Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YPN5

Protein Details
Accession A0A2T9YPN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-413ASKISEAKSKLKKHKKDWGMDCNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
399-404KLKKHK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MHVIKPDWLHHDDDKKKLTAIFSVDFDPTGTRLATAGMDNKIRLWNPIAFSDFETPSNNGKYLVSSADDMVILIWEQSFDTDFALQAGNLSQNKAFGACETAETWRPIKRLTGHESDVVDVAWAPHNQFLASCGLDNNIFIWDGQTFDKIHKITGHSEFVKGLSFDPTGELLASQSDDRTMKVWKTSDWSLESTISEPFQNSQFSTWSPDGSGVVAANAVNGSSPIVSVINRKTWKSELALVGHRAAIEAVRYNHRVFKIEEEKSNQEHKNEKDTTVSFNVDNAFVKNTSSNVETDQDRSVSIWLGSQPVPLVVVDSLFNGNIMDLSWCNIKSPSNSKNTYTSMLAACSYDGTVAILFFDQTDIGGSMVSLKEQNALTSKWSSGFRYDSASKISEAKSKLKKHKKDWGMDCNLINIVDSSDDNSVLESDSSVLINSSKSKQNLKKFDGNSEKLGSNNSLNKTNEPLSIDEPANFENITQILPTTNCNSTQLTNSSDQKITNEPEKSTAEVSNSEKSISTPEIAQVITRTTDGKKRVAPTFLRPLGGVPPIKKPNVMPQAADSAFSDTKSTGNKFYSPNLTKSISLGDANLSMHNFVNTENLTFGAKSVIEALGYIGRQLNQLSDIKADNKNAQVLLDDNQFPLIPNVNLKLKKIEPYKSHMPIETSTTRENNRIFSLTSNAVDDIILEDNTKTKKTQNSRLDENLLFPLPKVLQNLIRKSIKTDSMIICKNSVDPQTLSKVTVSSCQTADAWNYYLSSPVIALTSNEHFIAFGCSDSTLHIFLNSGLRVCPPIFVEAPISLIGCSDTFCYVISSSGFISVWDVVDLESIVSALSLKSLLRDNNHSKVQKNDKDFSLSITKVSTDSKGLPIVVLSNGFGYGYNIRMKSWMRISNPIEFLASKLNNFWSWSSVDKHIHSVENNEDSADESETDSEVGTIPSNEPDVIRLGQSSNYFKDSEKENSMKEIGSAFSGLSRKQKALYSTQLASYLQWSKYVSDMDTSEKQDSDLEIKAKNQINENIKENSKQNELNPNTDSLNAEKLISDDDNNSKFVTQETLSEKIKSMYGKHCINEITLGHIEHQLLSSIALESREEVLYWFKLYARWLAVYGTKKKIIDIFVNLLGPSNAHGLTPNVEEFTTNSKTDNKKWAPYLAGIPKRKILSMILPIISAEGNFREVSNEFSIILESISSLQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.54
3 0.54
4 0.51
5 0.46
6 0.41
7 0.41
8 0.36
9 0.32
10 0.33
11 0.31
12 0.28
13 0.26
14 0.22
15 0.17
16 0.16
17 0.14
18 0.12
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.15
23 0.19
24 0.21
25 0.24
26 0.24
27 0.26
28 0.31
29 0.3
30 0.3
31 0.3
32 0.3
33 0.3
34 0.34
35 0.35
36 0.3
37 0.34
38 0.36
39 0.33
40 0.3
41 0.3
42 0.29
43 0.32
44 0.34
45 0.3
46 0.26
47 0.25
48 0.25
49 0.24
50 0.23
51 0.2
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.15
57 0.12
58 0.1
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.15
76 0.16
77 0.18
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.12
84 0.15
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.19
89 0.22
90 0.25
91 0.27
92 0.28
93 0.3
94 0.29
95 0.34
96 0.37
97 0.42
98 0.46
99 0.5
100 0.48
101 0.52
102 0.51
103 0.45
104 0.39
105 0.3
106 0.23
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.1
129 0.08
130 0.1
131 0.11
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.21
136 0.2
137 0.23
138 0.25
139 0.27
140 0.31
141 0.36
142 0.42
143 0.37
144 0.38
145 0.36
146 0.32
147 0.31
148 0.25
149 0.21
150 0.17
151 0.16
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.18
168 0.19
169 0.25
170 0.26
171 0.25
172 0.31
173 0.34
174 0.38
175 0.36
176 0.36
177 0.32
178 0.32
179 0.31
180 0.26
181 0.24
182 0.19
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.18
191 0.18
192 0.24
193 0.23
194 0.21
195 0.19
196 0.19
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.13
216 0.17
217 0.25
218 0.28
219 0.29
220 0.32
221 0.34
222 0.37
223 0.35
224 0.38
225 0.34
226 0.36
227 0.4
228 0.38
229 0.36
230 0.33
231 0.29
232 0.22
233 0.18
234 0.13
235 0.1
236 0.13
237 0.15
238 0.19
239 0.22
240 0.24
241 0.29
242 0.3
243 0.32
244 0.29
245 0.35
246 0.39
247 0.41
248 0.45
249 0.46
250 0.5
251 0.51
252 0.58
253 0.51
254 0.47
255 0.5
256 0.48
257 0.51
258 0.49
259 0.46
260 0.43
261 0.41
262 0.42
263 0.38
264 0.37
265 0.27
266 0.26
267 0.26
268 0.22
269 0.21
270 0.17
271 0.15
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.17
281 0.18
282 0.19
283 0.2
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.15
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.09
299 0.1
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.07
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.18
320 0.26
321 0.32
322 0.38
323 0.41
324 0.43
325 0.47
326 0.47
327 0.45
328 0.38
329 0.33
330 0.26
331 0.24
332 0.21
333 0.16
334 0.13
335 0.11
336 0.1
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.13
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.19
369 0.19
370 0.2
371 0.22
372 0.2
373 0.25
374 0.26
375 0.24
376 0.25
377 0.25
378 0.22
379 0.24
380 0.25
381 0.24
382 0.26
383 0.33
384 0.39
385 0.47
386 0.57
387 0.64
388 0.71
389 0.74
390 0.8
391 0.8
392 0.81
393 0.81
394 0.81
395 0.77
396 0.71
397 0.63
398 0.54
399 0.46
400 0.36
401 0.27
402 0.17
403 0.1
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.07
422 0.09
423 0.12
424 0.16
425 0.19
426 0.29
427 0.36
428 0.45
429 0.53
430 0.57
431 0.62
432 0.59
433 0.65
434 0.65
435 0.6
436 0.54
437 0.48
438 0.43
439 0.35
440 0.35
441 0.27
442 0.22
443 0.24
444 0.23
445 0.26
446 0.27
447 0.27
448 0.29
449 0.29
450 0.27
451 0.24
452 0.24
453 0.19
454 0.21
455 0.21
456 0.18
457 0.17
458 0.16
459 0.15
460 0.13
461 0.11
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.17
477 0.18
478 0.18
479 0.21
480 0.24
481 0.25
482 0.25
483 0.24
484 0.23
485 0.24
486 0.24
487 0.25
488 0.25
489 0.22
490 0.25
491 0.26
492 0.25
493 0.23
494 0.22
495 0.17
496 0.18
497 0.21
498 0.19
499 0.19
500 0.18
501 0.16
502 0.15
503 0.17
504 0.14
505 0.12
506 0.1
507 0.1
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.1
517 0.15
518 0.18
519 0.22
520 0.25
521 0.28
522 0.31
523 0.35
524 0.35
525 0.36
526 0.42
527 0.4
528 0.37
529 0.32
530 0.3
531 0.27
532 0.28
533 0.25
534 0.17
535 0.23
536 0.26
537 0.26
538 0.26
539 0.25
540 0.3
541 0.36
542 0.35
543 0.28
544 0.26
545 0.32
546 0.31
547 0.31
548 0.21
549 0.17
550 0.17
551 0.16
552 0.15
553 0.1
554 0.12
555 0.14
556 0.15
557 0.14
558 0.16
559 0.19
560 0.2
561 0.22
562 0.3
563 0.3
564 0.31
565 0.31
566 0.31
567 0.28
568 0.27
569 0.25
570 0.17
571 0.15
572 0.12
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.06
583 0.08
584 0.07
585 0.08
586 0.07
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.07
591 0.06
592 0.06
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.08
608 0.1
609 0.09
610 0.1
611 0.11
612 0.14
613 0.16
614 0.18
615 0.17
616 0.17
617 0.18
618 0.16
619 0.15
620 0.12
621 0.11
622 0.12
623 0.12
624 0.11
625 0.1
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.09
631 0.07
632 0.08
633 0.1
634 0.16
635 0.17
636 0.17
637 0.2
638 0.2
639 0.27
640 0.31
641 0.36
642 0.33
643 0.39
644 0.47
645 0.48
646 0.48
647 0.42
648 0.39
649 0.33
650 0.35
651 0.31
652 0.26
653 0.23
654 0.25
655 0.25
656 0.28
657 0.28
658 0.24
659 0.23
660 0.22
661 0.2
662 0.18
663 0.2
664 0.17
665 0.16
666 0.15
667 0.13
668 0.12
669 0.11
670 0.1
671 0.08
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.09
677 0.11
678 0.12
679 0.11
680 0.15
681 0.23
682 0.3
683 0.4
684 0.46
685 0.51
686 0.56
687 0.58
688 0.59
689 0.51
690 0.46
691 0.37
692 0.29
693 0.23
694 0.17
695 0.16
696 0.12
697 0.13
698 0.13
699 0.13
700 0.2
701 0.26
702 0.29
703 0.34
704 0.36
705 0.34
706 0.36
707 0.38
708 0.34
709 0.3
710 0.32
711 0.29
712 0.32
713 0.35
714 0.33
715 0.3
716 0.26
717 0.25
718 0.24
719 0.22
720 0.18
721 0.16
722 0.18
723 0.22
724 0.22
725 0.22
726 0.18
727 0.18
728 0.16
729 0.2
730 0.2
731 0.17
732 0.17
733 0.17
734 0.17
735 0.17
736 0.18
737 0.14
738 0.13
739 0.11
740 0.12
741 0.11
742 0.12
743 0.11
744 0.09
745 0.08
746 0.07
747 0.07
748 0.06
749 0.06
750 0.08
751 0.09
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.09
756 0.09
757 0.12
758 0.09
759 0.08
760 0.07
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.1
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.09
770 0.12
771 0.12
772 0.11
773 0.1
774 0.11
775 0.13
776 0.12
777 0.13
778 0.1
779 0.13
780 0.13
781 0.13
782 0.14
783 0.12
784 0.14
785 0.13
786 0.12
787 0.08
788 0.08
789 0.08
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.06
794 0.06
795 0.07
796 0.08
797 0.08
798 0.09
799 0.09
800 0.09
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.08
805 0.09
806 0.08
807 0.08
808 0.07
809 0.07
810 0.06
811 0.06
812 0.06
813 0.04
814 0.04
815 0.04
816 0.03
817 0.03
818 0.03
819 0.03
820 0.03
821 0.04
822 0.04
823 0.06
824 0.1
825 0.13
826 0.16
827 0.24
828 0.3
829 0.35
830 0.43
831 0.45
832 0.44
833 0.51
834 0.58
835 0.57
836 0.58
837 0.56
838 0.5
839 0.53
840 0.5
841 0.45
842 0.41
843 0.35
844 0.29
845 0.25
846 0.24
847 0.19
848 0.21
849 0.18
850 0.14
851 0.15
852 0.16
853 0.17
854 0.17
855 0.15
856 0.14
857 0.13
858 0.12
859 0.1
860 0.08
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.08
866 0.08
867 0.11
868 0.15
869 0.15
870 0.15
871 0.19
872 0.21
873 0.24
874 0.3
875 0.34
876 0.33
877 0.42
878 0.45
879 0.48
880 0.48
881 0.43
882 0.37
883 0.3
884 0.28
885 0.27
886 0.25
887 0.18
888 0.18
889 0.2
890 0.19
891 0.21
892 0.21
893 0.15
894 0.17
895 0.2
896 0.22
897 0.25
898 0.29
899 0.28
900 0.32
901 0.32
902 0.33
903 0.31
904 0.31
905 0.3
906 0.29
907 0.28
908 0.24
909 0.21
910 0.2
911 0.2
912 0.17
913 0.12
914 0.1
915 0.1
916 0.1
917 0.1
918 0.08
919 0.07
920 0.07
921 0.07
922 0.07
923 0.07
924 0.08
925 0.09
926 0.1
927 0.1
928 0.1
929 0.1
930 0.13
931 0.13
932 0.12
933 0.12
934 0.12
935 0.15
936 0.19
937 0.22
938 0.22
939 0.24
940 0.24
941 0.24
942 0.27
943 0.28
944 0.3
945 0.34
946 0.35
947 0.33
948 0.36
949 0.37
950 0.34
951 0.29
952 0.25
953 0.17
954 0.15
955 0.14
956 0.1
957 0.12
958 0.14
959 0.16
960 0.22
961 0.25
962 0.25
963 0.27
964 0.32
965 0.32
966 0.37
967 0.42
968 0.4
969 0.39
970 0.39
971 0.39
972 0.35
973 0.31
974 0.29
975 0.27
976 0.22
977 0.23
978 0.23
979 0.21
980 0.24
981 0.25
982 0.21
983 0.18
984 0.19
985 0.23
986 0.27
987 0.29
988 0.28
989 0.27
990 0.27
991 0.25
992 0.25
993 0.23
994 0.22
995 0.21
996 0.21
997 0.22
998 0.3
999 0.33
1000 0.33
1001 0.36
1002 0.39
1003 0.44
1004 0.47
1005 0.5
1006 0.48
1007 0.46
1008 0.48
1009 0.47
1010 0.43
1011 0.42
1012 0.4
1013 0.41
1014 0.46
1015 0.47
1016 0.48
1017 0.45
1018 0.43
1019 0.38
1020 0.36
1021 0.33
1022 0.24
1023 0.24
1024 0.2
1025 0.19
1026 0.16
1027 0.16
1028 0.18
1029 0.17
1030 0.16
1031 0.17
1032 0.23
1033 0.25
1034 0.26
1035 0.26
1036 0.22
1037 0.22
1038 0.21
1039 0.21
1040 0.15
1041 0.19
1042 0.23
1043 0.28
1044 0.3
1045 0.31
1046 0.31
1047 0.28
1048 0.31
1049 0.28
1050 0.29
1051 0.31
1052 0.38
1053 0.42
1054 0.41
1055 0.44
1056 0.42
1057 0.4
1058 0.39
1059 0.31
1060 0.29
1061 0.26
1062 0.25
1063 0.23
1064 0.24
1065 0.23
1066 0.19
1067 0.19
1068 0.14
1069 0.12
1070 0.11
1071 0.11
1072 0.09
1073 0.1
1074 0.1
1075 0.1
1076 0.11
1077 0.13
1078 0.13
1079 0.12
1080 0.12
1081 0.15
1082 0.16
1083 0.17
1084 0.16
1085 0.15
1086 0.17
1087 0.19
1088 0.23
1089 0.22
1090 0.22
1091 0.21
1092 0.23
1093 0.29
1094 0.35
1095 0.4
1096 0.41
1097 0.43
1098 0.42
1099 0.44
1100 0.46
1101 0.45
1102 0.42
1103 0.41
1104 0.39
1105 0.37
1106 0.38
1107 0.35
1108 0.32
1109 0.26
1110 0.21
1111 0.16
1112 0.14
1113 0.12
1114 0.1
1115 0.12
1116 0.13
1117 0.16
1118 0.18
1119 0.18
1120 0.16
1121 0.16
1122 0.17
1123 0.18
1124 0.23
1125 0.24
1126 0.22
1127 0.23
1128 0.3
1129 0.36
1130 0.43
1131 0.51
1132 0.51
1133 0.54
1134 0.58
1135 0.61
1136 0.57
1137 0.54
1138 0.57
1139 0.56
1140 0.6
1141 0.58
1142 0.57
1143 0.58
1144 0.56
1145 0.53
1146 0.46
1147 0.4
1148 0.38
1149 0.4
1150 0.42
1151 0.37
1152 0.35
1153 0.34
1154 0.33
1155 0.28
1156 0.21
1157 0.15
1158 0.1
1159 0.12
1160 0.12
1161 0.12
1162 0.15
1163 0.15
1164 0.2
1165 0.21
1166 0.21
1167 0.19
1168 0.19
1169 0.2
1170 0.17
1171 0.16
1172 0.11
1173 0.08