42
1151 0.45
1152 0.44
1153 0.48
1154 0.54
1155 0.57
1156 0.55
1157 0.58
1158 0.59
1159 0.6
1160 0.59
1161 0.53
1162 0.5
1163 0.48
1164 0.48
1165 0.43
1166 0.41
1167 0.38
1168 0.43
1169 0.46
1170 0.43
1171 0.44
1172 0.41
1173 0.47
1174 0.47
1175 0.48
1176 0.48
1177 0.48
1178 0.54
1179 0.52
1180 0.54
1181 0.54
1182 0.52
1183 0.53
1184 0.52
1185 0.52
1186 0.48
1187 0.55
1188 0.54
1189 0.51
1190 0.52
1191 0.51
1192 0.55
1193 0.54
1194 0.55
1195 0.47
1196 0.43
1197 0.4
1198 0.36
1199 0.31
1200 0.21
1201 0.19
1202 0.24
1203 0.26
1204 0.26
1205 0.3
1206 0.36
1207 0.35
1208 0.41