Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YU27

Protein Details
Accession A0A2T9YU27    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-153EEQDQPSRTRRNRERSASPEKRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-153RRNRERSASPEKRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR008111  RNA-bd_8  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSKELDLEVDQTDLMMVEEDDSTVTRKGRGFKSNSDDKEEPKPDETEQPQRLTGIHEEAREEDLYDKFGEYGEIKNLHLNLDRKSGFVKGYAFIEYENYKDAKRAVKEGGEISLLGQKVTVSFNFIHDDEEQDQPSRTRRNRERSASPEKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.05
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.09
11 0.11
12 0.12
13 0.14
14 0.17
15 0.25
16 0.31
17 0.39
18 0.42
19 0.47
20 0.54
21 0.61
22 0.6
23 0.62
24 0.57
25 0.52
26 0.57
27 0.53
28 0.48
29 0.41
30 0.4
31 0.34
32 0.39
33 0.41
34 0.41
35 0.42
36 0.41
37 0.39
38 0.37
39 0.35
40 0.3
41 0.26
42 0.22
43 0.2
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.21
48 0.18
49 0.16
50 0.13
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.16
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.21
73 0.21
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.13
89 0.15
90 0.19
91 0.21
92 0.24
93 0.24
94 0.25
95 0.27
96 0.27
97 0.25
98 0.2
99 0.18
100 0.15
101 0.16
102 0.14
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.17
113 0.17
114 0.19
115 0.17
116 0.22
117 0.21
118 0.24
119 0.24
120 0.22
121 0.24
122 0.24
123 0.31
124 0.36
125 0.4
126 0.47
127 0.56
128 0.65
129 0.73
130 0.79
131 0.82
132 0.81
133 0.86