FuNGI

A0A2V1E9W8

Protein Details

Accession

A0A2V1E9W8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-71	TGNTPTARTGPPRRRKPRGADPLRAPRRPL	Hydrophilic
541-566	EASGNESSRKKQKKKHDKSTLGHASP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
51-72	GPPRRRKPRGADPLRAPRRPLK
530-536	RKKRPGS
546-557	ESSRKKQKKKHD

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNGAPNFVPPTGSTANAPTINGSTANNSIVHPSSSTSPATMTGNTPTARTGPPRRRKPRGADPLRAPRRPLKTIARPITSLTTMNQTSREHNAPSAMDVGPGKPNTAQDYRNELLSQGARSFPLVVSRKDLAGLRHHVMRLQSKDHINPQDDNQFTPPVRLHRRDPRAPPSGAGAQIVEEEDTKEDIEESKERERMEMQREERRKQREENQAKIAPTGVKKQPAFQKKTEQKYRPDDTPESRKRSALRYEETLPWHLEDFDNKQTWVGTYESTFSDAHVMLNAEGGQSIRMVPLEKWYRFQSKTKAKSTEDPELAKQKSSGYFLKLEQKVRIKQEDEQRAKAARGMRVRAGGGAADEGRIRRVATDDQRRPDADADDIDFNVEEDFADDEEGLNGLFEGEEADLKDTAEKVKRDQLAAAAFDLRDEQEVERQEKEEQETREQQRQLEKALRKSLVKREKNIDYEEEGDNPYESSSDSDTTDAEAENVKAEEAKKTAEQNGKPQESDKPASGASTKGANTPSGNHRPLDVRKKRPGSPNLSEASGNESSRKKQKKKHDKSTLGHASPTSSRAGSPVASRLPSAAEIHSALPPGGIKMKEFITRFRGRIDKANTPEFIKLVKVVAKYDKERGWLTPLPQLPKQE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.28
3	0.28
4	0.27
5	0.22
6	0.22
7	0.22
8	0.21
9	0.19
10	0.17
11	0.18
12	0.2
13	0.19
14	0.18
15	0.2
16	0.21
17	0.21
18	0.18
19	0.18
20	0.2
21	0.23
22	0.23
23	0.2
24	0.19
25	0.2
26	0.22
27	0.21
28	0.19
29	0.2
30	0.24
31	0.24
32	0.24
33	0.23
34	0.24
35	0.26
36	0.33
37	0.4
38	0.45
39	0.56
40	0.67
41	0.75
42	0.82
43	0.88
44	0.89
45	0.9
46	0.9
47	0.88
48	0.87
49	0.86
50	0.87
51	0.87
52	0.81
53	0.75
54	0.72
55	0.71
56	0.66
57	0.64
58	0.63
59	0.64
60	0.71
61	0.75
62	0.7
63	0.63
64	0.61
65	0.58
66	0.5
67	0.41
68	0.32
69	0.3
70	0.28
71	0.28
72	0.3
73	0.27
74	0.29
75	0.33
76	0.36
77	0.31
78	0.3
79	0.32
80	0.28
81	0.28
82	0.27
83	0.21
84	0.19
85	0.18
86	0.18
87	0.21
88	0.21
89	0.2
90	0.19
91	0.21
92	0.25
93	0.29
94	0.3
95	0.28
96	0.37
97	0.36
98	0.37
99	0.34
100	0.28
101	0.28
102	0.28
103	0.26
104	0.19
105	0.19
106	0.17
107	0.18
108	0.19
109	0.14
110	0.21
111	0.23
112	0.23
113	0.28
114	0.28
115	0.28
116	0.29
117	0.31
118	0.25
119	0.28
120	0.33
121	0.3
122	0.33
123	0.33
124	0.33
125	0.35
126	0.4
127	0.37
128	0.36
129	0.39
130	0.39
131	0.43
132	0.49
133	0.51
134	0.47
135	0.45
136	0.45
137	0.47
138	0.43
139	0.41
140	0.36
141	0.34
142	0.3
143	0.31
144	0.3
145	0.31
146	0.39
147	0.41
148	0.47
149	0.52
150	0.61
151	0.66
152	0.72
153	0.71
154	0.69
155	0.66
156	0.58
157	0.53
158	0.48
159	0.4
160	0.32
161	0.24
162	0.17
163	0.16
164	0.16
165	0.11
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.07
172	0.07
173	0.08
174	0.11
175	0.14
176	0.17
177	0.22
178	0.25
179	0.25
180	0.26
181	0.29
182	0.32
183	0.37
184	0.41
185	0.41
186	0.48
187	0.54
188	0.58
189	0.62
190	0.63
191	0.61
192	0.6
193	0.64
194	0.66
195	0.68
196	0.69
197	0.7
198	0.66
199	0.61
200	0.54
201	0.47
202	0.39
203	0.33
204	0.33
205	0.29
206	0.32
207	0.32
208	0.38
209	0.45
210	0.5
211	0.54
212	0.51
213	0.58
214	0.59
215	0.7
216	0.74
217	0.71
218	0.7
219	0.73
220	0.74
221	0.67
222	0.65
223	0.61
224	0.57
225	0.62
226	0.62
227	0.6
228	0.57
229	0.55
230	0.51
231	0.52
232	0.53
233	0.49
234	0.44
235	0.42
236	0.44
237	0.45
238	0.45
239	0.41
240	0.33
241	0.27
242	0.23
243	0.19
244	0.16
245	0.15
246	0.17
247	0.19
248	0.2
249	0.19
250	0.19
251	0.18
252	0.18
253	0.17
254	0.14
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.11
259	0.13
260	0.12
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.14
281	0.2
282	0.21
283	0.24
284	0.27
285	0.34
286	0.35
287	0.4
288	0.42
289	0.46
290	0.53
291	0.57
292	0.6
293	0.55
294	0.6
295	0.6
296	0.58
297	0.51
298	0.45
299	0.41
300	0.42
301	0.4
302	0.33
303	0.28
304	0.22
305	0.21
306	0.23
307	0.22
308	0.17
309	0.19
310	0.2
311	0.29
312	0.31
313	0.31
314	0.32
315	0.37
316	0.39
317	0.41
318	0.44
319	0.37
320	0.38
321	0.45
322	0.51
323	0.48
324	0.46
325	0.44
326	0.41
327	0.4
328	0.37
329	0.32
330	0.27
331	0.27
332	0.27
333	0.26
334	0.27
335	0.26
336	0.23
337	0.2
338	0.14
339	0.1
340	0.09
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.09
350	0.15
351	0.23
352	0.33
353	0.38
354	0.41
355	0.44
356	0.44
357	0.43
358	0.39
359	0.31
360	0.22
361	0.17
362	0.16
363	0.14
364	0.14
365	0.12
366	0.1
367	0.09
368	0.07
369	0.06
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.04
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.11
395	0.16
396	0.17
397	0.19
398	0.26
399	0.28
400	0.28
401	0.28
402	0.28
403	0.25
404	0.25
405	0.23
406	0.17
407	0.15
408	0.14
409	0.14
410	0.1
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.12
415	0.16
416	0.18
417	0.19
418	0.2
419	0.21
420	0.22
421	0.26
422	0.28
423	0.27
424	0.31
425	0.4
426	0.43
427	0.49
428	0.48
429	0.47
430	0.48
431	0.47
432	0.46
433	0.45
434	0.46
435	0.45
436	0.5
437	0.5
438	0.48
439	0.52
440	0.57
441	0.59
442	0.6
443	0.59
444	0.6
445	0.63
446	0.63
447	0.61
448	0.54
449	0.46
450	0.43
451	0.38
452	0.32
453	0.26
454	0.22
455	0.19
456	0.15
457	0.12
458	0.09
459	0.08
460	0.09
461	0.1
462	0.11
463	0.11
464	0.11
465	0.12
466	0.12
467	0.13
468	0.11
469	0.09
470	0.1
471	0.09
472	0.1
473	0.1
474	0.09
475	0.1
476	0.11
477	0.13
478	0.13
479	0.16
480	0.17
481	0.21
482	0.28
483	0.34
484	0.36
485	0.43
486	0.51
487	0.52
488	0.49
489	0.48
490	0.48
491	0.46
492	0.47
493	0.39
494	0.31
495	0.29
496	0.3
497	0.29
498	0.23
499	0.18
500	0.19
501	0.18
502	0.19
503	0.2
504	0.21
505	0.2
506	0.25
507	0.32
508	0.36
509	0.38
510	0.35
511	0.36
512	0.41
513	0.49
514	0.55
515	0.56
516	0.57
517	0.65
518	0.72
519	0.77
520	0.79
521	0.8
522	0.78
523	0.74
524	0.72
525	0.64
526	0.6
527	0.53
528	0.43
529	0.4
530	0.35
531	0.29
532	0.27
533	0.28
534	0.32
535	0.42
536	0.52
537	0.55
538	0.6
539	0.71
540	0.77
541	0.85
542	0.9
543	0.91
544	0.91
545	0.86
546	0.89
547	0.88
548	0.78
549	0.69
550	0.58
551	0.51
552	0.42
553	0.39
554	0.31
555	0.21
556	0.19
557	0.19
558	0.2
559	0.18
560	0.19
561	0.22
562	0.24
563	0.24
564	0.24
565	0.23
566	0.23
567	0.24
568	0.23
569	0.18
570	0.17
571	0.17
572	0.19
573	0.19
574	0.18
575	0.15
576	0.14
577	0.14
578	0.13
579	0.18
580	0.17
581	0.16
582	0.18
583	0.22
584	0.28
585	0.29
586	0.33
587	0.36
588	0.43
589	0.43
590	0.48
591	0.52
592	0.48
593	0.56
594	0.58
595	0.58
596	0.58
597	0.63
598	0.58
599	0.54
600	0.53
601	0.45
602	0.39
603	0.31
604	0.26
605	0.24
606	0.26
607	0.25
608	0.28
609	0.35
610	0.41
611	0.44
612	0.5
613	0.49
614	0.5
615	0.5
616	0.48
617	0.47
618	0.45
619	0.43
620	0.44
621	0.46
622	0.47

A0A2V1E9W8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer