Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T9YT86

Protein Details
Accession A0A2T9YT86    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-249VGKSVSKAKKSTKTQREKVHIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-277IDRPRRGERSERGGKFGNRKPR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MAESVASRNIFDLLKDDAPDAEVGFNIPKPTTDKPVKAAAKPQARPAFQNERSAGNTGSTNQRRGGSRPQGQSRNFDRDAAPSGRDFSDKPKTFGSRSRGQSNFPRRREDGDAPRGRRQFDRHSGTGIEDSEKKIKQGWEGSDSAVVKDQQEATEQAKVDTLAEDAETPAPEEPVDNTKTLQEYLAEKMTKLQVQEQKEVRKANEGVDKSLLKATEVLIKEEESFFVGKSVSKAKKSTKTQREKVHIDFTPKFAPIDRPRRGERSERGGKFGNRKPRTAAIKVNSEAEFPSLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.17
5 0.18
6 0.18
7 0.16
8 0.11
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.14
16 0.19
17 0.23
18 0.31
19 0.37
20 0.39
21 0.41
22 0.51
23 0.55
24 0.53
25 0.57
26 0.57
27 0.59
28 0.58
29 0.63
30 0.62
31 0.58
32 0.58
33 0.58
34 0.59
35 0.53
36 0.59
37 0.51
38 0.47
39 0.47
40 0.47
41 0.39
42 0.3
43 0.27
44 0.21
45 0.3
46 0.3
47 0.3
48 0.31
49 0.34
50 0.35
51 0.38
52 0.46
53 0.46
54 0.5
55 0.56
56 0.62
57 0.67
58 0.67
59 0.71
60 0.67
61 0.65
62 0.58
63 0.51
64 0.43
65 0.37
66 0.41
67 0.35
68 0.3
69 0.22
70 0.23
71 0.22
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.3
76 0.31
77 0.33
78 0.36
79 0.38
80 0.4
81 0.47
82 0.46
83 0.44
84 0.48
85 0.54
86 0.5
87 0.51
88 0.57
89 0.61
90 0.64
91 0.59
92 0.6
93 0.54
94 0.57
95 0.6
96 0.58
97 0.56
98 0.57
99 0.61
100 0.59
101 0.64
102 0.62
103 0.57
104 0.52
105 0.48
106 0.47
107 0.48
108 0.5
109 0.44
110 0.44
111 0.42
112 0.4
113 0.36
114 0.27
115 0.2
116 0.14
117 0.16
118 0.19
119 0.18
120 0.17
121 0.19
122 0.19
123 0.21
124 0.25
125 0.25
126 0.24
127 0.25
128 0.25
129 0.25
130 0.24
131 0.2
132 0.17
133 0.15
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.08
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.11
170 0.12
171 0.14
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.19
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.24
180 0.26
181 0.3
182 0.37
183 0.4
184 0.44
185 0.47
186 0.5
187 0.43
188 0.44
189 0.41
190 0.39
191 0.41
192 0.36
193 0.33
194 0.34
195 0.34
196 0.28
197 0.29
198 0.24
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.18
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.12
217 0.21
218 0.25
219 0.29
220 0.35
221 0.42
222 0.52
223 0.61
224 0.7
225 0.71
226 0.77
227 0.81
228 0.85
229 0.86
230 0.83
231 0.79
232 0.76
233 0.69
234 0.67
235 0.6
236 0.55
237 0.5
238 0.44
239 0.39
240 0.32
241 0.39
242 0.4
243 0.49
244 0.51
245 0.54
246 0.59
247 0.65
248 0.68
249 0.68
250 0.66
251 0.66
252 0.69
253 0.64
254 0.64
255 0.64
256 0.66
257 0.66
258 0.66
259 0.67
260 0.61
261 0.62
262 0.63
263 0.64
264 0.65
265 0.62
266 0.64
267 0.6
268 0.64
269 0.63
270 0.62
271 0.53
272 0.46
273 0.4