FuNGI

A0A2T9YMK4

Protein Details

Accession

A0A2T9YMK4

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-34	EEELKSLKKNLPKRKHSDSDQENL	Hydrophilic
80-107	DDYRQNSRKAASKKKKRRTGGNMFLDVE	Hydrophilic
694-717	FSNIKTPNRNQRQKPRGRPTPSFR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
87-97	RKAASKKKKRR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR041976 KOW_Spt5_3 IPR041977 KOW_Spt5_4 IPR041978 KOW_Spt5_5 IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN PF11942 Spt5_N
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1 cd06083 KOW_Spt5_3 cd06084 KOW_Spt5_4 cd06085 KOW_Spt5_5 cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MSIPSSPSGFEEELKSLKKNLPKRKHSDSDQENLSNEQNVSDEDIRISDDEDYTKSSSKANYNYEDSESDQDQNDPDYQDDYRQNSRKAASKKKKRRTGGNMFLDVEAAVDSEDEDDEEGAELDGDFIADDEAELAQAERAAIRNERRFIPSPQEEDAEEIAARLKDRYTNYSTRRAPVVSEQLPKQFILPSVQDPHLYVARCLQAKESDVVFQIMRRYFEKAETDNPLRILSAYCRSGIRGYVYIEAMNQTDAQLSLERIAGLTSQKVTLLPIDQMLDVVRVKKKEKSVQPGAWVRVKKGKYAGDLAQVLAVIDSTDSAELKLVPRIDYDEKYTQDGKKIKPSTSNGQTARAPQKLFDPREAERIDMNKPVIPRGSDVFHWNSDVYNKGYLEKELKLMSLQTTDVNPTLEEITLFSAGDSAALIEAATAAATISANSQNADDNKVSDVSIGDNVEVIEGDLIGISGTIISIDNDGIIRVRLNPNDLNKSNVKRQPQTIMSFRQRQLRKLFKAGDHVKVVRGKNSGVTGSVVAVENLIVTLISDLSLSEVKVFARDLSQSKEVSSVVSSNKFDKNDLVSLDGGRTVAIVIASERSLYKVLDQNNELLTINTYEATAPFTKSNFSSAMDSNGQEIKKNDLVVETTGLRRSGTILQLNRFVAFIRSQNVITNGGIFSTRVRSLALSTSQQNKMNPFSNIKTPNRNQRQKPRGRPTPSFRGRDPIIGQIVLITRGSFKGYMGVVKETVASMARVELHTSARIVNVERDKLDIKLKDGGTVPSATFGNPGGDRKDFRPNSQMSTPNSRFNTPAFNPSTPGNASSAGNSWNDNSGSNMPPQSPAWGASNSSEPDSKPWGASESSSAGWGSNDNSANSQPGVPETPGVSWDVSDNSSNQPENSSGWADSSSFEDQSEKTSFGTSDFGNKDSSLNSWNVPQTPGAPTPAPIGDSFNELSTQQSSNSWNTDSTTTEESGWGAPDSTFNSADDEFSQGSTENKSSFGNKSSGFQNSENSWGAEENGNTNKAWNAGQNDDFGSSKKSYNDNFSSNRDYENSNRGGYKKNPSNRSDGYENYNNKRNNDGYKNGNDYQGYNRNQNFSRNNNRGNNNSHQSRGRNFNNQRNSYNNNENNFGNSNHNDQYGARGSNDNSWGNTNNNADNTESSWAQSSANDAGPSWGDNSTGGTESKQNDNSSSWENSTAGDQPLSKENSTGGEQALSWENNSTEEKPSSWDISNDSTTDKNTHNSSYGW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.33
3	0.32
4	0.36
5	0.43
6	0.5
7	0.57
8	0.62
9	0.7
10	0.76
11	0.82
12	0.86
13	0.85
14	0.86
15	0.82
16	0.79
17	0.76
18	0.71
19	0.62
20	0.55
21	0.49
22	0.42
23	0.35
24	0.27
25	0.2
26	0.18
27	0.22
28	0.21
29	0.2
30	0.17
31	0.18
32	0.19
33	0.18
34	0.18
35	0.14
36	0.14
37	0.15
38	0.16
39	0.19
40	0.2
41	0.23
42	0.22
43	0.24
44	0.28
45	0.34
46	0.4
47	0.44
48	0.47
49	0.49
50	0.52
51	0.51
52	0.48
53	0.44
54	0.41
55	0.36
56	0.33
57	0.29
58	0.27
59	0.24
60	0.25
61	0.25
62	0.21
63	0.19
64	0.2
65	0.2
66	0.26
67	0.31
68	0.34
69	0.41
70	0.47
71	0.49
72	0.51
73	0.55
74	0.57
75	0.61
76	0.66
77	0.68
78	0.72
79	0.8
80	0.85
81	0.91
82	0.91
83	0.92
84	0.91
85	0.91
86	0.91
87	0.88
88	0.83
89	0.75
90	0.66
91	0.55
92	0.44
93	0.32
94	0.22
95	0.13
96	0.07
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.07
106	0.07
107	0.06
108	0.06
109	0.06
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.04
114	0.04
115	0.04
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.04
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.06
126	0.07
127	0.09
128	0.12
129	0.18
130	0.26
131	0.33
132	0.37
133	0.4
134	0.46
135	0.48
136	0.5
137	0.54
138	0.52
139	0.5
140	0.49
141	0.47
142	0.41
143	0.4
144	0.36
145	0.28
146	0.2
147	0.16
148	0.16
149	0.15
150	0.15
151	0.13
152	0.13
153	0.17
154	0.21
155	0.28
156	0.32
157	0.41
158	0.46
159	0.55
160	0.57
161	0.55
162	0.55
163	0.49
164	0.45
165	0.43
166	0.47
167	0.43
168	0.45
169	0.45
170	0.46
171	0.47
172	0.44
173	0.38
174	0.31
175	0.26
176	0.25
177	0.25
178	0.25
179	0.29
180	0.3
181	0.3
182	0.28
183	0.3
184	0.3
185	0.27
186	0.23
187	0.22
188	0.27
189	0.27
190	0.27
191	0.26
192	0.25
193	0.27
194	0.29
195	0.25
196	0.22
197	0.21
198	0.23
199	0.2
200	0.18
201	0.22
202	0.22
203	0.24
204	0.23
205	0.27
206	0.26
207	0.31
208	0.35
209	0.32
210	0.35
211	0.4
212	0.42
213	0.4
214	0.4
215	0.35
216	0.29
217	0.27
218	0.23
219	0.19
220	0.22
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.23
225	0.24
226	0.24
227	0.23
228	0.2
229	0.21
230	0.22
231	0.22
232	0.21
233	0.2
234	0.19
235	0.16
236	0.13
237	0.11
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.09
251	0.11
252	0.11
253	0.1
254	0.11
255	0.11
256	0.12
257	0.12
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.12
262	0.11
263	0.12
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.16
268	0.19
269	0.22
270	0.25
271	0.3
272	0.38
273	0.45
274	0.53
275	0.58
276	0.63
277	0.63
278	0.69
279	0.7
280	0.67
281	0.65
282	0.57
283	0.51
284	0.5
285	0.46
286	0.42
287	0.42
288	0.41
289	0.38
290	0.42
291	0.41
292	0.39
293	0.39
294	0.35
295	0.28
296	0.23
297	0.19
298	0.14
299	0.11
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.07
309	0.08
310	0.11
311	0.12
312	0.12
313	0.13
314	0.18
315	0.22
316	0.23
317	0.28
318	0.3
319	0.3
320	0.34
321	0.38
322	0.34
323	0.38
324	0.43
325	0.4
326	0.45
327	0.48
328	0.47
329	0.5
330	0.54
331	0.55
332	0.56
333	0.61
334	0.53
335	0.53
336	0.52
337	0.51
338	0.53
339	0.47
340	0.4
341	0.32
342	0.4
343	0.44
344	0.45
345	0.43
346	0.41
347	0.39
348	0.46
349	0.46
350	0.38
351	0.33
352	0.33
353	0.3
354	0.29
355	0.28
356	0.23
357	0.23
358	0.24
359	0.22
360	0.21
361	0.2
362	0.19
363	0.2
364	0.19
365	0.23
366	0.23
367	0.22
368	0.22
369	0.2
370	0.18
371	0.18
372	0.19
373	0.17
374	0.17
375	0.16
376	0.17
377	0.18
378	0.2
379	0.22
380	0.2
381	0.21
382	0.18
383	0.18
384	0.16
385	0.16
386	0.15
387	0.12
388	0.12
389	0.11
390	0.11
391	0.12
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.02
416	0.02
417	0.02
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.05
422	0.06
423	0.07
424	0.07
425	0.08
426	0.11
427	0.12
428	0.15
429	0.14
430	0.13
431	0.14
432	0.14
433	0.14
434	0.11
435	0.11
436	0.08
437	0.1
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.04
446	0.03
447	0.03
448	0.02
449	0.03
450	0.02
451	0.02
452	0.02
453	0.02
454	0.02
455	0.02
456	0.03
457	0.03
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.08
467	0.11
468	0.12
469	0.16
470	0.2
471	0.24
472	0.32
473	0.32
474	0.33
475	0.35
476	0.39
477	0.44
478	0.45
479	0.47
480	0.43
481	0.45
482	0.47
483	0.47
484	0.48
485	0.45
486	0.48
487	0.48
488	0.52
489	0.52
490	0.54
491	0.51
492	0.52
493	0.56
494	0.57
495	0.54
496	0.54
497	0.55
498	0.49
499	0.56
500	0.54
501	0.5
502	0.44
503	0.41
504	0.38
505	0.4
506	0.39
507	0.33
508	0.3
509	0.26
510	0.24
511	0.25
512	0.21
513	0.15
514	0.15
515	0.12
516	0.1
517	0.11
518	0.09
519	0.07
520	0.06
521	0.05
522	0.04
523	0.04
524	0.03
525	0.02
526	0.02
527	0.02
528	0.02
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.06
541	0.07
542	0.09
543	0.11
544	0.15
545	0.17
546	0.17
547	0.17
548	0.18
549	0.17
550	0.15
551	0.14
552	0.12
553	0.12
554	0.15
555	0.16
556	0.17
557	0.21
558	0.21
559	0.21
560	0.2
561	0.21
562	0.19
563	0.19
564	0.17
565	0.14
566	0.14
567	0.13
568	0.12
569	0.09
570	0.07
571	0.06
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.03
576	0.03
577	0.04
578	0.04
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.07
583	0.07
584	0.09
585	0.12
586	0.15
587	0.18
588	0.19
589	0.19
590	0.19
591	0.2
592	0.18
593	0.14
594	0.11
595	0.09
596	0.08
597	0.07
598	0.07
599	0.05
600	0.05
601	0.08
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.11
607	0.11
608	0.13
609	0.11
610	0.12
611	0.13
612	0.13
613	0.16
614	0.16
615	0.16
616	0.15
617	0.18
618	0.16
619	0.16
620	0.16
621	0.16
622	0.17
623	0.17
624	0.15
625	0.13
626	0.14
627	0.12
628	0.13
629	0.1
630	0.1
631	0.11
632	0.11
633	0.1
634	0.09
635	0.11
636	0.12
637	0.14
638	0.18
639	0.2
640	0.21
641	0.24
642	0.24
643	0.22
644	0.2
645	0.17
646	0.13
647	0.12
648	0.12
649	0.11
650	0.13
651	0.13
652	0.14
653	0.15
654	0.15
655	0.14
656	0.13
657	0.1
658	0.09
659	0.09
660	0.08
661	0.07
662	0.08
663	0.09
664	0.08
665	0.09
666	0.09
667	0.1
668	0.12
669	0.14
670	0.13
671	0.16
672	0.22
673	0.25
674	0.28
675	0.28
676	0.28
677	0.3
678	0.3
679	0.29
680	0.28
681	0.26
682	0.31
683	0.37
684	0.38
685	0.43
686	0.45
687	0.54
688	0.6
689	0.67
690	0.68
691	0.71
692	0.78
693	0.8
694	0.86
695	0.85
696	0.84
697	0.83
698	0.83
699	0.79
700	0.79
701	0.77
702	0.71
703	0.61
704	0.58
705	0.51
706	0.47
707	0.41
708	0.34
709	0.28
710	0.23
711	0.22
712	0.17
713	0.16
714	0.13
715	0.11
716	0.07
717	0.06
718	0.07
719	0.08
720	0.07
721	0.06
722	0.09
723	0.09
724	0.11
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.12
729	0.12
730	0.09
731	0.09
732	0.08
733	0.07
734	0.05
735	0.06
736	0.07
737	0.07
738	0.08
739	0.09
740	0.09
741	0.1
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.11
746	0.11
747	0.15
748	0.17
749	0.18
750	0.18
751	0.2
752	0.2
753	0.21
754	0.26
755	0.21
756	0.2
757	0.25
758	0.25
759	0.25
760	0.26
761	0.25
762	0.2
763	0.2
764	0.18
765	0.13
766	0.14
767	0.11
768	0.1
769	0.1
770	0.11
771	0.11
772	0.13
773	0.14
774	0.16
775	0.18
776	0.2
777	0.3
778	0.29
779	0.31
780	0.37
781	0.36
782	0.39
783	0.43
784	0.46
785	0.4
786	0.49
787	0.48
788	0.47
789	0.47
790	0.43
791	0.39
792	0.34
793	0.38
794	0.29
795	0.34
796	0.32
797	0.3
798	0.31
799	0.3
800	0.32
801	0.25
802	0.24
803	0.18
804	0.15
805	0.15
806	0.14
807	0.14
808	0.13
809	0.13
810	0.12
811	0.12
812	0.13
813	0.13
814	0.12
815	0.14
816	0.15
817	0.16
818	0.18
819	0.18
820	0.16
821	0.18
822	0.18
823	0.17
824	0.15
825	0.15
826	0.15
827	0.15
828	0.16
829	0.15
830	0.19
831	0.17
832	0.18
833	0.18
834	0.15
835	0.18
836	0.22
837	0.21
838	0.18
839	0.18
840	0.18
841	0.18
842	0.18
843	0.17
844	0.15
845	0.14
846	0.14
847	0.14
848	0.11
849	0.11
850	0.11
851	0.1
852	0.13
853	0.14
854	0.14
855	0.15
856	0.15
857	0.17
858	0.16
859	0.16
860	0.11
861	0.11
862	0.13
863	0.12
864	0.12
865	0.12
866	0.11
867	0.11
868	0.13
869	0.11
870	0.09
871	0.1
872	0.1
873	0.11
874	0.11
875	0.12
876	0.14
877	0.17
878	0.17
879	0.16
880	0.17
881	0.16
882	0.17
883	0.18
884	0.17
885	0.14
886	0.14
887	0.14
888	0.13
889	0.12
890	0.15
891	0.14
892	0.13
893	0.13
894	0.14
895	0.14
896	0.18
897	0.19
898	0.16
899	0.14
900	0.15
901	0.15
902	0.15
903	0.17
904	0.12
905	0.19
906	0.19
907	0.2
908	0.2
909	0.2
910	0.2
911	0.18
912	0.19
913	0.15
914	0.15
915	0.15
916	0.17
917	0.19
918	0.2
919	0.2
920	0.19
921	0.18
922	0.21
923	0.22
924	0.21
925	0.19
926	0.19
927	0.2
928	0.2
929	0.19
930	0.15
931	0.17
932	0.14
933	0.17
934	0.17
935	0.15
936	0.15
937	0.14
938	0.15
939	0.14
940	0.15
941	0.12
942	0.14
943	0.17
944	0.19
945	0.21
946	0.2
947	0.19
948	0.2
949	0.21
950	0.2
951	0.2
952	0.21
953	0.19
954	0.19
955	0.18
956	0.17
957	0.16
958	0.16
959	0.12
960	0.1
961	0.09
962	0.1
963	0.12
964	0.14
965	0.14
966	0.13
967	0.16
968	0.15
969	0.16
970	0.15
971	0.16
972	0.14
973	0.13
974	0.13
975	0.11
976	0.12
977	0.14
978	0.15
979	0.13
980	0.14
981	0.16
982	0.18
983	0.21
984	0.23
985	0.25
986	0.24
987	0.26
988	0.29
989	0.32
990	0.33
991	0.31
992	0.32
993	0.3
994	0.34
995	0.32
996	0.29
997	0.24
998	0.2
999	0.21
1000	0.19
1001	0.17
1002	0.17
1003	0.2
1004	0.2
1005	0.19
1006	0.2
1007	0.19
1008	0.18
1009	0.19
1010	0.19
1011	0.2
1012	0.23
1013	0.24
1014	0.25
1015	0.25
1016	0.25
1017	0.25
1018	0.21
1019	0.22
1020	0.19
1021	0.21
1022	0.23
1023	0.28
1024	0.3
1025	0.38
1026	0.42
1027	0.44
1028	0.47
1029	0.5
1030	0.52
1031	0.47
1032	0.46
1033	0.4
1034	0.39
1035	0.37
1036	0.4
1037	0.37
1038	0.33
1039	0.36
1040	0.35
1041	0.41
1042	0.43
1043	0.48
1044	0.5
1045	0.56
1046	0.62
1047	0.62
1048	0.68
1049	0.65
1050	0.66
1051	0.6
1052	0.54
1053	0.53
1054	0.53
1055	0.57
1056	0.55
1057	0.59
1058	0.56
1059	0.53
1060	0.56
1061	0.53
1062	0.54
1063	0.53
1064	0.53
1065	0.53
1066	0.56
1067	0.61
1068	0.57
1069	0.56
1070	0.48
1071	0.43
1072	0.45
1073	0.47
1074	0.43
1075	0.44
1076	0.45
1077	0.47
1078	0.48
1079	0.55
1080	0.54
1081	0.54
1082	0.62
1083	0.62
1084	0.68
1085	0.71
1086	0.75
1087	0.72
1088	0.72
1089	0.71
1090	0.69
1091	0.65
1092	0.61
1093	0.59
1094	0.59
1095	0.59
1096	0.62
1097	0.6
1098	0.61
1099	0.66
1100	0.71
1101	0.75
1102	0.75
1103	0.73
1104	0.7
1105	0.69
1106	0.66
1107	0.67
1108	0.64
1109	0.57
1110	0.54
1111	0.5
1112	0.48
1113	0.45
1114	0.39
1115	0.36
1116	0.32
1117	0.34
1118	0.33
1119	0.33
1120	0.29
1121	0.27
1122	0.31
1123	0.3
1124	0.29
1125	0.25
1126	0.27
1127	0.28
1128	0.32
1129	0.38
1130	0.33
1131	0.29
1132	0.31
1133	0.32
1134	0.31
1135	0.35
1136	0.33
1137	0.31
1138	0.31
1139	0.3
1140	0.28
1141	0.27
1142	0.27
1143	0.25
1144	0.22
1145	0.19
1146	0.2
1147	0.19
1148	0.18
1149	0.17
1150	0.18
1151	0.18
1152	0.21
1153	0.2
1154	0.17
1155	0.19
1156	0.19
1157	0.19
1158	0.18
1159	0.14
1160	0.12
1161	0.12
1162	0.14
1163	0.14
1164	0.16
1165	0.15
1166	0.15
1167	0.2
1168	0.23
1169	0.3
1170	0.33
1171	0.33
1172	0.33
1173	0.35
1174	0.37
1175	0.37
1176	0.38
1177	0.33
1178	0.31
1179	0.29
1180	0.27
1181	0.28
1182	0.27
1183	0.24
1184	0.22
1185	0.21
1186	0.21
1187	0.28
1188	0.32
1189	0.29
1190	0.26
1191	0.25
1192	0.27
1193	0.29
1194	0.28
1195	0.22
1196	0.18
1197	0.18
1198	0.2
1199	0.25
1200	0.21
1201	0.19
1202	0.19
1203	0.19
1204	0.21
1205	0.26
1206	0.25
1207	0.25
1208	0.27
1209	0.27
1210	0.29
1211	0.33
1212	0.34
1213	0.32
1214	0.32
1215	0.3
1216	0.34
1217	0.36
1218	0.33
1219	0.31
1220	0.29
1221	0.3
1222	0.32
1223	0.3
1224	0.3
1225	0.31
1226	0.34

A0A2T9YMK4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer