Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V1DBI6

Protein Details
Accession A0A2V1DBI6    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-65MSNSDLKEEKKKRKRQEESTEEAPKKSKKSKKAEDAPDAGAVKDKKKDKKSKKAKKAEDDQVAEPBasic
94-149TNGTLSRKDSKKNDKAKKDKKEKKSKKSKDESADKESKKDKKSKKSKQSEDVPQGEBasic
174-197DSEEAKEKKDKKSKKNKAQAESVTHydrophilic
203-232EDATASKKDKKDKKKSKKEKKEKKAAEESTBasic
387-411DEIEDKQKERKEKKAARQGEKDGAABasic
435-457AMMQEKPKPWQEKRENANNARAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-56EKKKRKRQEESTEEAPKKSKKSKKAEDAPDAGAVKDKKKDKKSKKAKK
100-140RKDSKKNDKAKKDKKEKKSKKSKDESADKESKKDKKSKKSK
179-190KEKKDKKSKKNK
209-227KKDKKDKKKSKKEKKEKKA
343-347KKEGR
363-405ARQEKIKAKNEKLANERIRIRERRDEIEDKQKERKEKKAARQG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSNSDLKEEKKKRKRQEESTEEAPKKSKKSKKAEDAPDAGAVKDKKKDKKSKKAKKAEDDQVAEPAEVAGKSDDVAMNDDFIPLGADDTPIAPTNGTLSRKDSKKNDKAKKDKKEKKSKKSKDESADKESKKDKKSKKSKQSEDVPQGEVADAMEVDVVGNIPETETEVISKADSEEAKEKKDKKSKKNKAQAESVTEELNGEDATASKKDKKDKKKSKKEKKEKKAAEESTEQDTTDAVAAAEEPVANGDATDAAQPAQEGEEDESGKKGRFIIFVGNLPFSATKETIEAHFAKLKPFEIRLRTYKGDNKFMGTCFIEFERFDHMQTALTKYHHSVFPDPKKKEGRKINVELSAGGGGNTAARQEKIKAKNEKLANERIRIRERRDEIEDKQKERKEKKAARQGEKDGAADAAEKEPEPEAASENNAIHPARLAMMQEKPKPWQEKRENANNARAPRYGGHRQRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.93
4 0.91
5 0.88
6 0.88
7 0.87
8 0.78
9 0.71
10 0.68
11 0.63
12 0.62
13 0.65
14 0.65
15 0.65
16 0.73
17 0.81
18 0.84
19 0.88
20 0.89
21 0.88
22 0.84
23 0.76
24 0.71
25 0.6
26 0.49
27 0.45
28 0.38
29 0.34
30 0.37
31 0.43
32 0.47
33 0.57
34 0.68
35 0.73
36 0.81
37 0.88
38 0.91
39 0.94
40 0.95
41 0.95
42 0.94
43 0.93
44 0.92
45 0.9
46 0.83
47 0.74
48 0.68
49 0.58
50 0.47
51 0.37
52 0.27
53 0.19
54 0.14
55 0.13
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.07
71 0.08
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.11
82 0.17
83 0.19
84 0.19
85 0.24
86 0.32
87 0.37
88 0.45
89 0.51
90 0.56
91 0.63
92 0.72
93 0.77
94 0.8
95 0.87
96 0.9
97 0.91
98 0.92
99 0.92
100 0.92
101 0.94
102 0.94
103 0.93
104 0.94
105 0.94
106 0.93
107 0.93
108 0.92
109 0.9
110 0.9
111 0.85
112 0.83
113 0.82
114 0.72
115 0.69
116 0.68
117 0.66
118 0.63
119 0.66
120 0.67
121 0.68
122 0.78
123 0.83
124 0.86
125 0.88
126 0.9
127 0.89
128 0.89
129 0.88
130 0.85
131 0.78
132 0.69
133 0.58
134 0.49
135 0.39
136 0.3
137 0.19
138 0.1
139 0.06
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.18
164 0.19
165 0.23
166 0.3
167 0.34
168 0.41
169 0.51
170 0.58
171 0.61
172 0.71
173 0.78
174 0.83
175 0.88
176 0.87
177 0.83
178 0.82
179 0.75
180 0.69
181 0.61
182 0.51
183 0.41
184 0.32
185 0.26
186 0.18
187 0.14
188 0.08
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.13
196 0.17
197 0.27
198 0.36
199 0.47
200 0.57
201 0.67
202 0.77
203 0.83
204 0.91
205 0.94
206 0.96
207 0.96
208 0.96
209 0.95
210 0.95
211 0.9
212 0.87
213 0.86
214 0.77
215 0.7
216 0.63
217 0.55
218 0.48
219 0.41
220 0.33
221 0.22
222 0.2
223 0.15
224 0.11
225 0.09
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.16
262 0.17
263 0.2
264 0.21
265 0.19
266 0.18
267 0.17
268 0.17
269 0.12
270 0.13
271 0.1
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.19
280 0.19
281 0.21
282 0.21
283 0.22
284 0.21
285 0.24
286 0.28
287 0.28
288 0.33
289 0.36
290 0.4
291 0.41
292 0.44
293 0.47
294 0.47
295 0.49
296 0.44
297 0.42
298 0.39
299 0.37
300 0.36
301 0.3
302 0.24
303 0.19
304 0.19
305 0.17
306 0.15
307 0.16
308 0.18
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.19
314 0.2
315 0.23
316 0.19
317 0.2
318 0.21
319 0.21
320 0.24
321 0.23
322 0.25
323 0.28
324 0.36
325 0.45
326 0.54
327 0.54
328 0.59
329 0.67
330 0.69
331 0.72
332 0.72
333 0.71
334 0.71
335 0.76
336 0.74
337 0.69
338 0.64
339 0.54
340 0.45
341 0.36
342 0.26
343 0.19
344 0.13
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.15
353 0.24
354 0.32
355 0.41
356 0.49
357 0.53
358 0.6
359 0.64
360 0.67
361 0.65
362 0.67
363 0.64
364 0.61
365 0.63
366 0.62
367 0.66
368 0.65
369 0.66
370 0.65
371 0.64
372 0.64
373 0.66
374 0.65
375 0.61
376 0.65
377 0.66
378 0.62
379 0.66
380 0.65
381 0.67
382 0.67
383 0.71
384 0.71
385 0.73
386 0.79
387 0.8
388 0.85
389 0.85
390 0.87
391 0.84
392 0.81
393 0.73
394 0.63
395 0.53
396 0.43
397 0.33
398 0.26
399 0.21
400 0.15
401 0.13
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.14
406 0.14
407 0.13
408 0.14
409 0.14
410 0.17
411 0.19
412 0.19
413 0.19
414 0.21
415 0.2
416 0.18
417 0.17
418 0.16
419 0.14
420 0.14
421 0.15
422 0.16
423 0.24
424 0.32
425 0.37
426 0.4
427 0.45
428 0.52
429 0.6
430 0.62
431 0.66
432 0.68
433 0.72
434 0.77
435 0.82
436 0.84
437 0.81
438 0.84
439 0.8
440 0.75
441 0.7
442 0.62
443 0.55
444 0.49
445 0.51
446 0.52